Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5473
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5473, 327 aa
1>>>pF1KE5473 327 - 327 aa - 327 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9707+/-0.00123; mu= 12.3044+/- 0.072
mean_var=112.2446+/-32.528, 0's: 0 Z-trim(101.9): 368 B-trim: 812 in 2/45
Lambda= 0.121057
statistics sampled from 6292 (6733) to 6292 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 1.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 2141 385.5 3e-107
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1147 211.9 5.3e-55
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1124 207.9 8.8e-54
CCDS31536.1 OR9G1 gene_id:390174|Hs108|chr11 ( 305) 1112 205.8 3.6e-53
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1110 205.5 4.7e-53
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1096 203.0 2.6e-52
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1083 200.8 1.2e-51
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1078 199.9 2.5e-51
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1077 199.7 2.5e-51
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1068 198.1 7.6e-51
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1066 197.8 9.7e-51
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1060 196.7 2e-50
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1058 196.4 2.5e-50
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1057 196.2 2.9e-50
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1056 196.0 3.3e-50
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1052 195.4 5.4e-50
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1048 194.6 8.5e-50
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1045 194.1 1.2e-49
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1040 193.2 2.2e-49
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1037 192.7 3.2e-49
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1032 191.9 6.1e-49
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1027 191.0 1.1e-48
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1026 190.8 1.2e-48
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1024 190.4 1.5e-48
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1022 190.1 2e-48
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1018 189.4 3.2e-48
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1016 189.0 4e-48
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1014 188.7 5.2e-48
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1011 188.2 7.5e-48
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 1009 187.8 9.6e-48
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1008 187.6 1.1e-47
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1008 187.7 1.2e-47
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1001 186.4 2.5e-47
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 999 186.1 3.4e-47
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 998 185.9 3.6e-47
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 989 184.3 1.1e-46
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 988 184.2 1.3e-46
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 987 184.0 1.4e-46
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 986 183.8 1.5e-46
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 986 183.8 1.6e-46
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 983 183.3 2.2e-46
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 983 183.3 2.2e-46
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 982 183.1 2.5e-46
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 980 182.8 3.2e-46
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 972 181.4 8.4e-46
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 972 181.4 8.4e-46
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 967 180.5 1.5e-45
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 964 180.0 2.2e-45
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 963 179.8 2.5e-45
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 963 179.8 2.5e-45
>>CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 2141 init1: 2141 opt: 2141 Z-score: 2038.9 bits: 385.5 E(32554): 3e-107
Smith-Waterman score: 2141; 99.7% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTDTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTNTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
310 320
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 749 init1: 749 opt: 1147 Z-score: 1101.0 bits: 211.9 E(32554): 5.3e-55
Smith-Waterman score: 1147; 54.7% identity (81.8% similar) in 307 aa overlap (20-326:3-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
...:..:::::::::::..:::..:. :.:. .:: .:. : :: :: ::.::.::
CCDS31 MVIIHSDSHLHTPMYFFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
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CCDS31 GFATVECYLLASMAYDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTDTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
: :::.: :.::::: :::. .::.:::. :... :.::.:. ..:.::::: : ..:
CCDS31 LSFCGSNEINHFFCDIPPLLALSCSDTRI-SKLVVFVAGFNVFFTLLVILISYFFICITI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
:.::: :..:.:::::::: .. .:::...::: .:.:. :.. ::.:..::::. :.:
CCDS31 QRMHSAEGQKKVFSTCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPML
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE5 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
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CCDS31 NPLIYSLRNKEVKSALWKILNKLYPQY
290 300
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1167 init1: 1112 opt: 1124 Z-score: 1079.0 bits: 207.9 E(32554): 8.8e-54
Smith-Waterman score: 1124; 54.4% identity (81.1% similar) in 307 aa overlap (16-321:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MIFPSHDSQAFTSVDMEVG-NCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMT
: :: : ::.:.:::::.: : . .:: .:: :::.::. :..
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LVILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFS
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CCDS31 LIALIKMDSHLHMPMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVF
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pF1KE5 CVVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTF
: .. :::.:::::::::.:::::::::. .: .:: .:.:.:.::::... .: ...
CCDS31 CGMGLTECFLLAAMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RLHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTDTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLA
. ::: .:.::::: ::.. .::.:: . : : . : . . :.:..:::: :. :
CCDS31 QHDFCGPYMINHFFCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ILRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPL
...: ::.:: :::::::::: .: ::::: .::: ::::.:::.::::...::... :.
CCDS31 VVKISSATGRTKAFSTCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPV
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE5 LNPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
.::.:::.:::.::.:.::: .
CCDS31 VNPIIYSFRNKEIKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
290 300 310 320
>>CCDS31536.1 OR9G1 gene_id:390174|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1105 init1: 1105 opt: 1112 Z-score: 1068.0 bits: 205.8 E(32554): 3.6e-53
Smith-Waterman score: 1112; 56.1% identity (79.2% similar) in 303 aa overlap (16-318:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
:. .: :. ::::::::..: : :: ::: .: .:. :: ::
CCDS31 MQRSNHTV-TEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
..:: .:: :::::::: :::::::.::.::::::::..:.:::: ::.::: :.:::
CCDS31 IVLICNDSCLHTPMYFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
.::.:::::::.::::..:: .::::. .:: ::. ::: :: :::.:. : .::
CCDS31 GLAYSECYLLAAVAYDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTDTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
..:: .:::: :::: :::...: . :. .. ... .:. . :: ::. :. ..
CCDS31 FNFCRENIIDDFFCDLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
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CCDS31 LRISSSKGYLKAFSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPML
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE5 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
: .::::::::.:::..:
CCDS31 NLMIYSLRNKDVKEALKKLLP
290 300
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1125 init1: 1103 opt: 1110 Z-score: 1066.0 bits: 205.5 E(32554): 4.7e-53
Smith-Waterman score: 1110; 54.2% identity (80.9% similar) in 299 aa overlap (20-318:3-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
: : .:::::.:.. : . : :: :::..::::: ::. .
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
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CCDS31 IELILLDSCLHTPMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
. .: .:::.:::::.::.:.:: :. ::.: .:. :. :::: ::::: ::.::::
CCDS31 AFITAESFLLASMAYDRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFR
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTDTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
: :: .:...:::::::::. .::.:. . : :.. ::::. : :::.:::::. :...:
CCDS31 LSFCRSNVVEHFFCDAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITI
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
....: ::.:::::::::: .: .:::. .::: ::.:.. . ::.:..::... :.:
CCDS31 MKMRSPEGRQKAFSTCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPML
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE5 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
:::.::::::..: ::.:
CCDS31 NPLVYSLRNKEVKSAFKKTVGKAKASIGFIF
290 300 310
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1121 init1: 1090 opt: 1096 Z-score: 1052.7 bits: 203.0 E(32554): 2.6e-52
Smith-Waterman score: 1096; 52.5% identity (80.6% similar) in 299 aa overlap (20-318:11-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
: : .:::.:::.: . . : .::..::..:. .. ::. .
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGM
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CCDS31 IVLIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFG
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CCDS31 SFLGTECFLLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFR
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CCDS31 LSFCGSNRINHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAV
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CCDS31 LKMPSLEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVL
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310 320
pF1KE5 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
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CCDS31 NPLIYSLKNKDVKKALKKILWKHIL
300 310
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CCDS79 MLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFC
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CCDS79 TFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFI
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CCDS79 LKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEW-LLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLS
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pF1KE5 ILRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPL
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CCDS79 VLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPV
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CCDS79 LNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
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CCDS32 GLTTDPQLQRLLFVVFLGMYTATLLGNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSS
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CCDS32 TVVPQTLVNFLAKRKVISYFGCMTQMFFYAGFATSECYLIAAMAYDRYAAICNPLLYSTI
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pF1KE5 EKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAILRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSL
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CCDS32 LFMYLRPRSSYSLTQDRTVAVIYTVVIPVLNPLMYSLRNKDVKKALIKVWGRKTME
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CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGM
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CCDS31 IVLIRMDYQLHTPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFC
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CCDS31 IFADSECLLLSVMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFR
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CCDS31 LCFCGSNEINHFFCDIPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSV
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CCDS31 NPLIYSLRNKDVKEALKKLKNKILF
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CCDS53 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCM
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