FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9399, 1791 aa 1>>>pF1KB9399 1791 - 1791 aa - 1791 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8082+/-0.00132; mu= 22.1839+/- 0.079 mean_var=86.8064+/-17.757, 0's: 0 Z-trim(103.3): 115 B-trim: 320 in 2/48 Lambda= 0.137657 statistics sampled from 7218 (7337) to 7218 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16 Scan time: 6.250 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33737.1 SCN11A gene_id:11280|Hs108|chr3 (1791) 12000 2394.7 0 CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1998) 3630 732.5 3.7e-210 CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836) 3018 610.9 1.3e-173 CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 2919 591.3 1.2e-167 CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 2919 591.3 1.2e-167 CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009) 2919 591.3 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(1998 aa) initn: 4872 init1: 832 opt: 3630 Z-score: 3886.5 bits: 732.5 E(32554): 3.7e-210 Smith-Waterman score: 5413; 50.4% identity (70.4% similar) in 1840 aa overlap (111-1750:113-1900) 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 LDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPFNSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVI ...::. :: :... :::::.:.:. :.. CCDS46 LDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTIL 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 INCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEALIKILARGFILDEFSFLRDPWNWLDS :::::: ... : .: .::.:: ::.:.::::::: : :.:::::::::: CCDS46 TNCVFMA----QHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARGFCLHAFTFLRDPWNWLDF 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 pF1KB9 IVIGIAIVSYIPGITI-KLLPLRTFRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLRSVKKLVNVIIL :: .: :: .: . .: ::::::.::::.:::. ::.:::::..:::::..:..: CCDS46 SVIIMAYVS--ENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLADVMVL 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 TFFCLSIFALVGQQLFMGSLNLKCISRDCKNISNP-----------EAYDHCFEKKEN-- : ::::.:::.: :::::.: ::. :. ... :. : . :: CCDS46 TVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCV-RNFTALNGTNGSVEADGLVWESLDLYLSDPENYL 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 ----SPEFKMCGIWMGNSACSIQYECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWE . . .:: ..: :.: .. :::..::.::.:.:.:::.::::::: :: CCDS46 LKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAWAFLALFRLMTQDCWE 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 KLYQQTLRTTGLYSVFFFIVVIFLGSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQ .:::::::..: ..::..:::::::::.:: ::::.:::::::. . :: : ::: :: CCDS46 RLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAETEEKEKRFQ 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 pF1KB9 EAQQLLKEEKEALVAMGIDRSSLTSLETSYFTP--------KKRKLFGN----------- ::...::.:.:::. :.: : .::: : ..: :.:: ... CCDS46 EAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRKRMSSGTEECGEDRLP 440 450 460 470 480 490 470 pF1KB9 ----------------------------KKRKSFFL------------------------ ..: :.: CCDS46 KSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSEADFADDENSTAGESE 500 510 520 530 540 550 480 490 pF1KB9 -------------RESGKDQP-PGS-----------DSDEDCQK---------------- : :.. :: ::. .: ::. CCDS46 SHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGVVSLLGAGDPEATSPG 560 570 580 590 600 610 500 510 520 530 pF1KB9 ----KPQLLEQTKRL--------------SQNLSLDHFDEHGDPLQRQRALSAVSILTIT .: .::. :: .: :.: : :::::::::.:: . CCDS46 SHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPG---ARQRALSAVSVLTSA 620 630 640 650 660 670 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 MKEQEKSQEPCLPCGENLASKYLVWNCCPQWLCVKKVLRTVMTDPFTELAITICIIINTV ..: :.:.. : :: . ::..::.:.::: :. .:. .. :. ::::.:.::.::..::. CCDS46 LEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTDLTITMCIVLNTL 680 690 700 710 720 730 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 FLAMEHHKMEASFEKMLNIGNLVFTSIFIAEMCLKIIALDPYHYFRRGWNIFDSIVALLS :.:.::..: . ::.::..::::::.:: ::: .::::::::.::..::::::::...:: CCDS46 FMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQGWNIFDSIIVILS 740 750 760 770 780 790 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 FADVMNCVLQKRSWPFLRSFRVLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGSLTVVLVIVI . .. ... : :::::.::::::::::::::::::::::::::::.::.::.:.. CCDS46 LMELGLSRMSNLS--VLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIV 800 810 820 830 840 850 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 FIFSVVGMQLFGRSFNSQKSPKLCNPTGPTVSCLRHWHMGDFWHSFLVVFRILCGEWIEN :::.::::::::.... .. . .: : .::: ::.:.::..::::::::::. CCDS46 FIFAVVGMQLFGKNYSELRD----SDSG----LLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWIET 860 870 880 890 900 780 790 800 810 820 830 pF1KB9 MWECMQEANASSSLCVIVFILITVIGKLVVLNLFIALLLNSFSNEERNGNLEGEARK-TK ::.::. . ..:::..::.:. :::.:::::::.::::.::: . : . : :. .. CCDS46 MWDCMEVS--GQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSAD--NLTAPDEDREMNN 910 920 930 940 950 840 850 860 870 880 pF1KB9 VQLALDRFRRAFCFVRHTLEHFCHKWCRKQNLPQQKEV--AGG----CAAQSKDIIPLVM .:::: :..:.. ::..: :: :.. ::. . : : : : . : CCDS46 LQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQR--PQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPP--P 960 970 980 990 1000 1010 890 900 910 920 930 940 pF1KB9 EMKRGSETQEELGILTSVPKTLGVRHDWTWL-APLAEEEDDVEFSGEDNAQRITQPEP-- : .. :..: . . :. : . .:.: :.:.. . ::. . . : CCDS46 ETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 950 960 970 980 990 pF1KB9 -EQQAYELHQENKKPTSQRVQS-VEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVTSILSEC------ .:.. . . : ..:. : : :: : . : :.. . : CCDS46 KQQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPED 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KB9 -----STIDLQDGFGWLPEMVPK-----KQPERCLPKGFGC---CFPCCSVDKRKPPWVI :: :. . . : :..: :.:: :. .: : : :::.:: . : . CCDS46 SCSEGSTADMTNT-AELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEG--CVRRC-PCCAVDTTQAPGKV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB9 WWNLRKTCYQIVKHSWFESFIIFVILLSSGALIFEDVHLENQPKIQELLNCTDIIFTHIF :: ::::::.::.:::::.::::.:::::::: :::..::.. :. ::. .: .::..: CCDS46 WWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVF 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB9 ILEMVLKWVAFGFGKYFTSAWCCLDFIIVIVSVTTLI-------NLMELKSFRTLRALRP .:::.:::::.:: ::::.::: :::.:: ::...:. .. .::.:::::::: CCDS46 VLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB9 LRALSQFEGMKVVVNALIGAIPAILNVLLVCLIFWLVFCILGVYFFSGKFGKCINGT--D :::::.::::.::::::.::::.:.:::::::::::.: :.:: .:.::::.::: : : CCDS46 LRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGD 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB9 SVINYTIITNKSQCES----GNFSWINQKVNFDNVGNAYLALLQVATFKGWMDIIYAAVD .::::..::::::: :.. : . :::::::: .::::::: CCDS46 LPLNYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVY-------------- 1380 1390 1400 1410 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB9 STEKEQQPEFESNSLGYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQQKKLGGQDIFMTEE :.::..: : :::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: CCDS46 ----EEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEE 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KB9 QKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKCQGLVFDIVTSQIFDIIIISLIILNMISMMAESY :::::::::::::::::::::::::: ::..:::::.: ::. :. :: :::..::.:. CCDS46 QKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETD 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KB9 NQPKAMKSILDHLNWVFVVIFTLECLIKIFALRQYYFTNGWNLFDCVVVLLSIVSTMIST .: .:: ..: .::.::: ::..:. :::.:::::.::.:: :::.::::.:..: CCDS46 DQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSD 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KB9 LENQEHIPFPPTLFRIVRLARIGRILRLVRAARGIRTLLFALMMSLPSLFNIGLLLFLIM . :... : :::::..:::::::::::.:.:.::::::::::::::.::::::::::.: CCDS46 I-IQKYF-FSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVM 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KB9 FIYAILGMNWFSKVNPESGIDDIFNFKTFASSMLCLFQISTSAGWDSLLSPMLRSKES-C :::.:.:: :. :. :.::::.:::.:::.::::::::.::::::.::::.: . : CCDS46 FIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYC 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KB9 -------NSSSENCHLPGIATSYFVSYIIISFLIVVNMYIAVILENFNTATEESEDPLGE :.: .: :... .:..:::::::::::::::.:::::..::::: .::.: CCDS46 DPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSE 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KB9 DDFDIFYEVWEKFDPEATQFIKYSALSDFADALPEPLRVAKPNKYQFLVMDLPMVSEDRL ::::.:::.::::::::::::.::.:::::::: ::::.::::. ... ::::::: ::. CCDS46 DDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRI 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KB9 HCMDILFAFTARVLGGSDGLDSMKAMMEEKFMEANPLKKLYEPIVTTTKRKEEERGAAII :::::::::: :::: : .:..: .:::::: ::: : ::::.:: .::.:: .: .: CCDS46 HCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVI 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KB9 QKAFRKYMMKVTKGDQGDQNDLENGPHSPLQTLCNGDLSSFGVAKGKVHCD :.:::..... CCDS46 QRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSI 1900 1910 1920 1930 1940 1950 >-- initn: 402 init1: 316 opt: 375 Z-score: 392.9 bits: 86.1 E(32554): 1.4e-15 Smith-Waterman score: 375; 57.4% identity (80.2% similar) in 101 aa overlap (15-110:12-112) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MDDRCYPVIFPDERNFRPFTSDSLAAIEKRIAIQKEK-----KKSKDQTGEVPQPRPQLD .:: :: .::::::::.: .. . ..:.. : :::::: CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LKASRKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPF :.::.::: :::. :.::::.::::::::: ..:::.:::. .::.:::: .::. CCDS46 LQASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 NSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEAL CCDS46 HPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKIL 120 130 140 150 160 170 >>CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836 aa) initn: 4970 init1: 1037 opt: 3018 Z-score: 3230.2 bits: 610.9 E(32554): 1.3e-173 Smith-Waterman score: 5544; 50.7% identity (72.3% similar) in 1818 aa overlap (16-1750:17-1744) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MDDRCYPVIFPDERNFRPFTSDSLAAIEKRIAIQKEKKKSKDQTGEVPQP--RPQLDLK .:::: .::::::.: :...: . .... :. .: .:. ::. CCDS45 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQR-AVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 ASRKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPFNS :...:: .::: : :.:: :::::::.: :.:::.:::. ..:.:::: ::....::. CCDS45 AGKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 IRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEALIK .: ::.: .:.::::::. :.. :::::. . ..: .: .::::: ::.::: CCDS45 VRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKN----VEYTFTGIYTFESLIK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 ILARGFILDEFSFLRDPWNWLDSIVIGIAIVSYIPGITIKLLPLRTFRVFRALKAISVVS :::::: .:.:.:::::::::: :: .: .. . . .. ::::::.::::.:.:. CCDS45 ILARGFCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLG-NISALRTFRVLRALKTITVIP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 RLKVIVGALLRSVKKLVNVIILTFFCLSIFALVGQQLFMGSLNLKCI------------- ::.:::::..::::: .:.::: ::::.::::: :::::.: ::. CCDS45 GLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTW 240 250 260 270 280 290 290 300 pF1KB9 -------------------------SRDCKNISNPEAYDHCFEKK------------ENS . : : : . :. :.: CCDS45 YSNDTWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGS 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 PEFKMCGIWMGNSACSIQYECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWEKLYQQ . .:: . : ::: .: ::.:.::..:.:.:.:::.::::::: ::.:.: CCDS45 NDALLCGNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQL 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 TLRTTGLYSVFFFIVVIFLGSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQEAQQL :::..: ..::.:.::::::::::: ::::.::: :::. . :: . ::. ::. . CCDS45 TLRAAGKTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEEEFQQMLEK 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 LKEEKEALVAMGIDRSSLTSLETSYFTPKKRKLFGNKKRKSFFLRESGK-DQPPGSDSDE .:...: : .: :. :.:. : :. . CCDS45 FKKHQEEL----------------------------EKAKAAQALEGGEADGDPAHG--K 480 490 500 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 DCQKKPQLLEQTKRLSQNLSLDHFD-EHGDPLQRQRALSAVSILTITMKEQEKSQEPCLP :: : ::: . :.: : : . . :..: .:.: :.... : : CCDS45 DC---------------NGSLDTSQGEKGAPRQSSSGDSGIS---DAMEELEEAHQKCPP 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 CGENLASKYLVWNCCPQWLCVKKVLRTVMTDPFTELAITICIIINTVFLAMEHHKMEASF . : : :.:::: :: :.... .. :::..:.:::::..::.:.::::. : : CCDS45 WWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHYPMTEHF 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 EKMLNIGNLVFTSIFIAEMCLKIIALDPYHYFRRGWNIFDSIVALLSFADVMNCVLQKRS ...:..::::::.:: ::: ::.::.:::.::..::::::::.. ::.... .: : CCDS45 DNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLS 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB9 WPFLRSFRVLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGSLTVVLVIVIFIFSVVGMQLFGR :::::.:::::::::::::: :::::::::::::.::.::.:..:::.::::::::. CCDS45 --VLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGK 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB9 SFNSQKSPKLCNPTGPTVSC-LRHWHMGDFWHSFLVVFRILCGEWIENMWECMQEANASS :.. .:. . ..: : .::: ::.::::.:::::::::::.::.::. : .. CCDS45 SYK----ECVCKIA---LDCNLPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIETMWDCMEVA--GQ 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 pF1KB9 SLCVIVFILITVIGKLVVLNLFIALLLNSFSNEERNGNLEGEARKTKVQLALDRFRRAFC ..:. ::... :::.:::::::.::::.::: . .. : ... ...:.:. :.. .. CCDS45 AMCLTVFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDE-DGEMNNLQIAIGRIKLGIG 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 pF1KB9 FVRHTLEHFCHK--WCRKQNLPQQKEVAG-GCAAQSKDIIPLVMEMKRGSETQEELGILT :.. : . : :. . . :. : : :... . : : .. .:.: . CCDS45 FAKAFLLGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAP---EDEKKEPPEEDLKKDN 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 pF1KB9 SVPKTLGVRHDWTWLAPLAEEEDDVEFSGEDNAQRITQPEPEQQAYELHQENKKPTSQRV . . .:. : . : : ..: : .: : : : ... . :: . CCDS45 HILNHMGLADG----PPSSLELDHLNFI---NNPYLTIQVP--IASE-ESDLEMPTEE-- 900 910 920 930 970 980 990 1000 1010 pF1KB9 QSVEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVTSILSECSTIDLQ----DGFGWLPEMVPKKQPER : : :: ::. . . :. : .: : ::: : . : : .:::. CCDS45 ---ETDTFS--EPEDSKKPPQPLYDGNS--SVCSTADYKPPEEDPEEQAEENPEGEQPEE 940 950 960 970 980 990 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB9 CLPKGFGCCFPCCSVDKRKPPWVIWWNLRKTCYQIVKHSWFESFIIFVILLSSGALIFED :. .. .:: :: . ::.::..:..::.:.:::.::.:.:::::::: ::: CCDS45 CFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFED 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB9 VHLENQPKIQELLNCTDIIFTHIFILEMVLKWVAFGFGKYFTSAWCCLDFIIVIVSVTTL ...:.. :. .:. .: .::.:::.::.:::::.:: :::.::: :::.:: ::. .: CCDS45 IYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISL 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB9 I-------NLMELKSFRTLRALRPLRALSQFEGMKVVVNALIGAIPAILNVLLVCLIFWL . .: .::.:::::::::::::.::::.::::::.::::.:.::::::::::: CCDS45 VANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KB9 VFCILGVYFFSGKFGKCINGTDSV-INYTIITNKSQCES----GNFSWINQKVNFDNVGN .: :.:: .:.::: ::: : : .. . ..:::.::: :. :.: :::.:::: CCDS45 IFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSECESLMHTGQVRWLNVKVNYDNVGL 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KB9 AYLALLQVATFKGWMDIIYAAVDSTEKEQQPEFESNSLGYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIG .::.:::::::::::::.:::::: :::.::..: : :.:::.::::::::::::::: CCDS45 GYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKEEQPQYEVNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIG 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KB9 VIIDNFNQQQKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKCQGLVFDIVTS :::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :: ::.:.:.::. CCDS45 VIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLVTK 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KB9 QIFDIIIISLIILNMISMMAESYNQPKAMKSILDHLNWVFVVIFTLECLIKIFALRQYYF : ::: :. :: :::..::.:. :: . .:: ..: .:..::: ::..:..::::::: CCDS45 QAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLALRQYYF 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KB9 TNGWNLFDCVVVLLSIVSTMISTLENQEHIPFPPTLFRIVRLARIGRILRLVRAARGIRT : :::.:: :::.::::. .: : .. . :::::..:::::::.:::.:.:.:::: CCDS45 TVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFV--SPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRT 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KB9 LLFALMMSLPSLFNIGLLLFLIMFIYAILGMNWFSKVNPESGIDDIFNFKTFASSMLCLF ::::::::::.::::::::::.::::.:.::. :. :. ::::::.:::.::..:..::: CCDS45 LLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSIICLF 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KB9 QISTSAGWDSLLSPMLRS-KESCNSSSEN--------CHLPGIATSYFVSYIIISFLIVV .:.::::::.::.:.: : .:. . :: : :.:. .: ::::::::::: CCDS45 EITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENPGTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFLIVV 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KB9 NMYIAVILENFNTATEESEDPLGEDDFDIFYEVWEKFDPEATQFIKYSALSDFADALPEP :::::.::::::.::::: .:::::::..:::.::::::.::::: :: ::::.:.: :: CCDS45 NMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEP 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KB9 LRVAKPNKYQFLVMDLPMVSEDRLHCMDILFAFTARVLGGSDGLDSMKAMMEEKFMEANP ::.::::: .....::::: :..::.:::::.: .::: : .:..: :::::: ::: CCDS45 LRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANP 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KB9 LKKLYEPIVTTTKRKEEERGAAIIQKAFRKYMMKVTKGDQGDQNDLENGPHSPLQTLCNG : ::::.:: :::.:: : ::.:.:..... CCDS45 SKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEG 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KB9 DLSSFGVAKGKVHCD CCDS45 LLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPG 1780 1790 1800 1810 1820 1830 >>CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981 aa) initn: 5081 init1: 1006 opt: 2919 Z-score: 3123.5 bits: 591.3 E(32554): 1.2e-167 Smith-Waterman score: 5088; 47.9% identity (70.4% similar) in 1834 aa overlap (118-1752:117-1906) 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 HKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPFNSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMA .:..::.. :::::::.:. :.. :::::. CCDS54 KKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPLRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMT 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 TGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEALIKILARGFILDEFSFLRDPWNWLDSIVIGIAI . . ..: .: .::::: ::.::::.:::: :..:.:::::::::: :: .: CCDS54 MSNPPDWTKN----VEYTFTGIYTFESLIKIIARGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAY 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 VSYIPGITIKLLPLRTFRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLRSVKKLVNVIILTFFCLSIF :. . . .. ::::::.::::.:::. ::.:::::..::::: .:.::: ::::.: CCDS54 VTEFVDLG-NVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVF 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB9 ALVGQQLFMGSLNLKCISRDCKNISNPEAYDHCFEKK-----------ENSPEFK----- ::.: :::::.: :::. : : : : .::. :. :: CCDS54 ALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEE---HSIEKNITVNYNGTLINETVFEFDWKSYI 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 ----------------MCGIWMGNSACSIQYECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRL .:: . : : : .. ::.:.::.::.:.:.::..::: CCDS54 QDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRL 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 MTQDSWEKLYQQTLRTTGLYSVFFFIVVIFLGSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIE :::: ::.::: :::..: ..::..:::::::::::: ::::.:::::::. . : : CCDS54 MTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQATLEEAE 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 pF1KB9 AKEKMFQEAQQLLKEEKEAL----VAMGIDRS---------SLTSLETSYFTPK------ :: ::. . ::...:: .: . ..: : .: :.: .. : CCDS54 QKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATASEHSREPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERR 440 450 460 470 480 490 460 470 pF1KB9 -------------------------------KRKLF-----GNK----KRKS------FF .:: : ::. :: : . CCDS54 NRRKKRKQKEQSGGEEKDEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLS 500 510 520 530 540 550 480 490 pF1KB9 LRES----------------GKDQPPGSDSD---------EDCQKK------PQL----- .: : :. . ::..: :: ... :. CCDS54 IRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERR 560 570 580 590 600 610 500 510 pF1KB9 ---LEQTKRLSQNLSL--------DHFDEHG----------------------------D : ::.: :. :.. . : .: : CCDS54 NSNLSQTSRSSRMLAVFPANGKMHSTVDCNGVVSLGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLED 620 630 640 650 660 670 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 PLQRQRALSAVSILTITMKEQEKSQEPCLPCGENLASKYLVWNCCPQWLCVKKVLRTVMT : :::::.: .:::: :..: :.:.. : :: .... .:.:.: : :: ::.:. :. CCDS54 PSQRQRAMSIASILTNTVEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVM 680 690 700 710 720 730 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 DPFTELAITICIIINTVFLAMEHHKMEASFEKMLNIGNLVFTSIFIAEMCLKIIALDPYH :::..:::::::..::.:.::::. : :...:..::::::.:: ::: :::::.:::. CCDS54 DPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYY 740 750 760 770 780 790 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 YFRRGWNIFDSIVALLSFADVMNCVLQKRSWPFLRSFRVLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIG ::..::::::.... ::.... .. : :::::.:::::::::::::: :::::: CCDS54 YFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLS--VLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIG 800 810 820 830 840 850 700 710 720 730 740 750 pF1KB9 NSVGALGSLTVVLVIVIFIFSVVGMQLFGRSFNSQKSPKLCNPTGPTVSC-LRHWHMGDF :::::::.::.::.:..:::.::::::::.:... .:. .. .: : .:::.:: CCDS54 NSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDC----VCKIAS---DCQLPRWHMNDF 860 870 880 890 900 760 770 780 790 800 810 pF1KB9 WHSFLVVFRILCGEWIENMWECMQEANASSSLCVIVFILITVIGKLVVLNLFIALLLNSF .::::.:::.:::::::.::.::. :. ...:. ::... :::.:::::::.::::.:: CCDS54 FHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAG--QAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSF 910 920 930 940 950 960 820 830 840 850 860 870 pF1KB9 SNEERNGNLEGEARKTKVQLALDRFRRAFCFVRHTLEHFCHK-WCRKQNLPQQKEVAGGC : .. .. . . . ...:.:.::.... .:.. . .: .. . :::.. .. . CCDS54 SADNLAAT-DDDNEMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDL 970 980 990 1000 1010 1020 880 890 900 910 920 930 pF1KB9 AAQSKDIIPLVMEMKRGSETQEELGILTSVPKTL-GVRHDWTWLAPLAEEEDDVEFSGED .. . . .. .: ..: : .: : :. . . .: : . : . . CCDS54 NNKKDSCMS-----NHTAEIGKDLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFIN-N 1030 1040 1050 1060 1070 1080 940 950 960 970 980 990 pF1KB9 NAQRITQPEPEQQAYELHQENKKPTSQRVQSVEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVTSILS . .: : .. .... : . :. ::.. ... ..: . .: : CCDS54 PSLTVTVPIAVGES-DFENLNTE-----------DFSSESD----LEESKEKLNESSSSS 1090 1100 1110 1120 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB9 ECSTIDLQDGFGWLPEMVPKK--QPERCLPKGFGCCFPCCSVDKRKPPWVIWWNLRKTCY : ::.:. : . :.. .:: :. .: : ::... .. :::::.::. CCDS54 EGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLRRTCF 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB9 QIVKHSWFESFIIFVILLSSGALIFEDVHLENQPKIQELLNCTDIIFTHIFILEMVLKWV .::.:.:::.::.:.:::::::: :::...... :. .:. .: .::.::::::.:::: CCDS54 RIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWV 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB9 AFGFGKYFTSAWCCLDFIIVIVSVTTLI-------NLMELKSFRTLRALRPLRALSQFEG :.:. :::.::: :::.:: ::...: .: .::.:::::::::::::.::: CCDS54 AYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEG 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB9 MKVVVNALIGAIPAILNVLLVCLIFWLVFCILGVYFFSGKFGKCINGTDS-VINYTIITN :.::::::.::::.:.:::::::::::.: :.:: .:.::: .::: : . .. ..: CCDS54 MRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIEDVNN 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KB9 KSQC----ESGNFS-WINQKVNFDNVGNAYLALLQVATFKGWMDIIYAAVDSTEKEQQPE ...: : .. . : : :::::::: .::.:::::::::::::.:::::: . : ::. CCDS54 HTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPK 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KB9 FESNSLGYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQQKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMK .: . :.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::: CCDS54 YEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMK 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KB9 KLGSKKPQKPIPRPLNKCQGLVFDIVTSQIFDIIIISLIILNMISMMAESYNQPKAMKSI :::::::::::::: :: ::.:::.:: :.::: :. :: :::..::.:. .: . . .: CCDS54 KLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEYVTTI 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KB9 LDHLNWVFVVIFTLECLIKIFALRQYYFTNGWNLFDCVVVLLSIVSTMISTLENQEHIPF :...: ::.:.:: ::..:...::.:::: :::.:: :::.::::. ... : .. . CCDS54 LSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFV-- 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KB9 PPTLFRIVRLARIGRILRLVRAARGIRTLLFALMMSLPSLFNIGLLLFLIMFIYAILGMN :::::..:::::::::::...:.::::::::::::::.::::::::::.::::::.::. CCDS54 SPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMS 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KB9 WFSKVNPESGIDDIFNFKTFASSMLCLFQISTSAGWDSLLSPMLRSKE-SCNSSSEN--- :. :. : ::::.:::.::..::.:::::.::::::.::.:.: :: .:. .. : CCDS54 NFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNPGS 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KB9 -----CHLPGIATSYFVSYIIISFLIVVNMYIAVILENFNTATEESEDPLGEDDFDIFYE : :... .::::::::::.:::::::::::::..::::: .::.::::..::: CCDS54 SVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYE 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KB9 VWEKFDPEATQFIKYSALSDFADALPEPLRVAKPNKYQFLVMDLPMVSEDRLHCMDILFA :::::::.::::... ::.:: :: :: . .::: :...::::::: ::.::.::::: CCDS54 VWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFA 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KB9 FTARVLGGSDGLDSMKAMMEEKFMEANPLKKLYEPIVTTTKRKEEERGAAIIQKAFRKYM :: :::: : .:... .:::.:: .:: : :.::.:: :::.:: .:.:::.:.:... CCDS54 FTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHL 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KB9 MKVTKGDQGDQNDLENGPHSPLQTLCNGDLSSFGVAKGKVHCD .: : CCDS54 LKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDRVT 1910 1920 1930 1940 1950 1960 >-- initn: 357 init1: 289 opt: 369 Z-score: 386.5 bits: 84.9 E(32554): 3.3e-15 Smith-Waterman score: 369; 53.3% identity (79.4% similar) in 107 aa overlap (11-116:11-115) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MDDRCYPVIFPDERNFRPFTSDSLAAIEKRIAIQKEKKKSKDQTGEVPQ-PRPQLDLKAS :: :: :: .::::::.::: .: :. . :. . . :.:. ::.:. CCDS54 MEQTVLVPPGPDSFNF--FTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 RKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPFNSIR ..:: .::::: :....:::::::.: :.:::.:::. ..:.:::: ::.:. ::: CCDS54 KNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPLR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 SLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEALIKIL CCDS54 KIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARGF 120 130 140 150 160 170 >>CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998 aa) initn: 5081 init1: 1006 opt: 2919 Z-score: 3123.4 bits: 591.3 E(32554): 1.2e-167 Smith-Waterman score: 4985; 47.3% identity (69.5% similar) in 1838 aa overlap (134-1752:133-1923) 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 SAKHALFIFGPFNSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAE .:. :.. :::::. . . ..: .: CCDS33 SATSALYILTPFNPLRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKN----VE 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 CVFTGIYIFEALIKILARGFILDEFSFLRDPWNWLDSIVIGIAIVSYIPGITIKLLPLRT .::::: ::.::::.:::: :..:.:::::::::: :: .: :. . . .. ::: CCDS33 YTFTGIYTFESLIKIIARGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLG-NVSALRT 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 FRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLRSVKKLVNVIILTFFCLSIFALVGQQLFMGSLNLKC :::.::::.:::. ::.:::::..::::: .:.::: ::::.:::.: :::::.: :: CCDS33 FRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKC 220 230 240 250 260 270 290 300 310 pF1KB9 ISRDCKNISNPEAYDHCFEKK-----------ENSPEFK--------------------- :. : : : : .::. :. :: CCDS33 IQWPPTNASLEE---HSIEKNITVNYNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDAL 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KB9 MCGIWMGNSACSIQYECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWEKLYQQTLRT .:: . : : : .. ::.:.::.::.:.:.::..::::::: ::.::: :::. CCDS33 LCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRA 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KB9 TGLYSVFFFIVVIFLGSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQEAQQLLKEE .: ..::..:::::::::::: ::::.:::::::. . : : :: ::. . ::.. CCDS33 AGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQ 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 KEAL---------------VAMG------------------------------------- .:: : : CCDS33 QEAAQQAATATASEHSREPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEE 460 470 480 490 500 510 440 450 460 pF1KB9 --------------IDRS----------------------SLTSLETSYFTPKKRK---L : :. :: :.. : :.:.. . : CCDS33 KDEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSL 520 530 540 550 560 570 470 480 pF1KB9 F---------GNK----------------KRKSFFL-------RESGKDQPPGSD----- : :.. .: :.:. :.:. .: :. CCDS33 FSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNSNLSQTSRSSRMLAV 580 590 600 610 620 630 490 500 510 pF1KB9 --------SDEDCQ------------KKP--QLL--------EQTKRLSQNL--SLDHFD : ::. .: ::: :. :: :... :.: .. CCDS33 FPANGKMHSTVDCNGVVSLVGGPSVPTSPVGQLLPEGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLE 640 650 660 670 680 690 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 EHGDPLQRQRALSAVSILTITMKEQEKSQEPCLPCGENLASKYLVWNCCPQWLCVKKVLR :: :::::.: .:::: :..: :.:.. : :: .... .:.:.: : :: ::.:. CCDS33 ---DPSQRQRAMSIASILTNTVEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVN 700 710 720 730 740 750 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 TVMTDPFTELAITICIIINTVFLAMEHHKMEASFEKMLNIGNLVFTSIFIAEMCLKIIAL :. :::..:::::::..::.:.::::. : :...:..::::::.:: ::: :::::. CCDS33 LVVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAM 760 770 780 790 800 810 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 DPYHYFRRGWNIFDSIVALLSFADVMNCVLQKRSWPFLRSFRVLRVFKLAKSWPTLNTLI :::.::..::::::.... ::.... .. : :::::.:::::::::::::: :: CCDS33 DPYYYFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLS--VLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLI 820 830 840 850 860 700 710 720 730 740 750 pF1KB9 KIIGNSVGALGSLTVVLVIVIFIFSVVGMQLFGRSFNSQKSPKLCNPTGPTVSC-LRHWH :::::::::::.::.::.:..:::.::::::::.:... .:. .. .: : .:: CCDS33 KIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDC----VCKIAS---DCQLPRWH 870 880 890 900 910 920 760 770 780 790 800 810 pF1KB9 MGDFWHSFLVVFRILCGEWIENMWECMQEANASSSLCVIVFILITVIGKLVVLNLFIALL :.::.::::.:::.:::::::.::.::. : ....:. ::... :::.:::::::.::: CCDS33 MNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVA--GQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALL 930 940 950 960 970 980 820 830 840 850 860 pF1KB9 LNSFSNEERNGNLEGEARKTKVQLALDRFRRAFCFVRHTLEHFCHK-WCRKQNLPQQKEV :.::: .. .. . . . ...:.:.::.... .:.. . .: .. . :::.. .. . CCDS33 LSSFSADNLAAT-DDDNEMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKP 990 1000 1010 1020 1030 870 880 890 900 910 920 pF1KB9 AGGCAAQSKDIIPLVMEMKRGSETQEELGILTSVPKTL-GVRHDWTWLAPLAEEEDDVEF .. . . .. .: ..: : .: : :. . . .: : . : CCDS33 LDDLNNKKDSCMS-----NHTAEIGKDLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSF 1040 1050 1060 1070 1080 1090 930 940 950 960 970 980 pF1KB9 SGEDNAQRITQPEPEQQAYELHQENKKPTSQRVQSVEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVT . . . .: : .. .... : . :. ::.. ... ..: . . CCDS33 IN-NPSLTVTVPIAVGES-DFENLNTE-----------DFSSESD----LEESKEKLNES 1100 1110 1120 1130 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KB9 SILSECSTIDLQDGFGWLPEMVPKK--QPERCLPKGFGCCFPCCSVDKRKPPWVIWWNLR : :: ::.:. : . :.. .:: :. .: : ::... .. ::::: CCDS33 SSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLR 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB9 KTCYQIVKHSWFESFIIFVILLSSGALIFEDVHLENQPKIQELLNCTDIIFTHIFILEMV .::..::.:.:::.::.:.:::::::: :::...... :. .:. .: .::.::::::. CCDS33 RTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEML 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB9 LKWVAFGFGKYFTSAWCCLDFIIVIVSVTTLI-------NLMELKSFRTLRALRPLRALS :::::.:. :::.::: :::.:: ::...: .: .::.::::::::::::: CCDS33 LKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALS 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB9 QFEGMKVVVNALIGAIPAILNVLLVCLIFWLVFCILGVYFFSGKFGKCINGTDS-VINYT .::::.::::::.::::.:.:::::::::::.: :.:: .:.::: .::: : . .. CCDS33 RFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIE 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KB9 IITNKSQC----ESGNFS-WINQKVNFDNVGNAYLALLQVATFKGWMDIIYAAVDSTEKE ..:...: : .. . : : :::::::: .::.:::::::::::::.:::::: . : CCDS33 DVNNHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVE 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KB9 QQPEFESNSLGYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQQKKLGGQDIFMTEEQKKYY ::..: . :.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::: CCDS33 LQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYY 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KB9 NAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKCQGLVFDIVTSQIFDIIIISLIILNMISMMAESYNQPKA :::::::::::::::::: :: ::.:::.:: :.::: :. :: :::..::.:. .: . CCDS33 NAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEY 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KB9 MKSILDHLNWVFVVIFTLECLIKIFALRQYYFTNGWNLFDCVVVLLSIVSTMISTLENQE . .::...: ::.:.:: ::..:...::.:::: :::.:: :::.::::. ... : .. CCDS33 VTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKY 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KB9 HIPFPPTLFRIVRLARIGRILRLVRAARGIRTLLFALMMSLPSLFNIGLLLFLIMFIYAI . :::::..:::::::::::...:.::::::::::::::.::::::::::.:::::: CCDS33 FV--SPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KB9 LGMNWFSKVNPESGIDDIFNFKTFASSMLCLFQISTSAGWDSLLSPMLRSKE-SCNSSSE .::. :. :. : ::::.:::.::..::.:::::.::::::.::.:.: :: .:. .. CCDS33 FGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKV 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KB9 N--------CHLPGIATSYFVSYIIISFLIVVNMYIAVILENFNTATEESEDPLGEDDFD : : :... .::::::::::.:::::::::::::..::::: .::.::::. CCDS33 NPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFE 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KB9 IFYEVWEKFDPEATQFIKYSALSDFADALPEPLRVAKPNKYQFLVMDLPMVSEDRLHCMD .::::::::::.::::... ::.:: :: :: . .::: :...::::::: ::.::.: CCDS33 MFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLD 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KB9 ILFAFTARVLGGSDGLDSMKAMMEEKFMEANPLKKLYEPIVTTTKRKEEERGAAIIQKAF :::::: :::: : .:... .:::.:: .:: : :.::.:: :::.:: .:.:::.:. CCDS33 ILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAY 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KB9 RKYMMKVTKGDQGDQNDLENGPHSPLQTLCNGDLSSFGVAKGKVHCD :....: : CCDS33 RRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSY 1920 1930 1940 1950 1960 1970 >-- initn: 426 init1: 358 opt: 438 Z-score: 460.5 bits: 98.6 E(32554): 2.5e-19 Smith-Waterman score: 438; 54.0% identity (80.6% similar) in 124 aa overlap (11-133:11-132) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MDDRCYPVIFPDERNFRPFTSDSLAAIEKRIAIQKEKKKSKDQTGEVPQ-PRPQLDLKAS :: :: :: .::::::.::: .: :. . :. . . :.:. ::.:. CCDS33 MEQTVLVPPGPDSFNF--FTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 RKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPFNSIR ..:: .::::: :....:::::::.: :.:::.:::. ..:.:::: ::.:. ::: .: CCDS33 KNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPLR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 SLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEALIKIL ..::.. ::::::: CCDS33 KIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARGF 120 130 140 150 160 170 >>CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009 aa) initn: 5081 init1: 1006 opt: 2919 Z-score: 3123.4 bits: 591.3 E(32554): 1.2e-167 Smith-Waterman score: 4931; 47.4% identity (69.4% similar) in 1821 aa overlap (159-1752:154-1934) 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 SLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEALIKILARGFILDEF : .: .::::: ::.::::.:::: :..: CCDS54 ILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARGFCLEDF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 SFLRDPWNWLDSIVIGIAIVSYIPGITIKLLPLRTFRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLR .:::::::::: :: .: :. . . .. ::::::.::::.:::. ::.:::::.. CCDS54 TFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLG-NVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 SVKKLVNVIILTFFCLSIFALVGQQLFMGSLNLKCISRDCKNISNPEAYDHCFEKK---- ::::: .:.::: ::::.:::.: :::::.: :::. : : : : .::. CCDS54 SVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEE---HSIEKNITVN 250 260 270 280 290 310 320 330 pF1KB9 -------ENSPEFK---------------------MCGIWMGNSACSIQYECKHTKINPD :. :: .:: . : : : .. ::. CCDS54 YNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPN 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 YNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWEKLYQQTLRTTGLYSVFFFIVVIFLGSFYLINLTL :.::.::.:.:.::..::::::: ::.::: :::..: ..::..:::::::::::: : CCDS54 YGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLIL 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KB9 AVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQEAQQLLKEEKEAL----VAMGIDRS--------- :::.:::::::. . : : :: ::. . ::...:: .: . ..: CCDS54 AVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATASEHSREPSAAGRL 420 430 440 450 460 470 450 460 pF1KB9 SLTSLETSYFTPK-------------------------------------KRKLF----- : .: :.: .. : .:: : CCDS54 SDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEKDEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIE 480 490 500 510 520 530 470 480 pF1KB9 GNK----KRKS------FFLRES----------------GKDQPPGSDSD---------E ::. :: : . .: : :. . ::..: : CCDS54 GNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFE 540 550 560 570 580 590 490 500 pF1KB9 DCQKK------PQL--------LEQTKRLSQNLS-------------------------- : ... :. : ::.: :. :. CCDS54 DNESRRDSLFVPRRHGERRNSNLSQTSRSSRMLAVFPANGKMHSTVDCNGVVSLVGGPSV 600 610 620 630 640 650 510 520 pF1KB9 -------------LDH--FDEHG-----------------------DPLQRQRALSAVSI .:. :..: :: :::::.: .:: CCDS54 PTSPVGQLLPEVIIDKPATDDNGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLEDPSQRQRAMSIASI 660 670 680 690 700 710 530 540 550 560 570 580 pF1KB9 LTITMKEQEKSQEPCLPCGENLASKYLVWNCCPQWLCVKKVLRTVMTDPFTELAITICII :: :..: :.:.. : :: .... .:.:.: : :: ::.:. :. :::..:::::::. CCDS54 LTNTVEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVMDPFVDLAITICIV 720 730 740 750 760 770 590 600 610 620 630 640 pF1KB9 INTVFLAMEHHKMEASFEKMLNIGNLVFTSIFIAEMCLKIIALDPYHYFRRGWNIFDSIV .::.:.::::. : :...:..::::::.:: ::: :::::.:::.::..::::::... CCDS54 LNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFI 780 790 800 810 820 830 650 660 670 680 690 700 pF1KB9 ALLSFADVMNCVLQKRSWPFLRSFRVLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGSLTVVL . ::.... .. : :::::.:::::::::::::: :::::::::::::.::.:: CCDS54 VTLSLVELGLANVEGLS--VLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVL 840 850 860 870 880 890 710 720 730 740 750 760 pF1KB9 VIVIFIFSVVGMQLFGRSFNSQKSPKLCNPTGPTVSC-LRHWHMGDFWHSFLVVFRILCG .:..:::.::::::::.:... .:. .. .: : .:::.::.::::.:::.::: CCDS54 AIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDC----VCKIAS---DCQLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCG 900 910 920 930 940 950 770 780 790 800 810 820 pF1KB9 EWIENMWECMQEANASSSLCVIVFILITVIGKLVVLNLFIALLLNSFSNEERNGNLEGEA ::::.::.::. :. ...:. ::... :::.:::::::.::::.::: .. .. . . CCDS54 EWIETMWDCMEVAG--QAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAAT-DDDN 960 970 980 990 1000 830 840 850 860 870 880 pF1KB9 RKTKVQLALDRFRRAFCFVRHTLEHFCHK-WCRKQNLPQQKEVAGGCAAQSKDIIPLVME . ...:.:.::.... .:.. . .: .. . :::.. .. . .. . . CCDS54 EMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMS---- 1010 1020 1030 1040 1050 1060 890 900 910 920 930 940 pF1KB9 MKRGSETQEELGILTSVPKTL-GVRHDWTWLAPLAEEEDDVEFSGEDNAQRITQPEPEQQ .. .: ..: : .: : :. . . .: : . : . . . .: : . CCDS54 -NHTAEIGKDLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFIN-NPSLTVTVPIAVGE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 950 960 970 980 990 1000 pF1KB9 AYELHQENKKPTSQRVQSVEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVTSILSECSTIDLQDGFGW . .... : . :. ::.. ... ..: . .: :: ::.:. CCDS54 S-DFENLNTE-----------DFSSESD----LEESKEKLNESSSSSEGSTVDIGAPVEE 1130 1140 1150 1160 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB9 LPEMVPKK--QPERCLPKGFGCCFPCCSVDKRKPPWVIWWNLRKTCYQIVKHSWFESFII : . :.. .:: :. .: : ::... .. :::::.::..::.:.:::.::. CCDS54 QPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIV 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB9 FVILLSSGALIFEDVHLENQPKIQELLNCTDIIFTHIFILEMVLKWVAFGFGKYFTSAWC :.:::::::: :::...... :. .:. .: .::.::::::.:::::.:. :::.::: CCDS54 FMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWC 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB9 CLDFIIVIVSVTTLI-------NLMELKSFRTLRALRPLRALSQFEGMKVVVNALIGAIP :::.:: ::...: .: .::.:::::::::::::.::::.::::::.:::: CCDS54 WLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIP 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KB9 AILNVLLVCLIFWLVFCILGVYFFSGKFGKCINGTDS-VINYTIITNKSQC----ESGNF .:.:::::::::::.: :.:: .:.::: .::: : . .. ..:...: : .. CCDS54 SIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNET 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KB9 S-WINQKVNFDNVGNAYLALLQVATFKGWMDIIYAAVDSTEKEQQPEFESNSLGYIYFVV . : : :::::::: .::.:::::::::::::.:::::: . : ::..: . :.:::. CCDS54 ARWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVI 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KB9 FIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQQKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPR ::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 FIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPR 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KB9 PLNKCQGLVFDIVTSQIFDIIIISLIILNMISMMAESYNQPKAMKSILDHLNWVFVVIFT : :: ::.:::.:: :.::: :. :: :::..::.:. .: . . .::...: ::.:.:: CCDS54 PGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFT 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KB9 LECLIKIFALRQYYFTNGWNLFDCVVVLLSIVSTMISTLENQEHIPFPPTLFRIVRLARI ::..:...::.:::: :::.:: :::.::::. ... : .. . :::::..::::: CCDS54 GECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVS--PTLFRVIRLARI 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KB9 GRILRLVRAARGIRTLLFALMMSLPSLFNIGLLLFLIMFIYAILGMNWFSKVNPESGIDD ::::::...:.::::::::::::::.::::::::::.::::::.::. :. :. : :::: CCDS54 GRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDD 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KB9 IFNFKTFASSMLCLFQISTSAGWDSLLSPMLRSKE-SCNSSSEN--------CHLPGIAT .:::.::..::.:::::.::::::.::.:.: :: .:. .. : : :... CCDS54 MFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNPGSSVKGDCGNPSVGI 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KB9 SYFVSYIIISFLIVVNMYIAVILENFNTATEESEDPLGEDDFDIFYEVWEKFDPEATQFI .::::::::::.:::::::::::::..::::: .::.::::..::::::::::.::::. CCDS54 FFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFM 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KB9 KYSALSDFADALPEPLRVAKPNKYQFLVMDLPMVSEDRLHCMDILFAFTARVLGGSDGLD .. ::.:: :: :: . .::: :...::::::: ::.::.::::::: :::: : .: CCDS54 EFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMD 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KB9 SMKAMMEEKFMEANPLKKLYEPIVTTTKRKEEERGAAIIQKAFRKYMMKVTKGDQGDQND ... .:::.:: .:: : :.::.:: :::.:: .:.:::.:.:....: : CCDS54 ALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYN 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1770 1780 1790 pF1KB9 LENGPHSPLQTLCNGDLSSFGVAKGKVHCD CCDS54 KNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHEQEGKD 1950 1960 1970 1980 1990 2000 >-- initn: 481 init1: 413 opt: 493 Z-score: 519.5 bits: 109.5 E(32554): 1.3e-22 Smith-Waterman score: 493; 54.0% identity (81.0% similar) in 137 aa overlap (11-146:11-145) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MDDRCYPVIFPDERNFRPFTSDSLAAIEKRIAIQKEKKKSKDQTGEVPQ-PRPQLDLKAS :: :: :: .::::::.::: .: :. . :. . . :.:. ::.:. CCDS54 MEQTVLVPPGPDSFNF--FTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 RKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPFNSIR ..:: .::::: :....:::::::.: :.:::.:::. ..:.:::: ::.:. ::: .: CCDS54 KNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPLR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 SLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEALIKIL ..::.. :::::::.:. :.. ::::: CCDS54 KIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARGF 120 130 140 150 160 170 >>CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962 aa) initn: 5072 init1: 1032 opt: 2838 Z-score: 3036.6 bits: 575.2 E(32554): 8.1e-163 Smith-Waterman score: 5704; 51.9% identity (72.3% similar) in 1854 aa overlap (75-1750:77-1864) 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 GEVPQPRPQLDLKASRKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFS :.::::::::: ..:::.:::. .::.::: CCDS54 PEEEAPRPQLDLQASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFS 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 AKHALFIFGPFNSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAEC : .::....::. :: :... :::::.:.:. :.. :::::: ... : .: CCDS54 ATNALYVLSPFHPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMA----QHDPPPWTKYVEY 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 VFTGIYIFEALIKILARGFILDEFSFLRDPWNWLDSIVIGIAIVSYIPGITI-KLLPLRT .::.:: ::.:.::::::: : :.:::::::::: :: .: :: .: . .: ::: CCDS54 TFTAIYTFESLVKILARGFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVS--ENIKLGNLSALRT 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 FRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLRSVKKLVNVIILTFFCLSIFALVGQQLFMGSLNLKC :::.::::.:::. ::.:::::..:::::..:..:: ::::.:::.: :::::.: :: CCDS54 FRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKC 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 ISRDCKNISNP-----------EAYDHCFEKKEN------SPEFKMCGIWMGNSACSIQY . :. ... :. : . :: . . .:: ..: : CCDS54 V-RNFTALNGTNGSVEADGLVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGY 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 ECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWEKLYQQTLRTTGLYSVFFFIVVIFL .: .. :::..::.::.:.:.:::.::::::: ::.:::::::..: ..::..:::: CCDS54 RCLKAGENPDHGYTSFDSFAWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFL 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 GSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQEAQQLLKEEKEALVAMGIDRSSLT :::::.:: ::::.:::::::. . :: : ::: ::::...::.:.:::. :.: : . CCDS54 GSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRS 400 410 420 430 440 450 450 460 pF1KB9 SLETSYFTP--------KKRKLFGN----------------------------------- ::: : ..: :.:: ... CCDS54 SLEMSPLAPVNSHERRSKRRKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTS 460 470 480 490 500 510 470 480 pF1KB9 ----KKRKSFFL-------------------------------------RESGKDQP-PG ..: :.: : :.. :: :: CCDS54 MKPRSSRGSIFTFRRRDLGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPG 520 530 540 550 560 570 490 500 pF1KB9 S-----------DSDEDCQK--------------------KPQLLEQTKRL--------- . .: ::. .: .::. CCDS54 TSAPGHALHGKKNSTVDCNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGG 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 pF1KB9 -----SQNLSLDHFDEHGDPLQRQRALSAVSILTITMKEQEKSQEPCLPCGENLASKYLV :: .: :.: : :::::::::.:: ...: :.:.. : :: . ::..::. CCDS54 PQMLTSQAPCVDGFEE---PGARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLI 640 650 660 670 680 690 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 WNCCPQWLCVKKVLRTVMTDPFTELAITICIIINTVFLAMEHHKMEASFEKMLNIGNLVF :.::: :. .:. .. :. ::::.:.::.::..::.:.:.::..: . ::.::..::::: CCDS54 WECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVF 700 710 720 730 740 750 620 630 640 650 660 670 pF1KB9 TSIFIAEMCLKIIALDPYHYFRRGWNIFDSIVALLSFADVMNCVLQKRSWPFLRSFRVLR :.:: ::: .::::::::.::..::::::::...::. .. ... : :::::.:: CCDS54 TGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLS--VLRSFRLLR 760 770 780 790 800 810 680 690 700 710 720 730 pF1KB9 VFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGSLTVVLVIVIFIFSVVGMQLFGRSFNSQKSPKLC ::::::::::::::::::::::::::.::.::.:..:::.::::::::.... .. CCDS54 VFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRD---- 820 830 840 850 860 870 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 NPTGPTVSCLRHWHMGDFWHSFLVVFRILCGEWIENMWECMQEANASSSLCVIVFILITV . .: : .::: ::.:.::..::::::::::.::.::. .. .:::..::.:. : CCDS54 SDSG----LLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWIETMWDCMEVSG--QSLCLLVFLLVMV 880 890 900 910 920 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 IGKLVVLNLFIALLLNSFSNEERNGNLEGEARK-TKVQLALDRFRRAFCFVRHTLEHFCH ::.:::::::.::::.::: . : . : :. ...:::: :..:.. ::..: :: CCDS54 IGNLVVLNLFLALLLSSFSAD--NLTAPDEDREMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCC 930 940 950 960 970 980 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 KWCRKQNLPQQKEVAGGCAAQSKDIIPLVMEMKRGSETQEELGILTSVPKTLGVRHDWTW :.. ::. .. :::.. .: . . : .:: : :.. . CCDS54 GLLRQR--PQKP---AALAAQGQ--LPSCIATPYSPPPPET----EKVPPT---RKETRF 990 1000 1010 1020 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 LAPLAEEEDDVEFSGEDNAQRITQPEPEQQAYELHQENKKPTSQRVQSVEIDMFSEDEPH :: ::. .: : .:: . .. :... .. : .. .:.: CCDS54 ------EE------GEQPGQG-TPGDPEPVCVPI-AVAESDTDDQEEDEENSLGTEEES- 1030 1040 1050 1060 1070 980 990 1000 1010 1020 pF1KB9 LTIQDPRKKSDVTSILSECSTIDLQDGFGWLPEMVPK-----KQPERCLPKGFGC---CF . : :. . :: :: :. . . : :..: :.:: :. .: : : CCDS54 -SKQTPEDSC------SEGSTADMTNT-AELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEG--CVRRC- 1080 1090 1100 1110 1120 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB9 PCCSVDKRKPPWVIWWNLRKTCYQIVKHSWFESFIIFVILLSSGALIFEDVHLENQPKIQ :::.:: . : .:: ::::::.::.:::::.::::.:::::::: :::..::.. :. CCDS54 PCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIK 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB9 ELLNCTDIIFTHIFILEMVLKWVAFGFGKYFTSAWCCLDFIIVIVSVTTLI-------NL ::. .: .::..:.:::.:::::.:: ::::.::: :::.:: ::...:. .. CCDS54 VLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEM 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB9 MELKSFRTLRALRPLRALSQFEGMKVVVNALIGAIPAILNVLLVCLIFWLVFCILGVYFF .::.:::::::::::::.::::.::::::.::::.:.:::::::::::.: :.:: .: CCDS54 GPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLF 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KB9 SGKFGKCINGT--DSVINYTIITNKSQCES----GNFSWINQKVNFDNVGNAYLALLQVA .::::.::: : : .::::..::::::: :.. : . :::::::: .:::::::: CCDS54 AGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVA 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KB9 TFKGWMDIIYAAVDSTEKEQQPEFESNSLGYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQ ::::::::.:::::: :.::..: : :::::.:::::::::::::::::::::::: CCDS54 TFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQ 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB9 QKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKCQGLVFDIVTSQIFDIIIIS .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::..:::::.: ::. :. CCDS54 KKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMF 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KB9 LIILNMISMMAESYNQPKAMKSILDHLNWVFVVIFTLECLIKIFALRQYYFTNGWNLFDC :: :::..::.:. .: .:: ..: .::.::: ::..:. :::.:::::.::.:: CCDS54 LICLNMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDF 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB9 VVVLLSIVSTMISTLENQEHIPFPPTLFRIVRLARIGRILRLVRAARGIRTLLFALMMSL :::.::::.:..: . :... : :::::..:::::::::::.:.:.::::::::::::: CCDS54 VVVILSIVGTVLSDI-IQKYF-FSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSL 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KB9 PSLFNIGLLLFLIMFIYAILGMNWFSKVNPESGIDDIFNFKTFASSMLCLFQISTSAGWD :.::::::::::.::::.:.:: :. :. :.::::.:::.:::.::::::::.:::::: CCDS54 PALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWD 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KB9 SLLSPMLRSKES-C-------NSSSENCHLPGIATSYFVSYIIISFLIVVNMYIAVILEN .::::.: . : :.: .: :... .:..:::::::::::::::.:::: CCDS54 GLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILEN 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KB9 FNTATEESEDPLGEDDFDIFYEVWEKFDPEATQFIKYSALSDFADALPEPLRVAKPNKYQ :..::::: .::.:::::.:::.::::::::::::.::.:::::::: ::::.::::. . CCDS54 FSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQIS 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KB9 FLVMDLPMVSEDRLHCMDILFAFTARVLGGSDGLDSMKAMMEEKFMEANPLKKLYEPIVT .. ::::::: ::.:::::::::: :::: : .:..: .:::::: ::: : ::::.: CCDS54 LINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITT 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KB9 TTKRKEEERGAAIIQKAFRKYMMKVTKGDQGDQNDLENGPHSPLQTLCNGDLSSFGVAKG : .::.:: .: .::.:::..... CCDS54 TLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSE 1850 1860 1870 1880 1890 1900 >>CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015 aa) initn: 5077 init1: 1032 opt: 2838 Z-score: 3036.4 bits: 575.2 E(32554): 8.3e-163 Smith-Waterman score: 5508; 51.2% identity (71.2% similar) in 1819 aa overlap (128-1750:130-1917) 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 RTIYRFSAKHALFIFGPFNSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSN ::::.:.:. :.. :::::: ... CCDS46 KTIFRFSATNALYVLSPFHPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMA----QHDPPP 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 NTDIAECVFTGIYIFEALIKILARGFILDEFSFLRDPWNWLDSIVIGIAIVSYIPGITIK : .: .::.:: ::.:.::::::: : :.:::::::::: :: .: .. . . . CCDS46 WTKYVEYTFTAIYTFESLVKILARGFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLG-N 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 LLPLRTFRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLRSVKKLVNVIILTFFCLSIFALVGQQLFMG . ::::::.::::.:::.: ::.:::::..:::::..:..:: ::::.:::.: ::::: CCDS46 VSALRTFRVLRALKTISVISGLKTIVGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMG 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 SLNLKCISRDCKNISNP-----------EAYDHCFEKKEN------SPEFKMCGIWMGNS .: ::. :. ... :. : . :: . . .:: . CCDS46 NLRHKCV-RNFTALNGTNGSVEADGLVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAG 280 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 ACSIQYECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWEKLYQQTLRTTGLYSVFFF .: :.: .. :::..::.::.:.:.:::.::::::: ::.:::::::..: ..:: CCDS46 TCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFF 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 IVVIFLGSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQEAQQLLKEEKEALVAMGI ..:::::::::.:: ::::.:::::::. . :: : ::: ::::...::.:.:::. :. CCDS46 MLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGV 400 410 420 430 440 450 450 460 pF1KB9 DRSSLTSLETSYFTP--------KKRKLFGN----------------------------- : : .::: : ..: :.:: ... CCDS46 DTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTR 460 470 480 490 500 510 470 pF1KB9 ----------KKRKSFFL-------------------------------------RESGK ..: :.: : :.. CCDS46 GLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQ 520 530 540 550 560 570 480 490 500 pF1KB9 DQP-PGS-----------DSDEDCQK--------------------KPQLLEQTKRL--- :: ::. .: ::. .: .::. CCDS46 GQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTP 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 pF1KB9 -----------SQNLSLDHFDEHGDPLQRQRALSAVSILTITMKEQEKSQEPCLPCGENL :: .: :.: : :::::::::.:: ...: :.:.. : :: . : CCDS46 SEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEE---PGARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRL 640 650 660 670 680 690 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 ASKYLVWNCCPQWLCVKKVLRTVMTDPFTELAITICIIINTVFLAMEHHKMEASFEKMLN :..::.:.::: :. .:. .. :. ::::.:.::.::..::.:.:.::..: . ::.::. CCDS46 AQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQ 700 710 720 730 740 750 620 630 640 650 660 670 pF1KB9 IGNLVFTSIFIAEMCLKIIALDPYHYFRRGWNIFDSIVALLSFADVMNCVLQKRSWPFLR .::::::.:: ::: .::::::::.::..::::::::...::. .. ... : :: CCDS46 VGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLS--VLR 760 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 pF1KB9 SFRVLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGSLTVVLVIVIFIFSVVGMQLFGRSFNSQ :::.::::::::::::::::::::::::::::.::.::.:..:::.::::::::.... CCDS46 SFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSEL 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 KSPKLCNPTGPTVSCLRHWHMGDFWHSFLVVFRILCGEWIENMWECMQEANASSSLCVIV .. . .: : .::: ::.:.::..::::::::::.::.::. . ..:::..: CCDS46 RD----SDSG----LLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWIETMWDCMEVS--GQSLCLLV 870 880 890 900 910 800 810 820 830 840 pF1KB9 FILITVIGKLVVLNLFIALLLNSFSNEERNGNLEGEARK-TKVQLALDRFRRAFCFVRHT :.:. :::.:::::::.::::.::: . : . : :. ...:::: :..:.. ::..: CCDS46 FLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSAD--NLTAPDEDREMNNLQLALARIQRGLRFVKRT 920 930 940 950 960 970 850 860 870 880 890 900 pF1KB9 LEHFCHKWCRKQNLPQQKEVAGG----CAAQSKDIIPLVMEMKRGSETQEELGILTSVPK :: :.. .: : : : . : : .. :..: . . CCDS46 TWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPP--PETEKVPPTRKETRFEEGEQP 980 990 1000 1010 1020 1030 910 920 930 940 950 960 pF1KB9 TLGVRHDWTWL-APLAEEEDDVEFSGEDNAQRITQPEP--EQQAYELHQENKKPTSQRVQ :. : . .:.: :.:.. . ::. . . : .:.. . . : ..:. CCDS46 GQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQESQPVSGGPEAPPDSRTW 1040 1050 1060 1070 1080 1090 970 980 990 1000 1010 pF1KB9 S-VEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVTSILSEC-----------STIDLQDGFGWLPEMV : : :: : . : :.. . : :: :. . . : :.. CCDS46 SQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNT-AELLEQI 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB9 PK-----KQPERCLPKGFGC---CFPCCSVDKRKPPWVIWWNLRKTCYQIVKHSWFESFI : :.:: :. .: : : :::.:: . : .:: ::::::.::.:::::.:: CCDS46 PDLGQDVKDPEDCFTEG--CVRRC-PCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFI 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB9 IFVILLSSGALIFEDVHLENQPKIQELLNCTDIIFTHIFILEMVLKWVAFGFGKYFTSAW ::.:::::::: :::..::.. :. ::. .: .::..:.:::.:::::.:: ::::.:: CCDS46 IFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAW 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB9 CCLDFIIVIVSVTTLI-------NLMELKSFRTLRALRPLRALSQFEGMKVVVNALIGAI : :::.:: ::...:. .. .::.:::::::::::::.::::.::::::.::: CCDS46 CWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAI 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB9 PAILNVLLVCLIFWLVFCILGVYFFSGKFGKCINGT--DSVINYTIITNKSQCES----G :.:.:::::::::::.: :.:: .:.::::.::: : : .::::..::::::: : CCDS46 PSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNKSQCESLNLTG 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KB9 NFSWINQKVNFDNVGNAYLALLQVATFKGWMDIIYAAVDSTEKEQQPEFESNSLGYIYFV .. : . :::::::: .::::::::::::::::.:::::: :.::..: : ::::: CCDS46 ELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFV 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KB9 VFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQQKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIP .::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 IFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIP 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KB9 RPLNKCQGLVFDIVTSQIFDIIIISLIILNMISMMAESYNQPKAMKSILDHLNWVFVVIF ::::: ::..:::::.: ::. :. :: :::..::.:. .: .:: ..: .::.:: CCDS46 RPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIF 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KB9 TLECLIKIFALRQYYFTNGWNLFDCVVVLLSIVSTMISTLENQEHIPFPPTLFRIVRLAR : ::..:. :::.:::::.::.:: :::.::::.:..: . :... : :::::..:::: CCDS46 TGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDI-IQKYF-FSPTLFRVIRLAR 1580 1590 1600 1610 1620 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KB9 IGRILRLVRAARGIRTLLFALMMSLPSLFNIGLLLFLIMFIYAILGMNWFSKVNPESGID :::::::.:.:.::::::::::::::.::::::::::.::::.:.:: :. :. :.::: CCDS46 IGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGID 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KB9 DIFNFKTFASSMLCLFQISTSAGWDSLLSPMLRSKES-C-------NSSSENCHLPGIAT :.:::.:::.::::::::.::::::.::::.: . : :.: .: :... CCDS46 DMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGI 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KB9 SYFVSYIIISFLIVVNMYIAVILENFNTATEESEDPLGEDDFDIFYEVWEKFDPEATQFI .:..:::::::::::::::.:::::..::::: .::.:::::.:::.:::::::::::: CCDS46 LFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFI 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KB9 KYSALSDFADALPEPLRVAKPNKYQFLVMDLPMVSEDRLHCMDILFAFTARVLGGSDGLD .::.:::::::: ::::.::::. ... ::::::: ::.:::::::::: :::: : .: CCDS46 EYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMD 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KB9 SMKAMMEEKFMEANPLKKLYEPIVTTTKRKEEERGAAIIQKAFRKYMMKVTKGDQGDQND ..: .:::::: ::: : ::::.:: .::.:: .: .::.:::..... CCDS46 ALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFR 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1770 1780 1790 pF1KB9 LENGPHSPLQTLCNGDLSSFGVAKGKVHCD CCDS46 QQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQ 1930 1940 1950 1960 1970 1980 >-- initn: 437 init1: 366 opt: 425 Z-score: 446.5 bits: 96.0 E(32554): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 425; 54.2% identity (79.7% similar) in 118 aa overlap (15-127:12-129) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MDDRCYPVIFPDERNFRPFTSDSLAAIEKRIAIQKEK-----KKSKDQTGEVPQPRPQLD .:: :: .::::::::.: .. . ..:.. : :::::: CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LKASRKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPF :.::.::: :::. :.::::.::::::::: ..:::.:::. .::.:::: .::....:: CCDS46 LQASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 NSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEAL . :: :... : CCDS46 HPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKIL 120 130 140 150 160 170 >>CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016 aa) initn: 5072 init1: 1032 opt: 2838 Z-score: 3036.4 bits: 575.2 E(32554): 8.3e-163 Smith-Waterman score: 5500; 51.3% identity (71.2% similar) in 1820 aa overlap (129-1750:131-1918) 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 TIYRFSAKHALFIFGPFNSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNN :::.:.:. :.. :::::: ... CCDS46 TIFRFSATNALYVLSPFHPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMA----QHDPPPW 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 TDIAECVFTGIYIFEALIKILARGFILDEFSFLRDPWNWLDSIVIGIAIVSYIPGITI-K : .: .::.:: ::.:.::::::: : :.:::::::::: :: .: :: .: . . CCDS46 TKYVEYTFTAIYTFESLVKILARGFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVS--ENIKLGN 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 LLPLRTFRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLRSVKKLVNVIILTFFCLSIFALVGQQLFMG : ::::::.::::.:::. ::.:::::..:::::..:..:: ::::.:::.: ::::: CCDS46 LSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMG 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 SLNLKCISRDCKNISNP-----------EAYDHCFEKKEN------SPEFKMCGIWMGNS .: ::. :. ... :. : . :: . . .:: . CCDS46 NLRHKCV-RNFTALNGTNGSVEADGLVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAG 280 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 ACSIQYECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWEKLYQQTLRTTGLYSVFFF .: :.: .. :::..::.::.:.:.:::.::::::: ::.:::::::..: ..:: CCDS46 TCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFF 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 IVVIFLGSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQEAQQLLKEEKEALVAMGI ..:::::::::.:: ::::.:::::::. . :: : ::: ::::...::.:.:::. :. CCDS46 MLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGV 400 410 420 430 440 450 450 460 pF1KB9 DRSSLTSLETSYFTP--------KKRKLFGN----------------------------- : : .::: : ..: :.:: ... CCDS46 DTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTR 460 470 480 490 500 510 470 pF1KB9 ----------KKRKSFFL-------------------------------------RESGK ..: :.: : :.. CCDS46 GLSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQ 520 530 540 550 560 570 480 490 500 pF1KB9 DQP-PGS-----------DSDEDCQK--------------------KPQLLEQTKRL--- :: ::. .: ::. .: .::. CCDS46 GQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTP 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 pF1KB9 -----------SQNLSLDHFDEHGDPLQRQRALSAVSILTITMKEQEKSQEPCLPCGENL :: .: :.: : :::::::::.:: ...: :.:.. : :: . : CCDS46 SEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPG---ARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRL 640 650 660 670 680 690 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 ASKYLVWNCCPQWLCVKKVLRTVMTDPFTELAITICIIINTVFLAMEHHKMEASFEKMLN :..::.:.::: :. .:. .. :. ::::.:.::.::..::.:.:.::..: . ::.::. CCDS46 AQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQ 700 710 720 730 740 750 620 630 640 650 660 670 pF1KB9 IGNLVFTSIFIAEMCLKIIALDPYHYFRRGWNIFDSIVALLSFADVMNCVLQKRSWPFLR .::::::.:: ::: .::::::::.::..::::::::...::. .. ... : :: CCDS46 VGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLS--VLR 760 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 pF1KB9 SFRVLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGSLTVVLVIVIFIFSVVGMQLFGRSFNSQ :::.::::::::::::::::::::::::::::.::.::.:..:::.::::::::.... CCDS46 SFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSEL 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 KSPKLCNPTGPTVSCLRHWHMGDFWHSFLVVFRILCGEWIENMWECMQEANASSSLCVIV .. . .: : .::: ::.:.::..::::::::::.::.::. . ..:::..: CCDS46 RD----SDSG----LLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWIETMWDCMEVS--GQSLCLLV 870 880 890 900 910 800 810 820 830 840 pF1KB9 FILITVIGKLVVLNLFIALLLNSFSNEERNGNLEGEARK-TKVQLALDRFRRAFCFVRHT :.:. :::.:::::::.::::.::: . : . : :. ...:::: :..:.. ::..: CCDS46 FLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSAD--NLTAPDEDREMNNLQLALARIQRGLRFVKRT 920 930 940 950 960 970 850 860 870 880 890 900 pF1KB9 LEHFCHKWCRKQNLPQQKEVAGG----CAAQSKDIIPLVMEMKRGSETQEELGILTSVPK :: :.. .: : : : . : : .. :..: . . CCDS46 TWDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPP--PETEKVPPTRKETRFEEGEQP 980 990 1000 1010 1020 1030 910 920 930 940 950 960 pF1KB9 TLGVRHDWTWL-APLAEEEDDVEFSGEDNAQRITQPEP---EQQAYELHQENKKPTSQRV :. : . .:.: :.:.. . ::. . . : .:.. . . : ..:. CCDS46 GQGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQQESQPVSGGPEAPPDSRT 1040 1050 1060 1070 1080 1090 970 980 990 1000 pF1KB9 QS-VEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVTSILSEC-----------STIDLQDGFGWLPEM : : :: : . : :.. . : :: :. . . : :. CCDS46 WSQVSATASSEAEASASQADWRQQWKAEPQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNT-AELLEQ 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB9 VPK-----KQPERCLPKGFGC---CFPCCSVDKRKPPWVIWWNLRKTCYQIVKHSWFESF .: :.:: :. . :: : :::.:: . : .:: ::::::.::.:::::.: CCDS46 IPDLGQDVKDPEDCFTE--GCVRRC-PCCAVDTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETF 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB9 IIFVILLSSGALIFEDVHLENQPKIQELLNCTDIIFTHIFILEMVLKWVAFGFGKYFTSA :::.:::::::: :::..::.. :. ::. .: .::..:.:::.:::::.:: ::::.: CCDS46 IIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNA 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB9 WCCLDFIIVIVSVTTLI-------NLMELKSFRTLRALRPLRALSQFEGMKVVVNALIGA :: :::.:: ::...:. .. .::.:::::::::::::.::::.::::::.:: CCDS46 WCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGA 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB9 IPAILNVLLVCLIFWLVFCILGVYFFSGKFGKCINGT--DSVINYTIITNKSQCES---- ::.:.:::::::::::.: :.:: .:.::::.::: : : .::::..::::::: CCDS46 IPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNKSQCESLNLT 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KB9 GNFSWINQKVNFDNVGNAYLALLQVATFKGWMDIIYAAVDSTEKEQQPEFESNSLGYIYF :.. : . :::::::: .::::::::::::::::.:::::: :.::..: : :::: CCDS46 GELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYF 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KB9 VVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQQKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPI :.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 VIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPI 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KB9 PRPLNKCQGLVFDIVTSQIFDIIIISLIILNMISMMAESYNQPKAMKSILDHLNWVFVVI :::::: ::..:::::.: ::. :. :: :::..::.:. .: .:: ..: .::.: CCDS46 PRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAI 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KB9 FTLECLIKIFALRQYYFTNGWNLFDCVVVLLSIVSTMISTLENQEHIPFPPTLFRIVRLA :: ::..:. :::.:::::.::.:: :::.::::.:..: . :... : :::::..::: CCDS46 FTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDI-IQKYF-FSPTLFRVIRLA 1580 1590 1600 1610 1620 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KB9 RIGRILRLVRAARGIRTLLFALMMSLPSLFNIGLLLFLIMFIYAILGMNWFSKVNPESGI ::::::::.:.:.::::::::::::::.::::::::::.::::.:.:: :. :. :.:: CCDS46 RIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGI 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KB9 DDIFNFKTFASSMLCLFQISTSAGWDSLLSPMLRSKES-C-------NSSSENCHLPGIA ::.:::.:::.::::::::.::::::.::::.: . : :.: .: :... CCDS46 DDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVG 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KB9 TSYFVSYIIISFLIVVNMYIAVILENFNTATEESEDPLGEDDFDIFYEVWEKFDPEATQF .:..:::::::::::::::.:::::..::::: .::.:::::.:::.::::::::::: CCDS46 ILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQF 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KB9 IKYSALSDFADALPEPLRVAKPNKYQFLVMDLPMVSEDRLHCMDILFAFTARVLGGSDGL :.::.:::::::: ::::.::::. ... ::::::: ::.:::::::::: :::: : . CCDS46 IEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEM 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KB9 DSMKAMMEEKFMEANPLKKLYEPIVTTTKRKEEERGAAIIQKAFRKYMMKVTKGDQGDQN :..: .:::::: ::: : ::::.:: .::.:: .: .::.:::..... CCDS46 DALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLF 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1770 1780 1790 pF1KB9 DLENGPHSPLQTLCNGDLSSFGVAKGKVHCD CCDS46 RQQAGSGLSEEDAPEREGLIAYVMSENFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNL 1930 1940 1950 1960 1970 1980 >-- initn: 376 init1: 376 opt: 435 Z-score: 457.3 bits: 98.0 E(32554): 3.8e-19 Smith-Waterman score: 435; 54.6% identity (79.8% similar) in 119 aa overlap (15-128:12-130) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MDDRCYPVIFPDERNFRPFTSDSLAAIEKRIAIQKEK-----KKSKDQTGEVPQPRPQLD .:: :: .::::::::.: .. . ..:.. : :::::: CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQESREGLPEEEAPRPQLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 LKASRKLPKLYGDIPRELIGKPLEDLDPFYRNHKTFMVLNRKRTIYRFSAKHALFIFGPF :.::.::: :::. :.::::.::::::::: ..:::.:::. .::.:::: .::....:: CCDS46 LQASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 NSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNNTDIAECVFTGIYIFEAL . :: :... :: CCDS46 HPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKIL 120 130 140 150 160 170 >>CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016 aa) initn: 5077 init1: 1032 opt: 2838 Z-score: 3036.4 bits: 575.2 E(32554): 8.3e-163 Smith-Waterman score: 5497; 51.1% identity (71.2% similar) in 1819 aa overlap (129-1750:131-1918) 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 TIYRFSAKHALFIFGPFNSIRSLAIRVSVHSLFSMFIIGTVIINCVFMATGPAKNSNSNN :::.:.:. :.. :::::: ... CCDS46 TIFRFSATNALYVLSPFHPIRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMA----QHDPPPW 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 TDIAECVFTGIYIFEALIKILARGFILDEFSFLRDPWNWLDSIVIGIAIVSYIPGITIKL : .: .::.:: ::.:.::::::: : :.:::::::::: :: .: .. . . .. CCDS46 TKYVEYTFTAIYTFESLVKILARGFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLG-NV 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 LPLRTFRVFRALKAISVVSRLKVIVGALLRSVKKLVNVIILTFFCLSIFALVGQQLFMGS ::::::.::::.:::.: ::.:::::..:::::..:..:: ::::.:::.: :::::. CCDS46 SALRTFRVLRALKTISVISGLKTIVGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGN 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 LNLKCISRDCKNISNP-----------EAYDHCFEKKEN------SPEFKMCGIWMGNSA : ::. :. ... :. : . :: . . .:: .. CCDS46 LRHKCV-RNFTALNGTNGSVEADGLVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGT 280 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 CSIQYECKHTKINPDYNYTNFDNFGWSFLAMFRLMTQDSWEKLYQQTLRTTGLYSVFFFI : :.: .. :::..::.::.:.:.:::.::::::: ::.:::::::..: ..::. CCDS46 CPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFM 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 VVIFLGSFYLINLTLAVVTMAYEEQNKNVAAEIEAKEKMFQEAQQLLKEEKEALVAMGID .:::::::::.:: ::::.:::::::. . :: : ::: ::::...::.:.:::. :.: CCDS46 LVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVD 400 410 420 430 440 450 450 460 pF1KB9 RSSLTSLETSYFTP--------KKRKLFGN------------------------------ : .::: : ..: :.:: ... CCDS46 TVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKRRKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRG 460 470 480 490 500 510 470 pF1KB9 ---------KKRKSFFL-------------------------------------RESGKD ..: :.: : :.. CCDS46 LSRTSMKPRSSRGSIFTFRRRDLGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQG 520 530 540 550 560 570 480 490 500 pF1KB9 QP-PGS-----------DSDEDCQK--------------------KPQLLEQTKRL---- :: ::. .: ::. .: .::. CCDS46 QPSPGTSAPGHALHGKKNSTVDCNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPS 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 pF1KB9 ----------SQNLSLDHFDEHGDPLQRQRALSAVSILTITMKEQEKSQEPCLPCGENLA :: .: :.: : :::::::::.:: ...: :.:.. : :: . :: CCDS46 EEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEPG---ARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLA 640 650 660 670 680 690 560 570 580 590 600 610 pF1KB9 SKYLVWNCCPQWLCVKKVLRTVMTDPFTELAITICIIINTVFLAMEHHKMEASFEKMLNI ..::.:.::: :. .:. .. :. ::::.:.::.::..::.:.:.::..: . ::.::.. CCDS46 QRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMDPFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQV 700 710 720 730 740 750 620 630 640 650 660 670 pF1KB9 GNLVFTSIFIAEMCLKIIALDPYHYFRRGWNIFDSIVALLSFADVMNCVLQKRSWPFLRS ::::::.:: ::: .::::::::.::..::::::::...::. .. ... : ::: CCDS46 GNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLS--VLRS 760 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 pF1KB9 FRVLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGSLTVVLVIVIFIFSVVGMQLFGRSFNSQK ::.::::::::::::::::::::::::::::.::.::.:..:::.::::::::.... . CCDS46 FRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELR 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KB9 SPKLCNPTGPTVSCLRHWHMGDFWHSFLVVFRILCGEWIENMWECMQEANASSSLCVIVF . . .: : .::: ::.:.::..::::::::::.::.::. . ..:::..:: CCDS46 D----SDSG----LLPRWHMMDFFHAFLIIFRILCGEWIETMWDCMEVS--GQSLCLLVF 870 880 890 900 910 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 ILITVIGKLVVLNLFIALLLNSFSNEERNGNLEGEARK-TKVQLALDRFRRAFCFVRHTL .:. :::.:::::::.::::.::: . : . : :. ...:::: :..:.. ::..: CCDS46 LLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSAD--NLTAPDEDREMNNLQLALARIQRGLRFVKRTT 920 930 940 950 960 970 860 870 880 890 900 pF1KB9 EHFCHKWCRKQNLPQQKEVAGG----CAAQSKDIIPLVMEMKRGSETQEELGILTSVPKT :: :.. .: : : : . : : .. :..: . . CCDS46 WDFCCGLLRQRPQKPAALAAQGQLPSCIATPYSPPP--PETEKVPPTRKETRFEEGEQPG 980 990 1000 1010 1020 1030 910 920 930 940 950 960 pF1KB9 LGVRHDWTWL-APLAEEEDDVEFSGEDNAQRITQPEP---EQQAYELHQENKKPTSQRVQ :. : . .:.: :.:.. . ::. . . : .:.. . . : ..:. CCDS46 QGTPGDPEPVCVPIAVAESDTDDQEEDEENSLGTEEESSKQQESQPVSGGPEAPPDSRTW 1040 1050 1060 1070 1080 1090 970 980 990 1000 1010 pF1KB9 S-VEIDMFSEDEPHLTIQDPRKKSDVTSILSEC-----------STIDLQDGFGWLPEMV : : :: : . : :.. . : :: :. . . : :.. 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