FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5930, 311 aa 1>>>pF1KE5930 311 - 311 aa - 311 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1440+/-0.000531; mu= 17.2540+/- 0.033 mean_var=153.5383+/-45.777, 0's: 0 Z-trim(107.7): 385 B-trim: 911 in 1/52 Lambda= 0.103506 statistics sampled from 15178 (15792) to 15178 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16 Scan time: 5.720 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 815 134.5 2.6e-31 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 788 130.5 4.3e-30 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 768 127.5 3.4e-29 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 760 126.3 7.7e-29 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 750 124.9 2.2e-28 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 750 124.9 2.2e-28 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 750 124.9 2.2e-28 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 735 122.6 1e-27 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 735 122.6 1e-27 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 735 122.6 1e-27 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 731 122.0 1.6e-27 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 715 119.6 8.2e-27 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 704 118.0 2.5e-26 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 696 116.8 5.8e-26 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 684 115.0 2e-25 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 683 114.9 2.3e-25 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 653 110.4 5e-24 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 650 109.9 6.8e-24 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 641 108.6 1.7e-23 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 634 107.5 3.5e-23 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 479 84.4 3.4e-16 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 451 80.2 6.1e-15 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 223 46.2 0.00011 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 223 46.3 0.00012 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 223 46.3 0.00012 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 214 44.8 0.00027 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 214 44.9 0.00029 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 213 44.9 0.00035 XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 210 44.4 0.00047 NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 210 44.4 0.00047 NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 208 43.9 0.00051 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 209 44.2 0.00052 NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 208 44.0 0.00056 NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 207 43.9 0.00061 NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 207 43.9 0.00061 XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 207 43.9 0.00061 NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 207 43.9 0.00061 XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 207 43.9 0.00063 XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 207 43.9 0.00063 XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 207 43.9 0.00063 XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 207 43.9 0.00063 NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 207 43.9 0.00064 NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 207 44.0 0.00066 XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 207 44.0 0.00066 XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 207 44.0 0.00066 XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 204 43.3 0.00076 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 204 43.3 0.00079 XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 204 43.4 0.00079 NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 205 43.7 0.00083 XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 204 43.4 0.00083 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 781 init1: 781 opt: 815 Z-score: 683.1 bits: 134.5 E(85289): 2.6e-31 Smith-Waterman score: 815; 40.7% identity (74.7% similar) in 300 aa overlap (3-302:6-305) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPM :.:..: :.:. :: . .. . .::.::...:. :: .:..: ...:::::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMS ::::.::: .:.:::: :::: . : : ....:...::. : ..::... .: ..:.:. 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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 829 init1: 716 opt: 768 Z-score: 645.1 bits: 127.5 E(85289): 3.4e-29 Smith-Waterman score: 768; 40.8% identity (71.1% similar) in 311 aa overlap (1-310:3-313) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGI-WELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPM . : :...::.:: ::.. :.: : :: :::..: :: ::: : . ::.:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMS ::::.::: :.. . : ::: . . :.. ..::.:::..:.::: :. :: .:..:. 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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa) initn: 762 init1: 738 opt: 760 Z-score: 638.7 bits: 126.3 E(85289): 7.7e-29 Smith-Waterman score: 760; 41.2% identity (72.5% similar) in 306 aa overlap (2-305:4-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMY .:::....:::. .: ::: . :::: .::....:::::: ... ..::::::: NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY :::.::: .:.:.::.:::: . . .: ..:::.::..::::. ::. . .:.::.: NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRD ::.:::::::.: ..:. : .....:. : .. :: : : .. : .:: . NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFIL--MMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAF .:: :.: ... ..: ... : :: : . ...:: :: :... . : ... ::: NP_001 PAQVLK-VACSNTLLNNIVLYVATAL-LGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 STCSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIK :::. .: :. :: ::: . :. . : .. . .. :... :.:::.:::::::..: NP_001 STCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVK 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 TAMWRLFVKIYFLQK :. ::. . 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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFST . :. :. .. : .. : :.. : :...::.::.::.:.: : ..: ::: : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTA :. .: :. : ...:. . : .. .:. .... :..: :.:::.::::::::.: : XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 MWRLFVKIYFLQK .:. : XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 774 init1: 750 opt: 750 Z-score: 630.6 bits: 124.9 E(85289): 2.2e-28 Smith-Waterman score: 750; 38.5% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMY :: : :.::.:. .:. :. .: :::..:.....:: ::. .: :...:::::: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY ::: :::..:. : . .::. . . :.....: . .:.::..: :... :...:.::.: NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRD :::::.: :.: :.: .: : ..:.:.:.: : . :.:. :. .::.. : .. . 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