FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1869, 390 aa 1>>>pF1KE1869 390 - 390 aa - 390 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7552+/-0.00063; mu= 15.4694+/- 0.038 mean_var=76.0850+/-15.128, 0's: 0 Z-trim(111.8): 39 B-trim: 9 in 1/53 Lambda= 0.147036 statistics sampled from 12628 (12667) to 12628 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.389), width: 16 Scan time: 3.200 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 ( 390) 2658 572.7 2e-163 CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 ( 412) 700 157.3 2.3e-38 CCDS1521.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 414) 699 157.1 2.6e-38 CCDS44318.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 442) 699 157.1 2.8e-38 CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 327 78.2 1.4e-14 CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 317 76.1 6.6e-14 CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 293 71.0 2.2e-12 CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 290 70.3 3e-12 CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 290 70.4 3.2e-12 >>CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 (390 aa) initn: 2658 init1: 2658 opt: 2658 Z-score: 3047.5 bits: 572.7 E(32554): 2e-163 Smith-Waterman score: 2658; 99.7% identity (99.7% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 MPPSGLRLLPLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 SPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 SPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 YDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 YLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 YLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 TGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 TGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 DFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 DFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 LEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS 370 380 390 >>CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 (412 aa) initn: 1022 init1: 669 opt: 700 Z-score: 802.4 bits: 157.3 E(32554): 2.3e-38 Smith-Waterman score: 1093; 46.3% identity (67.6% similar) in 410 aa overlap (15-390:9-412) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA :. : .:. . . .:::: :.:. .:.::.:::::::::::::. CCDS98 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 SPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRD---RVAGESAE--PEPEPEADYYAKEVTRVLMVE ::: . .: :::::::::. .. :: : . . :..:::::. . :.. CCDS98 SPPEPTVMTH--VPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ---THNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRL----KLKVEQHV :::. : : ... : :.: ... . : :::.:.::. . . ::.. CCDS98 GLAEHNELAVCPKGITSKVFRF-NVSSVEKNRTN---LFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 ELYQKYSNN----SWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCS ::.: . . ::.... : . :::::::: .::.:: : :...: :: CCDS98 ELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCP 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 C-------DSRDN---TLQVDINGFTTGR---RGDLATIHGM---NRPFLLLMATPLERA : : .: .... ..: . ::::. .. . . : :.:: : .: CCDS98 CHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRL 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 QH--LQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPC .. ..:..::::::::: . :.::::: ::::::.::::::.::::::.:::: ::: CCDS98 DNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPC 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 PYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRS ::. : :: .: ::.::: :: :::.:::::: :::: :.::::: :::::::::.:.: CCDS98 PYLRSADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKS 350 360 370 380 390 400 390 pF1KE1 CKCS :::: CCDS98 CKCS 410 >>CCDS1521.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 (414 aa) initn: 1019 init1: 653 opt: 699 Z-score: 801.2 bits: 157.1 E(32554): 2.6e-38 Smith-Waterman score: 1086; 45.1% identity (67.0% similar) in 412 aa overlap (18-390:9-414) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA .:.: : .::::.:.::. :::::::::::::::.:. CCDS15 MHYCVLSAFLILHLVTVALSLSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 SPPSQGEVP-PGPLPEAVLALYNSTRD----RVAGESAEPEPE-PEADYYAKEVTRVLM- ::: . : : .: :...:::::: ... ..: : : . .:::::: .. : CCDS15 SPPE--DYPEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMP 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KE1 --VETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRL---KLKV-EQH ..: : : . : . :..: ... . . : .::.:..:: : .: ::. CCDS15 PFFPSENAIPPTFYRPYFRI-VRFDVSAMEKNASN---LVKAEFRVFRLQNPKARVPEQR 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VELYQ-----KYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAH .:::: .. . ::...... :::::::: .:..:: . . ::..: : CCDS15 IELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSFDVTDAVHEWLHHKDRNLGFKISLH 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 CSC-----------DSRDNTLQV---DINGFTTGRRGDLATIHGMNR------PFLLLMA : : .... :.. :.: .: :: ::.. . : :::: CCDS15 CPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTSGDQKTIKSTRKKNSGKTPHLLLML 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 TPLERAQHLQSSRHR-RALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANF : : . :..:.. ::::. ::: ... :::.: :::::..:::::::::::::.::: CCDS15 LPSYRLESQQTNRRKKRALDAAYCFRNVQDNCCLRPLYIDFKRDLGWKWIHEPKGYNANF 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 CLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSN : : :::.:: :::.:.::.::: :: :::.:::: : :::: :.::.:. ::.::::: CCDS15 CAGACPYLWSSDTQHSRVLSLYNTINPEASASPCCVSQDLEPLTILYYIGKTPKIEQLSN 350 360 370 380 390 400 390 pF1KE1 MIVRSCKCS :::.::::: CCDS15 MIVKSCKCS 410 >>CCDS44318.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 (442 aa) initn: 1040 init1: 653 opt: 699 Z-score: 800.8 bits: 157.1 E(32554): 2.8e-38 Smith-Waterman score: 1025; 43.4% identity (63.7% similar) in 424 aa overlap (30-390:21-442) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA ::::.:.::. :::::::::::::::.:. CCDS44 MHYCVLSAFLILHLVTVALSLSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 SPPSQGEVP-PGPLPEAVLALYNSTRD----RVAGESAEPEPE-PEADYYAKEVTRVLM- ::: . : : .: :...:::::: ... ..: : : . .:::::: .. : CCDS44 SPPE--DYPEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMP 60 70 80 90 100 120 130 140 pF1KE1 ----VETHNEIYDKFKQSTHSI----------YM----------FFNTSELREAVPEPVL :: . . :. :. :. .: .. .. : CCDS44 PFFPSETVCPVVTTPSGSVGSLCSRQSQVLCGYLDAIPPTFYRPYFRIVRFDVSAMEKNA 110 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 pF1KE1 --LSRAELRLLRL---KLKV-EQHVELYQ-----KYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSF : .::.:..:: : .: ::..:::: .. . ::...... ::::: CCDS44 SNLVKAEFRVFRLQNPKARVPEQRIELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSF 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 pF1KE1 DVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSC-----------DSRDNTLQV---DINGFTTGRR ::: .:..:: . . ::..: :: : .... :.. :.: .: CCDS44 DVTDAVHEWLHHKDRNLGFKISLHCPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTS 230 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 pF1KE1 GDLATIHGMNR------PFLLLMATPLERAQHLQSSRHR-RALDTNYCFSSTEKNCCVRQ :: ::.. . : :::: : : . :..:.. ::::. ::: ... :::.: CCDS44 GDQKTIKSTRKKNSGKTPHLLLMLLPSYRLESQQTNRRKKRALDAAYCFRNVQDNCCLRP 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 LYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCV :::::..:::::::::::::.:::: : :::.:: :::.:.::.::: :: :::.:::: CCDS44 LYIDFKRDLGWKWIHEPKGYNANFCAGACPYLWSSDTQHSRVLSLYNTINPEASASPCCV 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 pF1KE1 PQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS : :::: :.::.:. ::.::::::::.::::: CCDS44 SQDLEPLTILYYIGKTPKIEQLSNMIVKSCKCS 410 420 430 440 >>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa) initn: 269 init1: 114 opt: 327 Z-score: 375.0 bits: 78.2 E(32554): 1.4e-14 Smith-Waterman score: 339; 27.9% identity (53.4% similar) in 427 aa overlap (4-389:3-395) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MPPSGLRLLL-LLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRG-------- .: : :: :::: :: : :::: :: .:: : : CCDS13 MVAGTRCLLALLLPQ----VLLGG--AAGLVP------ELGRRKFAAASSGRPSSQPSD 10 20 30 40 60 70 80 90 100 pF1KE1 QILSK--LRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYN-STRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEV ..::. ::: : . . : : .::. : . : .:. . : :. . . :... CCDS13 EVLSEFELRLLSMFGLKQRPT-PSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRA 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 TRVLMVETHNEIYDKFKQSTHSI--YMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLK--- . : . :.: ... ... . .::: : ..: ... :::...: ... CCDS13 NTVRSFH-HEESLEELPETSGKTTRRFFFNLS----SIPTEEFITSAELQVFREQMQDAL 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 -----VEQHVELYQ---KYSNNSW----RYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRG ......:. . :: : :..::. . : .: ::::: .: .: ..: CCDS13 GNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNAS-RWESFDVTPAVMRWTAQG 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 pF1KE1 GEIEGFRLS-AHCSCDSRDNTLQVDINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMAT-----PL .:: . :: . . .: :. . . . : ::.:. .. :: CCDS13 HANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQI----RPLLVTFGHDGKGHPL 230 240 250 260 270 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 ERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQ-LYIDFRKDLGWK-WIHEPKGYHANFCL .. .. :.....: . :. : :. ::.:: .:.::. :: : :::: .: CCDS13 HKREKRQAKHKQR---------KRLKSSCKRHPLYVDF-SDVGWNDWIVAPPGYHAFYCH 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 GPCPYIWS--LD-TQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYY-VGRKPKVEQL : ::. . :. :... : .: :. : : :::: : . ..: ..: ... CCDS13 GECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKA-CCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNY 330 340 350 360 370 380 380 390 pF1KE1 SNMIVRSCKCS ..:.:..: : CCDS13 QDMVVEGCGCR 390 >>CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 (426 aa) initn: 322 init1: 143 opt: 317 Z-score: 363.1 bits: 76.1 E(32554): 6.6e-14 Smith-Waterman score: 352; 26.6% identity (49.7% similar) in 447 aa overlap (1-390:1-426) 10 20 30 40 pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVL---TPGRP----AAGLSTCKTI----DMELVKRKRIEAI :: :: .: : :..: ::: : .: :. . . .::. CCDS54 MPLLWLRGFL--LASCWIIVRSSPTPGSEGHSAAPDCPSCALAALPKDVPNSQPEMVEAV 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 RGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVT . .::. :.: . :. . :.:.: :: :. : .:. .: : .... CCDS54 KKHILNMLHLKKRPDVTQ----PVPKA--ALLNAIRKLHVGKVGENGYVEIEDDIGRRAE 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 RVLMVETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLL-------RLKL ..: .:: ...: . :. : .:. :. :::. :. : . CCDS54 MNELMEQTSEIITFAESGTARKTLHFEIS--KEGSDLSVV-ERAEVWLFLKVPKANRTRT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 KVEQHVELYQKYSNNSWR-----------------YLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVR :: .. ::. ..: ::.... : : : :.. .. CCDS54 KVTIRLFQQQKHPQGSLDTGEEAEEVGLKGERSELLLSEKVVDARKST-WHVFPVSSSIQ 170 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 pF1KE1 QWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQV-------------DINGFTTGRRGDLATIHG . :..: :.. . .:. .: . .: : : . CCDS54 RLLDQGKSSLDVRIACE-QCQESGASLVLLGKKKKKEEEGEGKKKGGGEGGAGADEEKEQ 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 MNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWK-WI .::::.:.: : : :.::.:. : .. . :: .:....: ::.::. :: CCDS54 SHRPFLMLQARQSEDHPH---RRRRRGLE---C-DGKVNICCKKQFFVSF-KDIGWNDWI 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 pF1KE1 HEPKGYHANFCLGPCP-YIWSLDTQ----YSKVLALYNQ--HNPGASAAPCCVPQALEPL :.:::::.: : :: .: . . . .: :. : . :.: :. :::: :.:. CCDS54 IAPSGYHANYCEGECPSHIAGTSGSSLSFHSTVINHYRMRGHSPFANLKSCCVPTKLRPM 340 350 360 370 380 390 370 380 390 pF1KE1 PIVYYV-GRKPKVEQLSNMIVRSCKCS ..:: :.. ....::::. : :: CCDS54 SMLYYDDGQNIIKKDIQNMIVEECGCS 400 410 420 >>CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 (407 aa) initn: 292 init1: 114 opt: 293 Z-score: 335.9 bits: 71.0 E(32554): 2.2e-12 Smith-Waterman score: 383; 29.4% identity (51.8% similar) in 361 aa overlap (45-390:75-407) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 LLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQG-EVPPGPL :.:.:..:::::::: :. . :: : CCDS88 GERSSRPAPSVAPEPDGCPVCVWRQHSRELRLESIKSQILSKLRLKEAPNISREVVKQLL 50 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 pF1KE1 PEAV-LALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEAD-YYAKEVTRVLMV-ETHNEIY-DKFKQSTH :.: : . .: :.. .:: : : :.: : . :. :: . : : CCDS88 PKAPPLQQILDLHD-FQGDALQPEDFLEEDEYHATTETVISMAQETDPAVQTDGSPLCCH 110 120 130 140 150 160 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SIY----MFFNTSELR-----EAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWR . :: .. . . . ::.:. . :..:::: . . . . : CCDS88 FHFSPKVMFTKVLKAQLWVYLRPVPRPATVY---LQILRLKPLTGEGTAGGGGGGRRHIR 170 180 190 200 210 220 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 YLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFT : .. : : .: :.: :...:. . :....: : . : : : CCDS88 IRSLKIELHSRSGHWQSIDFKQVLHSWFRQPQSNWGIEINAF---DPSGTDLAVTSLG-- 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 TGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYI : .: .: ::. : . :: ...: :: : . :.:. :: : . 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CCDS89 VTDS--TSAYSSLLTFHLS-----TPRSHHLYHARLWLHVLPTLPGTLCLRIF-RWGPRR 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 WRYLSNRLLAPSDSPE--W--LSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQV : : ::: . : :.. .:. :: . ..:. : . CCDS89 RRQGSRTLLAEHHITNLGWHTLTLPSSGL------RGEKSGVLKLQLDCR--------PL 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 DINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCC . :. .::. : : ..::: : ::.. ..: :: : : .: :: CCDS89 EGNSTVTGQPRRLLDTAGHQQPFLELKI----RANEPGAGRARRRTPT--CEPATPL-CC 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KE1 VRQLYIDFRKDLGWK-WIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLD-----TQYSKVLALYNQHNP :. :.:: ..:::. :: .:.::. :.: : :: . . . .: :..: . .:: CCDS89 RRDHYVDF-QELGWRDWILQPEGYQLNYCSGQCPPHLAGSPGIAASFHSAVFSLLKANNP 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 pF1KE1 GASAAPCCVPQALEPLPIVY--YVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS ... :::: : .:: ..: . : :.. . .:.:..: :: CCDS89 WPASTSCCVPTARRPLSLLYLDHNGNVVKTD-VPDMVVEACGCS 310 320 330 340 350 >>CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 (375 aa) initn: 348 init1: 112 opt: 290 Z-score: 333.0 bits: 70.4 E(32554): 3.2e-12 Smith-Waterman score: 406; 27.9% identity (52.4% similar) in 359 aa overlap (42-390:49-375) 20 30 40 50 60 pF1KE1 LLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQGE---- : .:::::. :::::::: . :. .. CCDS23 GPVDLNENSEQKENVEKEGLCNACTWRQNTKSSRIEAIKIQILSKLRLETAPNISKDVIR 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 --VPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEIYDKFK .: .: . .. :. :: . : : . ::.: : .. . :.... . CCDS23 QLLPKAPPLRELIDQYDVQRDDSSDGSLEDD-----DYHATTET-IITMPTESDFLMQVD 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 QSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWRYLSNR . . .. :... . : . : :: .. : .. : ... :: . : CCDS23 GKPKCCFFKFSSKIQYNKVVKAQLW--IYLRPVETPTTVFVQILRLIKPMKDGTRYTGIR 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LLAPSDSPE---WLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFTTG : . .: : :.:: :...::.. :....: : . : : . : : CCDS23 SLKLDMNPGTGIWQSIDVKTVLQNWLKQPESNLGIEIKA---LDENGHDLAVTFPG--PG 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDF . :.: ::: . .: . : :: . . :::. :: : .:: CCDS23 E-------DGLN-PFLEVKVTDTPK-------RSRRDFGLDCDEHSTESRCCRYPLTVDF 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 RKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALE . .:: :: :: :.::.: : : ... ... : .: :: .::.:::.: . CCDS23 EA-FGWDWIIAPKRYKANYCSGECEFVFLQKYPHTH---LVHQANPRGSAGPCCTPTKMS 300 310 320 330 340 370 380 390 pF1KE1 PLPIVYYVGRKPKVE-QLSNMIVRSCKCS :. ..:. :.. . .. :.: : :: CCDS23 PINMLYFNGKEQIIYGKIPAMVVDRCGCS 350 360 370 390 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 12:11:47 2016 done: Sun Nov 6 12:11:48 2016 Total Scan time: 3.200 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]