FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5358, 307 aa 1>>>pF1KE5358 307 - 307 aa - 307 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8372+/- 0.001; mu= 19.0053+/- 0.060 mean_var=78.4663+/-17.253, 0's: 0 Z-trim(103.9): 44 B-trim: 35 in 1/49 Lambda= 0.144788 statistics sampled from 7594 (7628) to 7594 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16 Scan time: 1.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 2081 444.4 5.2e-125 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 801 177.0 1.6e-44 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 595 134.0 1.4e-31 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 536 121.7 7.5e-28 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 533 121.0 1.1e-27 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 526 119.6 3.1e-27 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 522 118.7 5.7e-27 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 520 118.3 7.5e-27 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 512 116.7 2.4e-26 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 492 112.5 4.3e-25 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 473 108.5 6.7e-24 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 463 106.4 2.8e-23 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 457 105.1 6.7e-23 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 455 104.7 8.9e-23 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 453 104.4 1.3e-22 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 449 103.5 2.1e-22 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 443 102.3 5.3e-22 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 432 99.9 2.5e-21 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 419 97.2 1.7e-20 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 397 92.7 4.3e-19 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 385 90.1 2.3e-18 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 383 89.7 3e-18 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 366 86.2 3.7e-17 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 353 83.4 2.3e-16 >>CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 (307 aa) initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081 Z-score: 2357.8 bits: 444.4 E(32554): 5.2e-125 Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETYY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETYY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLISFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 FPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLISFL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 ILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQLLLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 ILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQLLLL 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 ARGFWVA ::::::: CCDS43 ARGFWVA >>CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 (318 aa) initn: 813 init1: 473 opt: 801 Z-score: 912.6 bits: 177.0 E(32554): 1.6e-44 Smith-Waterman score: 801; 42.0% identity (71.0% similar) in 293 aa overlap (9-294:20-307) 10 20 30 40 pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILI .: .. :: :..::.::::. .:: ::. ::: : .:. CCDS58 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 SLGASRFCLQLVGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCV :::::::::: : ...: . . . . ::. ..: :::.::.: .::::..:: CCDS58 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 KIANITHSTFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMT :::..:: .:.::: .. ::.::.:..:: .: . :.::: :. .::..: : : CCDS58 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYL-R----NHL 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 YKWN-------TRIETYYFPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQ :: . : .:. ::.. :..: .::.. ..:::.:: :: .. . ... CCDS58 QPWNVTGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFR 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 DPSTQAHTRALKSLISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFI .::.::: .:: .:.:: .:. ::::...:: .. . .: :. ..::: .:::.: CCDS58 EPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPII 240 250 260 270 280 290 290 300 pF1KE5 LIFSNLKLRSVFSQLLLLARGFWVA :.::: .::.:. CCDS58 LLFSNCRLRAVLKSRRSSRCGTP 300 310 >>CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 (291 aa) initn: 577 init1: 258 opt: 595 Z-score: 680.6 bits: 134.0 E(32554): 1.4e-31 Smith-Waterman score: 595; 35.0% identity (65.3% similar) in 294 aa overlap (5-294:6-287) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQ ::.::.... : :: :. ...:: :::::::. ::.:.:::::::: :::::: CCDS57 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LVGTVHNF--YYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHS .. ..:: :.. . : . . . :.:.: :::. : :.:..:.:....:: CCDS57 WASMLNNFCSYFNLNYVLCN-------LTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 TFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIE ::::.::. ::.::::..:. . . :: : . .... : : . ..: CCDS57 IFLWLRWRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTV--TDKLE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 TYYFPSLK--LVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKS ... ... : ::: .::.: ..:. :: :...::.. . .:: .:. ::.: CCDS57 NFHQYQFQAHTVALVIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSMKARFTALRS 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFS : ..:... ::...: . . . : :. :: : .: :..:. :. .. CCDS57 LAVLFIVFTSYFLTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKRILK 230 240 250 260 270 280 300 pF1KE5 QLLLLARGFWVA CCDS57 GKC 290 >>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa) initn: 537 init1: 290 opt: 536 Z-score: 613.5 bits: 121.7 E(32554): 7.5e-28 Smith-Waterman score: 536; 36.0% identity (63.3% similar) in 278 aa overlap (19-291:19-293) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL .:: .:.:: :: .:.. .. .:.:: ::. ::.:: CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL : . : :. : ... . : . : ..:: . ::. . ::.:. : :: CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIR-KFSGNMTYKWNTRIETY :.:::. . :.::: :..: .:.: : . .: .. : . :.: :. :.. CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATE-NLNADFRFCVKAKRKTNLT--WSCRVNKT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YFPSLKLVI---WSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSL : :: . .:: : :.:..::: ::::: .::: .. . .::::.::.::::.. CCDS86 QHASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 ISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCI-SVHPFILIFSNLKLRSVFS ::::.:. .::..: ..... .... . .. : : : ::::..: ::: CCDS86 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 QLLLLARGFWVA CCDS86 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 >>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa) initn: 522 init1: 301 opt: 533 Z-score: 610.2 bits: 121.0 E(32554): 1.1e-27 Smith-Waterman score: 533; 33.3% identity (66.7% similar) in 306 aa overlap (1-304:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL : .:. :....:.. .:: .::::::: .::. . .:.:::::. ::.:: CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL : .. .:.. :.... .. .. : : :....:: : ::... .:::::.: :. CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETYY ::: .. . .:::: :::.::.. : .. ... . :.:.:... CCDS86 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVP---KNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 FPSLKLVIWS-IPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLISF : .: : . .:: . :.:..::. :: :::.... .. ...::::.:: ::.:..: : CCDS86 FKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LILYALSF-LSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQLL :.: . . . :.. .. .: . . .:.. . : : ::::..: ::: .: ..: CCDS86 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LLARGFWVA ... : CCDS86 RFVKCFLRRRKPFVP 300 310 >>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 471 init1: 235 opt: 526 Z-score: 602.4 bits: 119.6 E(32554): 3.1e-27 Smith-Waterman score: 526; 34.1% identity (66.6% similar) in 311 aa overlap (5-306:1-301) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSL----LGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRF . .:. ..:: : . .: :::::.:: . ::.. .. :.:: .:..:: CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 CLQLVGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITH : : . :.: .. . ... : . : .: . :. . ::... .::::... CCDS53 GLLWV-LLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 STFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFL-IRKFSGNMTYKWNTR :: :: : . . .::: .: :. :: .: ..:.. ..: :::: :. . CCDS53 FIFLHLKRRVKSVILVMLLGPLL--FLACHLFV-IN---MNEIVRTKEFEGNMT--WKIK 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IET-YYFPSLKLVIWS--IPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRA ... .:: .. ... . .::.. :.:.:::: :: .: ..:: .:.. :::::..: .: CCDS53 LKSAMYFSNMTVTMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LKSLISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCI-SVHPFILIFSNLKLR :...::::.: :. :::..:.. .: :..: . . :. . :.::::::..: ::. CCDS53 LQTVISFLLLCAIYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLK 230 240 250 260 270 280 300 pF1KE5 SVFSQLLLLARGFWVA ..: ... : .:: CCDS53 QTFLSVFWQMR-YWVKGEKTSSP 290 300 >>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa) initn: 497 init1: 434 opt: 522 Z-score: 597.7 bits: 118.7 E(32554): 5.7e-27 Smith-Waterman score: 522; 32.4% identity (62.4% similar) in 306 aa overlap (1-303:1-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL :.. . :..: . ::: .: :: :: : :.. :. :.:. .:. :. : CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL . . .: . ...:. :.. . : : : ..:. . :.::.:.:::...: ::: CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVN-YPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETY ::::: . :.:::..:.: : . .: . .:. : . . :.: .. . : CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASL--INEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YFPSLKLVIWSIP-FSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLIS :. . ..: .: . : :.: ::: :: :::..: .:: : .::.:.:: ::.. ..: CCDS58 YLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FLILYALSFLSLIIDA-AKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQL :..:. : ::...: . ..:. . .. ... . : ::::..: ::...: . 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