FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0835, 314 aa 1>>>pF1KE0835 314 - 314 aa - 314 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7418+/-0.00137; mu= 13.5821+/- 0.081 mean_var=74.8084+/-16.219, 0's: 0 Z-trim(99.6): 60 B-trim: 65 in 1/47 Lambda= 0.148286 statistics sampled from 5772 (5811) to 5772 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.501), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16 Scan time: 2.140 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 1976 432.7 1.8e-121 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 799 180.9 1.2e-45 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 652 149.4 3.3e-36 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 648 148.6 6.1e-36 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 642 147.3 1.5e-35 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 623 143.2 2.5e-34 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 598 137.9 9.9e-33 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 592 136.6 2.5e-32 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 590 136.2 3.3e-32 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 585 135.1 6.7e-32 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 584 134.9 8e-32 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 565 130.8 1.3e-30 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 563 130.4 1.8e-30 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 526 122.5 4.2e-28 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 516 120.3 1.8e-27 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 452 106.7 2.7e-23 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 449 106.0 4.2e-23 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 439 103.8 1.7e-22 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 439 103.9 1.7e-22 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 365 88.0 1e-17 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 340 82.7 4e-16 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 333 81.2 1.2e-15 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 322 78.8 5.7e-15 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 318 78.0 1e-14 >>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa) initn: 1976 init1: 1976 opt: 1976 Z-score: 2294.2 bits: 432.7 E(32554): 1.8e-121 Smith-Waterman score: 1976; 98.7% identity (99.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW :::::::::::::: ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS31 FLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLLW 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL :::::::::: ::: CCDS31 HLRNYTKTPNPLPL 310 >>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa) initn: 785 init1: 465 opt: 799 Z-score: 933.3 bits: 180.9 E(32554): 1.2e-45 Smith-Waterman score: 799; 42.1% identity (72.0% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL :: ... .:.::..:: ...:::.::::::: . .:..:. : :.::: :::: : : CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :::.: :.. : .:.: . . . ..: .::::. :.::::::.:::::..: : ::: CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSL--VLEIFIDISLNIIDK--SNLTLYLDESKTLYD :..::.. .: .:. . : .: :: . .. :. . . : .::: .:: . CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 KLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMV . : .:.:....:: . : :...:.::: :: : ..::. : :: ::::: ::.: : CCDS86 ST---KLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 MSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAV .:::.:::....:. .:.. .:: .. . : .:: :::::::::.:::.... CCDS86 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 RLLWHLRNYTKTPNALPL ...:.. . : CCDS86 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 >>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa) initn: 652 init1: 315 opt: 652 Z-score: 763.5 bits: 149.4 E(32554): 3.3e-36 Smith-Waterman score: 652; 39.2% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL : .. ::......: ....::: ::::::: . :: :. . :::: :::: : . CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL .:. :.:. .. ..:.. : . . ..: . :. . :.:: ::::::.:::.: . .:: CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLY-LDESKTLYDKLS ::. : : :.. ..: .:::: .::. .: :: .: :.. :. :. : CCDS86 WLKSRTN-MVLPFMI--VFLLI-SSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEY---F 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 ILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSF : . ::.: .. :.: : . .::..:: ::.:... . : :::.:::: .:::...:: CCDS86 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 LFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLL ..:::..:... . . : . :. . : : . .: ::::::::::::.:...:.: CCDS86 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 WHLRNYTKTPNALPL .:. : : CCDS86 QQLKCCEKRKNLRVT 300 >>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa) initn: 601 init1: 581 opt: 648 Z-score: 758.7 bits: 148.6 E(32554): 6.1e-36 Smith-Waterman score: 648; 38.3% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (8-309:8-313) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL .::::. ..: ...: : :: ::: : .:.... .:::.: ::. : : CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL .:: ::::. .. . . . . . . . : .::::. ::::::...: .::: : : :: CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFD--SLVLEI-FIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDK ::.::.. ..: .:. .:.: . ::. :. . .. .: :.: .. .... : CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM . .: :: : :. . :.: .:..:: ::::.. .. .::: .::::.::..... CCDS58 IHVLGTLWYLP---PLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVAN-GIFFMLWNNKYIKFVMLALNAF-PSCHSFILILGNSKLRQTA ::.:::...:... .:. : : : ..:. :.. ... : :. ::::::::::::.:: CCDS58 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNF--LPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTF 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 VRLLW----HLRNYTKTPNALPL : .: ::. .: : CCDS58 VVMLRCESGHLKPGSKGPIFS 300 310 >>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 667 init1: 362 opt: 642 Z-score: 751.9 bits: 147.3 E(32554): 1.5e-35 Smith-Waterman score: 642; 37.7% identity (69.2% similar) in 305 aa overlap (1-299:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL : . :.::.:: .:::...::: .:.::: . ::..:. ..:.::: :.:. : . CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :.. ..... : .:: . ... .: ..:.:. :..:::..:::.::: : ::: CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLL-IFDSLVLEIFI--DISLNII--DKSNLTLYLDESKTLY ::.:... :.: ..:. : . .. ::. : . : .. : : :.: .. :: : CCDS86 WLKWKID-MVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 -DKLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMK . : ::..: ...:: . : :...: :: :::...:: . :::: :::.: ::.: CCDS86 FEPL----TLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 MVMSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQT . ::.:.:.....: . . ..: . ..: .: .: ::.:::. :.::::: CCDS86 TMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQT 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 AVRLLWHLRNYTKTPNALPL ::.: CCDS86 FVRMLTCRKIACMI 300 >>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa) initn: 486 init1: 384 opt: 623 Z-score: 729.8 bits: 143.2 E(32554): 2.5e-34 Smith-Waterman score: 634; 38.1% identity (71.4% similar) in 315 aa overlap (1-307:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL :. . .:: .. :.::::. ::: ::.:::: . .:..:. :.: ::: :::: :. :. CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRIS-LV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE0 VILFDSFLVGLA-SHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLF ..: :. :.. :..: .. . . .: . ::...:::: :. :::.:::.: .:.: CCDS86 WLIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 LWLRWRMNGMI-VMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESK-TLYDK :.:.::.. .. :.::. :.::.. .:. .: :. :.: . : : : :. : ... CCDS86 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALI-NIHINASINGY-RRNKTCSSDSSNFTRFSS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM : .: . . . ::::.: :. .:.:..:. .: .... . : :.::.::: ..: :. CCDS86 LIVLTSTVFI--FIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHR-GVKSVI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALN-----AFPSCHSFILILGNSKLR .:..:. . :::. .:. .:... .. .. :. :.::::: .:::::.::: CCDS86 TFFLLYAI--FSLS----FFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLR 240 250 260 270 280 300 310 pF1KE0 QTAVRLLWHLRNYTKTPNALPL :... .: :: . : CCDS86 QASLSVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS 290 300 310 >>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 597 init1: 289 opt: 598 Z-score: 701.1 bits: 137.9 E(32554): 9.9e-33 Smith-Waterman score: 598; 35.8% identity (68.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL : : : :: :: .. :.:. ..: ::.::: : .: ::. :: ::: ::.: .: : CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL :.... . . : . ... .. :. .: . ::...:::: :::::..:::.: . .:: CCDS53 VLVLNWYATEL-NPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI :. :........:. :..:. .:... .: . ..:.: . ...: :: CCDS53 HLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINM-NQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMY--LSN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL :. :....::.: : :.:.:. :: .: ....: . ::.: : ..: .:.. : ::: CCDS53 T-TVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW .: ..:.:. .. : : :. . : ..:: : :::: ::.::.:: . .:: CCDS53 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL :.: ..: CCDS53 HVRYWVKGEKPSSS 300 >>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa) initn: 580 init1: 238 opt: 592 Z-score: 693.9 bits: 136.6 E(32554): 2.5e-32 Smith-Waterman score: 592; 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