FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5978, 312 aa 1>>>pF1KE5978 312 - 312 aa - 312 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2912+/-0.000537; mu= 16.2442+/- 0.033 mean_var=129.8915+/-36.449, 0's: 0 Z-trim(106.7): 314 B-trim: 850 in 1/51 Lambda= 0.112534 statistics sampled from 14306 (14771) to 14306 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16 Scan time: 5.460 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 859 151.8 1.7e-36 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 831 147.3 3.8e-35 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 831 147.3 3.8e-35 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 831 147.3 3.9e-35 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 826 146.5 6.8e-35 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 814 144.5 2.6e-34 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 808 143.5 5.1e-34 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 797 141.8 1.8e-33 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 795 141.4 2.2e-33 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 795 141.4 2.2e-33 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 795 141.4 2.2e-33 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 777 138.5 1.7e-32 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 770 137.4 3.7e-32 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 769 137.2 4.1e-32 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 758 135.4 1.4e-31 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 752 134.4 2.7e-31 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 751 134.3 3.2e-31 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 750 134.1 3.5e-31 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 738 132.2 1.3e-30 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 708 127.3 3.9e-29 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 466 88.0 2.7e-17 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 447 84.9 2.3e-16 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 231 50.0 9.1e-06 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 231 50.0 9.5e-06 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 228 49.4 1.2e-05 NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 219 48.0 3.3e-05 NP_001269833 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 291) 207 45.9 0.00012 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 206 45.8 0.00014 NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 205 45.7 0.00017 NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 198 44.7 0.00038 NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 195 44.1 0.00051 NP_005277 (OMIM: 600731) neuropeptides B/W recepto ( 333) 192 43.6 0.00068 NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 190 43.3 0.00093 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 191 43.6 0.00094 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 191 43.7 0.001 NP_000785 (OMIM: 126449) D(1A) dopamine receptor [ ( 446) 189 43.3 0.0011 NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 190 43.6 0.0012 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 186 42.6 0.0013 NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 188 43.1 0.0013 XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 188 43.2 0.0014 NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017 NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017 NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017 NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017 NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 185 42.6 0.0017 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 185 42.6 0.0017 NP_076404 (OMIM: 606379) G-protein coupled recepto ( 358) 184 42.3 0.0017 NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 181 41.8 0.0025 NP_113597 (OMIM: 601835) C-C chemokine receptor ty ( 374) 180 41.7 0.0028 NP_004358 (OMIM: 601835) C-C chemokine receptor ty ( 374) 180 41.7 0.0028 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 891 init1: 837 opt: 859 Z-score: 776.4 bits: 151.8 E(85289): 1.7e-36 Smith-Waterman score: 859; 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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 812 init1: 812 opt: 831 Z-score: 751.9 bits: 147.3 E(85289): 3.8e-35 Smith-Waterman score: 831; 40.0% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (4-308:6-310) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY ..... :.::::...:: : :::.:.. :. .: :.: :: . .: :.:::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY :::.::::..: :. : ::..: . .. :.. .:. :..:. .: . ::::.:.: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD :..::.:.:::: : :....: .: :..: . .: : : :: .:.:.:: :: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST . :.::. :::: : : .... ..:..: ..:.. :: .: :.:: ::.. . ::::: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA :.::..:: . :.. : .:..: ... .. . ..:: . ..:::: :::.:::. .: : NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK .. . ...: NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 812 init1: 812 opt: 831 Z-score: 751.9 bits: 147.3 E(85289): 3.8e-35 Smith-Waterman score: 831; 40.0% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (4-308:6-310) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY ..... :.::::...:: : :::.:.. :. .: :.: :: . .: :.:::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY :::.::::..: :. : ::..: . .. :.. .:. :..:. .: . ::::.:.: XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD :..::.:.:::: : :....: .: :..: . .: : : :: .:.:.:: :: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST . :.::. :::: : : .... ..:..: ..:.. :: .: :.:: ::.. . ::::: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA :.::..:: . :.. : .:..: ... .. . ..:: . ..:::: :::.:::. .: : XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK .. . ...: XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 812 init1: 812 opt: 831 Z-score: 751.7 bits: 147.3 E(85289): 3.9e-35 Smith-Waterman score: 831; 40.0% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (4-308:16-320) 10 20 30 40 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTM ..... :.::::...:: : :::.:.. :. .: :.: :: . XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 LDPHLKTPMYFFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVT .: :.:::::::.::::..: :. : ::..: . .. :.. .:. :..:. .: XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 EFFLLATMSYDRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCD . ::::.:.::..::.:.:::: : :....: .: :..: . .: : : :: XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 SNVINHFGCDALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPS .:.:.:: ::. :.::. :::: : : .... ..:..: ..:.. :: .: :.:: :: XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 VQQKKKAFSTCSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIY .. . ::::::.::..:: . :.. : .:..: ... .. . ..:: . ..:::: ::: XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 pF1KE5 TLRNEQVKQAFHDSLKKIAFRLKK .:::. .: :.. . ...: XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 310 320 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 859 init1: 789 opt: 826 Z-score: 747.4 bits: 146.5 E(85289): 6.8e-35 Smith-Waterman score: 826; 41.0% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (5-309:7-313) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDP-QLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPM : :. :::.... : ..: :::. .. :.... :. :: .:. :: :..:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMS ::::.:::::::.:. . ::..: .. . . :.. .:. :..: .:::.: ::::::. NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGC ::::::::.:::: .::.... .. :. .. . . : . :: .: .::: : NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFS :. :.::. :.::.:.: .......:. .: . .. ::: : .:::.::.. :.:::: NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQ :::::. :::. : : . :. :.... . .: .:. . ..:::: .::.::: .::. NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 AFHDSLKKI-AFRLKK :. ...:. :.: NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa) initn: 836 init1: 809 opt: 814 Z-score: 736.9 bits: 144.5 E(85289): 2.6e-34 Smith-Waterman score: 814; 42.7% identity (75.6% similar) in 295 aa overlap (8-299:10-301) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY : :::::... :.:. .::. ..:.:.:...:. ::: .. :::::.:::: NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLF-FADLFGVTEFFLLATMS ::: .::::..:::.. .:..::... .: :.: .:.:::: : : :: : .:::.:. NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGV-ECLLLAVMA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALM--IILPPLSLGFHLEFCDSNVINHF ::: ::::::::::.::. ..:. .: : .. . . :..: .: : . ..:: NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTL--RLPRCGHHEVDHF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 GCDALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKA . .... : .: :: : . :: . . :: ..:::.::.:..:.. :.. ..:: NP_001 LREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FSTCSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQV :.::.::.::::. ::. :..:..:.:. . . . .. . ..:.:: .::::::..: NP_001 FGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KQAFHDSLKKIAFRLKK : :. NP_001 KGALGRLLLGKRELGKE 300 310 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 874 init1: 779 opt: 808 Z-score: 731.7 bits: 143.5 E(85289): 5.1e-34 Smith-Waterman score: 808; 39.1% identity (74.7% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY ...:..: :.::::.. .::..::.:... : :.: :.: .: : .: .:.:::: NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY ::: ::::... ..: .:..: .. . .: :.. .: .:..: ...:: .:.. :.: NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD :::.:::.:: : ::: : :. . :.:. .. : : :::::::.:: :: NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST . :..:. :::: : :.. : .... ::. .. ::.:.. .:... : . ...:::: NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA :.::.:.. . :..::. :..::.. .: .: .::. . . :::: .::.::...::.: NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK . . ... NP_003 LANVISRKRTSSFL 310 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 756 init1: 556 opt: 797 Z-score: 722.1 bits: 141.8 E(85289): 1.8e-33 Smith-Waterman score: 797; 38.6% identity (73.8% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-295) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF :.... .: :.::::::.:..: ..:. .:. :...:.: . :.. .: : .:::. NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR : :::.. .... .: .. :.: : .:.:. :.: .:: .: .::..:.::. NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL :::::::::::.::.. :: .. ::.... . . :.: :: :::.:: :: NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS :.:.. :.:: ..: ...:.. . ..... ...::. :. . :. :.. ..::.::: NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALSTCV 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH :::::: . . :::.:..:.: . :.:.:... . :.:::: .::::.: :.:.: NP_001 SHITVVILFFVPCIFVYMRPAA--TLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIR 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 DSLKKIAFRLKK NP_001 KLCSRKDISGDK 300 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 787 init1: 787 opt: 795 Z-score: 720.2 bits: 141.4 E(85289): 2.2e-33 Smith-Waterman score: 795; 40.1% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (4-307:6-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY .: .. ::::::. : . .: ::..... :...: :. :. : :: .:.:::: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY ::: :::....:.... ::..: . . .: : ...:. ::::. .: :: :::.:.: NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD :::::.: :.: ::: . .: ..: :..... .. :.: .: .. :.:..:. NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST : .... : ::: : ...:... .. . :.::: :: ::::. : . .:::: : NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA :.::.:::.. :: :: ::.: .. : .: ::. . ..:::: .::.:::..:: : NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK .. : :.. NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 787 init1: 787 opt: 795 Z-score: 720.2 bits: 141.4 E(85289): 2.2e-33 Smith-Waterman score: 795; 40.1% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (4-307:6-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY .: .. ::::::. : . .: ::..... :...: :. :. : :: .:.:::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY ::: :::....:.... ::..: . . .: : ...:. ::::. .: :: :::.:.: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD :::::.: :.: ::: . .: ..: :..... .. :.: .: .. :.:..:. XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST : .... : ::: : ...:... .. . :.::: :: ::::. : . .:::: : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA :.::.:::.. :: :: ::.: .. : .: ::. . ..:::: .::.:::..:: : XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK .. : :.. XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 312 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:27:33 2016 done: Tue Nov 8 08:27:34 2016 Total Scan time: 5.460 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]