Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5960
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5960, 312 aa
1>>>pF1KE5960 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2162+/-0.000548; mu= 16.4859+/- 0.034
mean_var=116.0619+/-31.286, 0's: 0 Z-trim(106.9): 288 B-trim: 901 in 1/50
Lambda= 0.119050
statistics sampled from 14617 (14992) to 14617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.5), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 5.080
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 952 175.4 1.3e-43
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 831 154.7 2.3e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 797 148.8 1.3e-35
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 796 148.6 1.5e-35
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 792 148.0 2.4e-35
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 790 147.6 3e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 775 145.0 1.8e-34
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 771 144.4 2.9e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 763 143.0 7.5e-34
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 761 142.6 9.6e-34
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 761 142.6 9.6e-34
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 761 142.7 9.8e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 757 141.9 1.5e-33
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 742 139.4 9.5e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 741 139.2 1e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 722 135.9 9.9e-32
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 703 132.7 9.6e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 538 104.3 3.3e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 476 93.7 5.3e-19
NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 191 44.8 0.0003
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 192 45.1 0.00033
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 192 45.2 0.00035
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 183 43.4 0.00079
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 180 42.9 0.0011
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 179 42.7 0.0012
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 167 40.7 0.0051
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 167 40.7 0.0052
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 167 40.7 0.0055
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 166 40.5 0.0057
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 166 40.5 0.0057
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 165 40.3 0.0064
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 952 init1: 952 opt: 952 Z-score: 904.2 bits: 175.4 E(85289): 1.3e-43
Smith-Waterman score: 952; 46.7% identity (77.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:3-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
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310
pF1KE5 LCSRLAHFTKIL
::::
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 831; 39.6% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (4-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
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pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIF-FSHALGGTEMVLLIAMA
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGA-EMVLFTTMA
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pF1KE5 FDRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYC
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pF1KE5 TLSAHVTVVILFFGPLMFFYTWP--SPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKV
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300 310
pF1KE5 AMRRLCSRLAHFTKIL
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NP_001 GIRKVFAFLKH
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 797; 37.7% identity (75.0% similar) in 300 aa overlap (5-301:7-306)
10 20 30 40 50
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pF1KE5 CDLPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKAL
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300 310
pF1KE5 VAMRRLCSRLAHFTKIL
: ...
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 796; 38.0% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (3-304:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPM
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pF1KE5 TLSAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSP--TSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKV
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pF1KE5 AMRRLCSRLAHFTKIL
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHS
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pF1KE5 MAFDRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSF
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pF1KE5 LSTLSAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLD--KYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDM
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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pF1KE5 KVAMRRLCSRLAHFTKIL
. :..::
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 792; 39.0% identity (73.7% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-315)
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pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
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pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
:.:.:::..:... . ..:... .. .:::: :..: .:.::: :::: :.::: .::.
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
:::.:.: :.: .:: .: . :: . :.: : :: ... .::.: ...: . :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKALST
: ..::::..:. : . :.: .. . : :...::: :. :. : .: : ::. :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 LSAHVTVVILFFGPLMFFYTWP--SPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE5 MRRLCSRLAHFTKIL
..: ... .:. :
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 792; 39.0% identity (73.7% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-315)
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pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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300 310
pF1KE5 MRRLCSRLAHFTKIL
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 711 init1: 598 opt: 792 Z-score: 755.5 bits: 148.0 E(85289): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 792; 39.0% identity (73.7% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-315)
10 20 30 40 50 60
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRRLCSRLAHFTKIL
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 801 init1: 618 opt: 790 Z-score: 753.7 bits: 147.6 E(85289): 3e-35
Smith-Waterman score: 790; 37.8% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKALST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300 310
pF1KE5 MRRLCSRLAHFTKIL
. . ::
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 727 init1: 572 opt: 775 Z-score: 739.8 bits: 145.0 E(85289): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 775; 39.7% identity (71.6% similar) in 310 aa overlap (4-310:2-311)
10 20 30 40 50 60
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
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NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKALST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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312 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:17:37 2016 done: Tue Nov 8 08:17:37 2016
Total Scan time: 5.080 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]