FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6008, 314 aa 1>>>pF1KE6008 314 - 314 aa - 314 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8801+/-0.00066; mu= 18.3073+/- 0.040 mean_var=91.4989+/-24.526, 0's: 0 Z-trim(104.1): 307 B-trim: 733 in 1/47 Lambda= 0.134081 statistics sampled from 12149 (12532) to 12149 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.457), E-opt: 0.2 (0.147), width: 16 Scan time: 5.880 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1028 210.1 4.9e-54 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 960 196.9 4.4e-50 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 929 190.9 2.8e-48 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 929 190.9 2.8e-48 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 929 190.9 2.8e-48 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 929 190.9 2.9e-48 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 902 185.7 1e-46 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 882 181.8 1.5e-45 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 872 179.9 5.9e-45 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 863 178.2 2e-44 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 863 178.2 2e-44 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 863 178.2 2e-44 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 830 171.8 1.6e-42 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 820 169.8 6.2e-42 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 810 167.9 2.4e-41 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 803 166.5 6e-41 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 769 160.0 5.8e-39 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 750 156.3 7.3e-38 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 744 155.2 1.7e-37 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 742 154.8 2.2e-37 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 523 112.4 1.2e-24 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 464 101.0 3.4e-21 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 202 50.3 6.1e-06 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 190 48.1 3.5e-05 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 190 48.1 3.5e-05 NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 179 46.0 0.00017 XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 179 46.0 0.00017 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 178 45.9 0.0002 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 178 45.9 0.00021 XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 176 45.4 0.00023 XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 176 45.4 0.00024 NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 176 45.4 0.00024 XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 176 45.4 0.00024 NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 172 44.5 0.00035 NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 172 44.5 0.00035 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 172 44.5 0.00037 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 171 44.3 0.00041 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 170 44.1 0.00044 XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 170 44.2 0.0005 NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 170 44.2 0.0005 NP_056542 (OMIM: 162323) substance-P receptor isof ( 311) 166 43.3 0.00076 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 167 43.7 0.00079 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 167 43.7 0.00087 NP_001049 (OMIM: 162323) substance-P receptor isof ( 407) 166 43.5 0.0009 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 164 43.0 0.001 NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 164 43.0 0.0011 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 162 42.7 0.0016 NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 160 42.3 0.0019 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 160 42.3 0.0019 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 160 42.3 0.002 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 1039 init1: 1015 opt: 1028 Z-score: 1091.2 bits: 210.1 E(85289): 4.9e-54 Smith-Waterman score: 1028; 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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 STCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVK :::.::: .. .. :....: ::: .: .:::: :::::..::.:.:..:.::::::: NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 NAFMKVVEKAKYSLDSVF .: ::. 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XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 941 init1: 921 opt: 929 Z-score: 987.7 bits: 190.9 E(85289): 2.8e-48 Smith-Waterman score: 929; 44.8% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (3-310:5-312) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMY :.. ::::.::::. :. : ::..: .:: :. ::: .:. . .:: :::::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAY :::::::.. : .: ...::.:.. ..: ..::. .: .::.: .:. ..:.::. ::: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCD :...:::.:::::. :: ..:: :. : .:.. ::. .. :::: .:.: ::::: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 KPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLST .. :.::. :..:.:.. ... .. .: : ::. : :.:: . :: : .:: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 CGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNA ::::: ...::: :.: .:. : :::: . : .:.:.::.. :::.:..:.:::. .:.: NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 FMKVVEKAKYSLDSVF . ::: .. .:. NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 941 init1: 921 opt: 929 Z-score: 987.6 bits: 190.9 E(85289): 2.9e-48 Smith-Waterman score: 929; 44.8% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (3-310:15-322) 10 20 30 40 pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILIL :.. ::::.::::. :. : ::..: .:: :. ::: .:. . XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 LDSHLHTPMYFFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATV .:: :::::::::::::.. : .: ...::.:.. ..: ..::. .: .::.: .:. . XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 ENYLLSSMAYDRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCM .:.::. ::::...:::.:::::. :: ..:: :. : .:.. ::. .. :::: XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 SNVIHHFFCDKPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHT .:.: ::::: .. :.::. :..:.:.. ... .. .: : ::. : :.:: . XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GKGYQKPLSTCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVY :: : .::::::: ...::: :.: .:. : :::: . : .:.:.::.. :::.:..: XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 pF1KE6 TLRNKDVKNAFMKVVEKAKYSLDSVF .:::. .:.:. ::: .. .:. XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 310 320 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 925 init1: 900 opt: 902 Z-score: 959.5 bits: 185.7 E(85289): 1e-46 Smith-Waterman score: 902; 44.2% identity (74.4% similar) in 301 aa overlap (3-303:8-308) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHT : . . :::.:..: :.:.: .:.. ..::.:: ::: .::: ::::::: NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 PMYFFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSS ::::::::::. . :... :..:..: .:.:::..: :..: ...:.: :: NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 MAYDRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHF :.:::::::: :::::. : : : ::.. .: :: :.... . :: . .: . :: NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FCDKPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKP ::. ::.. :.: . :..:: :.. ::. :.. :.. : :: :. .::. .. : :: NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LSTCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDV ..:::.::.:. ::.: .. ::..: :..:.: :. ..:::.. : :.:..:::::: : NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 KNAFMKVVEKAKYSLDSVF ..: ... NP_001 RGAVKRLMGWE 310 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 898 init1: 732 opt: 882 Z-score: 938.6 bits: 181.8 E(85289): 1.5e-45 Smith-Waterman score: 882; 43.2% identity (76.6% similar) in 303 aa overlap (3-305:5-305) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMY :.:.:.::.::::...:. . :::.. .::.:. ::: .: :. .::.:::::: NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAY ::: ::::: . .:. ..:..:. :: . :.:... :::...: .:. .. ::. :.: NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCD :::.:.::::.: . :: .::. :: : .. :.: . .. .:: . :: : ::::. NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 KPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLST ::.. :. .. : ::. . :.. ... ... :.:: :..:..: .. : : .:: NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 CGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNA :::::....::: ..:: :. :.::.... : .::::... :::.:..:.::::::: : NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQE--KSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 FMKVVEKAKYSLDSVF . ::. . NP_003 LRKVATRNFP 300 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 897 init1: 813 opt: 872 Z-score: 928.0 bits: 179.9 E(85289): 5.9e-45 Smith-Waterman score: 872; 43.8% identity (73.4% similar) in 304 aa overlap (3-305:5-308) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAP-ELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPM : ::.:::::..... : :.: ::. : :::.:: :: .:.. : : ::.:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMA :::: :::. ::.. ...::.: :: .: .::. .::.::.: :...: .::..:: NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFC ::::.:.:.:::: . :. :. : :: . . :: :..: : . :: .: ..:::: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 DKPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLS :.: :. :.:.. . :. .. . . :.. :. : :: : .::: ..:: .: .: NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKN ::.:::... ::::. . :. :.:..: .. :. :. ::.. :::.::.:.:::..::: NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 AFMKVVEKAKYSLDSVF :. .. .: NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 870 init1: 849 opt: 863 Z-score: 918.6 bits: 178.2 E(85289): 2e-44 Smith-Waterman score: 863; 43.6% identity (77.4% similar) in 305 aa overlap (2-305:4-307) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMY .:.: :::::::::.. . .: ::..: ..:..:. :: ...:: :::.:::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAY :::.::::. ..:...:.:..:. .: : ::: ...::::.:: ... .: ::. ::: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCD :::.:::. :.:.. : .:: ::: .: ::... .: . ::.: .: .. : :. :. XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 KPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFA-LLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLS ::. :.: . .: . ...::. .... . ..:.::. :. :::: .. .: .: . XP_011 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKN ::.::: .. : : ..:. ::.: :: :. .:. ::::... :::.:..:.::::.::. XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 AFMKVVEKAKYSLDSVF :..:.. : XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 314 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:41:00 2016 done: Tue Nov 8 08:41:01 2016 Total Scan time: 5.880 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]