FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0835, 314 aa 1>>>pF1KE0835 314 - 314 aa - 314 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0934+/-0.000594; mu= 16.9358+/- 0.036 mean_var=74.7521+/-16.078, 0's: 0 Z-trim(105.8): 92 B-trim: 148 in 1/49 Lambda= 0.148341 statistics sampled from 13928 (13987) to 13928 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.475), E-opt: 0.2 (0.164), width: 16 Scan time: 6.190 The best scores are: opt bits E(85289) NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 1976 433.0 3.7e-121 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 799 181.1 2.5e-45 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 652 149.7 7.3e-36 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 648 148.8 1.3e-35 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 642 147.5 3.2e-35 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 623 143.5 5.5e-34 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 598 138.1 2.2e-32 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 592 136.8 5.5e-32 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 590 136.4 7.2e-32 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 585 135.3 1.5e-31 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 584 135.1 1.8e-31 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 570 132.1 1.4e-30 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 570 132.1 1.4e-30 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 570 132.1 1.4e-30 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 565 131.0 2.9e-30 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 563 130.6 4e-30 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 526 122.7 9.3e-28 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 516 120.6 4.1e-27 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 446 105.6 1.4e-22 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 439 104.1 3.8e-22 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 439 104.1 3.8e-22 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 365 88.3 2.3e-17 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 340 82.9 9e-16 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 333 81.4 2.7e-15 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 322 79.0 1.3e-14 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 318 78.2 2.3e-14 >>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa) initn: 1976 init1: 1976 opt: 1976 Z-score: 2296.1 bits: 433.0 E(85289): 3.7e-121 Smith-Waterman score: 1976; 98.7% identity (99.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_852 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_852 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW :::::::::::::: ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::: NP_852 FLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLLW 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL :::::::::: ::: NP_852 HLRNYTKTPNPLPL 310 >>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa) initn: 785 init1: 465 opt: 799 Z-score: 934.7 bits: 181.1 E(85289): 2.5e-45 Smith-Waterman score: 799; 42.1% identity (72.0% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL :: ... .:.::..:: ...:::.::::::: . .:..:. : :.::: :::: : : NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :::.: :.. : .:.: . . . ..: .::::. :.::::::.:::::..: : ::: NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSL--VLEIFIDISLNIIDK--SNLTLYLDESKTLYD :..::.. .: .:. . : .: :: . .. :. . . : .::: .:: . NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 KLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMV . : .:.:....:: . : :...:.::: :: : ..::. : :: ::::: ::.: : NP_076 ST---KLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 MSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAV .:::.:::....:. .:.. .:: .. . : .:: :::::::::.:::.... NP_076 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 RLLWHLRNYTKTPNALPL ...:.. . : NP_076 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 >>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa) initn: 652 init1: 315 opt: 652 Z-score: 764.9 bits: 149.7 E(85289): 7.3e-36 Smith-Waterman score: 652; 39.2% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL : .. ::......: ....::: ::::::: . :: :. . :::: :::: : . 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NP_058 IHVLGTLWYLP---PLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVAN-GIFFMLWNNKYIKFVMLALNAF-PSCHSFILILGNSKLRQTA ::.:::...:... .:. : : : ..:. :.. ... : :. ::::::::::::.:: NP_058 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNF--LPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTF 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 VRLLW----HLRNYTKTPNALPL : .: ::. .: : NP_058 VVMLRCESGHLKPGSKGPIFS 300 310 >>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 667 init1: 362 opt: 642 Z-score: 753.3 bits: 147.5 E(85289): 3.2e-35 Smith-Waterman score: 642; 37.7% identity (69.2% similar) in 305 aa overlap (1-299:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL : . :.::.:: .:::...::: .:.::: . ::..:. ..:.::: :.:. : . NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :.. ..... : .:: . ... .: ..:.:. :..:::..:::.::: : ::: NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLL-IFDSLVLEIFI--DISLNII--DKSNLTLYLDESKTLY ::.:... :.: ..:. : . .. ::. : . : .. : : :.: .. :: : NP_076 WLKWKID-MVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 -DKLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMK . : ::..: ...:: . : :...: :: :::...:: . :::: :::.: ::.: NP_076 FEPL----TLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 MVMSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQT . ::.:.:.....: . . ..: . ..: .: .: ::.:::. :.::::: NP_076 TMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQT 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 AVRLLWHLRNYTKTPNALPL ::.: NP_076 FVRMLTCRKIACMI 300 >>NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 member (317 aa) initn: 486 init1: 384 opt: 623 Z-score: 731.2 bits: 143.5 E(85289): 5.5e-34 Smith-Waterman score: 634; 38.1% identity (71.4% similar) in 315 aa overlap (1-307:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL :. . .:: .. :.::::. ::: ::.:::: . .:..:. :.: ::: :::: :. :. NP_076 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRIS-LV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE0 VILFDSFLVGLA-SHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLF ..: :. :.. :..: .. . . .: . ::...:::: :. :::.:::.: .:.: NP_076 WLIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 LWLRWRMNGMI-VMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESK-TLYDK :.:.::.. .. :.::. :.::.. .:. .: :. :.: . : : : :. : ... NP_076 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALI-NIHINASINGY-RRNKTCSSDSSNFTRFSS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM : .: . . . ::::.: :. .:.:..:. .: .... . : :.::.::: ..: :. NP_076 LIVLTSTVFI--FIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHR-GVKSVI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALN-----AFPSCHSFILILGNSKLR .:..:. . :::. .:. .:... .. .. :. :.::::: .:::::.::: NP_076 TFFLLYAI--FSLS----FFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLR 240 250 260 270 280 300 310 pF1KE0 QTAVRLLWHLRNYTKTPNALPL :... .: :: . : NP_076 QASLSVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS 290 300 310 >>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 597 init1: 289 opt: 598 Z-score: 702.4 bits: 138.1 E(85289): 2.2e-32 Smith-Waterman score: 598; 35.8% identity (68.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL : : : :: :: .. :.:. ..: ::.::: : .: ::. :: ::: ::.: .: : NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :.... . . : . ... .. :. .: . ::...:::: :::::..:::.: . .:: NP_795 VLVLNWYATEL-NPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI :. :........:. :..:. .:... .: . ..:.: . ...: :: NP_795 HLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINM-NQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMY--LSN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL :. :....::.: : :.:.:. :: .: ....: . ::.: : ..: .:.. : ::: NP_795 T-TVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW .: ..:.:. .. : : :. . : ..:: : :::: ::.::.:: . .:: NP_795 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL :.: ..: NP_795 HVRYWVKGEKPSSS 300 >>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa) initn: 580 init1: 238 opt: 592 Z-score: 695.3 bits: 136.8 E(85289): 5.5e-32 Smith-Waterman score: 592; 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