Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5956
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5956, 312 aa
  1>>>pF1KE5956 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3785+/-0.00128; mu= 15.3551+/- 0.075
 mean_var=150.5665+/-48.667, 0's: 0 Z-trim(102.2): 382  B-trim: 794 in 2/48
 Lambda= 0.104523
 statistics sampled from 6366 (6861) to 6366 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.211), width:  16
 Scan time:  1.870

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11       ( 312) 2046 321.2 6.5e-88
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11       ( 313) 1026 167.4 1.3e-41
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12       ( 309)  981 160.6 1.4e-39
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1        ( 308)  975 159.7 2.6e-39
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11       ( 323)  971 159.1 4.1e-39
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12       ( 311)  968 158.6 5.5e-39
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7        ( 311)  955 156.7 2.2e-38
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11          ( 327)  955 156.7 2.2e-38
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14       ( 331)  955 156.7 2.2e-38
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12      ( 312)  953 156.4 2.7e-38
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1        ( 325)  941 154.6 9.5e-38
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2        ( 331)  940 154.5 1.1e-37
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11       ( 315)  937 154.0 1.4e-37
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12      ( 312)  935 153.7 1.7e-37
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12      ( 312)  935 153.7 1.7e-37
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12       ( 312)  934 153.5 1.9e-37
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2        ( 312)  929 152.8 3.3e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12      ( 316)  928 152.6 3.7e-37
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12      ( 312)  927 152.5   4e-37
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12       ( 314)  925 152.2   5e-37
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1        ( 317)  918 151.1   1e-36
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12      ( 312)  917 151.0 1.1e-36
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12       ( 312)  916 150.8 1.3e-36
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11       ( 317)  912 150.2 1.9e-36
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14     ( 326)  912 150.2   2e-36
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14      ( 324)  909 149.8 2.7e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  904 149.0 4.5e-36
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14      ( 330)  900 148.4   7e-36
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1       ( 322)  899 148.3 7.7e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1        ( 312)  898 148.1 8.3e-36
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12      ( 312)  897 147.9 9.3e-36
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9       ( 320)  895 147.7 1.2e-35
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22       ( 326)  895 147.7 1.2e-35
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11      ( 303)  893 147.3 1.4e-35
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14      ( 345)  892 147.2 1.7e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6       ( 312)  891 147.0 1.7e-35
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12      ( 309)  889 146.7 2.1e-35
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1         ( 317)  885 146.1 3.3e-35
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14       ( 326)  881 145.6 5.1e-35
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9       ( 318)  878 145.1 6.8e-35
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9       ( 319)  875 144.6 9.4e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9          ( 316)  873 144.3 1.1e-34
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11      ( 311)  871 144.0 1.4e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6          ( 357)  868 143.7 2.1e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1          ( 320)  866 143.3 2.4e-34
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11       ( 327)  865 143.1 2.7e-34
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11     ( 301)  863 142.8 3.2e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9        ( 311)  862 142.7 3.6e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11       ( 324)  862 142.7 3.7e-34
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9       ( 318)  861 142.5   4e-34


>>CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11            (312 aa)
 initn: 2046 init1: 2046 opt: 2046  Z-score: 1691.9  bits: 321.2 E(32554): 6.5e-88
Smith-Waterman score: 2046; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMYFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSFDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSFDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCDVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCDVG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFSTCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFSTCA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 SHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGALR
              250       260       270       280       290       300

              310  
pF1KE5 KAMTCPKTGHAK
       ::::::::::::
CCDS31 KAMTCPKTGHAK
              310  

>>CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11            (313 aa)
 initn: 1041 init1: 548 opt: 1026  Z-score: 860.6  bits: 167.4 E(32554): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 1026; 48.2% identity (81.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMYFF
       : : ...::. :..::..  ..  ::... .:: :: .::  ::. .: . ::: :::::
CCDS31 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSFDR
       : :::::.: :::.. ::::. ..  . .: .. :..:..:.::.::.::..:..:::::
CCDS31 LSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSFDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCDVG
       :..::.:::. .::.:. :: :.:. :: .:  :.  :... .::.: .. :.::.::..
CCDS31 YMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCDIA
              130       140       150       160       170          

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFSTCA
       : :..:::.: ..: .. . . ::: .:: :.  ::.::.:.::::::. :.::.:::::
CCDS31 PLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFSTCA
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 SHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGALR
       ::.::::. .:. .:.:.::. .::.  .::..:: :..:::::::::..::..:. .::
CCDS31 SHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLITVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEVLR
     240       250       260       270       280       290         

              310    
pF1KE5 KAMTCPKTGHAK  
       ...           
CCDS31 ETVNRIMTLIQRKT
     300       310   

>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12            (309 aa)
 initn: 1008 init1: 963 opt: 981  Z-score: 824.0  bits: 160.6 E(32554): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 981; 47.2% identity (77.6% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMYFF
       :.: :.. ::::::.     ::. .:: .::::.:.. ::  ::. .  .:.:: :::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSFDR
       : :.::::: .:.  ::..: .....  :: .. :: : :: .:.:.::: .:. ::.::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCDVG
       :..::.:::. :::.:..:.::.. ::. ::  ..   .:. :. :: .:...:.::: :
CCDS31 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFSTCA
       : .. :: :::.:::. .. .....  .:..  .:: ::. .:::::::  . :.::::.
CCDS31 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 SHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGALR
       ::. :.:: ::. .:::. :.:. .  .:: ..:: : .::::::::::.::..:: :..
CCDS31 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
              250       260       270       280       290       300

              310  
pF1KE5 KAMTCPKTGHAK
        ..         
CCDS31 DSVKKIVKL   
                   

>>CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1             (308 aa)
 initn: 986 init1: 956 opt: 975  Z-score: 819.1  bits: 159.7 E(32554): 2.6e-39
Smith-Waterman score: 975; 48.8% identity (77.6% similar) in 299 aa overlap (3-301:5-303)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMY
           : :.  .:.:::::  : ::  ::. ... ::::..::  :.  : .  .:. :::
CCDS31 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 FFLCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSF
       ::: :::::::::::...:: :. ..    .: .. :::: .: : .: ::...:. :..
CCDS31 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 DRYLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCD
       :: :.:: :::. .::.: :  ::::.::: ::. .   : :.  : :::  .:.::.::
CCDS31 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE5 VGPSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFST
       ..: .  :: .:. .::.. . ...:: .: :....::.::.:.:::::::.:..:.:::
CCDS31 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE5 CASHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGA
       :.:::::: . ::...:...: . .... . :.: ::::..::.:::::::.:::::. .
CCDS31 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
              250       260       270       280       290       300

      300       310  
pF1KE5 LRKAMTCPKTGHAK
       : :           
CCDS31 LLKKWKGK      
                     

>>CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11            (323 aa)
 initn: 982 init1: 939 opt: 971  Z-score: 815.6  bits: 159.1 E(32554): 4.1e-39
Smith-Waterman score: 971; 46.9% identity (79.3% similar) in 305 aa overlap (3-307:5-309)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMY
           : : .: :.:::::  . .:  .:.....:::.: .:. :::.  : . ::.: ::
CCDS31 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 FFLCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSF
       ::: :.::::.  .:.:.::.: .....  .: .  :..:....::.:::.:..:..::.
CCDS31 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 DRYLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCD
       ::::.:: ::.. :.:....: ::.:.::..::  :.: :.:. .::::: : :.::. :
CCDS31 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE5 VGPSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFST
         : :. .: :: .:.:.. . . ::. ::: .. .::  ::...:: :.:. ..:.:::
CCDS31 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE5 CASHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGA
       :::::::: ..::. .:.:.: .  .:  .:: .:::. :.::::::::.:.:: .:. :
CCDS31 CASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKVQQA
              250       260       270       280       290       300

      300       310           
pF1KE5 LRKAMTCPKTGHAK         
       ::.:.  :.              
CCDS31 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
              310       320   

>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12            (311 aa)
 initn: 1033 init1: 953 opt: 968  Z-score: 813.3  bits: 158.6 E(32554): 5.5e-39
Smith-Waterman score: 968; 46.5% identity (78.1% similar) in 301 aa overlap (3-303:2-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMYFF
         : :..:::.:::.     ::  .:. .:.::::...::  ::. .... .:: :::::
CCDS31  MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSFDR
       : :.::::: .::. ::..::....   .: .. :  : :: .:.:.::: ::: ::.::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCDVG
       :..::.:::. .::. :::  :.: .:. ::  .:   :::.:: .:..:::.:: ::  
CCDS31 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFSTCA
       : :. .: :: .::..:   .....  .: . ..::.::. .:::::::. ..:.::::.
CCDS31 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 SHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGALR
       ::. :.:. ::. .:::  :.:. . ...: ...::: ..:.:::::::.::..:: :..
CCDS31 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
     240       250       260       270       280       290         

              310  
pF1KE5 KAMTCPKTGHAK
       ...         
CCDS31 NVVHKVVFYANQ
     300       310 

>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7             (311 aa)
 initn: 948 init1: 643 opt: 955  Z-score: 802.8  bits: 156.7 E(32554): 2.2e-38
Smith-Waterman score: 955; 45.9% identity (76.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:3-305)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMY
         ..: : .:.:::.:::   .... .:. ....::::.: : .::  :  .  :. :::
CCDS43 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 FFLCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSF
       ::: :::::: :: ....:::: .:  . . : .. :..: .: . .  :: ..:. :..
CCDS43 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 DRYLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCD
       :::..:: :::.::::.  ::..:::.::..:: : . . ...  : ::: :::.::.::
CCDS43 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE5 VGPSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFST
       ..: :. .: : :: ::.  : .....   :.....::  ::..:: .:  ::.::.:::
CCDS43 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMP--TGKQKAFST
              190       200       210       220         230        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE5 CASHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGA
       :::::.::...:.:..::: :: .  .:..::..:.. .:.:: :::::: .::.::: :
CCDS43 CASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEA
      240       250       260       270       280       290        

      300       310  
pF1KE5 LRKAMTCPKTGHAK
       :.:   :       
CCDS43 LKKLAYCQASRSD 
      300       310  

>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11               (327 aa)
 initn: 959 init1: 702 opt: 955  Z-score: 802.5  bits: 156.7 E(32554): 2.2e-38
Smith-Waterman score: 955; 47.5% identity (76.4% similar) in 297 aa overlap (7-299:10-306)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE5    MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPM
                ..::.:::::.   ::. ::  ..:.:.:.:. : ::: ..  .  :. ::
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80            90       100       110   
pF1KE5 YFFLCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVART----VICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLIL
       :::: :.:::::::.:..:::.:. :: ..     .: .  :. : .: . .: :: ..:
CCDS77 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE5 TIMSFDRYLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVIS
       ..:..:::..:: :::.:.:....::.:.: .::. :: : . ...:.  : .:: :.:.
CCDS77 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE5 HFYCDVGPSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQ
       ::.:::.: :. .: : :  ::   : .:... : :  .  ::. : .:...::::.:. 
CCDS77 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE5 KTFSTCASHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNK
       :.::::::::::: ..:.: .:.: :: : :.:  ::.:::: ....:::::.:: .::.
CCDS77 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
              250       260       270       280       290       300

           300       310          
pF1KE5 EVKGALRKAMTCPKTGHAK        
       ::: ::                     
CCDS77 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
              310       320       

>>CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14            (331 aa)
 initn: 1013 init1: 522 opt: 955  Z-score: 802.5  bits: 156.7 E(32554): 2.2e-38
Smith-Waterman score: 955; 48.0% identity (80.3% similar) in 294 aa overlap (8-300:12-305)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE5     MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIP
                  :::.: :.: ... .. :: ...:.:.:.:.:: ::...: :. ::: :
CCDS32 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE5 MYFFLCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIM
       ::::: ::: :::  :...:::.:..:.  . .: .. :. : .:.::.:..:::.:..:
CCDS32 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE5 SFDRYLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNN-VISHF
       : ::::.::.::..: .:.. .:...::. :: :.. :.  :. .  :::: .. :..::
CCDS32 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE5 YCDVGPSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKT
       .:: :: :. :: .:. ::    . . ::: .:::.. .::  :. :.: ::::.:.::.
CCDS32 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGRQKA
              190       200       210       220       230       240

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE5 FSTCASHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEV
       ::::.::: ::.:.::...:.:.::.  .:   : .:.:..:..:::::::::..::..:
CCDS32 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
              250       260       270       280       290       300

         300       310                
pF1KE5 KGALRKAMTCPKTGHAK              
       : ::.                          
CCDS32 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
              310       320       330 

>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12           (312 aa)
 initn: 1024 init1: 953 opt: 953  Z-score: 801.1  bits: 156.4 E(32554): 2.7e-38
Smith-Waterman score: 953; 46.3% identity (79.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMYFF
       :::.:..:.:::::.      :. ::: ...::.:...:: .::. . ..:.:: :::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSFDR
       : :.::::: .:.. ::..: : :..  .: .. :. : :: .:.:.::: .:. ::.::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCDVG
        ..::.:::.  ::....:  :..:::..:: :.:  .:::.:: ::..:::.:: :: .
CCDS31 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFSTCA
       : :. .: .: .:::.. . .....  .: . ..::  :. .::.::: . ..:.::::.
CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 SHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGALR
       ::. :::. :.. .:::.. .:.    ..: :.:::: ..:::::::::.:::.:: :..
CCDS31 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
              250       260       270       280       290       300

              310  
pF1KE5 KAMTCPKTGHAK
                   
CCDS31 SMVQKMIFSLNK
              310  




312 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 08:15:06 2016 done: Tue Nov  8 08:15:07 2016
 Total Scan time:  1.870 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com