FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5908, 310 aa 1>>>pF1KE5908 310 - 310 aa - 310 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6923+/-0.0013; mu= 13.6812+/- 0.076 mean_var=139.7921+/-41.930, 0's: 0 Z-trim(102.1): 424 B-trim: 733 in 2/49 Lambda= 0.108476 statistics sampled from 6283 (6793) to 6283 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16 Scan time: 2.050 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1466 241.8 5e-64 CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1177 196.6 2.1e-50 CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1158 193.6 1.6e-49 CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1149 192.3 4.8e-49 CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1144 191.4 7.4e-49 CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1141 191.0 1.1e-48 CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1107 185.6 4.1e-47 CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1102 184.9 7e-47 CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1093 183.5 1.9e-46 CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1076 180.8 1.2e-45 CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1066 179.2 3.5e-45 CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1058 178.0 8.4e-45 CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1056 177.6 1e-44 CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1043 175.6 4.2e-44 CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1041 175.3 5.5e-44 CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1002 169.2 3.6e-42 CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 989 167.2 1.5e-41 CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 980 165.8 3.9e-41 CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 959 162.5 3.9e-40 CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 959 162.5 4.1e-40 CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 933 158.4 6.5e-39 CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 932 158.3 7.2e-39 CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 929 157.8 1e-38 CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 928 157.6 1.1e-38 CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 924 157.0 1.7e-38 CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 920 156.4 2.7e-38 CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 918 156.1 3.3e-38 CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 918 156.1 3.3e-38 CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 917 155.9 3.6e-38 CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 912 155.1 6.3e-38 CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 911 155.0 7.2e-38 CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 911 155.0 7.5e-38 CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 907 154.3 1.1e-37 CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 900 153.2 2.3e-37 CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 893 152.1 5e-37 CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 886 151.0 1.1e-36 CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 871 148.7 5.4e-36 CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 870 148.6 6e-36 CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 861 147.1 1.6e-35 CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 858 146.7 2.2e-35 CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 855 146.2 3.1e-35 CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 844 144.5 1e-34 CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 844 144.5 1e-34 CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 844 144.5 1e-34 CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 842 144.2 1.3e-34 CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 835 143.1 2.7e-34 CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 829 142.1 5.1e-34 CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 786 135.4 5.6e-32 CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 785 135.3 6.1e-32 CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 779 134.3 1.2e-31 >>CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 (310 aa) initn: 1466 init1: 1466 opt: 1466 Z-score: 1262.9 bits: 241.8 E(32554): 5e-64 Smith-Waterman score: 1466; 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CCDS31 RKKVTSDND >>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa) initn: 1182 init1: 1155 opt: 1158 Z-score: 1002.4 bits: 193.6 E(32554): 1.6e-49 Smith-Waterman score: 1158; 54.4% identity (80.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF :. :::::::. ::.:.: .:. ::.: .:. :::::::...: :. .:.::.:: CCDS31 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR : .::. : : :. ::.:::: : : :::. ::.:.:. : ::: ::::: . : :: CCDS31 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ :: ::::::::::... .:. .. .:::. .::..:. :...::::::: :.: :::.. CCDS31 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS :.:: ::.:::.:......:::.: :.:.:..:: :.: :::..::: .:::::: : CCDS31 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW :: .:..::::: ::: :.: :::.:::::. : .:::.::::.:.:::.::.::: CCDS31 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 SKKLITDDKR ..... . : CCDS31 GRNVFLEAKGK 310 >>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa) initn: 1149 init1: 987 opt: 1149 Z-score: 994.0 bits: 192.3 E(32554): 4.8e-49 Smith-Waterman score: 1149; 51.4% identity (82.0% similar) in 311 aa overlap (1-310:55-365) 10 20 30 pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFL :: .. ::::.::::.:.: ..:.::.:: CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 pF1KE5 RLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALK-NPMFFFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTT .:..:. ::.::.... .: :: .::.::: .::. :.:.:. :.:.::::.: : CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 ISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVG ::: ::.:.:. : :. .:...: : :::: ::::::: .:... .::.::.:::.: CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 SCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQPLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSY . .::..::.....::::::::::: .::: :::. ::..:.. .:..: ::: :: ... CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 VMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVSHIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMI .:. ::...: :::.::.: :::::: ::: :::::: ::::.:: ..: .::: CCDS31 SLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMA 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 pF1KE5 AVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLWSKKLITDDKR :.:: . . .:::.:::..: :::.:::..:.. ....:.. CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL 330 340 350 360 370 >>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 1164 init1: 1140 opt: 1144 Z-score: 990.6 bits: 191.4 E(32554): 7.4e-49 Smith-Waterman score: 1144; 52.0% identity (81.0% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF :. .:::.:.:::.::.: .:.:::.:: .:. :..:::::...: .:..: .::.:: CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR : ::. : :.::.::.: .. ...:::. :: :.: :.:: :.:.:.. : : CCDS31 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ :: :::::::..:. :::: ::..:.:::. .::. :. . .:::::::::.: :::. CCDS31 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS :::: .:..:....::.:.:.: :.. ...:..:: ..::::.: : . .:::::: : CCDS31 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW :. ::..:: ::::::. : .::.:: ..::::: : .:::.::::.:.:. :::.::: CCDS31 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 SKKLITDDKR . ::. CCDS31 RRDLISSST >>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa) initn: 1155 init1: 1136 opt: 1141 Z-score: 987.6 bits: 191.0 E(32554): 1.1e-48 Smith-Waterman score: 1141; 54.3% identity (81.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:31-334) 10 20 30 pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFL :. .:::::::::::::.: .:.::: :: CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 RLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTI .:. :..::::::... .::.: .::.::: ::. :: ::..::.:::: : .: :: CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 SFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGS ::. :: :.: .:.:. :...:.. : :::. :::::: . ... :: ... .::.:. 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CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS 310 320 330 340 >>CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 1107 init1: 1107 opt: 1107 Z-score: 959.3 bits: 185.6 E(32554): 4.1e-47 Smith-Waterman score: 1107; 52.8% identity (80.5% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF : ..::::.:. :: ::: ... ::.:: .::.:..:: ::...:. :..: .::.:: CCDS31 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR : ::: . :..:::..:.: : : :::. :. :.: : :: ::..... : : CCDS31 LSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAYDC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ :: ::::::::.:::. .: .:.: .:.:. ::..::.. ..:::::::::.: ::::: CCDS31 YVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCDLQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS ::.: ::..:.. ......::: . . :...:. ::...: .::::::: .::::::.: CCDS31 PLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVNLRNHSAEGRHKALSTCAS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW :: :::::::: ::.: ...: ::..:::::: : .:::.::::.:.::: :.:.:: CCDS31 HITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTEDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIAIRRLW 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 SKKLITDDKR ::: CCDS31 SKKENPGRE >>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 1098 init1: 1098 opt: 1102 Z-score: 955.1 bits: 184.9 E(32554): 7e-47 Smith-Waterman score: 1102; 51.5% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF :. ::.:::.:::::..: .::.::.:. .:. :..: .::.... .: .: .::.. 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CCDS31 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW 310 320 >>CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 1059 init1: 1059 opt: 1076 Z-score: 933.1 bits: 180.8 E(32554): 1.2e-45 Smith-Waterman score: 1076; 49.8% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF : ::::::::::::..: .::.::.: .:.....::.::.... .: .:..::.:: CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR : :::. :.: :. .:..:.:.: .. :: :. :: :::. : : .:...: . : :. 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