FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5957, 312 aa 1>>>pF1KE5957 312 - 312 aa - 312 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9057+/-0.000595; mu= 18.2767+/- 0.037 mean_var=82.7118+/-18.624, 0's: 0 Z-trim(106.0): 250 B-trim: 803 in 1/50 Lambda= 0.141023 statistics sampled from 13796 (14121) to 13796 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.495), E-opt: 0.2 (0.166), width: 16 Scan time: 5.890 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 864 186.3 6.8e-47 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 838 181.0 2.6e-45 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 835 180.4 4.1e-45 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 835 180.4 4.1e-45 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 835 180.4 4.1e-45 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 832 179.8 6.3e-45 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 830 179.4 8.2e-45 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 828 179.0 1.1e-44 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 827 178.8 1.2e-44 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 806 174.5 2.4e-43 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 802 173.7 4.2e-43 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 799 173.1 6.4e-43 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 793 171.9 1.5e-42 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 778 168.8 1.2e-41 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 775 168.2 1.9e-41 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 775 168.2 1.9e-41 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 775 168.2 1.9e-41 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 766 166.4 6.8e-41 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 745 162.1 1.3e-39 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 703 153.6 4.9e-37 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 484 109.0 1.3e-23 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 470 106.2 9.2e-23 NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 235 58.4 2.4e-08 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 213 54.0 6.2e-07 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 207 52.7 1.3e-06 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 189 49.2 2e-05 NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 179 47.0 6.8e-05 XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 179 47.0 6.8e-05 NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 179 47.0 6.8e-05 NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 179 47.0 6.8e-05 NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 179 47.1 7e-05 XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 179 47.1 7e-05 XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 179 47.1 7e-05 XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 179 47.1 7e-05 NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 179 47.1 7.2e-05 NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 176 46.4 9.7e-05 XP_016867841 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 176 46.4 0.0001 NP_001139739 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 176 46.4 0.0001 XP_005250508 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 176 46.4 0.0001 NP_001139738 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 176 46.4 0.0001 NP_061843 (OMIM: 605188) probable G-protein couple ( 370) 176 46.4 0.0001 NP_001139737 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 176 46.4 0.0001 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 176 46.5 0.00012 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 176 46.6 0.00013 NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 174 46.0 0.00014 NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 173 45.8 0.00016 NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 170 45.2 0.00023 NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 170 45.3 0.00027 NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 170 45.3 0.00027 NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 170 45.3 0.00029 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 864 init1: 605 opt: 864 Z-score: 962.9 bits: 186.3 E(85289): 6.8e-47 Smith-Waterman score: 864; 42.2% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (2-304:4-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY :: ::.:.:.::::.:. .::...: :... :.:.: ::: .: : .::.:.:::: NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLRNFSLEISFTSVCN-----PRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLA ::: : .::..::: :..: ..:. :.::. .: :..::: :..:: .:.. 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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFST .....:.:::. :. .. .. :.. . ::.::: :: :::.: : . ::::: : NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQA :.::. ::.. :: :: :.. .. .: : ... . ..:::::.::.:::..:: : NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 FKDVLRKISHKKKKH .. .: :.: NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 812 init1: 606 opt: 835 Z-score: 931.0 bits: 180.4 E(85289): 4.1e-45 Smith-Waterman score: 835; 42.6% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (3-306:5-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY :.: :..::::::... . .: .: .... ::..: :: :. : :::.:.:::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLRNFSL-EISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSY ::: :.:: ..:... :..: .:. :.: ...::::::: . ::. :: ::: :.: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCD : :::.: :.:..:: .: .: :.::..::. :. .:: .: .. :::..:. XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFST .....:.:::. :. .. .. :.. . ::.::: :: :::.: : . ::::: : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQA :.::. ::.. :: :: :.. .. .: : ... . ..:::::.::.:::..:: : XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 FKDVLRKISHKKKKH .. .: :.: XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 806 init1: 661 opt: 832 Z-score: 927.5 bits: 179.8 E(85289): 6.3e-45 Smith-Waterman score: 832; 44.8% identity (71.8% similar) in 308 aa overlap (7-308:10-316) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPM :..:.:::. :::..:..:.:.::: .: : :: : :. :: NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKS-----ISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFL :::: :.: ::: ...: :..: ... :.:. ::...: .::.::. :: :: : NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFV-GSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LASMSYDCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVI :: :.:: :.::: :::: .:.: :.: :. .:: .:: . . . . :..: :.: NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DHFTCDSAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQR .:: :: .:::..:::: :: :: .::::.: :.. : .. ::. : ....:::: : NP_003 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KKAFSTCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRN ::::::.::. :: : :.. ::.:.. .: . .: :..: . ..:.:::.:: ::: NP_003 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 QQVKQAFKDVLRKISHKKKKH :.::.:. .:. .:. NP_003 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV 300 310 320 >>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa) initn: 820 init1: 626 opt: 830 Z-score: 925.5 bits: 179.4 E(85289): 8.2e-45 Smith-Waterman score: 830; 43.4% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (3-302:5-305) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY : .. : :::::..: :.:. ..: ....:.:...:: ::: .. :: ::.:::: NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSY ::: ..: :..:::. :..: .. ::.::: .:: :::.:. ::..: .::: :.: NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMG---LQLDFCDSNVIDHF : ::::::::: .::. :.: :. .: : . :::. :.: : . .::: NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCG---VANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 TCDSAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKA . :....:..: ..: :.::. ...: :....:::.::.:..:.: ::. :.:: NP_001 LREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FSTCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQV :.::.::. :::. ::. :.::.. .:. . . .. . :.:.:::.::::::..: NP_001 FGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KQAFKDVLRKISHKKKKH : :. .: NP_001 KGALGRLLLGKRELGKE 300 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 818 init1: 673 opt: 828 Z-score: 923.3 bits: 179.0 E(85289): 1.1e-44 Smith-Waterman score: 828; 41.6% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (3-305:5-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNP-QLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPM : : ...:::..... : ..: ..: .. :.... :: :: .:: : :..:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMS ::::::.: :::.:. : :..: ..:. : .::. .::.:..::.:.: .: ::::.:. 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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 793 init1: 538 opt: 827 Z-score: 922.3 bits: 178.8 E(85289): 1.2e-44 Smith-Waterman score: 827; 40.3% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (3-304:6-308) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPM : : .: :::::..: :.. :.:..... :. :.. ::..: : .::::.::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMS :::: :.: ... . : :..: ..: ...:.. .: : :.: .: .: :...:. NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTC :: :.:::.:: :..::: .: ........:. . . .. ::: :: :::: :: : NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DSAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFS : :: .::::: ...:. ::..: :.. .....:: :: .:..: ::. :.:::. NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQ ::.::. .::. : : ::.:...:. . .. . .... : : :::::.::.:::...:. NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 AFKDVLRKISHKKKKH :.: . .. NP_001 ALKRLQKRKCC 310 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 603 init1: 329 opt: 806 Z-score: 899.2 bits: 174.5 E(85289): 2.4e-43 Smith-Waterman score: 806; 41.9% identity (69.7% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF :.::...:.:.:::::.::..: .:: .:. :...:.: . :. . : .:::. NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC : .: .. ..:: .: .. : : :.: .:.: .:.: :.:..: .::. :.:: NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA :::::::::: :::.. .: :. :..::: . . .:: :: :::::: :: NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS :::...:::: :::. . : . .. :...::. :. . :: : . :.::.::: NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALSTCV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK ::. :: . . :::.:.. .: . . :.:::. : ..:::::.::::.: :.:.: NP_001 SHITVVILFFVPCIFVYMRPAAT--LPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNA-- 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 DVLRKISHKKKKH .::. .: NP_001 --IRKLCSRKDISGDK 300 312 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:15:43 2016 done: Tue Nov 8 08:15:44 2016 Total Scan time: 5.890 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]