FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5483, 335 aa 1>>>pF1KE5483 335 - 335 aa - 335 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5772+/-0.00147; mu= 8.8618+/- 0.084 mean_var=157.0973+/-55.131, 0's: 0 Z-trim(100.6): 392 B-trim: 719 in 2/46 Lambda= 0.102327 statistics sampled from 5690 (6183) to 5690 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 1.660 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 2191 336.5 1.8e-92 CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1259 198.9 4.7e-51 CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1174 186.3 2.8e-47 CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1139 181.2 1e-45 CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1125 179.1 4.3e-45 CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1077 172.0 5.7e-43 CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1056 168.9 4.8e-42 CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1035 165.8 4.2e-41 CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1032 165.4 5.7e-41 CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1030 165.1 6.9e-41 CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1028 164.8 8.5e-41 CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1025 164.3 1.2e-40 CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1018 163.3 2.4e-40 CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1015 162.9 3.3e-40 CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 997 160.2 2.1e-39 CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 981 157.9 1.1e-38 CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 968 155.9 4e-38 CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 965 155.5 5.4e-38 CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 962 155.0 7.3e-38 CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 924 149.4 3.6e-36 CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 920 148.8 5.3e-36 CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 915 148.1 9e-36 CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 913 147.8 1.1e-35 CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 910 147.4 1.5e-35 CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 900 145.9 4.2e-35 CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 900 145.9 4.2e-35 CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 894 145.0 7.7e-35 CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 893 144.9 9e-35 CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 884 143.6 2.3e-34 CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 866 140.9 1.4e-33 CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 856 139.4 3.7e-33 CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 839 136.9 2.1e-32 CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 837 136.6 2.6e-32 CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 834 136.1 3.6e-32 CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 817 133.6 2e-31 CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 816 133.5 2.2e-31 CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 812 132.9 3.4e-31 CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 806 132.0 6.4e-31 CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 795 130.4 2.1e-30 CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 767 126.3 3.7e-29 CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 742 122.6 4.4e-28 CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 735 121.5 8.9e-28 CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 723 119.8 3.1e-27 CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 718 119.0 5.1e-27 CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 713 118.3 8.6e-27 CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 698 116.1 3.9e-26 CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 671 112.1 6.3e-25 CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 644 108.1 1e-23 CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 633 106.5 3e-23 CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 628 105.7 5.1e-23 >>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 (335 aa) initn: 2191 init1: 2191 opt: 2191 Z-score: 1773.4 bits: 336.5 E(32554): 1.8e-92 Smith-Waterman score: 2191; 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CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQMFF ::: ::. . :: :::.:::::: :.::::::.::::: .:: :.::.:.:: :: CCDS53 ILIVVIVMERNLHVPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 IHFLFI-HSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSIFLL .:..:. .::.::::::::.::::.::::.:.:: :.:.:. :....:: :.:: :::: CCDS53 VHMMFVGESAILLAMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIHILQ ..: .: ::. :..:::.:.:.:.:.::..:.:::... .. . ::..::.::: ::. CCDS53 KRLPFCLTNIVPHSYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILR 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLASLYVV ::::: ::::: :::::::::.::::.::::..:......:: :.:: .::::::.:::. CCDS53 AVFRLPSQDARHKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFG-RNIPQHVHILLANLYVA 230 240 250 260 270 280 310 320 330 pF1KE5 IPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK .::::::..:::.:: : ::. . : .. CCDS53 VPPMLNPIVYGVKTKQIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS 290 300 310 320 >>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa) initn: 637 init1: 637 opt: 1174 Z-score: 962.3 bits: 186.3 E(32554): 2.8e-47 Smith-Waterman score: 1174; 54.9% identity (81.3% similar) in 315 aa overlap (15-328:3-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE ::... .: :. . .:.:::::::.:.:..:::::.::.:. CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ :: ::. .:. . :::::..:::::: .:..:::. .::::. .::: :.: ::::: CCDS31 GNCILLYLIVVEHSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQ 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE5 MFFIHFLFI-HSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI :::.:. :. ::.:.:::::.::::::::::.:::: :.: : . . .:: :..:.. CCDS31 MFFLHYNFVLDSAILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDV 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIH ::: : .:. :: ::.:::.:.:.:.:.::::: :::. . .... :..::.::: : CCDS31 FLLTCLPFCRTRIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAH 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLASL :: ::: : :::: .:::.:::::.::::.::.::.::..:.::: ... ::..:.: CCDS31 ILCAVFGLPSQDACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFG-HNVSRTFHIMFANL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 pF1KE5 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK :.:::: :::..:::.:: : . . .:: CCDS31 YIVIPPALNPMVYGVKTKQIRDKVILLFSKGTG 290 300 310 320 >>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa) initn: 1142 init1: 757 opt: 1139 Z-score: 934.4 bits: 181.2 E(32554): 1e-45 Smith-Waterman score: 1139; 56.9% identity (81.9% similar) in 299 aa overlap (23-319:5-303) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCF-LTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITAL : ::... : :::::::: :.:..:::: ::..:: CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVAL 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EGNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLT ::. :: :: . :: :::.:: .:. .:. ::.::.:: :: ::: . ::: :::. CCDS31 VGNAALILVIAMDNALHAPMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLA 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 QMFFIHFLF-IHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPS ::: .: .. ..:..:::::::::::::.::::.:::. :::.: ..: .: :. : CCDS31 QMFCVHSIYALESSILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPF 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IFLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYI ::::..: :: ...::.:::::::.:.:..:..:. :::..:::. ::: .::..:: CCDS31 IFLLRRLPYCGHRVMTHTYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 HILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLAS ::.:::.: :.::. :::::::::: .::.::.::.:: ...::: . .: .:::.::. CCDS31 FILHAVFHLPSHDAQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLAN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 pF1KE5 LYVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK :::..::.:::..::.::: : CCDS31 LYVLVPPVLNPILYGARTKEIRSRLLKLLHLGKTSI 290 300 310 >>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa) initn: 702 init1: 510 opt: 1125 Z-score: 923.1 bits: 179.1 E(32554): 4.3e-45 Smith-Waterman score: 1125; 54.6% identity (83.3% similar) in 306 aa overlap (23-327:5-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE :... . .. .: :::::: ::::...::: .:. :: CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALI 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ :: .. :: ... ::.::. ::.:::..:: :::.:.:: :. .:.. : :..:::: CCDS31 GNFTILLVIKTDSSLHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQ 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE5 MFFIH-FLFIHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI ::::: : ...::::.:::.: :::::.::.: .:::.::.. : ... ...:...::: CCDS31 MFFIHNFTLMESAVLVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIH .:. .: .: ..: ::.:::::.:::::..:.::. ::: : . . .:: .:..::.: CCDS31 LLILRLPFCGNHVIPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCA-ICNLVFDITVIALSYVH 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLASL :: ::::: ...:: :.:::::::.:::: ::.::::: ...::: :..: :.:::::.: CCDS31 ILCAVFRLPTHEARLKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFG-RNVPRYIHILLANL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 pF1KE5 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK :::.:::::::::::::: : . .:... CCDS31 YVVVPPMLNPVIYGVRTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF 290 300 310 320 >>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa) initn: 645 init1: 483 opt: 1077 Z-score: 884.9 bits: 172.0 E(32554): 5.7e-43 Smith-Waterman score: 1077; 53.0% identity (79.9% similar) in 313 aa overlap (16-327:2-312) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE :. ... :... . .. .: ::::::..:::...:: ..:..:: CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ :: :. :: .. :::::: ::.:: : :. :::.:.:: :. .:.. . ::: :::.. CCDS31 GNTALLFVIQTEQSLHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSH 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE5 MFFIHFLF-IHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI ::::::. ..: ::.:::::::.:::.::::. :::::.:. :. :. .:. .. : . 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