Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6090
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6090, 325 aa
  1>>>pF1KE6090 325 - 325 aa - 325 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7920+/-0.00127; mu= 12.9651+/- 0.076
 mean_var=133.8570+/-45.606, 0's: 0 Z-trim(101.9): 370  B-trim: 821 in 2/43
 Lambda= 0.110855
 statistics sampled from 6249 (6712) to 6249 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.206), width:  16
 Scan time:  1.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11      ( 325) 2156 357.2   1e-98
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11      ( 312) 1465 246.6 1.9e-65
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11      ( 317) 1405 237.1 1.5e-62
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11      ( 313) 1362 230.2 1.7e-60
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11      ( 311) 1273 215.9 3.3e-56
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11      ( 320) 1237 210.2 1.8e-54
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11      ( 323) 1183 201.6 7.2e-52
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11      ( 318) 1154 196.9 1.8e-50
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11      ( 335) 1123 192.0 5.7e-49
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11      ( 321) 1120 191.5 7.7e-49
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11      ( 316) 1119 191.3 8.6e-49
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11      ( 321) 1115 190.7 1.3e-48
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11       ( 320) 1093 187.2 1.5e-47
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11      ( 314) 1073 184.0 1.4e-46
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11      ( 317) 1071 183.6 1.8e-46
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11       ( 312) 1068 183.2 2.4e-46
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11      ( 314) 1061 182.0 5.3e-46
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11      ( 329) 1059 181.7 6.8e-46
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11      ( 324) 1040 178.7 5.5e-45
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11      ( 312) 1011 174.0 1.3e-43
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11      ( 342) 1006 173.3 2.5e-43
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11       ( 314)  992 171.0 1.1e-42
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11      ( 314)  981 169.2 3.8e-42
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11      ( 315)  979 168.9 4.7e-42
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11      ( 318)  970 167.5 1.3e-41
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11        ( 320)  963 166.4 2.8e-41
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11      ( 326)  956 165.3 6.1e-41
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11      ( 312)  944 163.3 2.3e-40
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11      ( 324)  943 163.2 2.6e-40
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11      ( 321)  936 162.1 5.6e-40
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11      ( 312)  931 161.2 9.6e-40
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11      ( 317)  922 159.8 2.6e-39
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11      ( 313)  912 158.2 7.9e-39
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11      ( 350)  910 157.9 1.1e-38
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11      ( 312)  906 157.2 1.5e-38
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11      ( 324)  899 156.1 3.4e-38
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11      ( 320)  896 155.7 4.7e-38
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11      ( 354)  893 155.2   7e-38
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11      ( 313)  881 153.2 2.4e-37
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11        ( 310)  803 140.8 1.4e-33
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11      ( 318)  800 140.3   2e-33
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11      ( 365)  760 134.0 1.8e-31
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11      ( 313)  752 132.6   4e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11      ( 324)  747 131.8 7.1e-31
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11      ( 315)  730 129.1 4.6e-30
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11      ( 320)  723 128.0   1e-29
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11      ( 323)  709 125.8 4.8e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11      ( 319)  690 122.7 3.9e-28
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7       ( 310)  681 121.3   1e-27
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1        ( 312)  677 120.6 1.6e-27


>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11           (325 aa)
 initn: 2156 init1: 2156 opt: 2156  Z-score: 1885.6  bits: 357.2 E(32554): 1e-98
Smith-Waterman score: 2156; 99.7% identity (99.7% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHTY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
              250       260       270       280       290       300

              310       320     
pF1KE6 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
              310       320     

>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11           (312 aa)
 initn: 1488 init1: 1465 opt: 1465  Z-score: 1288.6  bits: 246.6 E(32554): 1.9e-65
Smith-Waterman score: 1465; 68.5% identity (87.7% similar) in 308 aa overlap (5-312:5-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
           :::.:.:  :::::::::.::::::.:::: ::.::..::.:::.::::. :::::
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
       ::::::::.  :.::::.::::::::::.::. : : .:: :::::: :: ::...::.:
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
       ::: .:::::::::. :::::..:...  :  : :..: : ..::: :::::....::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
       ::: ::: :.:: ::::::::: .:  .. :. .:: ::: :: ::::::....:::...
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
       ::::::::.: :::::.:::::::::.:.:.::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS31 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
              250       260       270       280       290       300

              310       320     
pF1KE6 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
        . . ::..:..             
CCDS31 REQIVKIFVQKE             
              310               

>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11           (317 aa)
 initn: 1425 init1: 1397 opt: 1405  Z-score: 1236.7  bits: 237.1 E(32554): 1.5e-62
Smith-Waterman score: 1405; 66.2% identity (87.1% similar) in 311 aa overlap (1-310:5-314)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE6     MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSS
           :   : ::::::::::::::::: .::::: ::  ::..::.:: ..:.::.:..:
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE6 LHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAV
       ::.::.:::::: . :.:::::::::::::::.: . : : .::..::::: :: ::: :
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140        150       160       170     
pF1KE6 LVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVI-GLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHV
       :::::.: :.:::.::.:. :::.:..:.: :..:. :.: .:.: ..:.: :::::...
CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVL-RSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRI
              130       140       150        160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE6 IPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEAR
       ::::::::::.:.:.:::::.:: .::  :  :..:. .: ::::.:: ::: ::. :::
CCDS31 IPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEAR
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE6 LKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGV
       ::.:.:::::. :::::.:::.:::.:::::.:.:.::::.:::::::::: ::::::::
CCDS31 LKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGV
     240       250       260       270       280       290         

         300       310       320     
pF1KE6 RTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       ::::: . : .:.:.               
CCDS31 RTKQIRERVLRIFLKTNH            
     300       310                   

>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11           (313 aa)
 initn: 1383 init1: 1358 opt: 1362  Z-score: 1199.6  bits: 230.2 E(32554): 1.7e-60
Smith-Waterman score: 1362; 64.6% identity (87.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
       : . :::::: :::::::::::: .:::::::: .::.:::.:: .:..::.:..:::.:
CCDS53 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
       :.: :::: . :..::::::::::::::.:.. : : . :.:::::: ::.::: :::::
CCDS53 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140        150       160       170         
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVI-GLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHT
       :.: :.:::.:: :. :::.:..:.: :..:. :.: .::: ..:.: :::::...::::
CCDS53 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVL-RSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHT
              130       140       150        160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 YCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSL
       ::::::.:.:.:::::.::..:: .:  :..:. .: ::...:: ::: ::. :::::.:
CCDS53 YCEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKAL
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 STCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQ
       .:::::. ::::: :::.:::.:: ::...:.::::.:::::::::: :::::::::::.
CCDS53 NTCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKH
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320     
pF1KE6 IYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       : . : .:...               
CCDS53 IRETVLRIFFKTDH            
     300       310               

>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11           (311 aa)
 initn: 1325 init1: 1271 opt: 1273  Z-score: 1122.7  bits: 215.9 E(32554): 3.3e-56
Smith-Waterman score: 1273; 55.9% identity (85.5% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
       ::  : . ::: .:.:.:::::: .:.::. :::.::..::.:: :::::::....:..:
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
       ::::::.:.: :..:::...:.::::::.. . : . ::..:::.:: :: ::. ::.::
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
       :.: :::.: ::.:..:::..:.  :.. . .: .....: . ::  ::::  :.: :.:
CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
       :::::.:.:::..:.:: :::: ..  .:.....:..:::.:: ::::::.:.:.::.::
CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
       :::.:: :: .:: :..:::.:::::...: :::::.::::...:: :::.:::::::::
CCDS31 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
              250       260       270       280       290       300

              310       320     
pF1KE6 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
        . :  .. ..              
CCDS31 RERVLYVFTKK              
              310               

>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11           (320 aa)
 initn: 1220 init1: 757 opt: 1237  Z-score: 1091.4  bits: 210.2 E(32554): 1.8e-54
Smith-Waterman score: 1237; 54.1% identity (83.8% similar) in 314 aa overlap (1-313:7-318)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE6       MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTD
             :.. : ....:. :.:.:::::: .:.:::.::: .:..:..::  .: .: ..
CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE6 SSLHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMES
        :::.:::.::.::: ::. :::: .:: :.:::.. : : : .:::::::.:   ...:
CCDS31 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE6 AVLVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNH
       :.:.:::.: :::::.::.:..::: :..   ..:.  :.. ...:...:.  :::: ..
CCDS31 AILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200        210       220       230   
pF1KE6 VIPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCA-ICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHE
       .::::::::.:.:.:.::.:.::. ::.:. : ... :. .::.::.::::::: ::...
CCDS31 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQD
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE6 ARLKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIY
       :  :.:.:::::::::: :::::.::...::::.:: : .::..::::.:.:: :::..:
CCDS31 ACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVY
              250       260       270       280       290       300

           300       310       320     
pF1KE6 GVRTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       ::.::::    : :::  .:            
CCDS31 GVKTKQIRD--KVILLFSKGTG          
                310       320          

>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11           (323 aa)
 initn: 1157 init1: 732 opt: 1183  Z-score: 1044.7  bits: 201.6 E(32554): 7.2e-52
Smith-Waterman score: 1183; 53.8% identity (84.7% similar) in 301 aa overlap (5-304:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
           : : :::. :.: ::::::. :::...:.: .:. :..::  ...::  . .:: :
CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVMERNLHVP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
       :..::.:::. :. :::.:.:: :.:::.. ..: :.::.:: ::.: . . :::.:.::
CCDS53 MYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
       :.: .:::: ::.:...::  ::. :.:.:..:.. ...: :.:.  :::: ....::.:
CCDS53 AFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSY
              130       140       150       160       170       180

              190       200        210       220       230         
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCA-ICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSL
       :::.:.:.:.::.: .:: ::. . :  ...:. .::.::  :: ::::::...:: :.:
CCDS53 CEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKAL
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 STCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQ
       ::::::.:::: ::.:..:...::.::::.:...:::::::::.:::::::..:::.:::
CCDS53 STCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVKTKQ
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320     
pF1KE6 IYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       : . :                     
CCDS53 IREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS   
              310       320      

>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11           (318 aa)
 initn: 1144 init1: 748 opt: 1154  Z-score: 1019.7  bits: 196.9 E(32554): 1.8e-50
Smith-Waterman score: 1154; 54.2% identity (84.7% similar) in 301 aa overlap (11-308:12-311)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQ
                  :..:.: ::::::. :.::..::::.:..::.:: ...:::  :..:: 
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHA
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 PMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVA
       ::. :: .:. ::..::..:.::::.:.:..   : : .::.::: .:..  .::..:.:
CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140        150       160       170        
pF1KE6 MAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGL-GVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPH
       ::.: ::::::::.:..::.. :.. ::. :.: :.. .: : :.:.  ::.::..:. :
CCDS31 MAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLF-RSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTH
              130       140       150        160       170         

      180       190       200        210       220       230       
pF1KE6 TYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLC-AICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLK
       :::::::.:.:.::.: .::.:::  :.  . .:  .::.::  :: :::.::.:.:. :
CCDS31 TYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHK
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260        270       280       290      
pF1KE6 SLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRN-VPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVR
       .:::::::. .::.:: ::.:::.:::::.. ::...::.::::::.:::.:::..::.:
CCDS31 ALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGAR
     240       250       260       270       280       290         

        300       310       320     
pF1KE6 TKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       ::.: . . :.:                 
CCDS31 TKEIRSRLLKLLHLGKTSI          
     300       310                  

>>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11           (335 aa)
 initn: 704 init1: 511 opt: 1123  Z-score: 992.6  bits: 192.0 E(32554): 5.7e-49
Smith-Waterman score: 1123; 54.9% identity (83.0% similar) in 306 aa overlap (5-308:23-327)

                                 10        20        30        40  
pF1KE6                   MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALI
                             :... . .. .: :::::: ::::...::: .:. :: 
CCDS41 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE6 GNFTILLVIKTDSSLHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQ
       ::  .. :: ... ::.::. ::.:::..:: :::.:.:: :. .:..   : :..::::
CCDS41 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE6 MFFIHNFTLMESAVLVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSI
       ::::: : ...::::.:::.: :::::.::.: .:::.::.. :  ... ...:...:::
CCDS41 MFFIH-FLFIHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI
               130       140       150       160       170         

            170       180       190       200        210       220 
pF1KE6 LLILWLPFCGNHVIPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCA-ICNLVFDITVIALSYVH
       .:.  : .:  ..: ::.:::::.:::::..:.::. ::: : . .  .:: .:..::.:
CCDS41 FLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIH
     180       190       200       210       220       230         

             230       240       250       260        270       280
pF1KE6 ILCAVFRLPTHEARLKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFG-RNVPRYIHILLANL
       :: ::::: ...:: :.:::::::.:::: ::.::::: ...::: :.:: :.:::::.:
CCDS41 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASL
     240       250       260       270       280       290         

              290       300       310       320     
pF1KE6 YVVVPPMLNPVIYGVRTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       :::.:::::::::::::: : . .:...                 
CCDS41 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK         
     300       310       320       330              

>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11           (321 aa)
 initn: 1137 init1: 775 opt: 1120  Z-score: 990.3  bits: 191.5 E(32554): 7.7e-49
Smith-Waterman score: 1120; 50.3% identity (80.0% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
       :.  : :.. :.::.: :.::::  ..::.::::..:..:..::  .: .:. ...::.:
CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
       :.::::::. ::. . ..:::: : :::..:. : :. ::.:::: :.:: :::.::. :
CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
       : : ::::: ::.::.:::: :.. .: ..:.:.....::  .:   ::.: ....::::
CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGNILPHTY
              130       140       150       160       170       180

              190       200        210       220       230         
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGL-CAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSL
       :.::..:.:::...:.: ::::  :.    :::  :. ::. :: ::  : . .:: :..
CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAF
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260        270       280       290        
pF1KE6 STCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNV-PRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTK
       .:: .:.:.:.  ::::.:::..::::... :   ::..::.:...:: .::..:::.::
CCDS44 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
              250       260       270       280       290       300

      300       310       320     
pF1KE6 QIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
       ::  :: .::                 
CCDS44 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM      
              310       320       




325 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 09:24:31 2016 done: Tue Nov  8 09:24:32 2016
 Total Scan time:  1.450 Total Display time:  0.020

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com