FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5480, 331 aa 1>>>pF1KE5480 331 - 331 aa - 331 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5610+/-0.000471; mu= 20.3467+/- 0.030 mean_var=103.4751+/-27.951, 0's: 0 Z-trim(108.8): 420 B-trim: 1092 in 1/52 Lambda= 0.126083 statistics sampled from 16336 (16881) to 16336 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16 Scan time: 6.570 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 936 181.6 1.9e-45 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 848 165.6 1.2e-40 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 847 165.4 1.4e-40 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 822 160.9 3.3e-39 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 807 158.2 2.2e-38 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 805 157.8 2.8e-38 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 805 157.8 2.8e-38 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 805 157.8 2.8e-38 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 802 157.3 4.1e-38 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 802 157.3 4.1e-38 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 802 157.3 4.1e-38 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 792 155.4 1.4e-37 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 784 154.0 4e-37 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 776 152.5 1.1e-36 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 759 149.4 9.2e-36 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 728 143.8 4.6e-34 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 719 142.1 1.4e-33 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 717 141.8 1.8e-33 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 713 141.0 3e-33 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 691 137.0 4.8e-32 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 562 113.6 5.7e-25 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 540 109.6 9.2e-24 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 219 51.2 3.5e-06 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 211 49.8 9.5e-06 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 208 49.3 1.5e-05 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 208 49.4 1.6e-05 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 206 49.0 2.1e-05 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 204 48.5 2.4e-05 XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 202 48.2 3.2e-05 NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 202 48.2 3.2e-05 NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 202 48.2 3.2e-05 NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 202 48.2 3.2e-05 XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 202 48.2 3.3e-05 XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 202 48.2 3.3e-05 XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 202 48.2 3.3e-05 NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 202 48.3 3.4e-05 XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 199 47.7 4.8e-05 NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 199 47.7 4.8e-05 NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 199 47.8 5.2e-05 XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 199 47.9 5.7e-05 NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 197 47.3 6.2e-05 NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 197 47.3 6.2e-05 NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 197 47.3 6.3e-05 NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 197 47.3 6.3e-05 NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 197 47.4 6.3e-05 NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 197 47.4 6.4e-05 NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 197 47.4 6.4e-05 NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 197 47.4 6.5e-05 NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 197 47.4 6.5e-05 NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 197 47.4 6.7e-05 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 954 init1: 449 opt: 936 Z-score: 936.8 bits: 181.6 E(85289): 1.9e-45 Smith-Waterman score: 936; 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NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPN-I 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 VQHFFCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASG ..::::: .::: :.::. . : :::.:: ..... : .:..:: :. ::. ::::.: NP_003 INHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 HQKAFSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALR . ::::::.::: :: .::...::.:.::. .. ::: :.:. . ..:::::.:: :: NP_003 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 NEQVKEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK :..::.:: NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV 300 310 320 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 842 init1: 454 opt: 848 Z-score: 850.4 bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40 Smith-Waterman score: 848; 45.4% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (9-313:7-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSA-RVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQT .. .::.: .. .: . . :: .:: .::..: :: ::. :. :: :.. NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PMYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAV :::::: ::: ::: .. ::.::::...:... :::: .: ::.::.::.:..: .:::. NP_835 PMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLAT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 MSADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQH :. :::.::: ::.::..:. . ..: : : :. . :. . .::: . : .: NP_835 MAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKV-NH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FFCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQK ::::: :.:.:.:..: .: .: . ::.. :. :: :. :.:.::::.:..: NP_835 FFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 AFSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQ :::::.:::.::.::: :. . : :....: ... ... : :::.:::.::.::: . NP_835 AFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 VKEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK ::.::. :.::.: NP_835 VKNALSRTFHKVLALRNCIP 300 310 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 842 init1: 457 opt: 847 Z-score: 849.5 bits: 165.4 E(85289): 1.4e-40 Smith-Waterman score: 847; 42.2% identity (78.1% similar) in 306 aa overlap (12-316:10-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP ::::: :: . .. :: ::..: :.. ::. .. ..: :..:.:: NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM :::::.::: ... ...: ::::...::...:::::.:. :.::.. :...: .:...: NP_003 MYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF . ::: :::.:: : :.:: .: ...: . ...::. . : :. : :: .. :..:: NP_003 AYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFC-DSNVIHHF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA :::: ::..:.:..: : . .::.. ::..::. ::. ......:. :. :...: NP_003 FCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV ::::.::: .. :::.. :. :.:::.: :.. . ...:. : : :.:::.::.::...: NP_003 FSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 pF1KE5 KEALKDMF-RKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK :.:: ... :: ... : NP_003 KKALANVISRKRTSSFL 300 310 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 820 init1: 464 opt: 822 Z-score: 824.9 bits: 160.9 E(85289): 3.3e-39 Smith-Waterman score: 822; 42.9% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (12-312:12-311) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP :::.: :.:. .. :: .:: .: . : ::. .. ..: : .:::: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM :::::.::: ... : :.:::: ::::....::. .: ::::. .. .: ..::.: NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF . :::.:::.:: : ..:: ..:.:. . ..:: . : : . .: .: .. :..:: NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKN-VINHF 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA ::: :::.:.::.: : . .: : . ..: .:: .:.:.::.: : ::..:. NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV ::::.::: ::.. :. .:.: ::: : .:. ..:. :. :.:::.::.:::..: NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 pF1KE5 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK :.: . ..:. : NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS 300 310 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 804 init1: 420 opt: 807 Z-score: 810.2 bits: 158.2 E(85289): 2.2e-38 Smith-Waterman score: 807; 40.2% identity (73.5% similar) in 306 aa overlap (5-310:4-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP :.. .. : :.: :. .. ::..::..:. .:. :. .. ..: :..:.:: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM :::::.::: ... : .::::::.:..:.::.:..:: :.... .: :: :...: NP_001 MYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF . ::: :::.:: : .:: ..: ..:. .. ::. : :. : :: .. :..:: NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSN-VIRHF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA ::: :: :.::.: .. .:. . ..: :. .::: : .....: ::.:..:: NP_001 FCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV :.::.::: .:.::: :.::.:. :..:: . . ..:. : : :.:::.::.:::... 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NP_001 KDALKRLQKRKCC 300 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 819 init1: 423 opt: 805 Z-score: 808.2 bits: 157.8 E(85289): 2.8e-38 Smith-Waterman score: 805; 43.1% identity (71.4% similar) in 311 aa overlap (5-315:3-312) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP :...:. .::.: :: . . :: :: .:: .. ::.::. : :. :.:: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM :::::.::: ..: .. . .::::.: . . .:::: .:.::.:: :.. . .::::: XP_011 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF . :...:.::::.: :. .: .. . :: . . :: :. .: : :: ..:.. :: XP_011 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAIT-HF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGHQKA ::: :::.:.:..:. : . ..::... .: .:: :. .::..::..:. :: XP_011 FCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV :::: ::: :: :::.. : .: : .: :.. . .::. : :::.::::::.:::. . 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