Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5475
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5475, 328 aa
  1>>>pF1KE5475 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8280+/-0.00145; mu= 13.3466+/- 0.085
 mean_var=192.2410+/-67.667, 0's: 0 Z-trim(101.0): 383  B-trim: 389 in 1/46
 Lambda= 0.092502
 statistics sampled from 5882 (6339) to 5882 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.195), width:  16
 Scan time:  2.150

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11       ( 328) 2126 297.3 1.1e-80
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11        ( 315) 1425 203.8 1.5e-52
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11      ( 309) 1289 185.6 4.4e-47
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11       ( 344) 1278 184.2 1.3e-46
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11      ( 309) 1154 167.6 1.2e-41
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11      ( 309) 1142 166.0 3.6e-41
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11       ( 370) 1139 165.7 5.2e-41
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11       ( 329) 1130 164.4 1.1e-40
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11       ( 309) 1120 163.0 2.7e-40
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11      ( 309) 1117 162.6 3.6e-40
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11      ( 310) 1087 158.6 5.8e-39
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11       ( 311) 1067 156.0 3.7e-38
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11        ( 312) 1065 155.7 4.4e-38
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11       ( 309) 1039 152.2 4.9e-37
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11       ( 305) 1038 152.1 5.3e-37
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11       ( 318) 1005 147.7 1.2e-35
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17        ( 310) 1004 147.6 1.2e-35
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11       ( 314)  987 145.3 6.1e-35
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14      ( 343)  985 145.1 7.7e-35
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11      ( 311)  967 142.6 3.8e-34
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14       ( 313)  963 142.1 5.6e-34
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11      ( 311)  958 141.4 8.8e-34
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11       ( 309)  954 140.9 1.3e-33
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17       ( 307)  948 140.1 2.2e-33
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14        ( 313)  942 139.3 3.9e-33
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14      ( 310)  939 138.9 5.1e-33
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14       ( 307)  926 137.2 1.7e-32
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14       ( 308)  925 137.0 1.9e-32
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14       ( 348)  909 135.0 8.7e-32
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14       ( 313)  906 134.5 1.1e-31
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11       ( 314)  899 133.6 2.1e-31
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15       ( 316)  896 133.2 2.8e-31
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14       ( 314)  886 131.8 6.9e-31
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14      ( 304)  878 130.7 1.4e-30
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15       ( 313)  859 128.2 8.4e-30
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14       ( 312)  851 127.2 1.8e-29
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15        ( 305)  847 126.6 2.5e-29
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19       ( 305)  847 126.6 2.5e-29
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14        ( 311)  841 125.8 4.4e-29
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1         ( 305)  831 124.5 1.1e-28
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15       ( 312)  831 124.5 1.1e-28
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14        ( 323)  831 124.5 1.1e-28
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1       ( 312)  818 122.8 3.7e-28
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5         ( 312)  818 122.8 3.7e-28
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1        ( 312)  818 122.8 3.7e-28
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8       ( 312)  811 121.8 7.1e-28
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11      ( 311)  807 121.3   1e-27
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14       ( 310)  802 120.6 1.6e-27
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11      ( 316)  796 119.8 2.9e-27
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15      ( 312)  792 119.3 4.1e-27


>>CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11            (328 aa)
 initn: 2126 init1: 2126 opt: 2126  Z-score: 1562.1  bits: 297.3 E(32554): 1.1e-80
Smith-Waterman score: 2126; 99.4% identity (99.7% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLLELLCLDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
              250       260       270       280       290       300

              310       320        
pF1KE5 CEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
       :: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEKLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
              310       320        

>>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11             (315 aa)
 initn: 1422 init1: 761 opt: 1425  Z-score: 1056.7  bits: 203.8 E(32554): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 1425; 72.2% identity (88.2% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
       :: ..:.:::::::..::: :.:.::::::: :.::.:::::: :  :.:::::: ::::
CCDS73 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
       :: ::..:: :::..::::.. :.::: .::...:::::::.:..:::::::::::: ::
CCDS73 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
       :::: ::::::.:::: ::.::::::::::::::. ::: .::::.:::::: :  :::.
CCDS73 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIV-VYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
              130       140       150        160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
       ::::: : ::::::::::.:.: ::::::..:::: ::::. :::::::.: ::: :: :
CCDS73 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSS
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
          ::.: ::::::.::::::::: ::.:::::.::: ::.::::.::.:::.::...: 
CCDS73 GSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLL
     240       250       260       270       280       290         

              310       320        
pF1KE5 CEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
        . :.:                      
CCDS73 GKKLTIFIIGGVSVLM            
     300       310                 

>>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 1289 init1: 1289 opt: 1289  Z-score: 958.7  bits: 185.6 E(32554): 4.4e-47
Smith-Waterman score: 1289; 63.7% identity (85.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
       :.: .:::.:::::.::.:  .:.:::::::.::.:::::::: ::.  : .::: ::::
CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
       :: ::..: :::...::.:.  :.  . .::...::.::::::..::.:::::.::::: 
CCDS31 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
       :::: :::::: :: . ::..::::. .:::.::: :. ..:.::.::::::::  ::::
CCDS31 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
       :::.:.: ::. ::: ::::::. : ..: .:::: ::::. ::. ::. :.::: :: :
CCDS31 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
       :. ::.. ::::::::.::. .::.:: ..:::..:: :::::::.::.::: .:::.::
CCDS31 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
              250       260       270       280       290       300

              310       320        
pF1KE5 CEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
                                   
CCDS31 RRDLISSST                   
                                   

>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11            (344 aa)
 initn: 1322 init1: 1269 opt: 1278  Z-score: 950.3  bits: 184.2 E(32554): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 1278; 60.8% identity (85.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:31-339)

                                             10        20        30
pF1KE5                               MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFL
                                     :. ..:::::.::::::.:. .:.::: ::
CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
               10        20        30        40        50        60

               40        50        60        70        80        90
pF1KE5 LIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFFLAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAI
       :::.::..::::: :: ..: :::: :::::: ::..:..::::..::...::: .: .:
CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
               70        80        90       100       110       120

              100       110       120       130       140       150
pF1KE5 SLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDRYVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGG
       :...::.:::..::..::::.::::::::::.:: :::: :  ::: ::.:.:..: :::
CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
              130       140       150       160       170       180

              160       170       180       190       200       210
pF1KE5 FVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMYPLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFT
       :.::.::..:.:.::.:::::::. .::.::::.: : .::  ::...:::: :: : : 
CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
              190       200       210       220       230       240

              220       230       240       250       260       270
pF1KE5 FLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCISHIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMT
        .:.: ::::. ::: : : ..::. :: ::. :: : ::::::.:.:: :.::.:: ::
CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
              250       260       270       280       290       300

              280       290       300       310       320        
pF1KE5 VFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLWCEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
       :  ..:: :::::::.:...:::.::..:: . .:.. :                   
CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS              
              310       320       330       340                  

>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 1191 init1: 1140 opt: 1154  Z-score: 861.3  bits: 167.6 E(32554): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 1154; 56.1% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-300)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
       :.  .:.:::::::::..: ..: .::.:..:::.:.:: .:: ::  .:::::: ::. 
CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
       :::::..:: ::.. .:.:.   :  : :: ...:: :.: ::..:::: .::.:::::.
CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
       :::: :::::..:::. :: ::. :. .:::.:...::.:...::.:::::::: .::. 
CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
       :::.: : ::... : ..::.:.::.. :..::.:  :::  :.:.: : ::::: ::.:
CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
       :: :: : ::::::.:.::....:.:: ...::..:: :::::::.:....::::...: 
CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKL-
              250       260       270       280       290          

              310       320        
pF1KE5 CEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
       :                           
CCDS73 CSRKDISGDK                  
     300                           

>>CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 1138 init1: 1138 opt: 1142  Z-score: 852.7  bits: 166.0 E(32554): 3.6e-41
Smith-Waterman score: 1142; 55.5% identity (83.1% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-300)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
       :   .:::::.:::::..: ..: .::.: .::: .:.::.:: ::  .:::: : ::::
CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
       :::::..:: ::.. .:::. : : .. .: ...:: :.: ::.. :.::.::.:::::.
CCDS31 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
       :::: ::::: ..:.. :: ::. :. .:::.:...::.:. .::.:::::::: .::.:
CCDS31 YVAICKPLHYTTVMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
        :..: : .:. .:: ..::.:.::..   .::.:: :::  :::.: : ::.:: ::.:
CCDS31 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
       :: :: : :.::::.:.:: ...:.:: ..:::..:: :::::::.::...::::...: 
CCDS31 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKL-
              250       260       270       280       290          

              310       320        
pF1KE5 CEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
       :                           
CCDS31 CSRKAISSVK                  
     300                           

>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11            (370 aa)
 initn: 1172 init1: 960 opt: 1139  Z-score: 849.8  bits: 165.7 E(32554): 5.2e-41
Smith-Waterman score: 1139; 54.1% identity (83.4% similar) in 307 aa overlap (1-306:55-361)

                                             10        20        30
pF1KE5                               MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFL
                                     :. .: :::::::::.:.:.:.. .::.::
CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL
           30        40        50        60        70        80    

               40        50         60        70        80         
pF1KE5 LIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLG-SLMYFFLAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIA
       ..::.:. ::.:: :: ..::.:  : :::::..::..:: .:....::...: :    .
CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT
           90       100       110       120       130       140    

      90       100       110       120       130       140         
pF1KE5 ISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDRYVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIG
       ::. .:: ::: ::...:.::..:..::::::::: ::::: .:::: .: .:. ::  :
CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG
          150       160       170       180       190       200    

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE5 GFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMYPLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIF
       :..::..::.: ..::.::::::.: .::.:::::: : ::...:: :: :.:.::.. :
CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF
          210       220       230       240       250       260    

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE5 TFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCISHIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLM
       ..::.: .:::  :.:.:.: : ::: :: ::: :: : ::::::.:.:: : : .::. 
CCDS31 SLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMA
          270       280       290       300       310       320    

     270       280       290       300       310       320        
pF1KE5 TVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLWCEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
       ..:: :.. .::::::..:..:.:.::. .: ... .                      
CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL             
          330       340       350       360       370             

>>CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11            (329 aa)
 initn: 1118 init1: 1118 opt: 1130  Z-score: 843.8  bits: 164.4 E(32554): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1130; 56.7% identity (82.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:28-327)

                                          10        20        30   
pF1KE5                            MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIY
                                  :   .:.::: .:::.:. .:...:::.:::::
CCDS31 MQLVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIY
               10        20        30        40        50        60

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE5 IVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFFLAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLS
       .::. ::.:: ::  .::.:.: .::::: ::..:..::..:.:::. : : .  .::  
CCDS31 VVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYE
               70        80        90       100       110       120

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE5 ACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDRYVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVH
        ::.:::  :.:::.:..::.:::::::::: ::::  .::.: .: .:. :: .:::.:
CCDS31 CCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLH
              130       140       150       160       170       180

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE5 SVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMYPLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLL
       :.::....  ::.::::::.: .::.:::::. : .:: ::: ::::.:.::.. : .: 
CCDS31 SLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLA
              190       200       210       220       230       240

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE5 ISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCISHIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFY
        :  :::  :...: . : ::: :: .:.::::: :::::: ::.: :..:.:: :..::
CCDS31 ASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFY
              250       260       270       280       290       300

           280       290       300       310       320        
pF1KE5 SIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLWCEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
       .:.: :::::::.::. :.::::..:.                            
CCDS31 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW                          
              310       320                                   

>>CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11            (309 aa)
 initn: 1119 init1: 1119 opt: 1120  Z-score: 836.8  bits: 163.0 E(32554): 2.7e-40
Smith-Waterman score: 1120; 52.8% identity (82.2% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
       :. ..:::::.:::::.. .. : . ..::..:..:.. :::: :: : : :: : ::::
CCDS31 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
       :..:::.:...:....::...: :  . .:::..:. :::.::..::. ..::.::::::
CCDS31 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
       :::: :::::  ::.  :: :..  : .:::.:...:..:.:..:.::::.::: .::..
CCDS31 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
        :: : : ::...:: :. :.:..:..:: .:. :  :::  ::.::.. ::::: :: :
CCDS31 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
       :. ::.: ::::::.:.::: . :.:: :.:  :::: :::::::.::..:.:.:::.::
CCDS31 HLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLW
              250       260       270       280       290       300

              310       320        
pF1KE5 CEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
        .  ... :                   
CCDS31 MKWEALAGK                   
                                   

>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 1117 init1: 1117 opt: 1117  Z-score: 834.7  bits: 162.6 E(32554): 3.6e-40
Smith-Waterman score: 1117; 53.3% identity (85.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
       :. ..:::::.:.::::.: ..:. ::.::..:..:. ::::: ::   : .:.: ::::
CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
       :..:::.:..::.. .:::..: . .:  ::...::.: . ::..:..:..::.::: : 
CCDS31 LTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
       :::: :::.: .::.. .::::..:: .:::.:...::.:   ::.:::::: : .::.:
CCDS31 YVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLELLCIDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
       :::.:.::::. .:: :..:.:.::.. : .:..:  .::  ::. : : : ::: ::::
CCDS31 PLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICLLNFLILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
       :::::.: ::::::.:.: :...:.:: ..:::.... ::::..:.::..:.:.:...::
CCDS31 HIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLW
              250       260       270       280       290       300

              310       320        
pF1KE5 CEMLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
                                   
CCDS31 RKKVTSDND                   
                                   




328 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 01:06:09 2016 done: Tue Nov  8 01:06:10 2016
 Total Scan time:  2.150 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com