FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6032, 316 aa 1>>>pF1KE6032 316 - 316 aa - 316 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0775+/-0.000544; mu= 17.1284+/- 0.034 mean_var=84.2020+/-20.006, 0's: 0 Z-trim(107.3): 383 B-trim: 1674 in 2/45 Lambda= 0.139770 statistics sampled from 14822 (15340) to 14822 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.18), width: 16 Scan time: 5.180 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 923 196.7 5.2e-50 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 190.4 4e-48 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 892 190.4 4e-48 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 190.4 4e-48 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 880 188.0 2.1e-47 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 878 187.6 2.8e-47 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 870 186.0 8.7e-47 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 858 183.6 4.6e-46 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 856 183.2 5.9e-46 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 856 183.2 6.1e-46 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 856 183.2 6.1e-46 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 856 183.2 6.2e-46 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 842 180.4 4.3e-45 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 839 179.7 6.6e-45 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 832 178.3 1.7e-44 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 826 177.1 4e-44 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 818 175.5 1.2e-43 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 813 174.5 2.5e-43 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 804 172.7 9e-43 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 683 148.3 1.9e-35 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 511 113.6 5.4e-25 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 506 112.6 1.1e-24 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 225 56.0 1.4e-07 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 225 56.0 1.5e-07 NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 224 55.8 1.6e-07 XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 224 55.8 1.6e-07 NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 224 55.8 1.6e-07 NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 224 55.8 1.6e-07 XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 224 55.8 1.6e-07 XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 224 55.8 1.6e-07 XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 224 55.8 1.6e-07 NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 224 55.8 1.7e-07 NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 223 55.6 1.8e-07 XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 223 55.6 1.8e-07 NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 223 55.6 1.9e-07 XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07 XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07 XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07 XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07 XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07 NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 219 54.8 3.4e-07 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 216 54.1 4.4e-07 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 202 51.3 3.2e-06 NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 200 51.0 4.7e-06 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 198 50.6 6.1e-06 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 198 50.6 6.1e-06 NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 190 48.9 1.8e-05 XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 190 48.9 1.8e-05 XP_016856350 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 189 48.9 2.7e-05 XP_016856351 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 189 48.9 2.7e-05 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 963 init1: 747 opt: 923 Z-score: 1018.9 bits: 196.7 E(85289): 5.2e-50 Smith-Waterman score: 923; 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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT : ..::.:.:: : :.. : . .. . .: .::: .:..: : :.:::..::.: NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA :.::::.. .::.. .:::. :.: .. .::::.:.:::.: :::::::::::.:.: : NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 FKKVFACCSSARKVATSDA . .:.. NP_003 LANVISRKRTSSFL 310 >>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa) initn: 800 init1: 800 opt: 878 Z-score: 969.8 bits: 187.6 E(85289): 2.8e-47 Smith-Waterman score: 878; 42.2% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-303) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MTNTSSSD-FTLLGLLVNSEAAGI---VFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPM :.: ::. : :::. :: :. .:.:.:. .: ....: ..:.: .: .::.:: NP_009 MVNQSSTPGFLLLGF---SEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMA ::.::.::..: : . ::..:... . .: :::. :..:::..:.. .: .:: .:: NP_009 YFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFC .:::::::.::.: .... . : ::. :: : ... . :: :...:.: .:... : : NP_009 FDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFT :.::...:.: ::: : . . :..:..:.:.: .::. : .. :. ::.::.::: NP_009 EVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIG :::::::::..::.... .:. :.. .. :. : . ::.. :: ::::::.::::.: NP_009 TCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTR 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 AFKKVFACCSSARKVATSDA ::.... NP_009 AFRRLLGKEMGLTQS 300 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 816 init1: 816 opt: 870 Z-score: 961.0 bits: 186.0 E(85289): 8.7e-47 Smith-Waterman score: 870; 42.7% identity (75.7% similar) in 300 aa overlap (4-302:7-306) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLL-VNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPM : :.: :... . .: ...: ..:...: .. .: ..:.. .: ::.:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMA ::.: .::... : . :::.:. ..... :::..:. :..... . .: :::. :: NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFC ::::::.:.::.:::.::.. :::..:: : . . : .. :.::. ..::::: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFT . : ::::.::::.:.: . .:...:: .: ::. : .: ..:::.:..:::. NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIG :::::: :::.:: .. :: :.: ..::. :..: ::.:::::::.::::::..: . NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 AFKKVFACCSSARKVATSDA :....: NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 817 init1: 817 opt: 858 Z-score: 948.0 bits: 183.6 E(85289): 4.6e-46 Smith-Waterman score: 858; 43.3% identity (74.2% similar) in 298 aa overlap (4-301:10-307) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHT .: . : :.:. . ..:.:.: .: .. .:: .:.: .::.::: NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 PMYFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGL ::::.::.::..: . ...:.::... . :: ::...: ::... :.. .: :: . NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 MAYDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHF :.::::.::: ::.: :::. . : :::...: .: .. : . .:. :: :: :...:: NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FCEIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKA :::.::.:.:.:.:: . : ..: ...:::. .: :::. :. .: :: :. : .:. NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 FTTCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDV : ::..:: .::.:. :. :. : : .. .: : .. :::.::: ::::::.:::: : NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 IGAFKKVFACCSSARKVATSDA :: :.. NP_001 RGAVKRLMGWE 310 >>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa) initn: 778 init1: 778 opt: 856 Z-score: 946.0 bits: 183.2 E(85289): 5.9e-46 Smith-Waterman score: 856; 42.4% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (1-293:1-294) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MTNTSSSD-FTLLGLLVNSEAAGI---VFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPM :.: ::. : :::. :: :. .:.:.:. .: ....: ..:.: .: .::.:: XP_011 MVNQSSTPGFLLLGF---SEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMA ::.::.::..: : . ::..:... . .: :::. :..:::..:.. .: .:: .:: XP_011 YFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFC .:::::::.::.: .... . : ::. :: : ... . :: :...:.: .:... : : XP_011 FDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFT :.::...:.: ::: : . . :..:..:.:.: .::. : .. :. ::.::.::: XP_011 EVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIG :::::::::..::.... .:. :.. .. :. : . ::.. :: ::::::.::::. XP_011 TCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKR 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 AFKKVFACCSSARKVATSDA XP_011 RGS 300 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 852 init1: 852 opt: 856 Z-score: 945.8 bits: 183.2 E(85289): 6.1e-46 Smith-Waterman score: 856; 43.5% identity (75.7% similar) in 301 aa overlap (2-301:4-304) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MTNTSS-SDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPMY :: :: :.: :::: . . ..:. .:...:..: .::..:. ...:: :::::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMAY :.::.::..: : :::::.::. . . . ::: .: :... . .. . :::..::: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFCE :..::::.::.: . :... : ::.:: : ..:. .: : . . .:.. .:.::::. NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT . .:::.:.:: : :... .:... :. : .:: : :. ..::..:: :::.: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA :.:::.:: .::.. . .: : : :. :.: .....::.:::::::.::::::. . :: NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE6 FKKVFACCSSARKVATSDA .::: NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 316 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:53:43 2016 done: Tue Nov 8 08:53:44 2016 Total Scan time: 5.180 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]