FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5666, 520 aa 1>>>pF1KE5666 520 - 520 aa - 520 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9186+/-0.0009; mu= 14.5903+/- 0.054 mean_var=68.6085+/-13.671, 0's: 0 Z-trim(105.5): 25 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.154841 statistics sampled from 8427 (8451) to 8427 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16 Scan time: 2.460 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14261.1 MAOB gene_id:4129|Hs108|chrX ( 520) 3498 790.7 0 CCDS14260.1 MAOA gene_id:4128|Hs108|chrX ( 527) 2630 596.8 2e-170 CCDS59163.1 MAOA gene_id:4128|Hs108|chrX ( 394) 1996 455.1 6.5e-128 CCDS12787.1 IL4I1 gene_id:259307|Hs108|chr19 ( 567) 396 97.8 3.6e-20 CCDS12786.1 IL4I1 gene_id:259307|Hs108|chr19 ( 589) 396 97.8 3.7e-20 >>CCDS14261.1 MAOB gene_id:4129|Hs108|chrX (520 aa) initn: 3498 init1: 3498 opt: 3498 Z-score: 4221.3 bits: 790.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3498; 99.6% identity (99.8% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEARDHVGGRTYTLRNQKVKYVDLGGSY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS14 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEARDRVGGRTYTLRNQKVKYVDLGGSY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VGPTQNRILRLAKELGLETYKVNEVERLIHHVKGKSYPFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 VGPTQNRILRLAKELGLETYKVNEVERLIHHVKGKSYPFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 TMDDMGREIQSDAPWKAPLAEEWDNMTMKELLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEV ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TMDDMGREIPSDAPWKAPLAEEWDNMTMKELLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 SALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TRENVLVETLNHEMYEAKYVISAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TRENVLVETLNHEMYEAKYVISAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVY 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 YKEPFWRKKDYCGTMIIDGEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 YKEPFWRKKDYCGTMIIDGEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEER 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LKKLCELYAKVLGSLEALEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 LKKLCELYAKVLGSLEALEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 IYFAGTETATHWSGYMEGAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 IYFAGTETATHWSGYMEGAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 FLERHLPSVPGLLRLIGLTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 FLERHLPSVPGLLRLIGLTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV 490 500 510 520 >>CCDS14260.1 MAOA gene_id:4128|Hs108|chrX (527 aa) initn: 2628 init1: 2593 opt: 2630 Z-score: 3173.3 bits: 596.8 E(32554): 2e-170 Smith-Waterman score: 2630; 72.8% identity (90.3% similar) in 514 aa overlap (6-519:15-526) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEARDHVGGRTYTLRNQKV ::::.::::::..::::: . :..:.::::::.:::::::.::..: CCDS14 MENQEKASIAGHMFDVVVIGGGISGLSAAKLLTEYGVSVLVLEARDRVGGRTYTIRNEHV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 KYVDLGGSYVGPTQNRILRLAKELGLETYKVNEVERLIHHVKGKSYPFRGPFPPVWNPIT :::.::.::::::::::::.::::.:::::: :::...::::.::::: ::::::::. 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CCDS12 VLLTASGPAVK-RITFSPPLPRHMQEALRRLHYVPATKVFLSFRRPFWREEHIEGGH--S 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 GEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEERLKKLCELYAKVLGSL-EA . . : . . :: . .. . : .: :..:: :. . : . : . . 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CCDS12 NRIGGRIFTYRDQNTGWIGELGAMRMPSSHRILHKLCQGLGLNLTKFTQYDKNTWTEVHE 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 pF1KE5 VKGKSY-----PFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWRTMDDMGREIQSDAPWKAPLAEEWDNM :: ..: : . . . . .. . .... ..... . :: .... CCDS12 VKLRNYVVEKVPEKLGYALRPQEKGHSPEDIYQMALNQALKDLKALGCRKA--MKKFERH 180 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 TMKE-LLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGG :. : :: . .. : :: ... .....: ... . . . .. CCDS12 TLLEYLLGEGNLSRPAVQL---------LGDVMSEDGFFYLSFAEALRAHSCL---SDRL 240 250 260 270 210 220 230 240 250 pF1KE5 QERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQTRENVLVE------TLNHEMYEAKY : ..::: . . ... :. : :. ::. . : ..: :. . : .. .: CCDS12 QYSRIVGGWDLLPRALLSSLSGLVLLNAPVVAMTQGPHDVHVQIETSPPARNLKVLKADV 280 290 300 310 320 330 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VI-SAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVYYKEPFWRKKDYCGTMIID :. .: :.. .: :.:::: .. . :. . : .. ...::::.. : . 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