FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5817, 847 aa 1>>>pF1KE5817 847 - 847 aa - 847 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0058+/-0.00128; mu= 16.3724+/- 0.077 mean_var=64.3136+/-12.824, 0's: 0 Z-trim(99.4): 35 B-trim: 13 in 1/49 Lambda= 0.159927 statistics sampled from 5717 (5725) to 5717 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16 Scan time: 3.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32080.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14 ( 847) 5610 1304.0 0 CCDS53894.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14 ( 813) 4844 1127.3 0 CCDS13171.1 PYGB gene_id:5834|Hs108|chr20 ( 843) 4741 1103.5 0 CCDS8079.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11 ( 842) 4686 1090.9 0 CCDS53659.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11 ( 754) 3652 852.3 0 >>CCDS32080.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14 (847 aa) initn: 5610 init1: 5610 opt: 5610 Z-score: 6988.0 bits: 1304.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5610; 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81.9% identity (94.4% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV :::::::.:::.:::.::..:. .:::..::::::::::::::::::: :::.::::::: CCDS13 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI ::::::::::::::::.. :::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::. CCDS13 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .::::::: CCDS13 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN ::::::::::::.:::.::::::::.:::: :.::.:::::::.::::::::: ::::: CCDS13 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV :::::::.:::::.:.::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL :::::::::::::.:::: . : :..:::.::::::::::::.:::::::.::.::. 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CCDS80 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP :.:::..: .: ::::::::::::::::: :.: ::::::.:::::::. :.:..: :: CCDS80 DWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF ::::::::::.:: . ::::::::::.:::::::::.:::.:.: .:::: :::: :: CCDS80 GDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKF 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ :::::::::::::.::::::::.:::.::::...::.:: :: ::. :..:.:..::::: CCDS80 QNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQ 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV ::::::. .:: ::::.:::.:.::.::::::::::::::::::::.:::::..:.:.:: CCDS80 ENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA ::::.::::::::::::::::.:.:...::::.:: ::..:.:::::::::::::::::: CCDS80 PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPA 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::..:: CCDS80 ADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVD 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA ::..::.:.:::. .:::. ::.:...::::::::::::::.:::..::::::::::: CCDS80 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE :.:::.::: :: ::. :. ::..:::.:::::::::: .::..::.:::: .. .: CCDS80 YIKCQEKVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDE 790 800 810 820 830 840 pF1KE5 SNKVNGN . CCDS80 AI >>CCDS53659.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11 (754 aa) initn: 4129 init1: 3650 opt: 3652 Z-score: 4547.4 bits: 852.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3950; 70.4% identity (83.7% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-753) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV :..::.:::::.:::.::..:::::.::::.::::::::::::::::: ::::::::::: CCDS53 MSRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI ::::::::::::::::.: :: CCDS53 RDHLVGRWIRTQQHYYEKDPK--------------------------------------- 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA :: :::.::: CCDS53 -------------------------------------------------KISGGWQMEEA 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN ::::::::::::.:::: :::::::.::::. :.::.:::::::.::::::::: ::.:: CCDS53 DDWLRYGNPWEKARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVN 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV :::::::.:::::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 TMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL :::::::::::::.:::: . : ::::::.::::::::::.:::::::::.::.:.. CCDS53 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERM 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP :.:::..: .: ::::::::::::::::: :.: ::::::.:::::::. :.:..: :: CCDS53 DWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFP 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF ::::::::::.:: . ::::::::::.:::::::::.:::.:.: .:::: :::: :: CCDS53 GDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKF 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ :::::::::::::.::::::::.:::.::::...::.:: :: ::. :..:.:..::::: CCDS53 QNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQ 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV ::::::. .:: ::::.:::.:.::.::::::::::::::::::::.:::::..:.:.:: CCDS53 ENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV 460 470 480 490 500 510 610 620 630 640 650 660 pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA ::::.::::::::::::::::.:.:...::::.:: ::..:.:::::::::::::::::: CCDS53 PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPA 520 530 540 550 560 570 670 680 690 700 710 720 pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::..:: CCDS53 ADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVD 580 590 600 610 620 630 730 740 750 760 770 780 pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA ::..::.:.:::. .:::. ::.:...::::::::::::::.:::..::::::::::: CCDS53 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED 640 650 660 670 680 690 790 800 810 820 830 840 pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE :.:::.::: :: ::. :. ::..:::.:::::::::: .::..::.:::: .. .: CCDS53 YIKCQEKVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDE 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 SNKVNGN . CCDS53 AI 847 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:53:36 2016 done: Tue Nov 8 06:53:37 2016 Total Scan time: 3.290 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]