Result of FASTA (omim) for pFN21AE5479
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5479, 331 aa
  1>>>pF1KE5479 331 - 331 aa - 331 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9696+/-0.000507; mu= 18.3119+/- 0.031
 mean_var=103.4616+/-26.744, 0's: 0 Z-trim(108.4): 228  B-trim: 1141 in 1/52
 Lambda= 0.126091
 statistics sampled from 16222 (16504) to 16222 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.194), width:  16
 Scan time:  6.020

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 1195 228.7 1.3e-59
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  937 181.8 1.7e-45
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  908 176.5 6.5e-44
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  908 176.5 6.5e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  908 176.5 6.6e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  906 176.1 8.3e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  901 175.2 1.6e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  890 173.2 6.3e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  868 169.2   1e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  821 160.7 3.8e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  813 159.2   1e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  811 158.9 1.3e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  811 158.9 1.3e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  803 157.4 3.6e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  797 156.3 7.5e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  795 156.0   1e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  795 156.0   1e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  795 156.0   1e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  791 155.2 1.7e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  737 145.4 1.5e-34
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  540 109.6 9.3e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  536 108.9 1.5e-23
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325)  230 53.2 8.9e-07
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323)  227 52.6 1.3e-06
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332)  214 50.3 6.8e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382)  207 49.1 1.8e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382)  207 49.1 1.8e-05
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378)  195 46.9 8.1e-05
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317)  177 43.5  0.0007
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor  ( 428)  166 41.7  0.0034
NP_064707 (OMIM: 610376) atypical chemokine recept ( 362)  165 41.4  0.0034
XP_016860005 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362)  165 41.4  0.0034
XP_005246155 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362)  165 41.4  0.0034
XP_005246154 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362)  165 41.4  0.0034
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297)  161 40.6   0.005
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297)  161 40.6   0.005
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297)  161 40.6   0.005
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398)  162 40.9  0.0053
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398)  162 40.9  0.0053
NP_005297 (OMIM: 603823) free fatty acid receptor  ( 330)  161 40.7  0.0054
XP_016882198 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty  ( 330)  161 40.7  0.0054
XP_016882199 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty  ( 330)  161 40.7  0.0054
XP_016882200 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty  ( 330)  161 40.7  0.0054
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic  ( 408)  160 40.6   0.007
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349)  159 40.3  0.0072
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349)  159 40.3  0.0072
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380)  159 40.4  0.0076
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409)  159 40.4  0.0079


>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo   (327 aa)
 initn: 1201 init1: 907 opt: 1195  Z-score: 1191.4  bits: 228.7 E(85289): 1.3e-59
Smith-Waterman score: 1195; 59.1% identity (85.2% similar) in 298 aa overlap (8-301:9-306)

                10        20        30        40        50         
pF1KE5  MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPM
               ::. :.:.:::.   :: ::: :.::.:..::.::  ::... . ..::.::
NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90           100       110     
pF1KE5 YYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKR----ISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLL
       :.::..:::::::::.   :::: ::. ...     ::: ::::::::: .: :::::::
NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE5 ASMAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLN
       : ::::::.:::.::.: :.:.  ::.:... :...:: :::.:: .::....:: :..:
NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE5 HFFCDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCW
       :::::.::.:.:.:::.:::::.:::::..::. :: .:  ::. :: ::..::::.: .
NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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         240       250       260       270       280       290     
pF1KE5 RAFFTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNK
       .:: ::::::::: .::.: .:.:.::.:... ..:::.::::.::.:.:::.::::::.
NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
              250       260       270       280       290       300

         300       310       320       330 
pF1KE5 EFKNALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       : : ::                              
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV         
              310       320                

>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 975 init1: 926 opt: 937  Z-score: 937.9  bits: 181.8 E(85289): 1.7e-45
Smith-Waterman score: 937; 45.4% identity (74.7% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRP
          . .: : :  :::.:::: : :: .:::.::  : ..:. :....: .  .  :. :
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 MYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASM
       ::.:::..::... : :::.:::: .:: ..: ::. ::  :.::: ... ::  .::.:
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 AYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFF
       :::::::::.:: : :... :.:..:. .:...:   :.... :   . .: .::.::::
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAF
       ::. :.:::.::: .  : .    .  . .. ..  ..::  : :.::.: : .:  ..:
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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      240       250       260       270       280       290        
pF1KE5 FTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFK
        ::::::: ::..  .:::.: ::. . : ...:.:::.::.. :.:::::: ::::. :
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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      300       310       320       330 
pF1KE5 NALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       .: .:..                          
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS                   
              310                       

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 964 init1: 904 opt: 908  Z-score: 909.4  bits: 176.5 E(85289): 6.5e-44
Smith-Waterman score: 908; 43.3% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
       ::: : . :. :.:.:.   :  :.:::..::  :: ... :: :::.:  .. :: :::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
       .:::..::..: .    .:::: . .:. . ::: ::.::.::   .:  .  ::: :::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLV-GFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFC
       :..::.::::.: . .:  ::  :: :.  :..... .... ... ..::..:...::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV-LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE5 DISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFF
       :..:.:::.:.:    :.. .  . .... :.:  . :: ::: .::..::. : :.:: 
XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE5 TCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKN
       ::.:::.:: .::.... .:  : .  :  .. . .:::::.::.:::.:: :::. .:.
XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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pF1KE5 ALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       ::::. :                         
XP_011 ALKKVVGRVVFSV                   
     300       310                     

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 964 init1: 904 opt: 908  Z-score: 909.4  bits: 176.5 E(85289): 6.5e-44
Smith-Waterman score: 908; 43.3% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
       ::: : . :. :.:.:.   :  :.:::..::  :: ... :: :::.:  .. :: :::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
       .:::..::..: .    .:::: . .:. . ::: ::.::.::   .:  .  ::: :::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140        150       160       170         
pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLV-GFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFC
       :..::.::::.: . .:  ::  :: :.  :..... .... ... ..::..:...::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV-LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
              130       140       150        160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 DISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFF
       :..:.:::.:.:    :.. .  . .... :.:  . :: ::: .::..::. : :.:: 
NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 TCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKN
       ::.:::.:: .::.... .:  : .  :  .. . .:::::.::.:::.:: :::. .:.
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330 
pF1KE5 ALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       ::::. :                         
NP_036 ALKKVVGRVVFSV                   
     300       310                     

>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 964 init1: 904 opt: 908  Z-score: 909.3  bits: 176.5 E(85289): 6.6e-44
Smith-Waterman score: 908; 43.3% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-306:11-316)

                         10        20        30        40        50
pF1KE5           MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVW
                 ::: : . :. :.:.:.   :  :.:::..::  :: ... :: :::.: 
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KE5 SSTSLHRPMYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCT
        .. :: :::.:::..::..: .    .:::: . .:. . ::: ::.::.::   .:  
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140        150       160         
pF1KE5 ECVLLASMAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLV-GFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFC
       .  ::: ::::..::.::::.: . .:  ::  :: :.  :..... .... ... ..::
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV-LLHTLLMAPLSFC
              130       140       150       160        170         

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE5 GSNVLNHFFCDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIP
       ..:...:::::..:.:::.:.:    :.. .  . .... :.:  . :: ::: .::..:
XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE5 SATGCWRAFFTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLI
       :. : :.:: ::.:::.:: .::.... .:  : .  :  .. . .:::::.::.:::.:
XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320       330 
pF1KE5 YCLRNKEFKNALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       : :::. .:.::::. :                         
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV                   
     300       310       320                     

>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H  (311 aa)
 initn: 943 init1: 885 opt: 906  Z-score: 907.5  bits: 176.1 E(85289): 8.3e-44
Smith-Waterman score: 906; 43.2% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (3-303:4-304)

                10        20        30        40        50         
pF1KE5  MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPM
          : :.:..  :::.::   : .  .:: .::. :.  :. ::..:. .  .. :: ::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 YYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMA
       :.:::..::... :.:. .:::: ..: .:. :.::::. : ..::..  .:  :...::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFC
       ::::.:::.:: :  ...: ::. .:  ....:.: :....  . .. ::::::. ::::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 DISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFF
       :.  .: :.:::   ....  ::.... .   :. :.::..: .....: :: :  .:: 
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 TCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKN
       :::::::.:..:::. .:.:.  ..  : : ... ::.:::. :.:::::: :::::.:.
NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330 
pF1KE5 ALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       :::.                            
NP_001 ALKRLQKRKCC                     
              310                      

>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo  (317 aa)
 initn: 893 init1: 859 opt: 901  Z-score: 902.5  bits: 175.2 E(85289): 1.6e-43
Smith-Waterman score: 901; 46.1% identity (72.5% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)

               10        20         30        40        50         
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPG-LQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPM
       :.  : :... :::..: . :  .: :::: ::  :: .:  :  :::.. ..  :: ::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 YYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMA
       :.:: ..::::: .   :.::::  .: :.  :::.:: ::.:::  .  .:: :::.::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFC
       :::::::: ::.: :...     .:.. :.  :: .. ... .. :  :::.: .:::::
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE5 DISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFF
       :  :.:::.:.: .  :.  .. .......: :  . ::..:. :.:.:::: :  .:: 
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE5 TCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKN
       ::.::: ::..:: .  . :  :.. .:  :.::.:. :::.::.:::.:: :::.: ::
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330 
pF1KE5 ALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       ::...:                          
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP               
              310                      

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 857 init1: 857 opt: 890  Z-score: 891.7  bits: 173.2 E(85289): 6.3e-43
Smith-Waterman score: 890; 43.2% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
       :. .: : .  :.:.:.  .  :: .:::.::. : .... ::..:: .  ...:: :::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
       .::...::...   . ::::::  .: ..: :::.::. :.::: ::. :::.:.. :::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
       :::.:::.:: : ....  . :.... .:..:.   :...  .::..:: :::..:::::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFFT
         :..::.:.:    : .. ::: . .:  ::. . ::... .... . :. :  ::: :
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKNA
       ::::::.. .::.. .. :.::..  : ...:. ::.:::. :.:::::: ::.:: :.:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330 
pF1KE5 LKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
       :                              
NP_003 LANVISRKRTSSFL                 
              310                     

>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor   (311 aa)
 initn: 883 init1: 857 opt: 868  Z-score: 870.1  bits: 169.2 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 868; 43.0% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (5-306:8-309)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE5    MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHR
              :..  : :::::: . : :. ..:.. :. ::..:. :: ::.  . .. :: 
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE5 PMYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLAS
       :::.:::..:::.. :...  :..: ..   .: ::..::: ::::  .:  ::::::. 
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHF
       :.::::.:.:.::.: ::. : .:  :.  :.::::: : ..  :   : .::   ..::
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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       ::..  .:.:.:.:  . ::. .: . :....::.  . ::. :. :.::. :.::  ..
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       ..:.:. .:                         
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pF1KE5 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
       : .::.:... :.:.:.   : :: .:: :::  :: ... :: :::.: :.. :: :::
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       .:::..::..: ..:  .:::: ..  ..: ::..::.::.::.  ..  .  ::: :::
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       ::.:::::::.: :...: ::  ::  :.   : .:.... ... .::  .. . ::::.
NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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