Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6045
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6045, 317 aa
1>>>pF1KE6045 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4105+/-0.00127; mu= 9.3261+/- 0.073
mean_var=160.0612+/-55.417, 0's: 0 Z-trim(102.5): 373 B-trim: 828 in 2/46
Lambda= 0.101375
statistics sampled from 6494 (6991) to 6494 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 2097 319.6 2e-87
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1848 283.2 1.8e-76
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1504 232.9 2.6e-61
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1415 219.9 2.2e-57
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1334 208.0 7.8e-54
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1278 199.8 2.3e-51
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1237 193.8 1.5e-49
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1220 191.3 8.4e-49
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1140 179.6 2.7e-45
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1138 179.3 3.3e-45
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1116 176.1 3.2e-44
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1111 175.4 5.2e-44
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1098 173.5 2e-43
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1081 171.0 1.1e-42
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1076 170.3 1.9e-42
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1068 169.1 4.2e-42
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1067 168.9 4.5e-42
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1064 168.5 6.2e-42
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1052 166.8 2.1e-41
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1037 164.6 9.4e-41
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1036 164.4 1e-40
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1012 160.9 1.2e-39
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1001 159.3 3.8e-39
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 979 156.1 3.4e-38
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 949 151.7 7.5e-37
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 941 150.5 1.6e-36
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 939 150.3 2e-36
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 937 149.9 2.4e-36
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 931 149.1 4.3e-36
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 921 147.6 1.2e-35
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 918 147.2 1.7e-35
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 909 145.9 4.1e-35
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 905 145.3 6.1e-35
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 903 145.0 7.5e-35
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 901 144.7 9.2e-35
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 891 143.2 2.5e-34
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 884 142.2 5.1e-34
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 875 140.9 1.3e-33
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 837 135.4 6.5e-32
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 791 128.6 6.5e-30
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 789 128.3 7.7e-30
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 777 126.5 2.6e-29
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 758 123.8 2e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 751 122.7 3.7e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 734 120.3 2.1e-27
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 731 119.8 2.8e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 721 118.4 7.7e-27
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 677 111.9 6.6e-25
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 671 111.1 1.3e-24
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 665 110.2 2.3e-24
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 2097 init1: 2097 opt: 2097 Z-score: 1682.9 bits: 319.6 E(32554): 2e-87
Smith-Waterman score: 2097; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 TKQIRERVLRIFLKTNH
:::::::::::::::::
CCDS31 TKQIRERVLRIFLKTNH
310
>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1883 init1: 1836 opt: 1848 Z-score: 1486.2 bits: 283.2 E(32554): 1.8e-76
Smith-Waterman score: 1848; 89.1% identity (95.5% similar) in 313 aa overlap (5-317:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
: .: :::: ::::::::::::::::::: ::: :::.:::::.:..::::::::
CCDS53 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
::::::: :::::::::.:::::::::::::::: ::::::: ::.::::::::.:::::
CCDS53 LHEPMYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS53 LVAMAFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRII
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
:::::::::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::..::::::::::::::::
CCDS53 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
:::::::::::::::: :::::::.:: :::.:::::::.::::::::::.:::::::::
CCDS53 KALNTCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRERVLRIFLKTNH
::.::: :::::.::.:
CCDS53 TKHIRETVLRIFFKTDH
300 310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1496 init1: 1471 opt: 1504 Z-score: 1214.3 bits: 232.9 E(32554): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 1504; 69.0% identity (90.0% similar) in 310 aa overlap (5-314:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
: . : :.:.: :::::::::. .::::. :: .:::.:..:: ..::::.::.:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
::.::.::::::. :::::::.:::::::::::: .:::::::: .:::::.::.::...
CCDS31 LHQPMFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
::.::.::..:::.::.::::::.: ::..:...: :.: .:.:.:::.:::::::: :.
CCDS31 LVVMAYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
::::::: :.: :::: ::.:: .:: :: ...::::: ::: :: ::: ::: ..::
CCDS31 PHTYCEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
::.::::::. :.: :.:::::::.:::::.:::.::::.::::::::::::::::::::
CCDS31 KAFNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRERVLRIFLKTNH
::::::....::..
CCDS31 TKQIREQIVKIFVQKE
300 310
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 1432 init1: 1407 opt: 1415 Z-score: 1143.8 bits: 219.9 E(32554): 2.2e-57
Smith-Waterman score: 1415; 66.6% identity (87.5% similar) in 311 aa overlap (5-314:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
: : ::::::::::::::::: .::::: :: ::..::.:: ..:.::.:..:
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
::.::.:::::: . :.:::::::::::::::.: . : : .::..::::: :: ::: :
CCDS31 LHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVL-RSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRI
:::::.: :.:::.::.:. :::.:..:.: :..:. :.: .:.: ..:.:::::::...
CCDS31 LVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVI-GLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEAR
::::::::::.:.:.:::::.:: .:: : :..:. .: ::::.:: ::: ::. :::
CCDS31 IPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEAR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGV
::.:.:::::. :::::.:::.:::.:::::.:.:.::::.:::::::::: ::::::::
CCDS31 LKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 RTKQIRERVLRIFLKTNH
::::: . : .:.:.
CCDS31 RTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
300 310 320
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1351 init1: 1327 opt: 1334 Z-score: 1080.0 bits: 208.0 E(32554): 7.8e-54
Smith-Waterman score: 1334; 59.4% identity (87.4% similar) in 310 aa overlap (5-314:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
: :.. ::: .:.:.::::::: :.::. :: :::::::::...:.::..::.
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
:.:::.::::.:..:::.:::...:.:::::::...::..:.:...::.:: ::.::. :
CCDS31 LREPMFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
:.:::::::.:.: ::.:. ::::... :. :.: . ...:.:.:. ::::: .::
CCDS31 LLAMAFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHII
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
:.::::::::.:.:..:..: .:: .:...:...:: .::: :: ::: ::: .:.:
CCDS31 AHSYCEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
:::.:::.:.::: .:. :. ::::::::::.:: ::::..::::...::.:::.:::::
CCDS31 KALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRERVLRIFLKTNH
::::::::: .: :
CCDS31 TKQIRERVLYVFTKK
300 310
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1237 init1: 819 opt: 1278 Z-score: 1035.6 bits: 199.8 E(32554): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1278; 59.6% identity (85.6% similar) in 312 aa overlap (5-312:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAGRMSTSNHTQFH-PSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQ
:: :: .. : :..:.: :::::: .:.::..:: .:::::.::.::..:: ..
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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CCDS31 ILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRV
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CCDS31 AQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPIL
240 250 260 270 280 290
300 310
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CCDS31 YGARTKEIRSRLLKLLHLGKTSI
300 310
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CCDS31 RIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQ
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CCDS31 DACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMV
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300 310
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CCDS31 YGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
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CCDS53 LHVPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAI
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CCDS53 HKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGV
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CCDS53 KTKQIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
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CCDS31 AHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEAR
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