Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9422
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9422, 690 aa
1>>>pF1KE9422 690 - 690 aa - 690 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1901+/-0.00172; mu= 15.7729+/- 0.101
mean_var=131.4897+/-25.157, 0's: 0 Z-trim(101.0): 192 B-trim: 6 in 1/49
Lambda= 0.111848
statistics sampled from 6143 (6354) to 6143 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 4633 760.6 0
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CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 1403 239.6 2e-62
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 1403 239.7 2.2e-62
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 1362 233.1 2.2e-60
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 1323 226.8 1.8e-58
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 1323 226.8 1.8e-58
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 1139 197.0 1.4e-49
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 1139 197.1 1.5e-49
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 974 170.1 8.5e-42
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 967 169.0 2e-41
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 943 165.0 2.5e-40
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 909 159.7 1.5e-38
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CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 891 156.8 1.1e-37
CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 835) 891 156.8 1.2e-37
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 877 154.5 4.9e-37
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CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 877 154.6 5.7e-37
CCDS59361.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 765) 793 141.0 6.2e-33
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 741 132.7 2.3e-30
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 741 132.7 2.4e-30
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 716 129.2 8.9e-29
CCDS58645.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 867) 694 125.1 4.4e-28
CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 679 123.2 5.4e-27
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 628 115.0 1.8e-24
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 602 110.5 1.9e-23
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 595 109.7 6.8e-23
CCDS58644.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 821) 577 106.2 2e-22
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 552 102.4 5.3e-21
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 526 98.2 9.6e-20
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522) 500 94.0 1.7e-18
CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 385 74.9 2.8e-13
CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 385 75.0 3.3e-13
CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 ( 528) 373 73.0 1.2e-12
CCDS32461.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 687) 363 71.5 4.5e-12
CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 692) 363 71.6 4.5e-12
>>CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 (690 aa)
initn: 4633 init1: 4633 opt: 4633 Z-score: 4054.0 bits: 760.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4633; 99.9% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MKRLPLLVVFSTLLNCSYTQNCTKTPCLPNAKCEIRNGIEACYCNMGFSGNGVTICEDDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKRLPLLVVFSTLLNCSYTQNCTKTPCLPNAKCEIRNGIEACYCNMGFSGNGVTICEDDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ECGNLTQSCGENANCTNTEGSYYCMCVPGFRSSSNQDRFITNDGTVCIENVNANCHLDNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ECGNLTQSCGENANCTNTEGSYYCMCVPGFRSSSNQDRFITNDGTVCIENVNANCHLDNV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CIAANINKTLTKIRSIKEPVALLQEVYRNSVTDLSPTDIITYIEILAESSSLLGYKNNTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CIAANINKTLTKIRSIKEPVALLQEVYRNSVTDLSPTDIITYIEILAESSSLLGYKNNTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SAKDTLSNSTLTEFVKTVNNFVQRDTFVVWDKLSVNHRRTHLTKLMHTVEQATLRISQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SAKDTLSNSTLTEFVKTVNNFVQRDTFVVWDKLSVNHRRTHLTKLMHTVEQATLRISQSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 QKTTEFDTNSTDIALKVFFFDSYNMKHIHPHMNMDGDYINIFPKRKAAYDSNGNVAVAFL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS41 QKTTEFDTNSTDIALKVFFFDSYNMKHIHPHMNMDGDYINIFPKRKAAYDSNGNVAVAFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 YYKSIGPLLSSSDNFLLKPQNYDNSEEEERVISSVISVSMSSNPPTLYELEKITFTLSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YYKSIGPLLSSSDNFLLKPQNYDNSEEEERVISSVISVSMSSNPPTLYELEKITFTLSHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 KVTDRYRSLCAFWNYSPDTMNGSWSSEGCELTYSNETHTSCRCNHLTHFAILMSSGPSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KVTDRYRSLCAFWNYSPDTMNGSWSSEGCELTYSNETHTSCRCNHLTHFAILMSSGPSIG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 IKDYNILTRITQLGIIISLICLAICIFTFWFFSEIQSTRTTIHKNLCCSLFLAELVFLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IKDYNILTRITQLGIIISLICLAICIFTFWFFSEIQSTRTTIHKNLCCSLFLAELVFLVG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 INTNTNKLFCSIIAGLLHYFFLAAFAWMCIEGIHLYLIVVGVIYNKGFLHKNFYIFGYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 INTNTNKLFCSIIAGLLHYFFLAAFAWMCIEGIHLYLIVVGVIYNKGFLHKNFYIFGYLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 PAVVVGFSAALGYRYYGTTKVCWLSTENNFIWSFIGPACLIILVNLLAFGVIIYKVFRHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PAVVVGFSAALGYRYYGTTKVCWLSTENNFIWSFIGPACLIILVNLLAFGVIIYKVFRHT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AGLKPEVSCFENIRSCARGALALLFLLGTTWIFGVLHVVHASVVTAYLFTVSNAFQGMFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AGLKPEVSCFENIRSCARGALALLFLLGTTWIFGVLHVVHASVVTAYLFTVSNAFQGMFI
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670 680 690
pF1KE9 FLFLCVLSRKIQEEYYRLFKNVPCCFGCLR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FLFLCVLSRKIQEEYYRLFKNVPCCFGCLR
670 680 690
>>CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123 aa)
initn: 1304 init1: 1000 opt: 1403 Z-score: 1234.6 bits: 239.6 E(32554): 1.9e-62
Smith-Waterman score: 1403; 38.6% identity (69.6% similar) in 575 aa overlap (121-687:521-1094)
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 RSSSNQDRFITNDGTVCIENVNANCHLDNVCIAANINKTLTKIRSIKEPVALLQEVYRNS
: . .:. :::: .. ..: .:. ...
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160 170 180 190 200
pF1KE9 VTDLSPTDIITYIEILAESSSLLGYKNNTI--SAKDTLSNSTLTEFVKTVNNFVQRDTFV
. :. . .... . ..: . . . : ::. . : .: ::.:... ...
CCDS76 KGPVFAGDVSSSVRLMEQLVDILDAQLQELKPSEKDSAGRSYNKAIVDTVDNLLRPEALE
560 570 580 590 600 610
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 VWDKLSVNHRRTHLTKLMHTVEQATLRISQSFQKTTEFDTNSTDIALKVFFFDSYN-MKH
: ... ... : :. :.:.... ..... . :. . . .:.:.: ... . ..
CCDS76 SWKHMNSSEQAHTATMLLDTLEEGAFVLADNLLEPTRVSMPTENIVLEVAVLSTEGQIQD
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270 280 290 300 310 320
pF1KE9 IHPHMNMDG--DYINIFPKRKAAYDSNGNVAVAFLYYKSIGPLLSSSDNFLLKPQNYDNS
.. ... : . :.. . . :: . ..:. :.:.: .::. . . .. .
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330 340 350 360 370 380
pF1KE9 EEEERVISSVISVSMSSNPPTLYELEKITFTLSHRKVTDRYRSLCAFWNYSPDTMNGSWS
. : : :::::.... .: . . ::: : . . . :.::::: :: : ::
CCDS76 NSTIAVNSHVISVSINKESSRVYLTDPVLFTLPHIDPDNYFNANCSFWNYSERTMMGYWS
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390 400 410 420 430 440
pF1KE9 SEGCELTYSNETHTSCRCNHLTHFAILMSSGPSIGIKDYN---ILTRITQLGIIISLICL
..::.:. .:.:.:.: :.:::.:::::. :. :: .:: :: .::.:::.::
CCDS76 TQGCKLVDTNKTRTTCACSHLTNFAILMAHRE-IAYKDGVHELLLTVITWVGIVISLVCL
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pF1KE9 AICIFTFWFFSEIQSTRTTIHKNLCCSLFLAELVFLVGINTNTNKLFCSIIAGLLHYFFL
::::::: :: .:: :.::::::: .::.::..::.::. . . : :.:::::.:::
CCDS76 AICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCINLFIAEFIFLIGIDKTKYAIACPIFAGLLHFFFL
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pF1KE9 AAFAWMCIEGIHLYLIVVGVIYNKGFLHKNFYIFGYLSPAVVVGFSAALGYRYYGTTKVC
:::::::.::..:::..: :. .. .: .:. ::: ::.::: :::. :. ::: :.:
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pF1KE9 WLSTENNFIWSFIGPACLIILVNLLAFGVIIYKVFRHTAGLKPEVSCFENIRSCARGALA
:: ..: ::::::::. .:::.:.. . . . :. .:. :::. : .:::.: . ::.:
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pF1KE9 LLFLLGTTWIFGVLHVVHASVVTAYLFTVSNAFQGMFIFLFLCVLSRKIQEEYYRLFKNV
:: ::: :: ::.: . . ..: :::::. :::::.:::.: :.:..:...:: . :..
CCDS76 LLCLLGLTWSFGLLFINEETIVMAYLFTIFNAFQGVFIFIFHCALQKKVRKEYGKCFRHS
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690
pF1KE9 PCCFGCLR
:: :
CCDS76 YCCGGLPTESPHSSVKASTTRTSARYSSGTQDIH
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>>CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177 aa)
initn: 1304 init1: 1000 opt: 1403 Z-score: 1234.3 bits: 239.6 E(32554): 2e-62
Smith-Waterman score: 1403; 38.6% identity (69.6% similar) in 575 aa overlap (121-687:521-1094)
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 RSSSNQDRFITNDGTVCIENVNANCHLDNVCIAANINKTLTKIRSIKEPVALLQEVYRNS
: . .:. :::: .. ..: .:. ...
CCDS72 PCPKGTRGTASYLCMISTGTWNPKGPDLSNCTSHWVNQLAQKIRSGENAASLANELAKHT
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160 170 180 190 200
pF1KE9 VTDLSPTDIITYIEILAESSSLLGYKNNTI--SAKDTLSNSTLTEFVKTVNNFVQRDTFV
. :. . .... . ..: . . . : ::. . : .: ::.:... ...
CCDS72 KGPVFAGDVSSSVRLMEQLVDILDAQLQELKPSEKDSAGRSYNKAIVDTVDNLLRPEALE
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210 220 230 240 250 260
pF1KE9 VWDKLSVNHRRTHLTKLMHTVEQATLRISQSFQKTTEFDTNSTDIALKVFFFDSYN-MKH
: ... ... : :. :.:.... ..... . :. . . .:.:.: ... . ..
CCDS72 SWKHMNSSEQAHTATMLLDTLEEGAFVLADNLLEPTRVSMPTENIVLEVAVLSTEGQIQD
620 630 640 650 660 670
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 IHPHMNMDG--DYINIFPKRKAAYDSNGNVAVAFLYYKSIGPLLSSSDNFLLKPQNYDNS
.. ... : . :.. . . :: . ..:. :.:.: .::. . . .. .
CCDS72 FKFPLGIKGAGSSIQLSANTVKQNSRNGLAKLVFIIYRSLGQFLSTENATIKLGADFIGR
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330 340 350 360 370 380
pF1KE9 EEEERVISSVISVSMSSNPPTLYELEKITFTLSHRKVTDRYRSLCAFWNYSPDTMNGSWS
. : : :::::.... .: . . ::: : . . . :.::::: :: : ::
CCDS72 NSTIAVNSHVISVSINKESSRVYLTDPVLFTLPHIDPDNYFNANCSFWNYSERTMMGYWS
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390 400 410 420 430 440
pF1KE9 SEGCELTYSNETHTSCRCNHLTHFAILMSSGPSIGIKDYN---ILTRITQLGIIISLICL
..::.:. .:.:.:.: :.:::.:::::. :. :: .:: :: .::.:::.::
CCDS72 TQGCKLVDTNKTRTTCACSHLTNFAILMAHRE-IAYKDGVHELLLTVITWVGIVISLVCL
800 810 820 830 840
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pF1KE9 AICIFTFWFFSEIQSTRTTIHKNLCCSLFLAELVFLVGINTNTNKLFCSIIAGLLHYFFL
::::::: :: .:: :.::::::: .::.::..::.::. . . : :.:::::.:::
CCDS72 AICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCINLFIAEFIFLIGIDKTKYAIACPIFAGLLHFFFL
850 860 870 880 890 900
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 AAFAWMCIEGIHLYLIVVGVIYNKGFLHKNFYIFGYLSPAVVVGFSAALGYRYYGTTKVC
:::::::.::..:::..: :. .. .: .:. ::: ::.::: :::. :. ::: :.:
CCDS72 AAFAWMCLEGVQLYLMLVEVFESEYSRKKYYYVAGYLFPATVVGVSAAIDYKSYGTEKAC
910 920 930 940 950 960
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 WLSTENNFIWSFIGPACLIILVNLLAFGVIIYKVFRHTAGLKPEVSCFENIRSCARGALA
:: ..: ::::::::. .:::.:.. . . . :. .:. :::. : .:::.: . ::.:
CCDS72 WLHVDNYFIWSFIGPVTFIILLNIIFLVITLCKMVKHSNTLKPDSSRLENIKSWVLGAFA
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pF1KE9 LLFLLGTTWIFGVLHVVHASVVTAYLFTVSNAFQGMFIFLFLCVLSRKIQEEYYRLFKNV
:: ::: :: ::.: . . ..: :::::. :::::.:::.: :.:..:...:: . :..
CCDS72 LLCLLGLTWSFGLLFINEETIVMAYLFTIFNAFQGVFIFIFHCALQKKVRKEYGKCFRHS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
690
pF1KE9 PCCFGCLR
:: :
CCDS72 YCCGGLPTESPHSSVKASTTRTSARYSSGTQSRIRRMWNDTVRKQSESSFISGDINSTST
1090 1100 1110 1120 1130 1140
>>CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403 aa)
initn: 1304 init1: 1000 opt: 1403 Z-score: 1233.4 bits: 239.7 E(32554): 2.2e-62
Smith-Waterman score: 1403; 38.6% identity (69.6% similar) in 575 aa overlap (121-687:521-1094)
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 RSSSNQDRFITNDGTVCIENVNANCHLDNVCIAANINKTLTKIRSIKEPVALLQEVYRNS
: . .:. :::: .. ..: .:. ...
CCDS68 PCPKGTRGTASYLCMISTGTWNPKGPDLSNCTSHWVNQLAQKIRSGENAASLANELAKHT
500 510 520 530 540 550
160 170 180 190 200
pF1KE9 VTDLSPTDIITYIEILAESSSLLGYKNNTI--SAKDTLSNSTLTEFVKTVNNFVQRDTFV
. :. . .... . ..: . . . : ::. . : .: ::.:... ...
CCDS68 KGPVFAGDVSSSVRLMEQLVDILDAQLQELKPSEKDSAGRSYNKAIVDTVDNLLRPEALE
560 570 580 590 600 610
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 VWDKLSVNHRRTHLTKLMHTVEQATLRISQSFQKTTEFDTNSTDIALKVFFFDSYN-MKH
: ... ... : :. :.:.... ..... . :. . . .:.:.: ... . ..
CCDS68 SWKHMNSSEQAHTATMLLDTLEEGAFVLADNLLEPTRVSMPTENIVLEVAVLSTEGQIQD
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270 280 290 300 310 320
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.. ... : . :.. . . :: . ..:. :.:.: .::. . . .. .
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. : : :::::.... .: . . ::: : . . . :.::::: :: : ::
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..::.:. .:.:.:.: :.:::.:::::. :. :: .:: :: .::.:::.::
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::::::: :: .:: :.::::::: .::.::..::.::. . . : :.:::::.:::
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:::::::.::..:::..: :. .. .: .:. ::: ::.::: :::. :. ::: :.:
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:: ..: ::::::::. .:::.:.. . . . :. .:. :::. : .:::.: . ::.:
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CCDS32 EVTVLNTEGQVQELVFPQEEYPRKNSIQLSAKTIKQNSRNGVVKVVFILYNNLGLFLSTE
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CCDS32 RLDNIKSWALGAIALLFLLGLTWAFGLLFINKESVVMAYLFTTFNAFQGVFIFVFHCALQ
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CCDS82 RNHLNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKLQKRERSCRAYVQAMV
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CCDS82 ETVNNLLQPQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKL
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CCDS82 EVARLSTEGNLEDLKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLST-E
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CCDS82 NASMKLGTEALSTNHSVIVNSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNC
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CCDS82 SFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTTNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDL-LL
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CCDS82 DVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQP
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CCDS82 SAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPES
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CCDS82 FIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRT-HCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]