FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3459, 1342 aa 1>>>pF1KE3459 1342 - 1342 aa - 1342 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5025+/-0.00053; mu= 11.6725+/- 0.032 mean_var=639.2633+/-148.134, 0's: 0 Z-trim(118.8): 866 B-trim: 1783 in 1/54 Lambda= 0.050726 statistics sampled from 31006 (32187) to 31006 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16 Scan time: 18.780 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001973 (OMIM: 190151,607598) receptor tyrosine- (1342) 9408 706.2 4e-202 XP_005246433 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1298) 4154 321.7 2.2e-86 XP_005246434 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1282) 4142 320.8 4e-86 NP_005226 (OMIM: 600543,615515) receptor tyrosine- (1308) 3601 281.2 3.4e-74 XP_016859069 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1324) 3592 280.5 5.3e-74 NP_001036064 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CDC42 kinase (1086) 671 66.6 1.1e-09 XP_005269325 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1118) 671 66.6 1.1e-09 XP_011510619 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1219) 671 66.7 1.2e-09 NP_001161711 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1043) 612 62.3 2.2e-08 NP_001161710 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1058) 612 62.3 2.2e-08 NP_001129472 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1064) 612 62.3 2.2e-08 NP_001161709 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1079) 612 62.3 2.2e-08 XP_005245145 (OMIM: 164690) PREDICTED: Abelson tyr (1146) 612 62.3 2.2e-08 NP_001161708 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1161) 612 62.4 2.3e-08 NP_005149 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-protein (1167) 612 62.4 2.3e-08 XP_016856524 (OMIM: 164690) PREDICTED: Abelson tyr (1182) 612 62.4 2.3e-08 NP_009298 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-protein (1182) 612 62.4 2.3e-08 NP_001129473 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote ( 542) 600 60.8 3e-08 XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 601 61.4 3.6e-08 XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 601 61.4 3.7e-08 NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 601 61.4 3.7e-08 XP_011510844 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type ( 394) 593 60.1 3.7e-08 NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 ( 987) 599 61.3 4.1e-08 XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 599 61.3 4.1e-08 >>NP_001973 (OMIM: 190151,607598) receptor tyrosine-prot (1342 aa) initn: 9408 init1: 9408 opt: 9408 Z-score: 3749.7 bits: 706.2 E(85289): 4e-202 Smith-Waterman score: 9408; 100.0% identity (100.0% similar) in 1342 aa overlap (1-1342:1-1342) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEVVM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEVVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIFVM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIFVM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 LNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRDRDAEIVVKDNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRDRDAEIVVKDNG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 RSCPPCHEVCKGRCWGPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGGCSGPQD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RSCPPCHEVCKGRCWGPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGGCSGPQD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 TDCFACRHFNDSGACVPRCPQPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNFVVDQTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TDCFACRHFNDSGACVPRCPQPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNFVVDQTS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 CVRACPPDKMEVDKNGLKMCEPCGGLCPKACEGTGSGSRFQTVDSSNIDGFVNCTKILGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 CVRACPPDKMEVDKNGLKMCEPCGGLCPKACEGTGSGSRFQTVDSSNIDGFVNCTKILGN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 LDFLITGLNGDPWHKIPALDPEKLNVFRTVREITGYLNIQSWPPHMHNFSVFSNLTTIGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LDFLITGLNGDPWHKIPALDPEKLNVFRTVREITGYLNIQSWPPHMHNFSVFSNLTTIGG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 RSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIYISANRQLCYHHSLNWTKVLRGPTEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIYISANRQLCYHHSLNWTKVLRGPTEE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 RLDIKHNRPRRDCVAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSCRNYSRGGVCVTHCNFLNGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RLDIKHNRPRRDCVAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSCRNYSRGGVCVTHCNFLNGEP 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 REFAHEAECFSCHPECQPMEGTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHCVSSCPHGVLGAKGPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 REFAHEAECFSCHPECQPMEGTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHCVSSCPHGVLGAKGPI 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 YKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCLGQTLVLIGKTHLTMALTVIAGLVVIFMMLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 YKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCLGQTLVLIGKTHLTMALTVIAGLVVIFMMLG 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 GTFLYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKANKVLARIFKETELRKLKVLGSGVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GTFLYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKANKVLARIFKETELRKLKVLGSGVF 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 GTVHKGVWIPEGESIKIPVCIKVIEDKSGRQSFQAVTDHMLAIGSLDHAHIVRLLGLCPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GTVHKGVWIPEGESIKIPVCIKVIEDKSGRQSFQAVTDHMLAIGSLDHAHIVRLLGLCPG 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 SSLQLVTQYLPLGSLLDHVRQHRGALGPQLLLNWGVQIAKGMYYLEEHGMVHRNLAARNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SSLQLVTQYLPLGSLLDHVRQHRGALGPQLLLNWGVQIAKGMYYLEEHGMVHRNLAARNV 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 LLKSPSQVQVADFGVADLLPPDDKQLLYSEAKTPIKWMALESIHFGKYTHQSDVWSYGVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LLKSPSQVQVADFGVADLLPPDDKQLLYSEAKTPIKWMALESIHFGKYTHQSDVWSYGVT 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 VWELMTFGAEPYAGLRLAEVPDLLEKGERLAQPQICTIDVYMVMVKCWMIDENIRPTFKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VWELMTFGAEPYAGLRLAEVPDLLEKGERLAQPQICTIDVYMVMVKCWMIDENIRPTFKE 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 LANEFTRMARDPPRYLVIKRESGPGIAPGPEPHGLTNKKLEEVELEPELDLDLDLEAEED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LANEFTRMARDPPRYLVIKRESGPGIAPGPEPHGLTNKKLEEVELEPELDLDLDLEAEED 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 NLATTTLGSALSLPVGTLNRPRGSQSLLSPSSGYMPMNQGNLGESCQESAVSGSSERCPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NLATTTLGSALSLPVGTLNRPRGSQSLLSPSSGYMPMNQGNLGESCQESAVSGSSERCPR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 PVSLHPMPRGCLASESSEGHVTGSEAELQEKVSMCRSRSRSRSPRPRGDSAYHSQRHSLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 PVSLHPMPRGCLASESSEGHVTGSEAELQEKVSMCRSRSRSRSPRPRGDSAYHSQRHSLL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE3 TPVTPLSPPGLEEEDVNGYVMPDTHLKGTPSSREGTLSSVGLSSVLGTEEEDEDEEYEYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TPVTPLSPPGLEEEDVNGYVMPDTHLKGTPSSREGTLSSVGLSSVLGTEEEDEDEEYEYM 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE3 NRRRRHSPPHPPRPSSLEELGYEYMDVGSDLSASLGSTQSCPLHPVPIMPTAGTTPDEDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NRRRRHSPPHPPRPSSLEELGYEYMDVGSDLSASLGSTQSCPLHPVPIMPTAGTTPDEDY 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE3 EYMNRQRDGGGPGGDYAAMGACPASEQGYEEMRAFQGPGHQAPHVHYARLKTLRSLEATD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EYMNRQRDGGGPGGDYAAMGACPASEQGYEEMRAFQGPGHQAPHVHYARLKTLRSLEATD 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE3 SAFDNPDYWHSRLFPKANAQRT :::::::::::::::::::::: NP_001 SAFDNPDYWHSRLFPKANAQRT 1330 1340 >>XP_005246433 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: receptor (1298 aa) initn: 2971 init1: 1332 opt: 4154 Z-score: 1671.8 bits: 321.7 E(85289): 2.2e-86 Smith-Waterman score: 4179; 50.5% identity (72.8% similar) in 1277 aa overlap (1-1264:1-1234) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEVVM :. .: : :. : . ..::.:: :: : :: .: :.::..: : :: ::::: XP_005 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIFVM :::::. :: :::::. .::::::::::.:.: ::: :::..:::..:. ..:. .. XP_005 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRDR--DAEIVVKD ::: ... .:..: : .:::::.::::...: ::. ::: :.::::. . .:. 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XP_005 STINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNL 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 LNGEPREFAHEAECFSCHPECQPME-GTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHCVSSCPHGVL .:: ::: . . : : :.:. :: : ::.: : :.:..:.::.:::.:: .:: :. XP_005 YDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQ 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 GAKGPIYKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCLGQTLVLIGKTHLTMALTVIAGLVV ::.. :.:: : . ::.::: :::::: : ..::.: :. .: : .: ::.:: XP_005 GANSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCIGSSIEDCIG----LMDRTPL-IAAGVIGGLF- 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 IFMMLGGTF-LYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKA-NKVLARIFKETELRKL :....: :: .: : . :..:::.::.:: : .::: :: : :.. ::.:::::... 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NP_001 ERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYR 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 KYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAEPYAGLRLAEVPDLLEKGERLAQPQICTIDVYMVMVK :.::::::::::::.:::::::..:: :. :.:::::::::: :: :::::::::::: NP_001 KFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVK 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KE3 CWMIDENIRPTFKELANEFTRMARDPPRYLVIKRESGPGIAPGPEPHGLTNKKLEEVELE ::::: . :: ::::: ::.:::::: :::::. .. . :.:. . .. :.: .:: NP_001 CWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKL-PSPNDSKFFQNLLDEEDLE 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE3 PELDLDLDLEAEEDNLATTTLGSALSLPV---------GTLNRPRG-SQSLLSPSSGY-- .: . : . :. : . : . .: : .:.: NP_001 DMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE3 MPMNQGNLGESCQESAVSGSSERCPRPVSLHPMPRGCLASESSEGHVTGSE----AELQE :. :: .: ..: .:. . .::. : . . :.. : . : .::.: NP_001 APVAQGATAEIFDDSCCNGTLR---KPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE3 KVSMCRSRSRSRSPR--PRGDSAYHSQR-----HSLLTPV---TPLSPPGLEEEDVNGYV . : :.. .. : .. . :.: ..: .: . .:: :.: :: NP_001 EGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPL 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE3 MPDTHLKGTPSSREGTLSSVGLSSVLGTEEEDEDEEYEYMNRRRRHSPPHPPRPSSLEEL NP_001 YLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYF 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >>XP_016859067 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: receptor (1334 aa) initn: 2971 init1: 1332 opt: 3582 Z-score: 1445.5 bits: 279.8 E(85289): 8.9e-74 Smith-Waterman score: 4107; 49.8% identity (71.9% similar) in 1295 aa overlap (16-1264:15-1270) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MRANDALQVLGLLFSLARGS-EVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEVV .: :. . ..::.:: :: : :: .: :.::..: : :: :::: XP_016 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 MGNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIFV ::::::. :: :::::. .::::::::::.:.: ::: :::..:::..:. ..:. . 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XP_016 IPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQ 960 970 980 990 1000 1010 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 RESGPGIAPGPEPHGLTNKKLEEVELEPELDLDLDLEAEEDNLATTTLGSALSLPV---- .. . :.:. . .. :.: .:: .: . : . :. : . XP_016 GDDRMKL-PSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRNQ 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 -----GTLNRPRG-SQSLLSPSSGY--MPMNQGNLGESCQESAVSGSSERCPRPVSLHPM : . .: : .:.: :. :: .: ..: .:. .. ::. : . XP_016 FVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRK---PVAPHVQ 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 PRGCLASESSEGHVTGSE----AELQEKVSMCRSRSRSRSPR--PRGDSAYHSQR----- . :.. : . : .::.:. : :.. .. : .. . :.: XP_016 EDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDL 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 HSLLTPV---TPLSPPGLEEEDVNGYVMPDTHLKGTPSSREGTLSSVGLSSVLGTEEEDE ..: .: . .:: :.: :: XP_016 QALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNP 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >>NP_005219 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal growt (1210 aa) initn: 2900 init1: 1213 opt: 3422 Z-score: 1382.6 bits: 268.0 E(85289): 2.9e-70 Smith-Waterman score: 3422; 47.3% identity (75.0% similar) in 1014 aa overlap (9-1012:11-1014) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEV .:.:: .: .:.. . . :: :: : :. : :... .: .... ::: NP_005 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 VMGNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIF :.:::::. . .: :::::. :.::.::::.:.: .:: ::...::.. :....:. 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