FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2619, 456 aa 1>>>pF1KE2619 456 - 456 aa - 456 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1325+/-0.00117; mu= 12.2237+/- 0.070 mean_var=64.7348+/-13.261, 0's: 0 Z-trim(101.2): 74 B-trim: 2 in 1/47 Lambda= 0.159406 statistics sampled from 6333 (6407) to 6333 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16 Scan time: 2.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 3058 712.7 2e-205 CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 2930 683.2 1.5e-196 CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 1846 433.9 1.6e-121 CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 740 179.6 7.8e-45 CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 740 179.6 8.7e-45 CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 740 179.6 9.1e-45 CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 738 179.1 1e-44 CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 738 179.1 1.2e-44 CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 738 179.1 1.2e-44 CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 738 179.1 1.2e-44 CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 738 179.1 1.3e-44 CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 738 179.1 1.3e-44 CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 738 179.1 1.3e-44 CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 738 179.1 1.3e-44 CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 738 179.1 1.4e-44 CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 727 176.6 5.2e-44 CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 722 175.4 1.2e-43 CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 722 175.4 1.2e-43 CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 720 175.0 2e-43 CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 720 175.0 2.6e-43 CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 720 175.0 2.7e-43 CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 720 175.0 2.7e-43 CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 720 175.0 2.7e-43 CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 601 147.6 2.7e-35 CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 601 147.6 2.8e-35 CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 536) 601 147.6 2.9e-35 CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 583 143.5 6e-34 CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 583 143.5 6.7e-34 CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 769) 583 143.5 7.3e-34 CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 575 141.6 1.7e-33 CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 575 141.6 1.8e-33 CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 575 141.6 1.8e-33 CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 575 141.6 1.9e-33 CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 544 134.5 2.1e-31 CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 544 134.5 2.2e-31 CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 544 134.5 2.2e-31 CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 544 134.5 2.2e-31 CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 544 134.5 2.4e-31 CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 544 134.5 2.4e-31 CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 544 134.5 2.4e-31 CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 544 134.5 2.5e-31 CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 544 134.5 2.6e-31 CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 544 134.5 2.6e-31 CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 544 134.5 2.6e-31 CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 544 134.5 2.7e-31 CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 544 134.5 2.8e-31 CCDS34055.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 833) 464 116.1 1.4e-25 CCDS3713.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 875) 464 116.1 1.4e-25 CCDS42786.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 489) 460 115.2 1.5e-25 CCDS46459.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 575) 460 115.2 1.8e-25 >>CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 (456 aa) initn: 3058 init1: 3058 opt: 3058 Z-score: 3801.6 bits: 712.7 E(32554): 2e-205 Smith-Waterman score: 3058; 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CCDS51 FIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARH 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 MLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYH :: ::: :.::::::::::::::::.: :::. ::::..:.:::. :.:::::.::::: CCDS51 MLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYH 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIK ::::::::::::::::::::::::::::. .:: ::.:.:.:::.::.:::::::::::: CCDS51 SQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIK 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQ :::.::.::.: ::::::::::..:.:::: :..::: : :..: :.:.:::::::.:: CCDS51 TNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQ 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 NEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFH ::.:. ...:: :: :::.. ::..::.:::::::::::: ::.::::::.: :::.. CCDS51 NEFLTRLKAHLHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYR 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 pF1KE2 QGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFS-NTRLSQTMLGHVG ::..:.:..: .::::... .:: .::::::.:.::::: :::.:. :. ::..::::.. CCDS51 QGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLA 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 pF1KE2 LNKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS :::.::.: .: :. .... CCDS51 HNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP 410 420 430 440 450 >>CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 (606 aa) initn: 581 init1: 289 opt: 740 Z-score: 918.4 bits: 179.6 E(32554): 7.8e-45 Smith-Waterman score: 740; 30.7% identity (62.4% similar) in 449 aa overlap (5-439:107-541) 10 20 30 pF1KE2 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTA : ::: . : . : ... .:.. CCDS46 QGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLE----TLQTRHSVGEMASNKFK 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 pF1KE2 LYI-RMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEV-SVSARN----IRRLLSF . : : . ::.: . . :. ..: .:.:.:. .:.:.. . :. .. CCDS46 RILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLD-----QQTEVELPKVTAEEAPQPMSRISGL 140 150 160 170 180 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 QRYLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLT . .:. . ..:. ... :. . :: :: ...:..:.: .:... :... CCDS46 HGLCHSASL--SSATVPRFGVQTDQEEQLAK-ELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAII 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 FHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLA : .:. . :.. :.. : .:.:.. ::.. :::..:::::.:. : : : : CCDS46 FSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALE 250 260 270 280 290 300 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 NSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLR : .:: .:.:.: ::.:::::.. :::.:: :: .:...::::::: . ::. CCDS46 AVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQ 310 320 330 340 350 360 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 ESG--LFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQNEYLSLFRSHLDR------GDLCLED . .:..: ..: ... .. ..::::.:.. . :. ... .. : : :.. CCDS46 AENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSLGVLLLDN 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 TRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHT : ::: ..:::. :: . : .::.... :::.::: :.. : .::.::.:: CCDS46 YSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERESGLDISPMCDKHT 430 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 ESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNTRLSQTMLGHVGLNKASWKGLQREQSSSEDTDA :. . :.::. :...::. :: . . .: .: . :. : . .: :. :. CCDS46 ASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPD-AQDLLDTLEDNRE-WYQSKIPRSPSDLTNP 490 500 510 520 530 540 450 pF1KE2 AFELNSQLLPQENRLS CCDS46 ERDGPDRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLD 550 560 570 580 590 600 >>CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 (680 aa) initn: 581 init1: 289 opt: 740 Z-score: 917.5 bits: 179.6 E(32554): 8.7e-45 Smith-Waterman score: 740; 30.7% identity (62.4% similar) in 449 aa overlap (5-439:181-615) 10 20 30 pF1KE2 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTA : ::: . : . : ... .:.. CCDS42 QGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLE----TLQTRHSVGEMASNKFK 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 pF1KE2 LYI-RMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEV-SVSARN----IRRLLSF . : : . ::.: . . :. ..: .:.:.:. .:.:.. . :. .. CCDS42 RILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLD-----QQTEVELPKVTAEEAPQPMSRISGL 210 220 230 240 250 260 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 QRYLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLT . .:. . ..:. ... :. . :: :: ...:..:.: .:... :... CCDS42 HGLCHSASL--SSATVPRFGVQTDQEEQLAK-ELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAII 270 280 290 300 310 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 FHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLA : .:. . :.. :.. : .:.:.. ::.. :::..:::::.:. : : : : CCDS42 FSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALE 320 330 340 350 360 370 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 NSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLR : .:: .:.:.: ::.:::::.. :::.:: :: .:...::::::: . ::. CCDS42 AVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQ 380 390 400 410 420 430 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 ESG--LFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQNEYLSLFRSHLDR------GDLCLED . .:..: ..: ... .. ..::::.:.. . :. ... .. : : :.. 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CCDS56 RMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQISGVKK 180 190 200 210 220 230 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 YLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFH ..:: . .. ... ..: .. :: :..:.. .: . .:. :: ... .: CCDS56 LMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLTVIMH 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 pF1KE2 -LFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLAN .:. . :.. :.. . : .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. : : CCDS56 TIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTPALEA 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 SVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRE : .:: ...:.: ::.:::::.. :::.:: :: .:...::::::: . ::.: CCDS56 VFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQE 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 SG--LFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQNEYLSLFRSHLDR------GDLCLEDT . .:..: ..::... .. ..::::.:.. . :. ... .. : : :.. CCDS56 ENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNY 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 RHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTE : ::: ..:::. :: . .: .::.... ::::.::: :.. . .::.::.:. CCDS56 SDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCDKHNA 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 SIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNTRLSQTMLGHVGLNKASWKGLQREQSSSEDTDAA :. . :.::. :.:.::. :: . . .: .: . :. : :: : : CCDS56 SVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPD-AQDILDTLEDNRE-WYQSTIPQSPSPAPDDP 540 550 560 570 580 590 450 pF1KE2 FELNSQLLPQENRLS CCDS56 EEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDSESTEIPLDEQ 600 610 620 630 640 650 >>CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (687 aa) initn: 618 init1: 296 opt: 738 Z-score: 914.9 bits: 179.1 E(32554): 1.2e-44 Smith-Waterman score: 738; 30.4% identity (61.8% similar) in 448 aa overlap (5-439:162-599) 10 20 30 pF1KE2 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTA : ::: . : . : ..: .:.. 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