FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6033, 316 aa 1>>>pF1KE6033 316 - 316 aa - 316 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9628+/-0.000504; mu= 17.8188+/- 0.031 mean_var=105.9887+/-29.778, 0's: 0 Z-trim(107.8): 297 B-trim: 977 in 1/52 Lambda= 0.124579 statistics sampled from 15465 (15874) to 15465 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16 Scan time: 6.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1215 229.9 5.2e-60 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1189 225.2 1.3e-58 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1186 224.7 2e-58 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1166 221.1 2.3e-57 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 1012 193.4 5e-49 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1007 192.5 9.5e-49 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1007 192.5 9.5e-49 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1007 192.5 9.5e-49 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 943 181.0 2.7e-45 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 909 174.9 1.9e-43 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 909 174.9 1.9e-43 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 909 174.9 1.9e-43 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 907 174.5 2.4e-43 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 891 171.7 1.8e-42 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 884 170.4 4.3e-42 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 876 169.0 1.2e-41 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 873 168.4 1.7e-41 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 865 167.0 4.7e-41 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 830 160.7 3.5e-39 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 760 148.1 2.2e-35 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 531 107.0 5.4e-23 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 520 105.0 2.1e-22 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 213 49.9 9.7e-06 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 213 50.0 1e-05 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 204 48.4 3.4e-05 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 204 48.5 3.6e-05 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 200 47.5 4.4e-05 NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 191 45.9 0.00014 NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 190 45.7 0.00015 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 187 45.3 0.00027 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 185 44.8 0.0003 NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 182 44.3 0.00046 NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 179 43.8 0.00065 NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 179 43.8 0.00067 NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 179 43.8 0.00068 NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 179 43.8 0.00068 NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 179 43.8 0.0007 NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 178 43.6 0.0007 NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 179 43.9 0.00071 NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 179 43.9 0.00072 NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 175 43.0 0.001 NP_061822 (OMIM: 600896) urotensin-2 receptor [Hom ( 389) 175 43.1 0.0011 XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 170 42.1 0.0018 XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 171 42.4 0.0018 NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 171 42.4 0.0018 XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 170 42.1 0.0019 XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 170 42.2 0.002 XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 170 42.2 0.002 XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 170 42.2 0.0021 NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 170 42.2 0.0022 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 1233 init1: 1208 opt: 1215 Z-score: 1198.3 bits: 229.9 E(85289): 5.2e-60 Smith-Waterman score: 1215; 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NP_009 FRRL-LGKEMGLTQS 300 310 >>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa) initn: 1186 init1: 1186 opt: 1186 Z-score: 1170.1 bits: 224.7 E(85289): 2e-58 Smith-Waterman score: 1186; 56.4% identity (85.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY :. ::.:.. :.::::::.:.:::.::..:: :.:.:.:::..::: :: .:::::: NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY :::..:: .:. :::: :::: ..: :::.:: ::. ::.. .:::. ::.::::::: NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE :: .:.:.::.:..::.::.: .:.. .: :. .:: . .:..:: :::. .::.. : NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT .:.::..:::.:. :. .:: .: .. :...::.::..:..:::.:.::.:::::::: NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA :.:::.:: .:::.::.::.::. :..:: :. :::.::::::::.::::::..:::: NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD : :.:: NP_001 LGRLLLGKRELGKE 310 >>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa) initn: 1159 init1: 1159 opt: 1166 Z-score: 1150.9 bits: 221.1 E(85289): 2.3e-57 Smith-Waterman score: 1166; 57.5% identity (83.0% similar) in 294 aa overlap (5-298:3-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY :.:: ::::::::..: ::: ::...: :.:.:.::: .::. :: .::.::: XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY ::::::: .:.::::: .::.::.. ::.:. : .:... ..::..:::::.:::. XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE :::.:::.::.: .:.:::.: .::. ::. ::. :..: :..::.: : .: . :: XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT ::.::.:.: ::..:: .. :::: .:.::. ::::::: :: :::::.:: ::.::::: XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA :::::.:: .::...: .:::: : ....::: .:::.. :: :::.:::::::. : XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD XP_011 GS 300 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 910 init1: 847 opt: 1012 Z-score: 1001.2 bits: 193.4 E(85289): 5e-49 Smith-Waterman score: 1012; 49.3% identity (79.1% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY :.. :... :::::.:: :. :..:: ..: :....::: :: . .::.:::::: NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY ::: ::: .:.::.:...:: :: . .. :.... :.:.: . .: ..: :::::.: NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE :::.:.: :::: :: . :..:: :.: ::...:... .. ..:: : .. :.::: NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT .:.:. :: .:: .: .:. .::.:..::.::::::: : .:...::..: :::.: NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA :.:::.:::.:::. :. :. : . ::.: : ::.::.::::.:::.::.:::::::.: NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA 250 260 270 280 290 310 pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD :: NP_003 LRKVATRNFP 300 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 1015 init1: 996 opt: 1007 Z-score: 996.2 bits: 192.5 E(85289): 9.5e-49 Smith-Waterman score: 1007; 49.8% identity (79.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY : :.. . :.:::.:.. . . ::...: .::...::: ..:. :::::::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY :::.::: ::. ..:::.::::. . . :.. . .:.:::. ...::. : .::::::: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE :::.::: ::: :::: .:: :: .:.::.:.: .: ..: :::.: .. .::: :: XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT . ....::::::. ::. ..:.:.:.:..: :.:.:: : ...:.:.: ::.::: : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA :.:::.:: . ::. :: :.:: . : : :. :.::.:.::.:::.::.::::.:::: XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD . :. XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 1015 init1: 996 opt: 1007 Z-score: 996.2 bits: 192.5 E(85289): 9.5e-49 Smith-Waterman score: 1007; 49.8% identity (79.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY : :.. . :.:::.:.. . . ::...: .::...::: ..:. :::::::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY :::.::: ::. ..:::.::::. . . :.. . .:.:::. ...::. : .::::::: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE :::.::: ::: :::: .:: :: .:.::.:.: .: ..: :::.: .. .::: :: XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT . ....::::::. ::. ..:.:.:.:..: :.:.:: : ...:.:.: ::.::: : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA :.:::.:: . ::. :: :.:: . : : :. :.::.:.::.:::.::.::::.:::: XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD . :. 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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 977 init1: 933 opt: 943 Z-score: 934.1 bits: 181.0 E(85289): 2.7e-45 Smith-Waterman score: 943; 45.1% identity (78.2% similar) in 293 aa overlap (12-304:13-305) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPM :.:::::: :.. . ::.:.: .:. :: : .::.. .::.::::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMA :::::::: .:.:. .:..:..: .. ....:... ::. : .. .: :: :...:: NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFC ::::::.: :: : .:: : .:. .. ::...:: .::.: . .:: .:: .. :.:: NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFG ..: :. :.:.:: : .. . .. : :. .:.:..:::.: ....: :: ::.:::. 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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT : :.::.: :: .::. .. ... .:.: : ::.:: :: .::.. :. :: :::.: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA :.:::.::..::.::: .:..: . .: .. .....::.:::.:::.::.:::. .::: XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD :. .. XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 316 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:54:17 2016 done: Tue Nov 8 08:54:18 2016 Total Scan time: 6.100 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]