FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3247, 570 aa 1>>>pF1KE3247 570 - 570 aa - 570 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5970+/-0.000943; mu= -2.9425+/- 0.056 mean_var=359.6065+/-75.723, 0's: 0 Z-trim(116.3): 767 B-trim: 1028 in 2/51 Lambda= 0.067633 statistics sampled from 15996 (16905) to 15996 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.803), E-opt: 0.2 (0.519), width: 16 Scan time: 4.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31553.1 ZFP91 gene_id:80829|Hs108|chr11 ( 570) 3852 389.7 5.3e-108 CCDS53487.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 ( 474) 728 84.8 2.7e-16 CCDS31127.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 ( 519) 728 84.8 2.8e-16 CCDS44348.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 ( 524) 728 84.8 2.9e-16 CCDS12261.1 ZNF653 gene_id:115950|Hs108|chr19 ( 615) 592 71.6 3.2e-12 CCDS10986.1 ZNF276 gene_id:92822|Hs108|chr16 ( 539) 578 70.2 7.4e-12 CCDS45554.1 ZNF276 gene_id:92822|Hs108|chr16 ( 614) 578 70.2 8.2e-12 >>CCDS31553.1 ZFP91 gene_id:80829|Hs108|chr11 (570 aa) initn: 3852 init1: 3852 opt: 3852 Z-score: 2052.5 bits: 389.7 E(32554): 5.3e-108 Smith-Waterman score: 3852; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MPGETEEPRPPEQQDQEGGEAAKAAPEEPQQRPPEAVAAAPAGTTSSRVLRGGRDRGRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MPGETEEPRPPEQQDQEGGEAAKAAPEEPQQRPPEAVAAAPAGTTSSRVLRGGRDRGRAA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 AAAAAAAVSRRRKAEYPRRRRSSPSARPPDVPGQQPQAAKSPSPVQGKKSPRLLCIEKVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 AAAAAAAVSRRRKAEYPRRRRSSPSARPPDVPGQQPQAAKSPSPVQGKKSPRLLCIEKVT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 TDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPSRGWRSSRTSVSRHRDTENTRSSRSKTGSLQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPSRGWRSSRTSVSRHRDTENTRSSRSKTGSLQL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 ICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 ICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 RETPKPRRKSGKVKEEKEKKEIKVEVEVEVKEEENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 RETPKPRRKSGKVKEEKEKKEIKVEVEVEVKEEENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KRRKKPPIQYVRCEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 KRRKKPPIQYVRCEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RHAKHHTDQRDYICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 RHAKHHTDQRDYICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KHDADSFYQFSCNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 KHDADSFYQFSCNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 ESLTQPSDGQGLPLLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 ESLTQPSDGQGLPLLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 SGGTEGLVMNSDILGATTEVLIEDSDSAGP :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 SGGTEGLVMNSDILGATTEVLIEDSDSAGP 550 560 570 >>CCDS53487.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 (474 aa) initn: 727 init1: 571 opt: 728 Z-score: 406.1 bits: 84.8 E(32554): 2.7e-16 Smith-Waterman score: 742; 36.5% identity (58.8% similar) in 381 aa overlap (135-497:127-473) 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 VQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPS---RGWRSSRTSVSR : :.:. :: : :.: : :: .. 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CCDS53 HPALLLAPQ-ESPSGPLEPCPSISAPGPLGSSEGS--RPSASPQAPTLLPQQ 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 CLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTEGLVMNSDILGATTEVLIEDSD >>CCDS31127.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 (519 aa) initn: 727 init1: 571 opt: 728 Z-score: 405.6 bits: 84.8 E(32554): 2.8e-16 Smith-Waterman score: 772; 37.1% identity (60.4% similar) in 402 aa overlap (135-497:127-518) 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 VQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPS---RGWRSSRTSVSR : :.:. :: : :.: : :: .. CCDS31 VPGLRGPGGQDGGLVWECSAGHTFSWGPSLSPTPSEAPKPASLPHTTRRSWCSEATSGQE 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 HRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISE : :. .. :.. . : :.: :::. : :...:.::::: . CCDS31 LADLESEHDERTQEARLPRRVGPPPETFP---PPGEEE----GEEEEDNDEDEEEMLSDA 160 170 180 190 200 230 240 250 260 pF1KE3 EEIPFKDDPRD-ETYKPHL----------ERETPK-PRRKSGKV-----KEEKEKKEIKV ....: : : :.: : ::: : :. . . . ... CCDS31 SLWTYSSSPDDSEPDAPRLLPSPVTCTPKEGETPPAPAALSSPLAVPALSASSLSSRAPP 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 EVEVEVKEEEN---EIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRL--------PKR-RKKPPIQYVR .::.:. . . . .. : . : . .. .: ::: :: . . CCDS31 PAEVRVQPQLSRTPQAAQQTEALASTGSQAQSAPTPAWDEDTAQIGPKRIRKAAKRELMP 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 CEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDY :.. ::: .... .::.:: ::::. .:.. ::.:.::. : ..:.: .: : :.: ::: CCDS31 CDFPGCGRIFSNRQYLNHHKKYQHIHQKSFSCPEPACGKSFNFKKHLKEHMKLHSDTRDY 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 ICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKH-DADSFYQFS :::.:::.:..: ::..:: ::::::::::::::::::::::::::..:: .. . .: CCDS31 ICEFCARSFRTSSNLVIHRRIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHQRKHAETVAALRFP 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 pF1KE3 CNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGAL-----ITSTDILGTNPESLTQP :..:::.::: :::.::..:::: .:.: . .: : :.. ::.. : .: CCDS31 CEFCGKRFEKPDSVAAHRSKSHPALLLAPQ-ESPSGPLEPCPSISAPGPLGSSEGS--RP 450 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 SDGQGLP-LLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTE : . : :::. CCDS31 SASPQAPTLLPQQ 510 >>CCDS44348.1 ZNF692 gene_id:55657|Hs108|chr1 (524 aa) initn: 727 init1: 571 opt: 728 Z-score: 405.6 bits: 84.8 E(32554): 2.9e-16 Smith-Waterman score: 772; 37.1% identity (60.4% similar) in 402 aa overlap (135-497:132-523) 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 VQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSALPQEVSIAASRPS---RGWRSSRTSVSR : :.:. :: : :.: : :: .. CCDS44 VPGLRGPGGQDGGLVWECSAGHTFSWGPSLSPTPSEAPKPASLPHTTRRSWCSEATSGQE 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 HRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQLDYDVGEEHQSPGGISSEEEEEEEEEMLISE : :. .. :.. . : :.: :::. : :...:.::::: . CCDS44 LADLESEHDERTQEARLPRRVGPPPETFP---PPGEEE----GEEEEDNDEDEEEMLSDA 170 180 190 200 210 230 240 250 260 pF1KE3 EEIPFKDDPRD-ETYKPHL----------ERETPK-PRRKSGKV-----KEEKEKKEIKV ....: : : :.: : ::: : :. . . . ... CCDS44 SLWTYSSSPDDSEPDAPRLLPSPVTCTPKEGETPPAPAALSSPLAVPALSASSLSSRAPP 220 230 240 250 260 270 270 280 290 300 310 pF1KE3 EVEVEVKEEEN---EIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRL--------PKR-RKKPPIQYVR .::.:. . . . .. : . : . .. .: ::: :: . . CCDS44 PAEVRVQPQLSRTPQAAQQTEALASTGSQAQSAPTPAWDEDTAQIGPKRIRKAAKRELMP 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 CEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDY :.. ::: .... .::.:: ::::. .:.. ::.:.::. : ..:.: .: : :.: ::: CCDS44 CDFPGCGRIFSNRQYLNHHKKYQHIHQKSFSCPEPACGKSFNFKKHLKEHMKLHSDTRDY 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 ICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKH-DADSFYQFS :::.:::.:..: ::..:: ::::::::::::::::::::::::::..:: .. . .: CCDS44 ICEFCARSFRTSSNLVIHRRIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHQRKHAETVAALRFP 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 pF1KE3 CNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGAL-----ITSTDILGTNPESLTQP :..:::.::: :::.::..:::: .:.: . .: : :.. ::.. : .: CCDS44 CEFCGKRFEKPDSVAAHRSKSHPALLLAPQ-ESPSGPLEPCPSISAPGPLGSSEGS--RP 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 SDGQGLP-LLPEPLGNSTSGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTE : . : :::. CCDS44 SASPQAPTLLPQQ 520 >>CCDS12261.1 ZNF653 gene_id:115950|Hs108|chr19 (615 aa) initn: 680 init1: 562 opt: 592 Z-score: 333.0 bits: 71.6 E(32554): 3.2e-12 Smith-Waterman score: 600; 40.0% identity (62.7% similar) in 225 aa overlap (242-455:387-611) 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 EEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLERETPKPRRKSGKVKEEKEKKEIKVEVEVEVK :: : .. .:.:.... . :. . : CCDS12 AMMEGVAAYTQTEPEGSQPSTMDATAVAGIETKKEKEDLCLLKKEEKEEPVAPELATTVP 360 370 380 390 400 410 280 290 300 310 320 pF1KE3 EE-ENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLPKRRKKPP----------IQYVRCEMEGCGT : : : . : : . :. :..:.. ... .: .:::. CCDS12 ESAEPEAEADGEELDGSDMSAIIYEIPKEPEKRRRSKRSRVMDADGLLEMFHCPYEGCSQ 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 VLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDYICEYCARA : . .:.:.. : : :::::.::. : :...: :: :. :.. :: :... CCDS12 VYVALSSFQNHVNLVHRKGKTKVCPHPGCGKKFYLSNHLRRHMIIHSGVREFTCETCGKS 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 FKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKHDADSFYQFSCNICGKKFE :: ...: ::: :::: ::::::::. :::.:::::::::: :. :.:.:. :::.:: CCDS12 FKRKNHLEVHRRTHTGETPLQCEICGYQCRQRASLNWHMKKHTAEVQYNFTCDRCGKRFE 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 KKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNPESLTQPSDGQGLPLLPEPLG : ::: : ::::. CCDS12 KLDSVKFHTLKSHPDHKPT 600 610 >>CCDS10986.1 ZNF276 gene_id:92822|Hs108|chr16 (539 aa) initn: 538 init1: 370 opt: 578 Z-score: 326.3 bits: 70.2 E(32554): 7.4e-12 Smith-Waterman score: 592; 31.8% identity (56.9% similar) in 390 aa overlap (134-498:179-538) 110 120 130 140 150 pF1KE3 PVQGKKSPRLLCIEKVTTDKDPKEEKEEEDDSAL----PQEVSIAASRPS-RGWRSSRT- :::: : . : :. ::: . . CCDS10 YCGVIQVVWGCDQGHDYTMDTSSSCKAFLLDSALAVKWPWDKETAPRLPQHRGWNPGDAP 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 pF1KE3 SVSRHRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQLDYDVGEEHQ-------SPGGI----- ..:. : : . ....:: . . ..: . : : .:: . CCDS10 QTSQGRGTGTPVGAETKTLPSTDVAQPPSDSDAVGPRSGFPPQPSLPLCRAPGQLGEKQL 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 --SSEEEEEEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLERET--PKPRRK-SGKVKEEKEKK :. ... ..: .:: .. ...: :. . . :. : :.:: ::: .: :: : CCDS10 PSSTSDDRVKDEFSDLSEGDV-LSEDENDKKQNAQSSDESFEPYPERKVSGKKSESKEAK 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 EIKVEVEVEVKEEENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLPKRRKKPPIQYVRCEMEGCGT : :: .::. .: : : ..: : .:.. : : .: ..:: . CCDS10 ----------KSEEPRIRK--KPGPKPGWKKK------LRCEREELPTIY-KCPYQGCTA 330 340 350 360 330 340 350 360 370 pF1KE3 VLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKH-HTDQRDYICEYCAR : ...::: .: .. ::::.:...: ... : ::.: ::. :.:::. :.. 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