FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3349, 1034 aa 1>>>pF1KE3349 1034 - 1034 aa - 1034 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8466+/-0.000377; mu= 6.4021+/- 0.024 mean_var=211.0699+/-46.881, 0's: 0 Z-trim(118.6): 11 B-trim: 1518 in 1/56 Lambda= 0.088280 statistics sampled from 31768 (31780) to 31768 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16 Scan time: 14.700 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016883129 (OMIM: 614118) PREDICTED: teashirt ho (1034) 6869 888.5 0 NP_775756 (OMIM: 614118) teashirt homolog 2 isofor (1034) 6869 888.5 0 NP_001180350 (OMIM: 614118) teashirt homolog 2 iso (1031) 6780 877.2 0 XP_016883130 (OMIM: 614118) PREDICTED: teashirt ho ( 995) 6596 853.7 0 XP_005266698 (OMIM: 607842,614427) PREDICTED: teas (1032) 1972 264.8 1.8e-69 NP_005777 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 (1032) 1972 264.8 1.8e-69 NP_001295139 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolo (1077) 1972 264.8 1.8e-69 NP_065907 (OMIM: 614119) teashirt homolog 3 [Homo (1081) 1114 155.5 1.4e-36 >>XP_016883129 (OMIM: 614118) PREDICTED: teashirt homolo (1034 aa) initn: 6869 init1: 6869 opt: 6869 Z-score: 4739.1 bits: 888.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6869; 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XP_005 GGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLP-GTVKPLPAAVQSVQVQPSY 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 pF1KE3 TNKLRPIAPKWKVMPLVSMPTHLAPYTQVKKESEDKDEAVKECGK-------ESPHEEAS .. .. .. . :. : :.: . .. : .. . : :: . :..: : XP_005 AGGVKSLSSAEH-NALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKVNIKKEERPPEKEKS 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 pF1KE3 SFSHS------EGDSFRKSETPPEAKKTELGPLKEEEKLMKEGS-EKEKPQPLEPTSA-L :.... :. .: :.: .: . :: : : ::: . . :. :: .: . XP_005 SLAKAASPIAKENKDFPKTEEVS-GKPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEPLKAKV 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 SNGCA----LANHAPALPCINPLSALQSVLNNHLGKATEPLRSPSCSSPSSSTISMFHKS .::: . .:.: :::::::::..:.::::...:. ::: . ..:..: XP_005 TNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPV------SPSLDPLAMLYKI 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 NLNVMDKPVLSPASTRSASVSRRYLFENSDQPIDLTKSKSKKAESSQAQSCMSPPQKHAL . ...:::: . ...:.. :: .:::::::::::::.: :: :.: :: .. :: XP_005 SNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVADSVASPLRESAL 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 SDIADMVKVLPKATTPKPASSSRVPPMKLEMDVRRFEDVSSEVSTLHKRKGRQSNWNPQH ::.:::: : ::: .. : : : . : ::.. .:.: .:::::::::::::: XP_005 MDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSE-KSDADGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQH 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 LLILQAQFASSLFQTSEGKYLLSDLGPQERMQISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRKTGG :::::::::::: .:.::::..::::::::..::::::::::::::::::::::::.::: XP_005 LLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGG 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 pF1KE3 TKFLKNMDKGHPIFYCSDCASQFRTPSTYISHLESHLGFQMKDMTRLSVDQQSKVEQEIS ::::::.: :::.:.:.:::::::: ::::::::.::::..::...: ..: .. .:..: XP_005 TKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQE-QQNVS 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 RVSSAQRSPETIAAEEDTDSKFKCKLCCRTFVSKHAVKLHLSKTHSKSPEHHSQFVTDVD .: . . :.::: : :.:::: :::.:::::::::::::.:::: : .::... XP_005 KVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELE 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 EE .. XP_005 KQ >>NP_005777 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 iso (1032 aa) initn: 2613 init1: 762 opt: 1972 Z-score: 1368.4 bits: 264.8 E(85289): 1.8e-69 Smith-Waterman score: 3203; 51.6% identity (72.3% similar) in 1052 aa overlap (51-1034:3-1032) 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 LKEEEEIKEEEEEEDSGSVAQLQGGNDTGTDEELETGPEQKGCFSYQNSPGSHLSNQDAE .:: : : :::::: : .:::: NP_005 MCNEETEIKEAQ----SYQNSPVSSATNQDAG 10 20 90 100 110 120 130 pF1KE3 NESLLSDASDQVSDIKSVCGRDAS-DKKAHTHVRLPNEAHNCMDKMTAVYANILSDSYWS : .:..:::.. .:. .:. . : . : :... . .. :::::..:.: :: NP_005 YGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDSVSYPQDS---LAQIKAVYANLFSESCWS 30 40 50 60 70 80 140 150 pF1KE3 GLGLGFKLSNSERRNCD----------------------------------------TRN .:.: .: :.: . : : . NP_005 SLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPVSTTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTS 90 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 GSNKSDFDWHQDALSKSLQQNLPSRSVSKPSLFSSVQLYRQSSKMCGTVFTGASRFRCRQ :..: .:::: ::.:.:::. . .:::::.::::::..:. :.::::::.:::.. NP_005 TSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFSTVQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKD 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 CSAAYDTLVELTVHMNETGHYQDDNRKKDKLRPTSYSKPRKRAFQDMD-KEDAQKVLKCM :::::::::::::::::::::.:::: ::. . .::::::....:. ::::::::::: NP_005 CSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCM 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 FCGDSFDSLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPTISSKMVTPAKKRVF-DVNRPCSPD--- .:: ::.:::::::::::::::::::::::::.:. :.: .:::.. :. ::::. NP_005 YCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT-KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAG 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 -STTGSFADSFSSQKNANLQLSSNNRYGYQNGASYTWQFEACKSQILKCMECGSSHDTLQ .. ....: ..:: :: .. :::::::::::::::::: :.:::::::::::::::: NP_005 MAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQ 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 QLTTHMMVTGHFLKVTSSASKKGKQLVLDPLAVEKMQSLSEAPNSDSLAPKPSSNSASDC :::.::::::::::::.:::::::::::::.. ::.::. :.. . : : .. : NP_005 QLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKIQSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDS 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 TA--STTELKKESKKERPEETSKDEKVVKSEDYEDPLQKPLDPTIKYQYLREEDLEDGSK : .:.: ::: .::.: .. ::. .:. :: :.: ..:. : :::::::.:. : NP_005 PAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKI--KEESEDSLEK-FEPSTLYPYLREEDLDDSPK 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 GGGDILKSLENTVTTAINKAQNGAPSWSAYPSIHAAYQLSEGTKPPLPMGSQVLQIRPNL :: ::::::::::.:::.:::::::::..:::::::::: :: ::: . : .:..:. NP_005 GGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLP-GTVKPLPAAVQSVQVQPSY 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 pF1KE3 TNKLRPIAPKWKVMPLVSMPTHLAPYTQVKKESEDKDEAVKECGK-------ESPHEEAS .. .. .. . :. : :.: . .. : .. . : :: . :..: : NP_005 AGGVKSLSSAEH-NALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKVNIKKEERPPEKEKS 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 pF1KE3 SFSHS------EGDSFRKSETPPEAKKTELGPLKEEEKLMKEGS-EKEKPQPLEPTSA-L :.... :. .: :.: .: . :: : : ::: . . :. :: .: . NP_005 SLAKAASPIAKENKDFPKTEEVS-GKPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEPLKAKV 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 SNGCA----LANHAPALPCINPLSALQSVLNNHLGKATEPLRSPSCSSPSSSTISMFHKS .::: . .:.: :::::::::..:.::::...:. ::: . ..:..: NP_005 TNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPV------SPSLDPLAMLYKI 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 NLNVMDKPVLSPASTRSASVSRRYLFENSDQPIDLTKSKSKKAESSQAQSCMSPPQKHAL . ...:::: . ...:.. :: .:::::::::::::.: :: :.: :: .. :: NP_005 SNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVADSVASPLRESAL 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 SDIADMVKVLPKATTPKPASSSRVPPMKLEMDVRRFEDVSSEVSTLHKRKGRQSNWNPQH ::.:::: : ::: .. : : : . : ::.. .:.: .:::::::::::::: NP_005 MDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSE-KSDADGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQH 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 LLILQAQFASSLFQTSEGKYLLSDLGPQERMQISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRKTGG :::::::::::: .:.::::..::::::::..::::::::::::::::::::::::.::: NP_005 LLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGG 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 pF1KE3 TKFLKNMDKGHPIFYCSDCASQFRTPSTYISHLESHLGFQMKDMTRLSVDQQSKVEQEIS ::::::.: :::.:.:.:::::::: ::::::::.::::..::...: ..: .. .:..: NP_005 TKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQE-QQNVS 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 RVSSAQRSPETIAAEEDTDSKFKCKLCCRTFVSKHAVKLHLSKTHSKSPEHHSQFVTDVD .: . . :.::: : :.:::: :::.:::::::::::::.:::: : .::... NP_005 KVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELE 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 EE .. NP_005 KQ >>NP_001295139 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 (1077 aa) initn: 2723 init1: 762 opt: 1972 Z-score: 1368.1 bits: 264.8 E(85289): 1.8e-69 Smith-Waterman score: 3244; 51.0% identity (71.9% similar) in 1090 aa overlap (13-1034:13-1077) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPRRKQQAPKRAAGYAQEEQLKEEEEIKEEEEEEDSGSVAQLQGGNDTGTDEELETGPEQ :.:. ::.:: : .::. ::.: ..: .. .:: : : NP_001 MPRRKQQAPRRSAAYVPEEELKAAE--IDEEHVEDDGLSLDIQE-SEYMCNEETEIKEAQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 KGCFSYQNSPGSHLSNQDAENESLLSDASDQVSDIKSVCGRDAS-DKKAHTHVRLPNEAH :::::: : .:::: : .:..:::.. .:. .:. . : . : :... 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NP_001 -GTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSA-EHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVE 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 pF1KE3 KECGK-------ESPHEEASSFSHS------EGDSFRKSETPPEAKKTELGPLKEEEKLM : :: . :..: ::.... :. .: :.: .: . :: : : NP_001 KVTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAKENKDFPKTEEVS-GKPQKKGPEAETGKAK 650 660 670 680 690 700 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 KEGS-EKEKPQPLEPTSA-LSNGCA----LANHAPALPCINPLSALQSVLNNHLGKATEP ::: . . :. :: .: ..::: . .:.: :::::::::..:.::::...: NP_001 KEGPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKP 710 720 730 740 750 760 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 LRSPSCSSPSSSTISMFHKSNLNVMDKPVLSPASTRSASVSRRYLFENSDQPIDLTKSKS . ::: . ..:..: . ...:::: . ...:.. :: .:::::::::::::. NP_001 V------SPSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKN 770 780 790 800 810 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 KKAESSQAQSCMSPPQKHALSDIADMVKVLPKATTPKPASSSRVPPMKLEMDVRRFEDVS : :: :.: :: .. :: ::.:::: : ::: .. : : : . : ::.. 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