FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5476, 329 aa 1>>>pF1KE5476 329 - 329 aa - 329 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0382+/-0.000524; mu= 17.0808+/- 0.032 mean_var=86.4284+/-22.283, 0's: 0 Z-trim(107.4): 362 B-trim: 1824 in 2/47 Lambda= 0.137958 statistics sampled from 14968 (15516) to 14968 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16 Scan time: 5.840 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1282 265.9 7.7e-71 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 842 178.4 1.8e-44 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 842 178.4 1.8e-44 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 842 178.4 1.8e-44 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 830 176.0 9.3e-44 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 830 176.0 9.3e-44 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 830 176.0 9.5e-44 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 813 172.6 9.6e-43 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 805 171.0 2.9e-42 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 794 168.8 1.3e-41 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 789 167.8 2.7e-41 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 788 167.6 3.1e-41 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 785 167.0 4.7e-41 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 781 166.2 8.3e-41 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 779 165.8 1.1e-40 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 769 163.8 4.2e-40 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 755 161.0 2.9e-39 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 753 160.6 3.8e-39 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 742 158.5 1.7e-38 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 734 156.9 5.1e-38 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 559 122.0 1.6e-27 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 513 112.9 9.3e-25 NP_004221 (OMIM: 605111,610419,610419) sphingosine ( 353) 233 57.2 5.9e-08 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 214 53.6 1e-06 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 214 53.6 1.1e-06 NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 199 50.4 6.3e-06 NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 199 50.5 7e-06 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 198 50.3 7.9e-06 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 198 50.3 7.9e-06 NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 196 50.0 1.2e-05 XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 196 50.0 1.3e-05 NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 194 49.5 1.3e-05 NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 193 49.2 1.4e-05 XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 193 49.3 1.6e-05 XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 193 49.3 1.6e-05 XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 193 49.3 1.6e-05 XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 193 49.4 1.9e-05 XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 193 49.4 1.9e-05 XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 193 49.5 2.2e-05 NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 191 48.9 2.2e-05 XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 193 49.5 2.3e-05 NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 193 49.5 2.4e-05 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 189 48.4 2.4e-05 XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 190 48.7 2.5e-05 NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 188 48.3 3.1e-05 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 186 47.8 3.7e-05 NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 188 48.4 3.8e-05 NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 185 47.6 4.4e-05 NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 184 47.5 5.2e-05 XP_011543933 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 182 47.1 6.8e-05 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 1279 init1: 1279 opt: 1282 Z-score: 1392.8 bits: 265.9 E(85289): 7.7e-71 Smith-Waterman score: 1282; 61.2% identity (87.3% similar) in 299 aa overlap (28-326:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MQLVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIY :. .:.::: .:::..: ..:...::::..:: NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIY 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYE ..:: : .:::::::.::.:.::.:. :: :::::. ::: .:.::. ::: ..: .. NP_001 IITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFN 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 CCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLH ::.:.:: ::.::.: :::::::::.::::::::: :::.. .::.:.::.:.::::: NP_001 GCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLH 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 SLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLA . .:.:... :::::::::.:: ::: :::..:::.:... :...::::.:::::: .: NP_001 ATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLL 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 ASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFY .::.::: :::.:: ..: :::::: .:. :: ::::::::.:..: .:::::: .:.:: NP_001 VSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFY 220 230 240 250 260 270 310 320 pF1KE5 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW ..:::::::::::.: ..:::.::: NP_001 TMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK 280 290 300 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 823 init1: 596 opt: 842 Z-score: 919.4 bits: 178.4 E(85289): 1.8e-44 Smith-Waterman score: 842; 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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 TVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECC :: ::.::..... . : .:.::::.::::.: .: . .::..:. . : .:::. : XP_011 TVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGC 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 MAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSL ..:.. . .. .. .::.:::::..::.:.::: :. ::..:::.::. :. . :. : XP_011 LTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVL 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 VQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAAS .. ::. : ::. :.:.:: ::. :::...:..:.. ........:. . :: . :: XP_011 LHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILAS 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE5 YIVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKN-MA-LF :. : . :. :. :: ::.::::.:. :: ::. : .: .:.:. .:. :: .. XP_011 YMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVL 220 230 240 250 260 270 300 310 320 pF1KE5 YGILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW : ..::::::.::.:::. .:.:..:. XP_011 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 280 290 300 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 805 init1: 609 opt: 830 Z-score: 906.6 bits: 176.0 E(85289): 9.3e-44 Smith-Waterman score: 830; 41.8% identity (77.8% similar) in 297 aa overlap (33-326:8-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVV ...::..::::.. . :..::: :: .:.. NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 TVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECC :: ::.::..... . : .:.::::.::::.: .: . .::..:. . : .:::. : NP_036 TVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGC 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 MAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSL ..:.. . .. .. .::.:::::..::.:.::: :. ::..:::.::. :. . :. : NP_036 LTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVL 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 VQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAAS .. ::. : ::. :.:.:: ::. :::...:..:.. ........:. . :: . :: NP_036 LHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILAS 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE5 YIVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKN-MA-LF :. : . :. :. :: ::.::::.:. :: ::. : .: .:.:. .:. :: .. NP_036 YMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVL 220 230 240 250 260 270 300 310 320 pF1KE5 YGILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW : ..::::::.::.:::. .:.:..:. NP_036 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 280 290 300 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 805 init1: 609 opt: 830 Z-score: 906.4 bits: 176.0 E(85289): 9.5e-44 Smith-Waterman score: 830; 41.8% identity (77.8% similar) in 297 aa overlap (33-326:18-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVV ...::..::::.. . :..::: :: .:.. XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 TVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECC :: ::.::..... . : .:.::::.::::.: .: . .::..:. . : .:::. : XP_011 TVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGC 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 MAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSL ..:.. . .. .. .::.:::::..::.:.::: :. ::..:::.::. :. . :. : XP_011 LTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 VQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAAS .. ::. : ::. :.:.:: ::. :::...:..:.. ........:. . :: . :: XP_011 LHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILAS 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KE5 YIVILYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKN-MA-LF :. : . :. :. :: ::.::::.:. :: ::. : .: .:.:. .:. :: .. XP_011 YMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 pF1KE5 YGILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW : ..::::::.::.:::. .:.:..:. XP_011 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 290 300 310 320 >>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa) initn: 836 init1: 579 opt: 813 Z-score: 888.4 bits: 172.6 E(85289): 9.6e-43 Smith-Waterman score: 813; 39.5% identity (74.6% similar) in 299 aa overlap (34-329:6-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 VLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVT .:::..:::... :.: ..:. ::..:.:. NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCM :::::... . :: .:.: :: .:. .: . ..:. ::... : :::: :: NP_001 FLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCM 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLV .::: . :.:..:.:.:::::::::: ::: .:::..:.:. :.... . .: : NP_001 SQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASY . :.. : :::::.:.:: :.. ::: ..:. . . ..: . . . . .:.. :: NP_001 HTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISY 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 -IVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFS--TLPIDKNMALFY ..:. :: ....:. ::.:::..:. ::.:.. : :.::..: : :. :: .: .: NP_001 GFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALY 220 230 240 250 260 270 310 320 pF1KE5 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW ..:: :::..:...:.:.. ..::.:.. NP_001 TLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH 280 290 300 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 802 init1: 533 opt: 805 Z-score: 879.7 bits: 171.0 E(85289): 2.9e-42 Smith-Waterman score: 805; 39.5% identity (75.7% similar) in 296 aa overlap (37-329:15-310) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVTVCG :...:.:. ... :.::: :..:..:. : NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 NMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCMAQL :..:.. . : .:.::::.::::.: :..: :.:... .:::: :: :: NP_001 NLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLVQLL . . :: .: .::.::.::::.:.:.::: :..: ..: .:. ..:..:: .: .. NP_001 YFVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAASYIVI ...:.:.:: ..:: :.. ::...:..:.: : .. .:... :. .... .:: .: NP_001 FTFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAI 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LYS-LRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKN--MALFYGIL . . :: .:. : :...:::::...:.:::.: . :..: : :.. .:::: .. NP_001 VRAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVV 230 240 250 260 270 280 310 320 pF1KE5 TPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW :: ::::::::::. :..:...:. : NP_001 TPSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE 290 300 310 >>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa) initn: 817 init1: 611 opt: 794 Z-score: 867.9 bits: 168.8 E(85289): 1.3e-41 Smith-Waterman score: 794; 40.0% identity (76.3% similar) in 295 aa overlap (35-327:10-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIYVVTV .::..::.:.. : ::.:: .:: .:.::: NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 CGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECCMA ::.::...:.:. : .::::::::::: : :. .. ::.... ....::: :.. NP_002 VGNVLIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLT 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 QLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSLVQ ::. : ... ..:.::::::::::: ::: :: :. .:: .:... :. . :..:.. 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