Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6039
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6039, 317 aa
1>>>pF1KE6039 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6073+/-0.00129; mu= 14.1468+/- 0.075
mean_var=137.1909+/-45.684, 0's: 0 Z-trim(101.5): 373 B-trim: 786 in 2/48
Lambda= 0.109499
statistics sampled from 6178 (6616) to 6178 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 1.070
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs109|chr1 ( 317) 2064 338.5 4.2e-93
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs109|chr1 ( 316) 1346 225.1 5.9e-59
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs109|chr1 ( 309) 1310 219.4 3e-57
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs109|chr1 ( 320) 1254 210.6 1.4e-54
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs109|chr6 ( 357) 1207 203.2 2.6e-52
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs109|chr6 ( 312) 1199 201.9 5.7e-52
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs109|chr16 ( 312) 1189 200.3 1.7e-51
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs109|chr6 ( 313) 1183 199.3 3.3e-51
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs109|chr6 ( 316) 1183 199.3 3.3e-51
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs109|chr6 ( 311) 1181 199.0 4.1e-51
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs109|chr6 ( 320) 1176 198.2 7.2e-51
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs109|chr1 ( 314) 1170 197.3 1.4e-50
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs109|chr5 ( 311) 1157 195.2 5.7e-50
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs109|chr6 ( 313) 1156 195.1 6.3e-50
CCDS87377.1 OR2J1 gene_id:442185|Hs109|chr6 ( 312) 1154 194.7 7.9e-50
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs109|chr1 ( 317) 1152 194.4 9.9e-50
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs109|chr6 ( 312) 1145 193.3 2.1e-49
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs109|chr9 ( 316) 990 168.8 5e-42
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs109|chr12 ( 316) 953 163.0 2.9e-40
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs109|chr9 ( 318) 953 163.0 2.9e-40
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs109|chr9 ( 318) 943 161.4 8.6e-40
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs109|chr9 ( 319) 937 160.5 1.7e-39
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs109|chr9 ( 320) 935 160.2 2.1e-39
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs109|chr11 ( 330) 933 159.9 2.6e-39
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs109|chr9 ( 346) 933 159.9 2.7e-39
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs109|chr9 ( 347) 933 159.9 2.7e-39
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs109|chr9 ( 318) 917 157.3 1.5e-38
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs109|chr11 ( 324) 916 157.2 1.7e-38
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs109|chr7 ( 310) 904 155.2 6.1e-38
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs109|chr7 ( 310) 904 155.2 6.1e-38
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs109|chr7 ( 317) 904 155.3 6.1e-38
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs109|chr9 ( 312) 901 154.8 8.5e-38
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs109|chr11 ( 308) 895 153.8 1.6e-37
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs109|chr1 ( 320) 894 153.7 1.8e-37
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs109|chr7 ( 310) 886 152.4 4.4e-37
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs109|chrX ( 308) 885 152.2 4.8e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs109|chr6 ( 321) 884 152.1 5.5e-37
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs109|chr1 ( 312) 882 151.8 6.8e-37
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs109|chr9 ( 319) 879 151.3 9.5e-37
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs109|chr11 ( 305) 876 150.8 1.3e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs109|chr11 ( 316) 876 150.8 1.3e-36
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs109|chr1 ( 317) 876 150.8 1.3e-36
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs109|chr9 ( 318) 875 150.7 1.5e-36
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs109|chr7 ( 310) 870 149.9 2.5e-36
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs109|chr7 ( 311) 870 149.9 2.5e-36
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs109|chr11 ( 311) 868 149.6 3.1e-36
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs109|chr14 ( 310) 866 149.2 3.9e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs109|chr1 ( 312) 866 149.2 3.9e-36
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs109|chr11 ( 301) 865 149.1 4.3e-36
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs109|chr12 ( 313) 863 148.8 5.4e-36
>>CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs109|chr1 (317 aa)
initn: 2064 init1: 2064 opt: 2064 Z-score: 1785.1 bits: 338.5 E(33420): 4.2e-93
Smith-Waterman score: 2064; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KGALKKVLAKALGVNIL
:::::::::::::::::
CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs109|chr1 (316 aa)
initn: 1383 init1: 1340 opt: 1346 Z-score: 1172.2 bits: 225.1 E(33420): 5.9e-59
Smith-Waterman score: 1346; 65.0% identity (87.5% similar) in 311 aa overlap (4-313:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
...::.:. ::.:::::: :::.. ::..:: .:.:..::::..::: :. .::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
:::::::.:: . :::.:: :::::.. . ::..::::...:: . .:::.::.: ::
CCDS31 PMYFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
:. :::.::::::.: ..:: ..: .::. :::::. :.:.: .::.:::.:::: .::.
CCDS31 MAYDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
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CCDS31 FCEVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
:::: :::.:: ::::::::::::::. ::..::::::::::.:: .:::.::::: :.:
CCDS31 FGTCSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KGALKK-VLAKALGVNIL
::::. .:..: :
CCDS31 KGALRTLILGSAAGQSHKD
300 310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs109|chr1 (309 aa)
initn: 1335 init1: 1310 opt: 1310 Z-score: 1141.5 bits: 219.4 E(33420): 3e-57
Smith-Waterman score: 1310; 63.0% identity (87.2% similar) in 305 aa overlap (8-312:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
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CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
:::::::.::.: :::.:. :: :::: .: :::.::::...:: : :::::::.: :
CCDS31 PMYFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLAD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
:. :::.:::.::::.:.:. .::. :::..::::.:..:...:.:::::.::....:::
CCDS31 MALDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
:::::.:.::::: :: :: :::.:.::...: ..: .: :.:..:::::::. :.::
CCDS31 ICEVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
:.:: :::::: :::::::..::::. : ..:::::.:::::.:: :::.::::: :..
CCDS31 FSTCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KGALKKVLAKALGVNIL
: ::.:.:. :
CCDS31 KEALRKLLSGKL
300
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs109|chr1 (320 aa)
initn: 1279 init1: 1237 opt: 1254 Z-score: 1093.6 bits: 210.6 E(33420): 1.4e-54
Smith-Waterman score: 1254; 58.8% identity (86.6% similar) in 306 aa overlap (3-308:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
:.. .: :. :.::::: :.:. :::...: .:...:::: :::::. . .::
CCDS16 MMEIANVSSPEVFVLLGFSTRPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
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CCDS16 PMYFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLAT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
:: :::.:.::::::::.:: .::..:: .::.:..:..: ::::. ::.::. .:::
CCDS16 MSYDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
.::.:....:::: :..:: :...::..:...:...:::: :.::.:::.:.:: :.::
CCDS16 FCEMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
:.:: ::..::..:::.::::::::::: :..::::..::::::: ::::::::: ::
CCDS16 FNTCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KGALKKVLAKALGVNIL
:.::....
CCDS16 KSALRHMVLENCCGSAGKLAQI
300 310 320
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs109|chr6 (357 aa)
initn: 1245 init1: 1205 opt: 1207 Z-score: 1052.9 bits: 203.2 E(33420): 2.6e-52
Smith-Waterman score: 1207; 58.7% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (8-312:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
:.: :::: ::: : :. ::..:. :.:::.:: ::::::... :::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
:::::::.::.: :.:.:..::.:::. . :.:.::::...:. :::::::.: ::
CCDS46 PMYFFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
: ::.::.::::::...:: .::. ::. .:.::......::: ::..:.:::..::::
CCDS46 MCFDRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
.::::.:.::.:: :: :::::: :.:::..::..::.: ..:..:::::.:: ..::
CCDS46 FCEVPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
:::: ::: ::..:::: : ::::: . :.:.::.:::: ... :::::::::: :::
CCDS46 FGTCGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KGALKKVLAKALGVNIL
: :.:...::.:
CCDS46 KEAFKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs109|chr6 (312 aa)
initn: 1186 init1: 1186 opt: 1199 Z-score: 1046.7 bits: 201.9 E(33420): 5.7e-52
Smith-Waterman score: 1199; 57.3% identity (82.7% similar) in 307 aa overlap (8-314:3-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
:.:. ::.:::::..: :...:::..: ::::..::: :::.: :.::::
CCDS34 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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