FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5990, 314 aa 1>>>pF1KE5990 314 - 314 aa - 314 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6167+/-0.000676; mu= 14.2232+/- 0.041 mean_var=132.4620+/-36.971, 0's: 0 Z-trim(104.9): 468 B-trim: 811 in 1/47 Lambda= 0.111437 statistics sampled from 12637 (13217) to 12637 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.473), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16 Scan time: 5.260 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1015 175.8 9.9e-44 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 855 150.1 5.5e-36 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 851 149.5 8.7e-36 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 851 149.5 8.7e-36 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 851 149.5 8.7e-36 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 848 149.0 1.2e-35 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 845 148.5 1.7e-35 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 818 144.1 3.4e-34 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 818 144.1 3.4e-34 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 818 144.2 3.5e-34 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 815 143.7 4.8e-34 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 810 142.8 8.2e-34 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 809 142.7 9.3e-34 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 802 141.6 2e-33 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 789 139.5 8.5e-33 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 783 138.5 1.7e-32 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 781 138.2 2e-32 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 780 138.0 2.3e-32 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 767 135.9 1e-31 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 748 132.9 8.6e-31 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 585 106.7 6.5e-23 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 498 92.7 1.1e-18 NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 230 49.7 1.1e-05 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 224 48.7 2e-05 NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 227 49.5 2.1e-05 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 217 47.6 4.4e-05 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 217 47.7 5.4e-05 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 212 46.8 7.6e-05 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 210 46.4 9.2e-05 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 209 46.3 0.00011 NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 209 46.4 0.00012 NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 209 46.4 0.00012 NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 209 46.4 0.00012 NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 209 46.4 0.00012 NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 209 46.4 0.00012 NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 209 46.4 0.00012 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 209 46.4 0.00012 NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 209 46.4 0.00012 NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 209 46.4 0.00012 NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 209 46.4 0.00012 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 209 46.4 0.00012 NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 209 46.4 0.00013 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 207 45.9 0.00013 NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 209 46.5 0.00013 NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 209 46.5 0.00013 NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 207 46.1 0.00016 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 206 45.9 0.00017 XP_011543044 (OMIM: 118510) PREDICTED: muscarinic ( 460) 206 46.0 0.00018 NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 206 46.0 0.00018 NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 204 45.5 0.00018 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 1036 init1: 995 opt: 1015 Z-score: 906.1 bits: 175.8 E(85289): 9.9e-44 Smith-Waterman score: 1015; 48.0% identity (78.3% similar) in 300 aa overlap (5-304:3-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY :...:.:::::::... ..: ..:.:: ..:. :.:: :::.:. ..: : :::: NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF . :. ::.:: .: ::..:: : :.:.: :.::.::.: :.: :.: ::: .:.. 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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 790 init1: 606 opt: 851 Z-score: 763.5 bits: 149.5 E(85289): 8.7e-36 Smith-Waterman score: 851; 39.4% identity (74.4% similar) in 317 aa overlap (1-314:1-317) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY : . :.. .:::.:::::..:. .. .:..: ..::.:..:: :::. . .: .::.::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF :.:::::..:.: :. ..:.... .:. ::.: :..: .:.:: . : :..:: .:.. XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD :::.:.: :.:.... .:. :...::. : . : :. ... ::.: .: . :. XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTV-KHHSSRGSSKALST : .: .:::::: . .. .: .. .. : ... ::. .. :. : .: .: .::. : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSS--FLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIA :..:. :: : .: :: :. : :: : .:..::::.:.:: :::.::.:::.::: : XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 MRKLKNRFLNFNKAMPS .:: .: .... . . XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 859 init1: 629 opt: 848 Z-score: 761.0 bits: 149.0 E(85289): 1.2e-35 Smith-Waterman score: 848; 40.7% identity (75.7% similar) in 300 aa overlap (5-301:8-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHS : :. . :.:.:.:: .:.. .:.: ..:. :..:: .:.: .: :::. NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PMYFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMA ::::.:.:::..:. .. . :..... .::::. ::. :..:. . :: .::.. NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 MSFDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSF ::.::: :.:.::::. .. :. : :.::::. : .: . :.. .:.:: .:: : NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FCDLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSY-VIVLVTVKHHSSRGSSKA ::..:....:.::::.: : .. ::.:..: .:....:: .:: . .. .:. : .:. NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTD--KILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEV ..:: ::...: ::: : . .:. : :. : :....:::. ::.:::.::::::. : NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 KIAMRKLKNRFLNFNKAMPS . :...: NP_001 RGAVKRLMGWE 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 770 init1: 504 opt: 845 Z-score: 758.3 bits: 148.5 E(85289): 1.7e-35 Smith-Waterman score: 845; 39.4% identity (72.9% similar) in 317 aa overlap (1-313:1-317) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSN-SWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPM : .:: . .:::.:...:. :.: ..:..: .:..:. :::::......:: ::::: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMS ::.: :::...... .:::. :. :::: :: ::..:. .: .: .:: .:. NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 FDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFC .:::.:::.:::: ... .. . :..:::. : . :. . ...:::: .:. ::: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLPVVFQLACVDTYVLGLF-MISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALS : : :..:.:.:: .. .. ...: .. . :...: . :. . .: :..:. ::.: NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLS--SFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKI ::..:..:: ::. . :.:: : : . :.::. ::. :: ::::::.:::.::: NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 AMRKLKNRFLNFNKAMPS :. . .. : . . .: NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 796 init1: 606 opt: 818 Z-score: 734.9 bits: 144.1 E(85289): 3.4e-34 Smith-Waterman score: 818; 38.1% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY :. :.:..:::.::::: . . : ..:. : .:.::..:: ::...: .: ::.::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF :.:.:::..:. .. ..:::..... .:::: :::::..:. .:. . .:: .:.. NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD :...:.:.::::.. .. :.:. ::.. :... .. . .... : ::. . :::: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTV-KHHSSRGSSKALST . ...:.: ::.. ....: .... .. :. .. ::. . :: : :..: ::.:: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDK--ILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIA : .:. ::.::.. : .:. :::: ..: . .:.::. :: :::.::.:::. .: : NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 MRKLKNRFLNFNKAMPS ..:. .: NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 796 init1: 606 opt: 818 Z-score: 734.9 bits: 144.1 E(85289): 3.4e-34 Smith-Waterman score: 818; 38.1% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY :. :.:..:::.::::: . . : ..:. : .:.::..:: ::...: .: ::.::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF :.:.:::..:. .. ..:::..... .:::: :::::..:. .:. . .:: .:.. XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD :...:.:.::::.. .. :.:. ::.. :... .. . .... : ::. . :::: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTV-KHHSSRGSSKALST . ...:.: ::.. ....: .... .. :. .. ::. . :: : :..: ::.:: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDK--ILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIA : .:. ::.::.. : .:. :::: ..: . .:.::. :: :::.::.:::. .: : XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 MRKLKNRFLNFNKAMPS ..:. .: XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 796 init1: 606 opt: 818 Z-score: 734.7 bits: 144.2 E(85289): 3.5e-34 Smith-Waterman score: 818; 38.1% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (1-304:11-317) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVI :. :.:..:::.::::: . . : ..:. : .:.::..:: ::...: XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 VDPHLHSPMYFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGT .: ::.::::.:.:::..:. .. ..:::..... .:::: :::::..:. .:. XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 EIILLMAMSFDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCG . .:: .:..:...:.:.::::.. .. :.:. ::.. :... .. . .... : ::. XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KE5 PYEVDSFFCDLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTV-KHHS . ::::. ...:.: ::.. ....: .... .. :. .. ::. . :: : : XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 SRGSSKALSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDK--ILSVFYTIFTPTLNPIIY ..: ::.::: .:. ::.::.. : .:. :::: ..: . .:.::. :: :::.:: XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 pF1KE5 TLRNQEVKIAMRKLKNRFLNFNKAMPS .:::. .: :..:. .: XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 310 320 314 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:34:06 2016 done: Tue Nov 8 08:34:07 2016 Total Scan time: 5.260 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]