FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3331, 947 aa 1>>>pF1KE3331 947 - 947 aa - 947 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3503+/-0.000859; mu= 25.3670+/- 0.054 mean_var=359.9216+/-74.188, 0's: 0 Z-trim(109.6): 2084 B-trim: 124 in 2/53 Lambda= 0.067604 statistics sampled from 15501 (17841) to 15501 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16 Scan time: 12.130 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 6729 673.1 1.8e-192 NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 6729 673.1 1.8e-192 NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 6158 617.3 1e-175 NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2662 276.7 5.2e-73 XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2657 276.1 7e-73 XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2641 274.5 2e-72 XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2641 274.5 2e-72 XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2641 274.5 2e-72 XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2641 274.6 2.1e-72 XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2641 274.6 2.1e-72 NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2641 274.6 2.1e-72 NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2641 274.6 2.1e-72 NP_689496 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ho ( 867) 2565 266.9 3.2e-70 XP_016865204 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2565 266.9 3.2e-70 XP_016865202 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2565 266.9 3.2e-70 XP_016865200 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2565 266.9 3.2e-70 XP_016865199 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2565 266.9 3.2e-70 XP_016865201 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2565 266.9 3.2e-70 XP_016865203 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2565 266.9 3.2e-70 NP_001166109 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ( 900) 2565 266.9 3.2e-70 XP_016865206 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 900) 2565 266.9 3.2e-70 NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2536 264.1 2.2e-69 XP_016865210 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 753) 2497 260.1 3e-68 XP_016865209 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 786) 2497 260.2 3e-68 XP_016865208 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2497 260.2 3.1e-68 XP_016865207 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 806) 2496 260.1 3.3e-68 XP_016865205 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 821) 2496 260.1 3.3e-68 NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2493 259.8 4e-68 NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2493 259.8 4e-68 NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2493 259.8 4e-68 NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2493 259.8 4e-68 XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2493 259.8 4e-68 XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2493 259.8 4.1e-68 NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 2408 251.8 1.4e-65 XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2408 251.8 1.4e-65 XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2408 251.8 1.4e-65 XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2408 251.8 1.4e-65 NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 2408 251.8 1.4e-65 NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2394 250.2 3.3e-65 >>NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is (947 aa) initn: 6729 init1: 6729 opt: 6729 Z-score: 3576.4 bits: 673.1 E(85289): 1.8e-192 Smith-Waterman score: 6729; 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NP_009 STLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFS 880 890 900 910 920 930 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 VHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMR :: .:.: : : : :.:... .: : :.. :: ::: ::::.: . : : : NP_009 KHKKTHAGEKFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIHTEEKPYKYEECGKGFSTFSILTKHKV 940 950 960 970 980 990 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 THTGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAG ::::::..:.::::.:...:.:. :..:::::.::.: :: :::. ..: :. :::: NP_009 IHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAFSWPSSLTEHKATHAG 1000 1010 1020 1030 1040 1050 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 EKPYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPY :::: : ::::::: : : : ::.::.::.:.:::::: :.: :. :.: :.: .:: NP_009 EKPYKCEECGKAFSWPSRLTEHKATHAGEEPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPY 1060 1070 1080 1090 1100 1110 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 KCSQCEKSFSGKLRLLVHQRMHTTEKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNE :: .: :::: : :. .:: ::::.: :::::. .: : :.. :. :::: :.: NP_009 KCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEE 1120 1130 1140 1150 1160 1170 900 910 920 930 940 pF1KE3 CGKTFSQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH ::: : . :::. :. ::::: :: :::::. : : : .:.. :. .: NP_009 CGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCEECGKAYKWPSTLRYHKKIHTGEKPYKCEECGKA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 NP_009 FSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKIHTGEKL 1240 1250 1260 1270 1280 >-- initn: 2946 init1: 1014 opt: 1040 Z-score: 576.8 bits: 118.5 E(85289): 2.2e-25 Smith-Waterman score: 1125; 40.3% identity (63.0% similar) in 489 aa overlap (79-566:2-435) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 PRQKQKSRRIEKVLEWLFISQEQPKITKSWGPLSFMDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRS : :.: :: ..:. :::: :: ::. :::. NP_009 MGSLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQNLYRN 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 VMLENYSNLVSLGYQHTKPDIIFKLEQGEELCLVQAQVPNQTCPNTVWKI-DDLMDWHQE :::::: ::: :: :::.:. ::.:.: .. . . : .. .:: : .. NP_009 VMLENYRNLVFLGIAAFKPDLIIFLEEGKESWNMKRHEMVEESPVICSHFAQDL--WPEQ 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 NKDKLGSTAKSFECTTFGKLCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGF . . .: :. : .. .::: .. :: : .: : . NP_009 GIED-----------SFQKVIL--------RRYEKCGHENLHLK-IGYT------NVDEC 90 100 110 120 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 QVHGKSFFHSKHEQTVIGIKYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSS .:: ... .: .:.. . . .. :: .: . :: .. NP_009 KVHKEGY--NKLNQSLTTTQ-SKVFQRGKYANVFHK--------------CSNSNR---- 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 KSYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQL :. :. .: :.: ..: :.: :.::.: :. ..: : :.:.. : : NP_009 ------HKIRHTGKKHLQCKEYVRSFCMLSHLSQHKRIYTRENSYKCEEGGKAFNWSSTL 170 180 190 200 210 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 VIHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHE . .. ::::.::.: ::::.::. . :..:. :.:.: : :.::::::. .. : :. NP_009 TYYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKSYKCEECGKAFNQSAILTKHK 220 230 240 250 260 270 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 RIHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHT ::::::: .:.:: :::. :.: .:. :.::::: :..:::::. : ::.:..::. NP_009 IIHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHA 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 GVKPYGCIQCGKGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKL : ::: : .:::.:: : : :. ::: ::: :.:::::.. : : : . ::::: NP_009 GEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKP 340 350 360 370 380 390 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 HECNNCGKAFSFKSQLIIHQRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECT ..:..:::.::. : : :. :::::.::.:.::::::. 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XP_016 KPNKCEECGKAFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHAGEKPYK 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 CSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNEC :.:: :.:: : :. :. :::::.::.: ::::... . : :.: :.:.::: :.:: XP_016 CKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEEC 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 GKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAF ::.:.. : : :: ::::::::.:.:: :::: .:::: :.. :::: :: : .:::.: XP_016 GKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECGKGF 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE3 TFKSQL----IVHQG------------IHTGVKPYGCIQCGKGFSLKSQLIVHQRSHTGM .. : : ..:.: :.: ::: : .:::.:. .:.:. :.: ::: XP_016 SMFSILTKHKVIHNGEKPYKCEECDKATHAGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGE 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 KPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFSFKSQLIIHQRIHTGENPYE ::: :.::::.: . : : : ::::: ..:..::::....: : :..::: :.::. 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XP_016 HKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKI 830 840 850 860 870 880 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 HTTEKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTFSQKSILSAHQRTHTGE :: ::::.: ::::.: : : :. :.::::: :.::::.:: :..: :..::.:: XP_016 HTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKTHAGE 890 900 910 920 930 940 920 930 940 pF1KE3 KPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH : :: ::::. .: : .:.. :...: XP_016 KFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIHTEEKPYKYEECGKGFSTFSILTKHKVIHTGEKPYK 950 960 970 980 990 1000 >-- initn: 806 init1: 806 opt: 806 Z-score: 453.8 bits: 95.6 E(85289): 1.6e-18 Smith-Waterman score: 806; 56.1% identity (74.5% similar) in 196 aa overlap (723-918:972-1167) 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 VKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPY :.. .::::.:: : : :. :::::.:: XP_016 EKFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIHTEEKPYKYEECGKGFSTFSILTKHKVIHTGEKPY 950 960 970 980 990 1000 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 ECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNE .: ::::::: ...:. :.. :.:: :: : :: :::: : : : ::.:::::.:.: XP_016 KCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAFSWPSSLTEHKATHAGEKPYKCEE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 CGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFSGKLRLLVHQRMHTTEKPYECSECGKA ::::: : : : :. :::: .:::: .: :.:. . :. :.:.:: ::::.: ::::. 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