Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5817
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5817, 847 aa
  1>>>pF1KE5817 847 - 847 aa - 847 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0058+/-0.00128; mu= 16.3724+/- 0.077
 mean_var=64.3136+/-12.824, 0's: 0 Z-trim(99.4): 35  B-trim: 13 in 1/49
 Lambda= 0.159927
 statistics sampled from 5717 (5725) to 5717 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.176), width:  16
 Scan time:  3.290

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32080.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14          ( 847) 5610 1304.0       0
CCDS53894.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14          ( 813) 4844 1127.3       0
CCDS13171.1 PYGB gene_id:5834|Hs108|chr20          ( 843) 4741 1103.5       0
CCDS8079.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11           ( 842) 4686 1090.9       0
CCDS53659.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11          ( 754) 3652 852.3       0


>>CCDS32080.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14               (847 aa)
 initn: 5610 init1: 5610 opt: 5610  Z-score: 6988.0  bits: 1304.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5610; 100.0% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-847)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
              790       800       810       820       830       840

              
pF1KE5 SNKVNGN
       :::::::
CCDS32 SNKVNGN
              

>>CCDS53894.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14               (813 aa)
 initn: 4841 init1: 4841 opt: 4844  Z-score: 6033.2  bits: 1127.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5308; 96.0% identity (96.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-813)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
       :::::::::::::::::::::                                  :::::
CCDS53 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPK----------------------------------LGLDI
               70        80                                        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
         90       100       110       120       130       140      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
        150       160       170       180       190       200      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
        210       220       230       240       250       260      

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
        270       280       290       300       310       320      

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
        330       340       350       360       370       380      

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
        390       400       410       420       430       440      

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
        450       460       470       480       490       500      

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
        510       520       530       540       550       560      

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
        570       580       590       600       610       620      

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
        630       640       650       660       670       680      

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
        690       700       710       720       730       740      

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
        750       760       770       780       790       800      

              
pF1KE5 SNKVNGN
       :::::::
CCDS53 SNKVNGN
        810   

>>CCDS13171.1 PYGB gene_id:5834|Hs108|chr20               (843 aa)
 initn: 4772 init1: 4740 opt: 4741  Z-score: 5904.5  bits: 1103.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4741; 81.9% identity (94.4% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
       :::::::.:::.:::.::..:. .:::..::::::::::::::::::: :::.:::::::
CCDS13 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
       ::::::::::::::::.. :::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS13 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .:::::::
CCDS13 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
       ::::::::::::.:::.::::::::.::::  :.::.:::::::.::::::::: :::::
CCDS13 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       :::::::.:::::.:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
       :::::::::::::.::::    . : :..:::.::::::::::::.:::::::.::.::.
CCDS13 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
        :.::::.:.:: :::::::::::::::::.. :::::::::::: :::.:::...::::
CCDS13 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
        :::::::::.:::   :::::::::..:::::::::.:::.::: .::::: ::::.::
CCDS13 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
       :::::::::::::::::::::. :.:::::... ::::: ::  ...:.::.:..:::::
CCDS13 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
       ::::::: ::: ::::::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::.:: : ::
CCDS13 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::.:::::::::::::.::::.::..::::.::.::..::::::::::::::::::::
CCDS13 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
       .:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:..:: 
CCDS13 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
       :::.:::.:.:::. ::::: ..:::..::::::.:: ::::.:::..::::::::::::
CCDS13 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
       :..:: .:.::: ::: :.  :..::: :::::::::: :::..::.::::::.:   : 
CCDS13 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
              790       800       810       820       830       840

              
pF1KE5 SNKVNGN
              
CCDS13 PRD    
              

>>CCDS8079.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11                (842 aa)
 initn: 4675 init1: 4675 opt: 4686  Z-score: 5835.9  bits: 1090.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4686; 80.0% identity (94.1% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
       :..::.:::::.:::.::..:::::.::::.::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS80 MSRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
       ::::::::::::::::.: :::.:::::::::::::::::.::.:.:::::: ::::::.
CCDS80 RDHLVGRWIRTQQHYYEKDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLALENACDEATYQLGLDM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::  :::.:::
CCDS80 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKISGGWQMEEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
       ::::::::::::.:::: :::::::.::::. :.::.:::::::.::::::::: ::.::
CCDS80 DDWLRYGNPWEKARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       :::::::.:::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 TMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
       :::::::::::::.::::    . : ::::::.::::::::::.:::::::::.::.:..
CCDS80 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
        :.:::..: .: ::::::::::::::::: :.: ::::::.:::::::. :.:..: ::
CCDS80 DWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
        ::::::::::.:: . ::::::::::.:::::::::.:::.:.:  .:::: :::: ::
CCDS80 GDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
       :::::::::::::.::::::::.:::.::::...::.:: :: ::. :..:.:..:::::
CCDS80 QNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
       ::::::. .:: ::::.:::.:.::.::::::::::::::::::::.:::::..:.:.::
CCDS80 ENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::.::::::::::::::::.:.:...::::.:: ::..:.::::::::::::::::::
CCDS80 PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::..:: 
CCDS80 ADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
        ::..::.:.:::. .:::. ::.:...::::::::::::::.:::..::::::::::: 
CCDS80 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
       :.:::.::: :: ::. :. ::..:::.:::::::::: .::..::.::::  ..   .:
CCDS80 YIKCQEKVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDE
              790       800       810       820       830       840

              
pF1KE5 SNKVNGN
       .      
CCDS80 AI     
              

>>CCDS53659.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11               (754 aa)
 initn: 4129 init1: 3650 opt: 3652  Z-score: 4547.4  bits: 852.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3950; 70.4% identity (83.7% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-753)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
       :..::.:::::.:::.::..:::::.::::.::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS53 MSRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
       ::::::::::::::::.: ::                                       
CCDS53 RDHLVGRWIRTQQHYYEKDPK---------------------------------------
               70        80                                        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
                                                        ::  :::.:::
CCDS53 -------------------------------------------------KISGGWQMEEA
                                                               90  

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
       ::::::::::::.:::: :::::::.::::. :.::.:::::::.::::::::: ::.::
CCDS53 DDWLRYGNPWEKARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVN
            100       110       120       130       140       150  

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       :::::::.:::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
            160       170       180       190       200       210  

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
       :::::::::::::.::::    . : ::::::.::::::::::.:::::::::.::.:..
CCDS53 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERM
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pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
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CCDS53 DWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFP
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pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
        ::::::::::.:: . ::::::::::.:::::::::.:::.:.:  .:::: :::: ::
CCDS53 GDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKF
            340       350       360       370       380       390  

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       :::::::::::::.::::::::.:::.::::...::.:: :: ::. :..:.:..:::::
CCDS53 QNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQ
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pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
       ::::::. .:: ::::.:::.:.::.::::::::::::::::::::.:::::..:.:.::
CCDS53 ENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV
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pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::.::::::::::::::::.:.:...::::.:: ::..:.::::::::::::::::::
CCDS53 PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPA
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pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::..:: 
CCDS53 ADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVD
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pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
        ::..::.:.:::. .:::. ::.:...::::::::::::::.:::..::::::::::: 
CCDS53 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED
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pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
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CCDS53 YIKCQEKVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDE
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       .      
CCDS53 AI     
              




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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