Result of FASTA (omim) for pFN21AB7743
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7743, 437 aa
  1>>>pF1KB7743     437 - 437 aa - 437 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  64369986 residues in 92320 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6415+/-0.00028; mu= 4.3553+/- 0.018
 mean_var=191.9099+/-38.686, 0's: 0 Z-trim(124.1): 32  B-trim: 0 in 0/60
 Lambda= 0.092582
 statistics sampled from 46923 (46955) to 46923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.8), E-opt: 0.2 (0.509), width:  16
 Scan time:  6.140

The best scores are:                                      opt bits E(92320)
NP_005216 (OMIM: 189971) transcription factor E2F1 ( 437) 2892 398.0 2.7e-110
NP_004082 (OMIM: 600426) transcription factor E2F2 ( 437)  908 133.0 1.6e-30
XP_011539170 (OMIM: 600426) transcription factor E ( 435)  899 131.8 3.6e-30
XP_011512626 (OMIM: 600427) transcription factor E ( 459)  843 124.4 6.8e-28
NP_001230005 (OMIM: 600427) transcription factor E ( 334)  812 120.1 9.3e-27
XP_011539172 (OMIM: 600426) transcription factor E ( 350)  812 120.1 9.6e-27
NP_001940 (OMIM: 600427) transcription factor E2F3 ( 465)  797 118.2 4.8e-26
XP_005248923 (OMIM: 600427) transcription factor E ( 335)  790 117.2 7.1e-26
XP_011512630 (OMIM: 600427) transcription factor E ( 338)  790 117.2 7.2e-26
XP_005248922 (OMIM: 600427) transcription factor E ( 340)  790 117.2 7.2e-26
XP_016865819 (OMIM: 600427) transcription factor E ( 379)  790 117.2 7.9e-26
NP_001265204 (OMIM: 602944) transcription factor E ( 249)  492 77.3 5.4e-14
NP_937987 (OMIM: 602944) transcription factor E2F6 ( 281)  492 77.3 5.9e-14
XP_011539173 (OMIM: 600426) transcription factor E ( 241)  467 74.0 5.3e-13
XP_005245806 (OMIM: 600426) transcription factor E ( 241)  467 74.0 5.3e-13
XP_005245805 (OMIM: 600426) transcription factor E ( 249)  467 74.0 5.4e-13
NP_001941 (OMIM: 600659) transcription factor E2F4 ( 413)  459 73.0 1.7e-12
NP_001265206 (OMIM: 602944) transcription factor E ( 206)  452 71.9 1.9e-12
NP_001265205 (OMIM: 602944) transcription factor E ( 206)  452 71.9 1.9e-12
NP_001265207 (OMIM: 602944) transcription factor E ( 206)  452 71.9 1.9e-12
XP_016859037 (OMIM: 602944) transcription factor E ( 287)  436 69.9 1.1e-11
XP_016859036 (OMIM: 602944) transcription factor E ( 319)  436 69.9 1.2e-11
XP_016859038 (OMIM: 602944) transcription factor E ( 244)  396 64.5 3.8e-10
NP_001077057 (OMIM: 600967) transcription factor E ( 345)  397 64.7 4.6e-10
NP_001942 (OMIM: 600967) transcription factor E2F5 ( 346)  396 64.6 5.1e-10
NP_997705 (OMIM: 602944) transcription factor E2F6 ( 129)  236 42.9 0.00062


>>NP_005216 (OMIM: 189971) transcription factor E2F1 [Ho  (437 aa)
 initn: 2892 init1: 2892 opt: 2892  Z-score: 2101.8  bits: 398.0 E(92320): 2.7e-110
Smith-Waterman score: 2892; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MALAGAPAGGPCAPALEALLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MALAGAPAGGPCAPALEALLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGRGRHPGKGVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGRGRHPGKGVK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 SPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AKKSKNHIQWLGSHTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AKKSKNHIQWLGSHTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 QRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 RMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEG
              370       380       390       400       410       420

              430       
pF1KB7 IRDLFDCDFGDLTPLDF
       :::::::::::::::::
NP_005 IRDLFDCDFGDLTPLDF
              430       

>>NP_004082 (OMIM: 600426) transcription factor E2F2 [Ho  (437 aa)
 initn: 819 init1: 379 opt: 908  Z-score: 669.6  bits: 133.0 E(92320): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 936; 43.7% identity (62.7% similar) in 458 aa overlap (2-432:7-434)

                    10           20        30        40        50  
pF1KB7      MALAGAPAGGP-CAPALEA--LLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPA
             :::.: .  :  .::.    :  .:    :.: :.   .:.  .   :  :.: 
NP_004 MLQGPRALASAAGQTPKVVPAMSPTELWPSG----LSSPQLCPATATYYTPLYPQ-TAPP
               10        20        30            40        50      

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 APAAGPCDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGR-
       : : : :     : :::..:.       :: :: :.::.::::   . ..      .:. 
NP_004 AAAPGTC-----LDATPHGPEGQVVRCLPA-GRLPAKRKLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKC
          60             70        80         90       100         

                 120       130       140       150       160       
pF1KB7 ----GRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRI
           :    :  ::::::.::.:::.: ::.:. :::.: :::.::::::::: ::::::
NP_004 IRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRI
     110       120       130       140       150       160         

       170       180       190         200       210       220     
pF1KB7 YDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGS--HTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMN
       ::::::::::::: ::.::.:::.:          :. . : :.:..:...:: ::.:..
NP_004 YDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQ
     170       180       190       200       210       220         

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB7 ICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSE-NFQI
        :. ... :.::  ..:::::: ::.:....  :: :...::::.:.:.. : .: :.::
NP_004 SCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQI
     230       240       250       260       270       280         

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 SLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTT
        ::: ::::.:.:::::.           ::  :  :.   ...:.   : :. ::: .:
NP_004 YLKSTQGPIEVYLCPEEV-----------QEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSS-ST
     290       300                  310       320       330        

          350       360       370            380             390   
pF1KB7 DPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDED-----RLSPLVAADSLLE------HVRED--F
       :::       .::  : . .  ::. ..      : :: :.:::::      .  ::  .
NP_004 DPSI------MEPTASSVPA-PAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFL
       340             350        360       370       380       390

               400       410       420        430       
pF1KB7 SGLLP--EEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDC-DFGDLTPLDF
       :  :     .::.::  .  :: .::: :::: ::::  :.:::     
NP_004 SPTLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGEGISDLFDSYDLGDLLIN  
              400       410       420       430         

>>XP_011539170 (OMIM: 600426) transcription factor E2F2   (435 aa)
 initn: 796 init1: 587 opt: 899  Z-score: 663.2  bits: 131.8 E(92320): 3.6e-30
Smith-Waterman score: 927; 43.6% identity (62.5% similar) in 456 aa overlap (2-432:7-432)

                    10           20        30        40        50  
pF1KB7      MALAGAPAGGP-CAPALEA--LLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPA
             :::.: .  :  .::.    :  .:    :.: :.   .:.  .   :  :.: 
XP_011 MLQGPRALASAAGQTPKVVPAMSPTELWPSG----LSSPQLCPATATYYTPLYPQ-TAPP
               10        20        30            40        50      

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 APAAGPCDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGR-
       : : : :     : :::..:.       :: :: :.::.::::   . ..      .:. 
XP_011 AAAPGTC-----LDATPHGPEGQVVRCLPA-GRLPAKRKLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKC
          60             70        80         90       100         

                 120       130       140       150       160       
pF1KB7 ----GRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRI
           :    :  ::::::.::.:::.: ::.:. :::.: :::.::::::::: ::::::
XP_011 IRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRI
     110       120       130       140       150       160         

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB7 YDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGSHTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNIC
       ::::::::::::: ::.::.::  :        :. . : :.:..:...:: ::.:.. :
XP_011 YDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSC
     170       180       190       200       210       220         

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB7 TTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSE-NFQISL
       . ... :.::  ..:::::: ::.:....  :: :...::::.:.:.. : .: :.:: :
XP_011 SLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQIYL
     230       240       250       260       270       280         

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB7 KSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDP
       :: ::::.:.:::::.           ::  :  :.   ...:.   : :. ::: .:::
XP_011 KSTQGPIEVYLCPEEV-----------QEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSS-STDP
     290       300                  310       320       330        

        350       360       370            380             390     
pF1KB7 SQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDED-----RLSPLVAADSLLE------HVRED--FSG
       :       .::  : . .  ::. ..      : :: :.:::::      .  ::  .: 
XP_011 SI------MEPTASSVPA-PAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFLSP
             340        350       360       370       380       390

             400       410       420        430       
pF1KB7 LLP--EEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDC-DFGDLTPLDF
        :     .::.::  .  :: .::: :::: ::::  :.:::     
XP_011 TLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGEGISDLFDSYDLGDLLIN  
              400       410       420       430       

>>XP_011512626 (OMIM: 600427) transcription factor E2F3   (459 aa)
 initn: 916 init1: 406 opt: 843  Z-score: 622.4  bits: 124.4 E(92320): 6.8e-28
Smith-Waterman score: 950; 42.5% identity (64.8% similar) in 454 aa overlap (2-437:37-456)

                                            10        20           
pF1KB7                              MALAGAPAGGPCAPALEALLGAGALRLL--D
                                     :: ..: :   : :  :  ::  ...:  .
XP_011 PALEQYLVTAGGGEGAAVVAAAAAASMDKRALLASP-GFAAAAAAAAAPGA-YIQILTTN
         10        20        30        40         50         60    

      30        40        50        60        70          80       
pF1KB7 SSQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCDPDLLLFATPQAP--RPTPSAPRPALGR--
       .:     :. :....  .:  :.::.:     .:: ..::..:  :       :::::  
XP_011 TSTTSCSSSLQSGAVAAGPLLPSAPGAEQTAGSLL-YTTPHGPSSRAGLLQQPPALGRGG
           70        80        90        100       110       120   

                90        100       110       120       130        
pF1KB7 ------PPVKRRLDL-ETDHQYLAESSGPARGRGRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKR
             ::.::::.: :. ::::...    .:.::   ..  :: .:.::.:::.: ::.
XP_011 SGGGGGPPAKRRLELGESGHQYLSDGLKTPKGKGRAALRSPDSPKKKTRYDTSLGLLTKK
           130       140       150       160       170       180   

      140       150       160       170       180       190        
pF1KB7 FLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGSHTTVG
       :..:::.: :::.::: ::::::::::::::::::::::.:: :::::..::.:   .  
XP_011 FIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIHLIKKKSKNNVQWMGCSLSED
           190       200       210       220       230       240   

      200          210       220       230       240       250     
pF1KB7 VGGRL---EGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIA
        :: :   .::.... .:.. :..::.:.. :: .:.::.::...::::::: ::.:.:.
XP_011 -GGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTLDLKLLTEDSENQRLAYVTYQDIRKIS
            250       260       270       280       290       300  

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pF1KB7 DPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQE
          .: :.:.::::::.:.. :: :..:: : : ::::.:.::::::    :: :: .: 
XP_011 GLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDSIESLQIHLASTQGPIEVYLCPEETETH-SPMKTNNQ-
            310       320       330       340       350        360 

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB7 VTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDEDRLS
                 :    .  : :.  .: ..  :.  .:         ::.:         :
XP_011 ----------DHNGNIPKPASKDLASTNSGHSDCSVS---------MGNL---------S
                        370       380                390           

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB7 PLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDCDFGDLTPL
       ::..  .::....... . :   :..: ::    :: ..: : ::: ::::    .  ::
XP_011 PLASPANLLQQTEDQIPSNLEGPFVNLLPPLLQEDYLLSLGEEEGISDLFDAYDLEKLPL
            400       410       420       430       440       450  

              
pF1KB7 --DF   
         ::   
XP_011 VEDFMCS
              

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pF1KB7 CDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDL-ETDHQYLAESSGPARGRGRHPGK
                                     ::::.: :. ::::...    .:.::   .
NP_001                        MPLQQQAKRRLELGESGHQYLSDGLKTPKGKGRAALR
                                      10        20        30       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 GVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGI
       .  :: .:.::.:::.: ::.:..:::.: :::.::: ::::::::::::::::::::::
NP_001 SPDSPKKKTRYDTSLGLLTKKFIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGI
        40        50        60        70        80        90       

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pF1KB7 QLIAKKSKNHIQWLGSHTTVGVGGRL---EGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLL
       .:: :::::..::.:   .   :: :   .::.... .:.. :..::.:.. :: .:.::
NP_001 HLIKKKSKNNVQWMGCSLSED-GGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTLDLKLL
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pF1KB7 SEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPID
       .::...::::::: ::.:.:.   .: :.:.::::::.:.. :: :..:: : : ::::.
NP_001 TEDSENQRLAYVTYQDIRKISGLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDSIESLQIHLASTQGPIE
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pF1KB7 VFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLE
       :.::::::    :: :: .:           :    .  : :.  .: ..  :.  .:  
NP_001 VYLCPEETETH-SPMKTNNQ-----------DHNGNIPKPASKDLASTNSGHSDCSVS--
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pF1KB7 QEPLLSRMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFG
              ::.:         :::..  .::....... . :   :..: ::    :: ..
NP_001 -------MGNL---------SPLASPANLLQQTEDQIPSNLEGPFVNLLPPLLQEDYLLS
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          420       430            
pF1KB7 LEEGEGIRDLFDCDFGDLTPL--DF   
       : : ::: ::::    .  ::  ::   
NP_001 LGEEEGISDLFDAYDLEKLPLVEDFMCS
        310       320       330    

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Smith-Waterman score: 825; 45.1% identity (65.5% similar) in 357 aa overlap (2-347:7-340)

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pF1KB7      MALAGAPAGGP-CAPALEA--LLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPA
             :::.: .  :  .::.    :  .:    :.: :.   .:.  .   :  :.: 
XP_011 MLQGPRALASAAGQTPKVVPAMSPTELWPSG----LSSPQLCPATATYYTPLYPQ-TAPP
               10        20        30            40        50      

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pF1KB7 APAAGPCDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGR-
       : : : :     : :::..:.       :: :: :.::.::::   . ..      .:. 
XP_011 AAAPGTC-----LDATPHGPEGQVVRCLPA-GRLPAKRKLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKC
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pF1KB7 ----GRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRI
           :    :  ::::::.::.:::.: ::.:. :::.: :::.::::::::: ::::::
XP_011 IRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRI
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pF1KB7 YDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGS--HTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMN
       ::::::::::::: ::.::.:::.:          :. . : :.:..:...:: ::.:..
XP_011 YDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQ
     170       180       190       200       210       220         

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pF1KB7 ICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSE-NFQI
        :. ... :.::  ..:::::: ::.:....  :: :...::::.:.:.. : .: :.::
XP_011 SCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQI
     230       240       250       260       270       280         

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pF1KB7 SLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTT
        ::: ::::.:.:::::.           ::  :  :.   ...:.   : :. ::: .:
XP_011 YLKSTQGPIEVYLCPEEV-----------QEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSS-ST
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pF1KB7 DPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSP
       :::                                                         
XP_011 DPSIMEPTASSAS                                               
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>>NP_001940 (OMIM: 600427) transcription factor E2F3 iso  (465 aa)
 initn: 875 init1: 369 opt: 797  Z-score: 589.1  bits: 118.2 E(92320): 4.8e-26
Smith-Waterman score: 948; 42.8% identity (64.3% similar) in 460 aa overlap (2-437:37-462)

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pF1KB7                              MALAGAPAGGPCAPALEALLGAGALRLL--D
                                     :: ..: :   : :  :  ::  ...:  .
NP_001 PALEQYLVTAGGGEGAAVVAAAAAASMDKRALLASP-GFAAAAAAAAAPGA-YIQILTTN
         10        20        30        40         50         60    

      30        40        50        60        70          80       
pF1KB7 SSQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCDPDLLLFATPQAP--RPTPSAPRPALGR--
       .:     :. :....  .:  :.::.:     .:: ..::..:  :       :::::  
NP_001 TSTTSCSSSLQSGAVAAGPLLPSAPGAEQTAGSLL-YTTPHGPSSRAGLLQQPPALGRGG
           70        80        90        100       110       120   

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pF1KB7 ------PPVKRRLDL-ETDHQYLAESSGPARGRGR----HPG--KGVKSPGEKSRYETSL
             ::.::::.: :. ::::...    .:.::     :   :  :::.::.::.:::
NP_001 SGGGGGPPAKRRLELGESGHQYLSDGLKTPKGKGRAALRSPDSPKTPKSPSEKTRYDTSL
           130       140       150       160       170       180   

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pF1KB7 NLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLG
       .: ::.:..:::.: :::.::: ::::::::::::::::::::::.:: :::::..::.:
NP_001 GLLTKKFIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIHLIKKKSKNNVQWMG
           190       200       210       220       230       240   

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pF1KB7 SHTTVGVGGRL---EGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQ
          .   :: :   .::.... .:.. :..::.:.. :: .:.::.::...::::::: :
NP_001 CSLSED-GGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTLDLKLLTEDSENQRLAYVTYQ
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pF1KB7 DLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPG
       :.:.:.   .: :.:.::::::.:.. :: :..:: : : ::::.:.::::::    :: 
NP_001 DIRKISGLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDSIESLQIHLASTQGPIEVYLCPEETETH-SPM
            310       320       330       340       350        360 

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB7 KTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPV
       :: .:           :    .  : :.  .: ..  :.  .:         ::.:    
NP_001 KTNNQ-----------DHNGNIPKPASKDLASTNSGHSDCSVS---------MGNL----
                        370       380       390                    

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB7 DEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDCDF
            :::..  .::....... . :   :..: ::    :: ..: : ::: ::::   
NP_001 -----SPLASPANLLQQTEDQIPSNLEGPFVNLLPPLLQEDYLLSLGEEEGISDLFDAYD
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     430            
pF1KB7 GDLTPL--DF   
        .  ::  ::   
NP_001 LEKLPLVEDFMCS
            460     

>>XP_005248923 (OMIM: 600427) transcription factor E2F3   (335 aa)
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XP_005 EDYLLSLGEEEGISDLFDAYDLEKLPLVEDFMCS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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