FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5777, 632 aa 1>>>pF1KE5777 632 - 632 aa - 632 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8324+/-0.000363; mu= 11.4583+/- 0.023 mean_var=97.7842+/-19.512, 0's: 0 Z-trim(114.7): 142 B-trim: 84 in 1/57 Lambda= 0.129700 statistics sampled from 24516 (24668) to 24516 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16 Scan time: 9.190 The best scores are: opt bits E(85289) NP_061028 (OMIM: 300349) gamma-aminobutyric acid r ( 632) 4276 811.0 0 XP_011529486 (OMIM: 300349) PREDICTED: gamma-amino ( 406) 2592 495.8 1.2e-139 NP_000804 (OMIM: 600232) gamma-aminobutyric acid r ( 474) 1227 240.4 1.1e-62 NP_068711 (OMIM: 600232) gamma-aminobutyric acid r ( 512) 1227 240.4 1.2e-62 NP_000803 (OMIM: 137190,617153) gamma-aminobutyric ( 474) 1225 240.0 1.4e-62 NP_000805 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-amino ( 473) 1218 238.7 3.5e-62 NP_068712 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-amino ( 473) 1217 238.5 4e-62 NP_001178250 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-am ( 402) 1052 207.6 6.9e-53 XP_011519730 (OMIM: 137192,612269,617113) PREDICTE ( 414) 1052 207.6 7.1e-53 NP_001265560 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-am ( 388) 1024 202.4 2.5e-51 NP_001178249 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-am ( 388) 1024 202.4 2.5e-51 NP_000806 (OMIM: 137163,613060) gamma-aminobutyric ( 452) 936 185.9 2.6e-46 XP_011539496 (OMIM: 137163,613060) PREDICTED: gamm ( 465) 936 185.9 2.7e-46 XP_016856425 (OMIM: 137163,613060) PREDICTED: gamm ( 687) 936 186.0 3.8e-46 NP_000162 (OMIM: 138491,149400) glycine receptor s ( 449) 902 179.6 2.1e-44 XP_016864838 (OMIM: 138491,149400) PREDICTED: glyc ( 465) 902 179.6 2.2e-44 XP_011543798 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436) 901 179.4 2.4e-44 XP_006724550 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436) 901 179.4 2.4e-44 XP_011543797 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436) 901 179.4 2.4e-44 XP_016884916 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 452) 901 179.4 2.4e-44 NP_002054 (OMIM: 305990) glycine receptor subunit ( 452) 901 179.4 2.4e-44 NP_001112357 (OMIM: 305990) glycine receptor subun ( 452) 901 179.4 2.4e-44 NP_001112358 (OMIM: 305990) glycine receptor subun ( 452) 901 179.4 2.4e-44 NP_001243632 (OMIM: 137161) gamma-aminobutyric aci ( 462) 884 176.2 2.3e-43 NP_002033 (OMIM: 137161) gamma-aminobutyric acid r ( 479) 884 176.2 2.3e-43 NP_001254511 (OMIM: 137161) gamma-aminobutyric aci ( 392) 876 174.7 5.5e-43 XP_016866178 (OMIM: 137161) PREDICTED: gamma-amino ( 392) 876 174.7 5.5e-43 NP_001243633 (OMIM: 137161) gamma-aminobutyric aci ( 392) 876 174.7 5.5e-43 NP_001036008 (OMIM: 600421) glycine receptor subun ( 449) 875 174.5 7.1e-43 NP_001139512 (OMIM: 138491,149400) glycine recepto ( 457) 866 172.8 2.3e-42 NP_002034 (OMIM: 137162) gamma-aminobutyric acid r ( 465) 863 172.3 3.5e-42 XP_016864119 (OMIM: 600421) PREDICTED: glycine rec ( 424) 861 171.9 4.1e-42 NP_006520 (OMIM: 600421) glycine receptor subunit ( 464) 861 171.9 4.5e-42 NP_055026 (OMIM: 602729) gamma-aminobutyric acid r ( 440) 836 167.2 1.1e-40 NP_150092 (OMIM: 600233) gamma-aminobutyric acid r ( 467) 823 164.8 6.2e-40 XP_011519732 (OMIM: 600233) PREDICTED: gamma-amino ( 473) 823 164.8 6.3e-40 XP_011534015 (OMIM: 137162) PREDICTED: gamma-amino ( 421) 816 163.5 1.4e-39 NP_000807 (OMIM: 137164,607681,611277) gamma-amino ( 467) 814 163.1 2e-39 NP_944494 (OMIM: 137164,607681,611277) gamma-amino ( 475) 811 162.5 3e-39 NP_000802 (OMIM: 137143) gamma-aminobutyric acid r ( 453) 790 158.6 4.4e-38 NP_001278929 (OMIM: 138491,149400) glycine recepto ( 366) 787 158.0 5.4e-38 NP_001165413 (OMIM: 305990) glycine receptor subun ( 363) 786 157.8 6e-38 XP_016884917 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 363) 786 157.8 6e-38 XP_016884918 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 363) 786 157.8 6e-38 XP_006720522 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 462) 781 156.9 1.4e-37 NP_001158509 (OMIM: 137142) gamma-aminobutyric aci ( 462) 781 156.9 1.4e-37 NP_000801 (OMIM: 137142) gamma-aminobutyric acid r ( 462) 781 156.9 1.4e-37 XP_005268315 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 462) 781 156.9 1.4e-37 NP_001121115 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 778 156.4 2.1e-37 NP_001121120 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 778 156.4 2.1e-37 >>NP_061028 (OMIM: 300349) gamma-aminobutyric acid recep (632 aa) initn: 4276 init1: 4276 opt: 4276 Z-score: 4327.7 bits: 811.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4276; 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XP_011 QPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVGNVQVGMGQASRNPTLIHSPWRSM 370 380 390 400 >>NP_000804 (OMIM: 600232) gamma-aminobutyric acid recep (474 aa) initn: 1313 init1: 1211 opt: 1227 Z-score: 1246.3 bits: 240.4 E(85289): 1.1e-62 Smith-Waterman score: 1227; 52.3% identity (84.8% similar) in 310 aa overlap (54-363:31-340) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 NYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPV .: ..:.. .::.:. ::.::::.::: :: NP_000 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVCAQSVNDPSNMSLVKETVDRLLKGYDIRLRPDFGGPPV 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 PVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDC : ..: ..::...::.:::::.::.:.:.:.:.::.: :::::: :. ..::::: NP_000 AVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLDNRVADQLWVPDT 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 YFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVES ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: :.: .:: NP_000 YFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIES 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 YGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQR ::::..:: ..: . ::. . ....:::... . .:.: : :::: :: :.:...: NP_000 YGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVFSTGSYPRLSLSFKLKR 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 EVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNIS ... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.: NP_000 NIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIP 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 CIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVG .::::.:.. :. :::..::::. .::.:..:::.:: . NP_000 YVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAASANNEKMRLDVNKM 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 NVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAP NP_000 DPHENILLSTLEIKNEMATSEAVMGLGDPRSTMLAYDASSIQYRKAGLPRHSFGRNALER 370 380 390 400 410 420 >>NP_068711 (OMIM: 600232) gamma-aminobutyric acid recep (512 aa) initn: 1313 init1: 1211 opt: 1227 Z-score: 1245.8 bits: 240.4 E(85289): 1.2e-62 Smith-Waterman score: 1227; 52.3% identity (84.8% similar) in 310 aa overlap (54-363:31-340) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 NYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPV .: ..:.. .::.:. ::.::::.::: :: NP_068 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVCAQSVNDPSNMSLVKETVDRLLKGYDIRLRPDFGGPPV 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 PVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDC : ..: ..::...::.:::::.::.:.:.:.:.::.: :::::: :. ..::::: NP_068 AVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLDNRVADQLWVPDT 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 YFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVES ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: :.: .:: NP_068 YFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIES 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 YGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQR ::::..:: ..: . ::. . ....:::... . .:.: : :::: :: :.:...: NP_068 YGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVFSTGSYPRLSLSFKLKR 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 EVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNIS ... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.: NP_068 NIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIP 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 CIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVG .::::.:.. :. :::..::::. .::.:..:::.:: . NP_068 YVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAASANNEKMRLDVNKI 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 NVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAP NP_068 FYKDIKQNGTQYRSLWDPTGNLSPTRRTTNYDFSLYTMDPHENILLSTLEIKNEMATSEA 370 380 390 400 410 420 >>NP_000803 (OMIM: 137190,617153) gamma-aminobutyric aci (474 aa) initn: 1318 init1: 1196 opt: 1225 Z-score: 1244.3 bits: 240.0 E(85289): 1.4e-62 Smith-Waterman score: 1225; 45.0% identity (78.4% similar) in 398 aa overlap (43-431:17-413) 20 30 40 50 60 pF1KE5 LLLIRTWLAEGNYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANE----AVVQKILDRVLS :.... : . .:: . :.. .::.:. NP_000 MWTVQNRESLGLLSFPVMITMVCCAHSTNEPSNMSYVKETVDRLLK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNL ::.::::.::: :: : . : :.::...::.:::::.::.:.:.:::.::.: ::: NP_000 GYDIRLRPDFGGPPVDVGMRIDVASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQSWKDKRLSYSGIPLNL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 TLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLH ::: :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::. NP_000 TLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLR 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KFPMDKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFY ..:.:.: :.: .::::::..:: ..:. . .:. ......:::... ..::.: : NP_000 RYPLDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWNGGEGAVTGVNKIELPQFSIVDYKMVSKKVEFT 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TGSYIRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLIL ::.: :: :.:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: . NP_000 TGAYPRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSTLITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTM 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 TTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQ-PRRHRR :::..:::. ::.: .::::::.. :. ::::.::::...::.:...::... .. . NP_000 TTISTHLRETLPKIPYVKAIDIYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGKGPQKKGASKQDQ 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 PRRVIARYRYQQVVV---GNVQDGLINVEDGVS-SLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQ . ....: : ::. . ..... .: : .: .. : :. : : .: . . NP_000 SANEKNKLEMNKVQVDAHGNILLSTLEIRNETSGSEVLTSVSDPKATMYSYDS-ASIQYR 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 AQLATSESLSPLTSLSGQAPLATGESLSDLPSTSEQARHSYGVRFNGFQADDSIIPTEIR :.. :. NP_000 KPLSSREAYGRALDRHGVPSKGRIRRRASQLKVKIPDLTDVNSIDKWSRMFFPITFSLFN 410 420 430 440 450 460 >>NP_000805 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-aminobuty (473 aa) initn: 1329 init1: 1190 opt: 1218 Z-score: 1237.3 bits: 238.7 E(85289): 3.5e-62 Smith-Waterman score: 1218; 50.5% identity (83.7% similar) in 325 aa overlap (43-363:17-341) 20 30 40 50 60 pF1KE5 LLLIRTWLAEGNYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANE----AVVQKILDRVLS :.. . : . .:. . :.. .:..:. NP_000 MWGLAGGRLFGIFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNL ::.::::.::: :: : ..: ..::...::.:::::.::.:.: :.:.:::: ::: NP_000 GYDIRLRPDFGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 TLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLH ::: :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::. 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NP_000 TTINTHLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKT 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 RRVIARYRYQQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLAT NP_000 AKAKNDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQS 350 360 370 380 390 400 >>NP_068712 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-aminobuty (473 aa) initn: 1329 init1: 1190 opt: 1217 Z-score: 1236.2 bits: 238.5 E(85289): 4e-62 Smith-Waterman score: 1217; 52.4% identity (85.4% similar) in 309 aa overlap (55-363:33-341) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 YPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPVP : . :.. .:..:. ::.::::.::: :: NP_068 SGLLELLLPIWLSWTLGTRGSEPRSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPPVC 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 VRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDCY : ..: ..::...::.:::::.::.:.: :.:.:::: :::::: :. ..::::: : NP_068 VGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPDTY 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 FLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVESY :::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: :.: .::: NP_068 FLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIESY 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 GYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQRE :::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: : ::.: :: :.:...:. NP_068 GYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLKRN 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 VNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISC .. ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.: NP_068 IGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIPY 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 IKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVGN .::::.:.. :. ::::.::::...::.:..:::.:: . NP_068 VKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNRVD 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 VQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAPL NP_068 AHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRSLP 370 380 390 400 410 420 >>NP_001178250 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-aminob (402 aa) initn: 1191 init1: 1052 opt: 1052 Z-score: 1070.5 bits: 207.6 E(85289): 6.9e-53 Smith-Waterman score: 1052; 53.3% identity (85.8% similar) in 261 aa overlap (103-363:10-270) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 RLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDY :::.::.:.: :.:.:::: :::::: NP_001 MWATYQTEEDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDN 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 RMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPM :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:. 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NP_001 THLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAK 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 ARYRYQQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESL NP_001 NDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPRE 280 290 300 310 320 330 >>XP_011519730 (OMIM: 137192,612269,617113) PREDICTED: g (414 aa) initn: 1191 init1: 1052 opt: 1052 Z-score: 1070.3 bits: 207.6 E(85289): 7.1e-53 Smith-Waterman score: 1052; 53.3% identity (85.8% similar) in 261 aa overlap (103-363:22-282) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 RLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDY :::.::.:.: :.:.:::: :::::: XP_011 MQIPSLCDCALLFGSCHIIAKDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDN 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 RMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPM :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:. XP_011 RVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPL 60 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 DKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSY :.: :.: .::::::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: : ::.: XP_011 DEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAY 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 IRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTID :: :.:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::. XP_011 PRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTIN 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 SHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVI .:::. ::.: .::::.:.. :. ::::.::::...::.:..:::.:: . XP_011 THLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAK 240 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 ARYRYQQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESL XP_011 NDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPRE 300 310 320 330 340 350 >>NP_001265560 (OMIM: 137192,612269,617113) gamma-aminob (388 aa) initn: 1112 init1: 973 opt: 1024 Z-score: 1042.4 bits: 202.4 E(85289): 2.5e-51 Smith-Waterman score: 1024; 52.7% identity (85.5% similar) in 256 aa overlap (108-363:1-256) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 FGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEK :.:.: :.:.:::: :::::: :. .. NP_001 MYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQ 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 LWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQAC ::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: : NP_001 LWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNC 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 NLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLIL .: .::::::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: : ::.: :: : NP_001 TLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSL 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRD .:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. NP_001 SFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRE 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 KLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRY ::.: .::::.:.. :. ::::.::::...::.:..:::.:: . NP_001 TLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSK 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 QQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTS NP_001 SESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRF 280 290 300 310 320 330 632 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:33:19 2016 done: Tue Nov 8 06:33:21 2016 Total Scan time: 9.190 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]