Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5381
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5381, 305 aa
1>>>pF1KE5381 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6615+/-0.0012; mu= 13.4893+/- 0.070
mean_var=164.0493+/-54.714, 0's: 0 Z-trim(103.3): 391 B-trim: 831 in 2/44
Lambda= 0.100135
statistics sampled from 6820 (7341) to 6820 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 1.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 2019 304.5 6.4e-83
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1987 299.9 1.6e-81
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1977 298.5 4.3e-81
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1264 195.5 4.7e-50
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1259 194.8 7.3e-50
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1239 191.9 5.5e-49
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1233 191.0 9.9e-49
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1231 190.7 1.2e-48
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1226 190.0 2.1e-48
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1217 188.7 4.9e-48
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1215 188.4 5.9e-48
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1214 188.3 6.6e-48
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1214 188.3 6.6e-48
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1214 188.3 6.6e-48
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1213 188.1 7.3e-48
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1211 187.8 8.9e-48
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1173 182.3 4e-46
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1153 179.4 3e-45
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1110 173.2 2.2e-43
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1088 170.1 2e-42
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1083 169.3 3.3e-42
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1082 169.2 3.6e-42
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1073 167.9 8.9e-42
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1061 166.1 3e-41
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1061 166.1 3e-41
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1047 164.1 1.2e-40
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1044 163.7 1.6e-40
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1042 163.4 2e-40
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1041 163.3 2.2e-40
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1035 162.4 4.1e-40
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1033 162.1 4.9e-40
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1016 159.6 2.7e-39
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1013 159.2 3.6e-39
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1012 159.2 4.4e-39
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1010 158.8 4.9e-39
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1010 158.8 5.1e-39
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1005 158.1 8.6e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1004 157.9 8.9e-39
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1003 157.8 9.8e-39
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1001 157.5 1.2e-38
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1001 157.5 1.2e-38
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 998 157.0 1.6e-38
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 996 156.8 2e-38
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 988 155.6 4.5e-38
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 986 155.3 5.4e-38
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 955 150.8 1.2e-36
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 893 141.9 6e-34
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 881 140.1 2e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 877 139.6 3e-33
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 876 139.4 3.3e-33
>>CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 (305 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 1602.1 bits: 304.5 E(32554): 6.4e-83
Smith-Waterman score: 2019; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS32 SSVKF
>>CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 (305 aa)
initn: 1987 init1: 1987 opt: 1987 Z-score: 1577.1 bits: 299.9 E(32554): 1.6e-81
Smith-Waterman score: 1987; 99.0% identity (99.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS32 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS32 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS32 SSVKF
>>CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 (305 aa)
initn: 1977 init1: 1977 opt: 1977 Z-score: 1569.3 bits: 298.5 E(32554): 4.3e-81
Smith-Waterman score: 1977; 98.7% identity (99.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS30 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVTWGIGFLHSVSQLAFAVHLLFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS30 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS30 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS30 SSVKF
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1288 init1: 1264 opt: 1264 Z-score: 1012.1 bits: 195.5 E(32554): 4.7e-50
Smith-Waterman score: 1264; 59.5% identity (88.1% similar) in 294 aa overlap (2-295:33-326)
10 20 30
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGI
::::..::::.:.::: :::. : ..: .:
CCDS32 TSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYLAI
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40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCL
..::.::..::.:::.::.::::::::::.::. ..: ..::::.::. .::.::: .::
CCDS32 LLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDACL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVS
.:::..:.: :::::.:..:..:::.:::::::: :.: .:: .. ..: .::.:..:
CCDS32 AQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHTTS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 QLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISY
::::.:.:::::::.::::.:::: : :::: ::: ......:.:: :.. ::.::..::
CCDS32 QLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVVSY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVI
:.::.:... . .:: :::::::::: ::::::.:::.::: :.:: :::::...
CCDS32 TVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYTIF
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE5 TPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAHSSVKF
: .:::.:::::::..:.:. .:.
CCDS32 TLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 1259 init1: 1259 opt: 1259 Z-score: 1008.7 bits: 194.8 E(32554): 7.3e-50
Smith-Waterman score: 1259; 59.8% identity (85.0% similar) in 301 aa overlap (1-301:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
::.::..::::.: :: :.: .: . : :.::.::.. . ::::.::::
CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:::.:::.::. :. ..:::..::: .::.:::.::..:::.:: : ::::..:.::..
CCDS32 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
::.:::::::::.::: :: .....:..: :::::.:::.: ::::::::::::.::
CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTL
:: ::.::: :::...::...:::.... :. :::::::::. .. . ::::::::
CCDS32 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRR
:::::::.::::::...: ::: .::::.:::.: :::::::::.:::.:.:.:. .
CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRKWDAHSSVKF
::. ..:
CCDS32 LRNRHVNSWKN
310
>>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa)
initn: 1256 init1: 1231 opt: 1239 Z-score: 992.9 bits: 191.9 E(32554): 5.5e-49
Smith-Waterman score: 1239; 57.1% identity (87.8% similar) in 294 aa overlap (1-294:8-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
.:.::..::: .::.:: : : .: :.: ::.:::::..::.::. ::::::
CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:::.:::..:. .: ..::::.::.: ...:::.::..:::..:.: :.:::.:..:..
CCDS32 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
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240 250 260 270 280 290
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250 260 270 280 290 300
300
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.
CCDS32 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
310 320
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CCDS32 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
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300
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: . ::
CCDS32 LCSRLAHFTKIL
310
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CCDS32 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
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CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
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CCDS32 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
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300
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.:.
CCDS32 KLQNRRVTFQ
310
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10 20 30
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CCDS32 SLILITIKNHSPTGQS-KARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKFLAVFYTI
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