FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5444, 312 aa 1>>>pF1KE5444 312 - 312 aa - 312 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6354+/-0.00123; mu= 14.0841+/- 0.071 mean_var=160.4593+/-51.884, 0's: 0 Z-trim(104.1): 406 B-trim: 875 in 2/47 Lambda= 0.101249 statistics sampled from 7215 (7754) to 7215 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16 Scan time: 2.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 2078 316.2 2e-86 CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1836 280.9 8.9e-76 CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1234 193.0 2.7e-49 CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1230 192.4 4.3e-49 CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1203 188.4 6e-48 CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1198 187.7 1e-47 CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1192 186.8 1.9e-47 CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1184 185.7 4.2e-47 CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1179 184.9 6.9e-47 CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1175 184.3 1e-46 CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1168 183.3 2.1e-46 CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1167 183.2 2.3e-46 CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1167 183.2 2.3e-46 CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1154 181.3 8.7e-46 CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1140 179.2 3.6e-45 CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1110 174.8 7.5e-44 CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1010 160.3 1.9e-39 CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1005 159.5 3.1e-39 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 993 157.7 1e-38 CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 979 155.7 4.4e-38 CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 959 152.8 3.3e-37 CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 958 152.6 3.6e-37 CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 956 152.3 4.5e-37 CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 954 152.1 5.5e-37 CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 953 151.9 6.2e-37 CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 948 151.2 9.9e-37 CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 947 151.1 1.2e-36 CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 946 150.9 1.2e-36 CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 944 150.6 1.5e-36 CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 942 150.3 1.8e-36 CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 941 150.2 2e-36 CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 937 149.6 3e-36 CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 937 149.6 3.2e-36 CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 936 149.4 3.4e-36 CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 935 149.3 3.8e-36 CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 932 148.8 5e-36 CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 932 148.8 5e-36 CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 931 148.7 5.5e-36 CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 929 148.4 6.7e-36 CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 928 148.2 7.5e-36 CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 926 147.9 9e-36 CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 926 148.0 9.3e-36 CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 925 147.8 1e-35 CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 923 147.5 1.2e-35 CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 923 147.5 1.3e-35 CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 922 147.4 1.4e-35 CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 919 146.9 1.9e-35 CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 917 146.7 2.3e-35 CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 915 146.3 2.7e-35 CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 913 146.1 3.5e-35 >>CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 (312 aa) initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 1665.0 bits: 316.2 E(32554): 2e-86 Smith-Waterman score: 2078; 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CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AAKRLLGWEWGK : .... CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI 310 320 >>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa) initn: 1274 init1: 1225 opt: 1230 Z-score: 994.9 bits: 192.4 E(32554): 4.3e-49 Smith-Waterman score: 1230; 59.5% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (6-306:5-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM : : . :::: ::. : ::. ::..:. :..:. ::: ::..:.:: .::::: CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVVMS ::::::::.::::::::..::.:::. . .:.:::.::..::.. :::: .::.::.:: CCDS46 YFFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC .::.::.::::::...:: :.: :.::::. ::. :.:.:..:. .:::::. :::::: CCDS46 FDRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR ::::::.:::::: ::: :. .: .:.:::. ::: .:. :..::: .::. : .:.: CCDS46 EVPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG :::.::.:::::. .. ::::::: .: :.::...:: ...: :::::::::::.:: CCDS46 TCGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKE 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 AAKRLLGWEWGK : :::. CCDS46 AFKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP 300 310 320 330 340 350 >>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa) initn: 1199 init1: 1199 opt: 1203 Z-score: 974.3 bits: 188.4 E(32554): 6e-48 Smith-Waterman score: 1203; 58.5% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (6-306:5-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM : :: :::::::. :.::.:::: .:.:::.::.::. :::.::.: ::::: CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVVMS ::::::::.::.:.::: :: ::::. :.:::.:.::..:::. :::: .::.::. :. CCDS31 YFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC :::.:::.::::.:.:.::.:. :.. ::. :.. : .:..::. .::::.. .:::.: CCDS31 LDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFIC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR ::::::.:.:::: .:::.:.:.: .::.:: :: .:: :..::: ..:. . .:.: CCDS31 EVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFS 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG ::..:: :: .:. .. .:::: . . ::::::.::::.:::.:::.::::::: .: CCDS31 TCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKE 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 AAKRLLGWEWGK : ..:: CCDS31 ALRKLLSGKL 300 >>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa) initn: 1212 init1: 1188 opt: 1198 Z-score: 970.2 bits: 187.7 E(32554): 1e-47 Smith-Waterman score: 1198; 55.1% identity (81.4% similar) in 312 aa overlap (2-312:1-312) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM : . : ::: :.:::::. :::: ::..:: ::...: :: .:.. .::.::::: CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVVMS :::::::: .:.:.::: :::::.. .::.::.::..::: ...:: .::.::.::. 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CCDS46 ELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMN 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG :::.:: :::.:. .. ::::: .. : :::::..:::::.:::::::::::::: .: CCDS46 TCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKDMKD 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 AAKRLLGWEWGK : :.:. 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CCDS34 YFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC .:::.:::::::: ..:::..:. :. ::: ::. : ....... .::::::: .:::: CCDS34 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHRL-NHFFC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR :.:..:.:.:.::...: ..: : : .: ::: .: ::.::: ..::.: .:.: CCDS34 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFVARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG :::.::.:: ::. .. ::: . : .:::.:::::..:: ::::::::::: ::: CCDS34 TCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKG 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 AAKRLLGWEWGK : ..: : CCDS34 ALWKVL-WRGRDSG 300 310 >>CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 (317 aa) initn: 1167 init1: 1167 opt: 1175 Z-score: 952.0 bits: 184.3 E(32554): 1e-46 Smith-Waterman score: 1175; 55.7% identity (81.9% similar) in 298 aa overlap (13-310:16-313) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLH ::::: :. : ::. ::::.:. :.... ::. ::. : :: .:: CCDS31 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 TPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLV .:::.:::.::::::::::...::.:::. . .:::::.:: :: :: .::..:. 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