FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5491, 344 aa 1>>>pF1KE5491 344 - 344 aa - 344 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8205+/-0.000527; mu= 18.7823+/- 0.032 mean_var=87.1056+/-21.008, 0's: 0 Z-trim(107.2): 425 B-trim: 1788 in 2/48 Lambda= 0.137420 statistics sampled from 14711 (15292) to 14711 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.514), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16 Scan time: 5.740 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1286 265.8 9e-71 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 874 184.1 3.5e-46 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 872 183.7 4.6e-46 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 858 180.9 3.2e-45 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 856 180.5 4.3e-45 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 853 179.9 6.3e-45 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 853 179.9 6.3e-45 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 834 176.2 8.7e-44 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 834 176.2 8.7e-44 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 834 176.2 8.7e-44 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 832 175.8 1.1e-43 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 827 174.8 2.2e-43 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 825 174.4 3e-43 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 802 169.8 7e-42 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 792 167.8 2.7e-41 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 790 167.4 3.6e-41 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 785 166.5 7.4e-41 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 781 165.6 1.2e-40 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 777 164.9 2.2e-40 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 757 160.9 3.3e-39 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 569 123.6 5.7e-28 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 515 112.9 9.5e-25 NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 240 58.5 2.7e-08 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 233 57.0 6.4e-08 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 233 57.2 8.4e-08 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 233 57.3 9e-08 NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 221 54.7 3.8e-07 NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 217 53.9 6.3e-07 NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 217 53.9 6.5e-07 NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 217 53.9 6.6e-07 NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 217 53.9 6.6e-07 NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 217 54.0 6.8e-07 NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 217 54.0 7e-07 NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 216 53.8 7.7e-07 XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 217 54.1 8.7e-07 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 1277 init1: 1277 opt: 1286 Z-score: 1391.6 bits: 265.8 E(85289): 9e-71 Smith-Waterman score: 1286; 61.4% identity (87.5% similar) in 303 aa overlap (31-333:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL :.:.::.:::.:::::.::. ::..::.:. NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFF 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI .::..:..: .::.::: :: :::::::. :: :::::. ::.. .:..:. : ::.: NP_001 VIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG :.:::.:.: .:.:.::: :::.:::::.:.::::::: . ::. ::.:.. ..:.:: NP_001 LFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGG 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF :::. .:.:::.:::::::::::.:.::: :::.::::.:.. : . ::.: :: ..: NP_001 FLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFA 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT .:.:: ::: ::.:.:::...::. ::.::.::::::::::::.: :: .:.::::... NP_001 LLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVA 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 pF1KE5 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS . :.:::::::::::::::.::.:.::: :.: NP_001 IFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK 280 290 300 >>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa) initn: 876 init1: 615 opt: 874 Z-score: 950.2 bits: 184.1 E(85289): 3.5e-46 Smith-Waterman score: 874; 42.1% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (33-331:2-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLLI :.. :::::.::::..:: : ..:. ::.. NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTISF :.:...::.:::.. . ...: .::: :: .:. .: . .:.. :::. .:. ..:::. NP_001 YLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISY 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 QGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGFL :::.:::. :::..:...::::::.::: ::: ::...:: .: . . NP_001 AGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVT 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 HSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFFTI .: :. .:..: :::::.::.:.:.. ::: :.:. . .. . . . .. :. NP_001 NSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE5 LLSYG-VILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNS--TFPIDKSM .::: .:. :. ...::::::: ::.::.::: :.. : :. : :: : :: :: . NP_001 CISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVV 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE5 TVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS ... :..:: :::..:...: ::....::... NP_001 AALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH 280 290 300 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 896 init1: 609 opt: 872 Z-score: 947.9 bits: 183.7 E(85289): 4.6e-46 Smith-Waterman score: 872; 46.1% identity (75.5% similar) in 306 aa overlap (32-333:4-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 ELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLL :: ...:::.::::... : : .::. ::. NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTIS :: .:..::: .:. : ...: .:::::::.:::.:. ::...:::..:::::::::: NP_003 IYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTIS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGF : ::. :... .: .: ::. .:::::: :::.:: . :.: : . : .:. .:. NP_003 FAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGL 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVT-GLSMIANGGAICAVTFF :. .:. . .: :: ::: .:.:: ::.::.:..: . ..: : : : . :.. NP_003 LNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVG-TLL 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE5 TILLSYGVILHSL-KTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPI--DK .:: ::. .: :. . .: ::...:: :::::.:..:::.. ::. : ::.:.. . :: NP_003 VILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDK 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE5 SMTVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS .: : . ::::::::.:.. :.:.:. .. :.: NP_003 VASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL 280 290 300 310 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 854 init1: 642 opt: 858 Z-score: 932.9 bits: 180.9 E(85289): 3.2e-45 Smith-Waterman score: 858; 42.8% identity (73.2% similar) in 306 aa overlap (32-334:6-311) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 ELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLL .: . ::::::::. :: : :::. :: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLT 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTIS .: . ..::. ... : . : .::::::..:::.: : . ..:::.:..:::.:.:: NP_006 LYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSIS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGF . :: :... :: .: ..:..::::::.:::.:: ..:.: .:. ... ...:: NP_006 YYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGN 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFFT . :::. : . : .: :::..:.::: :::::.::.: .. . . :... . :. NP_006 MSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFII 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE5 ILLSYGVILHS-LKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTF-P-IDKS :..:: :: : :: .:. :..:.: :::::.: : .. .:.:.::. . : :: NP_006 IIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKI 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE5 MTVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS ..: :.. :.::::::.:.: ..:.: .:. .:: NP_006 ISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS 280 290 300 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 836 init1: 643 opt: 856 Z-score: 930.6 bits: 180.5 E(85289): 4.3e-45 Smith-Waterman score: 856; 40.3% identity (74.8% similar) in 318 aa overlap (20-334:4-319) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL :. .: : :...:.::.::::...:. :..::: :: XP_011 MGDRRADPRPMS--GTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI .:..:..::::::... .. : .::::::..:::.: .: . .:::... . : .:: XP_011 SMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTI 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG :: ::..:... .:. . .::.:::::...:.:.::: :....:.:.. . :. . XP_011 SFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVA 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF :. :.. :.. : ::. :.: .:.::. :::::.:..:... . ....:. . . :. XP_011 NLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KE5 TILLSYGVILHS-LKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSM :: :: : . ::. : .:. ::: ::.::..::.::. : .: : :. .:. XP_011 CILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDT 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE5 --TVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS ::. : .::::::.::.:.: .:.:..:. .. : XP_011 MATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 290 300 310 320 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 836 init1: 643 opt: 853 Z-score: 927.6 bits: 179.9 E(85289): 6.3e-45 Smith-Waterman score: 853; 41.3% identity (77.0% similar) in 305 aa overlap (33-334:5-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLLI :...:.::.::::...:. :..::: :: . 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XP_011 LLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLF 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE5 TVVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS .: ...::::::.::.:.: :.:.: .:: : .:..: XP_011 SVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT 280 290 300 310 344 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 01:14:10 2016 done: Tue Nov 8 01:14:11 2016 Total Scan time: 5.740 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]