FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5976, 312 aa 1>>>pF1KE5976 312 - 312 aa - 312 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5492+/-0.0012; mu= 14.5227+/- 0.070 mean_var=148.9639+/-46.482, 0's: 0 Z-trim(103.2): 393 B-trim: 853 in 2/46 Lambda= 0.105083 statistics sampled from 6805 (7290) to 6805 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16 Scan time: 1.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 2060 324.8 5.2e-89 CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 2060 324.8 5.2e-89 CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 2060 324.8 5.2e-89 CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 2053 323.8 1.1e-88 CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1526 243.9 1.2e-64 CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1441 231.0 9.3e-61 CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1215 196.7 1.9e-50 CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1206 195.3 4.8e-50 CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1203 194.9 6.6e-50 CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1184 192.0 5.1e-49 CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1177 191.0 1.1e-48 CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1128 183.5 1.8e-46 CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1123 182.8 3e-46 CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1121 182.5 4e-46 CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1120 182.3 4.1e-46 CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1115 181.6 6.9e-46 CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1059 173.1 2.5e-43 CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1057 172.8 3.1e-43 CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1033 169.2 4.3e-42 CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1021 167.3 1.4e-41 CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1017 166.7 2.1e-41 CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1016 166.6 2.3e-41 CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1013 166.1 3.1e-41 CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1013 166.1 3.2e-41 CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1011 165.8 3.9e-41 CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1011 165.8 3.9e-41 CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 999 164.0 1.4e-40 CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 990 162.6 3.5e-40 CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 982 161.4 8.1e-40 CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 974 160.2 1.9e-39 CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 972 159.9 2.3e-39 CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 970 159.6 2.9e-39 CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 965 158.8 4.9e-39 CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 960 158.1 8.2e-39 CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 959 157.9 9.5e-39 CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 957 157.6 1.1e-38 CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 952 156.9 1.9e-38 CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 946 156.0 3.8e-38 CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 943 155.5 4.9e-38 CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 940 155.0 6.7e-38 CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 939 154.9 7.5e-38 CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 932 153.8 1.6e-37 CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 931 153.7 1.7e-37 CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 923 152.5 4.1e-37 CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 918 151.7 6.8e-37 CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 899 148.8 5e-36 CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 843 140.3 1.8e-33 CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 823 137.3 1.5e-32 CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 821 137.0 1.9e-32 CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 818 136.5 2.5e-32 >>CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 (312 aa) initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 1711.5 bits: 324.8 E(32554): 5.2e-89 Smith-Waterman score: 2060; 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59.1% identity (84.8% similar) in 296 aa overlap (8-303:1-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY .:.::.::::. : :.: .:... :.: . . ::.:::..:..: ::::::: CCDS30 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF ::::.::.:::. :::.:::: :.: .:::::: ::..:::..: .:: :::.::::.: CCDS30 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD :::.:.:::::: ::: :....::.: .: ::. :::: :.: ::::: .:::::: CCDS30 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVTWGIGFLHSVSQLAFAVHLLFCGPNEVDSFYCD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL :::...:::::::::..:: .::: . : .: .:.:::..::.:. .. :::::::: CCDS30 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR .:: ::::::::: .:.:. : : ...:::::.: .:.::.:::..::.:::.::.::.. CCDS30 TAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQ 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 VCKQLVIYKRIS . : CCDS30 LRKWDAHSSVKF 300 >>CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 (305 aa) initn: 1227 init1: 1195 opt: 1203 Z-score: 1009.4 bits: 194.9 E(32554): 6.6e-50 Smith-Waterman score: 1203; 59.1% identity (84.5% similar) in 296 aa overlap (8-303:1-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY .:.::.::::. : .: .:... :.: . . ::.:::..:..: ::::::: CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF ::::.::.:::. :::.:::: :.: .:::::: ::..:::..: .:: :::.::::.: CCDS32 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD :::.:.:::::: ::: :....:::: .: ::. :::: :.: ::::: .:::::: CCDS32 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL :::...:::::::::..:: .::: . : .: .:.:::..::.:. .. :::::::: CCDS32 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR .:: ::::::::: .:.:. : : ...:::::.: .:.::.:::..::.:::.::.::.. CCDS32 TAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQ 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 VCKQLVIYKRIS . : CCDS32 LRKWDAHSSVKF 300 >>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa) initn: 1184 init1: 1184 opt: 1184 Z-score: 993.6 bits: 192.0 E(32554): 5.1e-49 Smith-Waterman score: 1184; 53.5% identity (83.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY :: : ::::::..::: : ..::. . : ::::.. . ::.::...::.: :::::: CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF :::..:::.:. : ..:::: :.. ...:::.::::::::::.. : :::::..::. 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CCDS32 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VCKQLVIYKRIS . .. . .::: CCDS32 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH 310 320 312 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:25:43 2016 done: Tue Nov 8 08:25:43 2016 Total Scan time: 1.860 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]