Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7743
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7743, 437 aa
  1>>>pF1KB7743     437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6182+/-0.000734; mu= 4.7230+/- 0.045
 mean_var=193.3463+/-38.820, 0's: 0 Z-trim(116.1): 12  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.092237
 statistics sampled from 16912 (16924) to 16912 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.796), E-opt: 0.2 (0.506), width:  16
 Scan time:  2.260

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS13224.1 E2F1 gene_id:1869|Hs109|chr20          ( 437) 2892 396.6 2.6e-110
CCDS236.1 E2F2 gene_id:1870|Hs109|chr1             ( 437)  908 132.6 7.8e-31
CCDS58999.1 E2F3 gene_id:1871|Hs109|chr6           ( 334)  812 119.7 4.4e-27
CCDS4545.1 E2F3 gene_id:1871|Hs109|chr6            ( 465)  797 117.8 2.3e-26
CCDS62859.1 E2F6 gene_id:1876|Hs109|chr2           ( 249)  492 77.1 2.3e-14
CCDS1680.2 E2F6 gene_id:1876|Hs109|chr2            ( 281)  492 77.1 2.5e-14
CCDS32464.1 E2F4 gene_id:1874|Hs109|chr16          ( 413)  459 72.8 7.2e-13
CCDS62858.1 E2F6 gene_id:1876|Hs109|chr2           ( 206)  452 71.7 7.9e-13


>>CCDS13224.1 E2F1 gene_id:1869|Hs109|chr20               (437 aa)
 initn: 2892 init1: 2892 opt: 2892  Z-score: 2094.1  bits: 396.6 E(33420): 2.6e-110
Smith-Waterman score: 2892; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MALAGAPAGGPCAPALEALLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MALAGAPAGGPCAPALEALLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGRGRHPGKGVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGRGRHPGKGVK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 SPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AKKSKNHIQWLGSHTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKKSKNHIQWLGSHTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 QRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 RMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEG
              370       380       390       400       410       420

              430       
pF1KB7 IRDLFDCDFGDLTPLDF
       :::::::::::::::::
CCDS13 IRDLFDCDFGDLTPLDF
              430       

>>CCDS236.1 E2F2 gene_id:1870|Hs109|chr1                  (437 aa)
 initn: 819 init1: 379 opt: 908  Z-score: 667.2  bits: 132.6 E(33420): 7.8e-31
Smith-Waterman score: 936; 43.7% identity (62.7% similar) in 458 aa overlap (2-432:7-434)

                    10           20        30        40        50  
pF1KB7      MALAGAPAGGP-CAPALEA--LLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPA
             :::.: .  :  .::.    :  .:    :.: :.   .:.  .   :  :.: 
CCDS23 MLQGPRALASAAGQTPKVVPAMSPTELWPSG----LSSPQLCPATATYYTPLYPQ-TAPP
               10        20        30            40        50      

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 APAAGPCDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGR-
       : : : :     : :::..:.       :: :: :.::.::::   . ..      .:. 
CCDS23 AAAPGTC-----LDATPHGPEGQVVRCLPA-GRLPAKRKLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKC
          60             70        80         90       100         

                 120       130       140       150       160       
pF1KB7 ----GRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRI
           :    :  ::::::.::.:::.: ::.:. :::.: :::.::::::::: ::::::
CCDS23 IRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRI
     110       120       130       140       150       160         

       170       180       190         200       210       220     
pF1KB7 YDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGS--HTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMN
       ::::::::::::: ::.::.:::.:          :. . : :.:..:...:: ::.:..
CCDS23 YDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQ
     170       180       190       200       210       220         

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB7 ICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSE-NFQI
        :. ... :.::  ..:::::: ::.:....  :: :...::::.:.:.. : .: :.::
CCDS23 SCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQI
     230       240       250       260       270       280         

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 SLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTT
        ::: ::::.:.:::::.           ::  :  :.   ...:.   : :. ::: .:
CCDS23 YLKSTQGPIEVYLCPEEV-----------QEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSS-ST
     290       300                  310       320       330        

          350       360       370            380             390   
pF1KB7 DPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDED-----RLSPLVAADSLLE------HVRED--F
       :::       .::  : . .  ::. ..      : :: :.:::::      .  ::  .
CCDS23 DPSI------MEPTASSVPA-PAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFL
       340             350        360       370       380       390

               400       410       420        430       
pF1KB7 SGLLP--EEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDC-DFGDLTPLDF
       :  :     .::.::  .  :: .::: :::: ::::  :.:::     
CCDS23 SPTLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGEGISDLFDSYDLGDLLIN  
              400       410       420       430         

>>CCDS58999.1 E2F3 gene_id:1871|Hs109|chr6                (334 aa)
 initn: 873 init1: 406 opt: 812  Z-score: 599.9  bits: 119.7 E(33420): 4.4e-27
Smith-Waterman score: 869; 45.6% identity (68.2% similar) in 355 aa overlap (89-437:8-331)

       60        70        80        90        100       110       
pF1KB7 CDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDL-ETDHQYLAESSGPARGRGRHPGK
                                     ::::.: :. ::::...    .:.::   .
CCDS58                        MPLQQQAKRRLELGESGHQYLSDGLKTPKGKGRAALR
                                      10        20        30       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 GVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGI
       .  :: .:.::.:::.: ::.:..:::.: :::.::: ::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPDSPKKKTRYDTSLGLLTKKFIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGI
        40        50        60        70        80        90       

       180       190       200          210       220       230    
pF1KB7 QLIAKKSKNHIQWLGSHTTVGVGGRL---EGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLL
       .:: :::::..::.:   .   :: :   .::.... .:.. :..::.:.. :: .:.::
CCDS58 HLIKKKSKNNVQWMGCSLSED-GGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTLDLKLL
       100       110        120       130       140       150      

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB7 SEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPID
       .::...::::::: ::.:.:.   .: :.:.::::::.:.. :: :..:: : : ::::.
CCDS58 TEDSENQRLAYVTYQDIRKISGLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDSIESLQIHLASTQGPIE
        160       170       180       190       200       210      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB7 VFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLE
       :.::::::    :: :: .:           :    .  : :.  .: ..  :.  .:  
CCDS58 VYLCPEETETH-SPMKTNNQ-----------DHNGNIPKPASKDLASTNSGHSDCSVS--
        220        230                  240       250       260    

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB7 QEPLLSRMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFG
              ::.:         :::..  .::....... . :   :..: ::    :: ..
CCDS58 -------MGNL---------SPLASPANLLQQTEDQIPSNLEGPFVNLLPPLLQEDYLLS
                            270       280       290       300      

          420       430            
pF1KB7 LEEGEGIRDLFDCDFGDLTPL--DF   
       : : ::: ::::    .  ::  ::   
CCDS58 LGEEEGISDLFDAYDLEKLPLVEDFMCS
        310       320       330    

>>CCDS4545.1 E2F3 gene_id:1871|Hs109|chr6                 (465 aa)
 initn: 875 init1: 369 opt: 797  Z-score: 587.0  bits: 117.8 E(33420): 2.3e-26
Smith-Waterman score: 948; 42.8% identity (64.3% similar) in 460 aa overlap (2-437:37-462)

                                            10        20           
pF1KB7                              MALAGAPAGGPCAPALEALLGAGALRLL--D
                                     :: ..: :   : :  :  ::  ...:  .
CCDS45 PALEQYLVTAGGGEGAAVVAAAAAASMDKRALLASP-GFAAAAAAAAAPGA-YIQILTTN
         10        20        30        40         50         60    

      30        40        50        60        70          80       
pF1KB7 SSQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCDPDLLLFATPQAP--RPTPSAPRPALGR--
       .:     :. :....  .:  :.::.:     .:: ..::..:  :       :::::  
CCDS45 TSTTSCSSSLQSGAVAAGPLLPSAPGAEQTAGSLL-YTTPHGPSSRAGLLQQPPALGRGG
           70        80        90        100       110       120   

                90        100       110             120       130  
pF1KB7 ------PPVKRRLDL-ETDHQYLAESSGPARGRGR----HPG--KGVKSPGEKSRYETSL
             ::.::::.: :. ::::...    .:.::     :   :  :::.::.::.:::
CCDS45 SGGGGGPPAKRRLELGESGHQYLSDGLKTPKGKGRAALRSPDSPKTPKSPSEKTRYDTSL
           130       140       150       160       170       180   

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB7 NLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLG
       .: ::.:..:::.: :::.::: ::::::::::::::::::::::.:: :::::..::.:
CCDS45 GLLTKKFIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIHLIKKKSKNNVQWMG
           190       200       210       220       230       240   

            200          210       220       230       240         
pF1KB7 SHTTVGVGGRL---EGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQ
          .   :: :   .::.... .:.. :..::.:.. :: .:.::.::...::::::: :
CCDS45 CSLSED-GGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTLDLKLLTEDSENQRLAYVTYQ
            250       260       270       280       290       300  

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB7 DLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPG
       :.:.:.   .: :.:.::::::.:.. :: :..:: : : ::::.:.::::::    :: 
CCDS45 DIRKISGLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDSIESLQIHLASTQGPIEVYLCPEETETH-SPM
            310       320       330       340       350        360 

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB7 KTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPV
       :: .:           :    .  : :.  .: ..  :.  .:         ::.:    
CCDS45 KTNNQ-----------DHNGNIPKPASKDLASTNSGHSDCSVS---------MGNL----
                        370       380       390                    

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB7 DEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDCDF
            :::..  .::....... . :   :..: ::    :: ..: : ::: ::::   
CCDS45 -----SPLASPANLLQQTEDQIPSNLEGPFVNLLPPLLQEDYLLSLGEEEGISDLFDAYD
            400       410       420       430       440       450  

     430            
pF1KB7 GDLTPL--DF   
        .  ::  ::   
CCDS45 LEKLPLVEDFMCS
            460     

>>CCDS62859.1 E2F6 gene_id:1876|Hs109|chr2                (249 aa)
 initn: 468 init1: 254 opt: 492  Z-score: 371.5  bits: 77.1 E(33420): 2.3e-14
Smith-Waterman score: 506; 37.1% identity (64.8% similar) in 267 aa overlap (87-351:5-245)

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB7 GPCDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLETDHQYLAESSGPARGRGRHPG
                                     : : :..:: . ::..          :.  
CCDS62                           MNPSPSKIRINLEDNVQYVSM---------RKAL
                                         10        20              

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB7 KGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEG
       : :: :    :...::   :..:..:.  .  :..::: .:  : :.:::.:::::::.:
CCDS62 K-VKRP----RFDVSLVYLTRKFMDLVRSAPGGILDLNKVATKLGVRKRRVYDITNVLDG
           30            40        50        60        70        80

        180       190        200       210       220       230     
pF1KB7 IQLIAKKSKNHIQWLGSH-TTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLS
       :.:. :::::::.:.::  .. :.  . . : ..: .:.  :. ::.:.. :. ::  :.
CCDS62 IDLVEKKSKNHIRWIGSDLSNFGAVPQQKKLQEELSDLSAMEDALDELIKDCAQQLFELT
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pF1KB7 EDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSEN-FQISLKSKQGPID
       .: ...:::::: ::..::    ::.:...::: ::.:..    :. . . ..: .::::
CCDS62 DDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAETRLDVPAPREDSITVHIRSTNGPID
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          300       310       320       330       340       350    
pF1KB7 VFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLE
       :.::  :            :  ::....... ...  :  : .:    . . :. ::   
CCDS62 VYLCEVE------------QGQTSNKRSEGVGTSSSESTHPEGPEEEENPQQSEELLEVS
                          210       220       230       240        

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pF1KB7 QEPLLSRMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFG
                                                                   
CCDS62 N                                                           
                                                                   

>>CCDS1680.2 E2F6 gene_id:1876|Hs109|chr2                 (281 aa)
 initn: 468 init1: 254 opt: 492  Z-score: 370.8  bits: 77.1 E(33420): 2.5e-14
Smith-Waterman score: 526; 36.5% identity (63.1% similar) in 293 aa overlap (61-351:11-277)

               40        50        60        70        80        90
pF1KB7 SQIVIISAAQDASAPPAPTGPAAPAAGPCDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKR
                                     :.:::  : .. :     :  . :  : : 
CCDS16                     MSQQRPARKLPSLLLDPTEETVRRRCRDPINVEGLLPSKI
                                   10        20        30        40

              100       110       120       130       140       150
pF1KB7 RLDLETDHQYLAESSGPARGRGRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGV
       :..:: . ::..          :.  : :: :    :...::   :..:..:.  .  :.
CCDS16 RINLEDNVQYVSM---------RKALK-VKRP----RFDVSLVYLTRKFMDLVRSAPGGI
               50                  60            70        80      

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pF1KB7 VDLNWAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGSH-TTVGVGGRLEGLTQD
       .::: .:  : :.:::.:::::::.::.:. :::::::.:.::  .. :.  . . : ..
CCDS16 LDLNKVATKLGVRKRRVYDITNVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSNFGAVPQQKKLQEE
         90       100       110       120       130       140      

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pF1KB7 LRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPP
       : .:.  :. ::.:.. :. ::  :..: ...:::::: ::..::    ::.:...::: 
CCDS16 LSDLSAMEDALDELIKDCAQQLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPA
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pF1KB7 ETQLQAVDSSEN-FQISLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSA
       ::.:..    :. . . ..: .:::::.::  :            :  ::....... ..
CCDS16 ETRLDVPAPREDSITVHIRSTNGPIDVYLCEVE------------QGQTSNKRSEGVGTS
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pF1KB7 TIVSPPPSSPPSSLTTDPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVR
       .  :  : .:    . . :. ::                                     
CCDS16 SSESTHPEGPEEEENPQQSEELLEVSN                                 
          260       270       280                                  

>>CCDS32464.1 E2F4 gene_id:1874|Hs109|chr16               (413 aa)
 initn: 397 init1: 162 opt: 459  Z-score: 344.7  bits: 72.8 E(33420): 7.2e-13
Smith-Waterman score: 459; 37.1% identity (65.1% similar) in 275 aa overlap (122-382:12-278)

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pF1KB7 LDLETDHQYLAESSGPARGRGRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVV
                                     ::  ::.: ::.: : .:. ::... :::.
CCDS32                    MAEAGPQAPPPPGTPSRHEKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVL
                                  10        20        30        40 

             160        170       180       190          200       
pF1KB7 DLNWAAEVLKV-QKRRIYDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLG---SHTTVGVGGRLEGLT
       ::. ::..: : ::::::::::::::: :: ::::: ::: :   . .:  .. .:  : 
CCDS32 DLKLAADTLAVRQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKSKNSIQWKGVGPGCNTREIADKLIELK
              50        60        70        80        90       100 

       210       220       230       240       250        260      
pF1KB7 QDLRQLQESEQQLDHLMNICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDL-RSIADPAEQMVMVIK
        ....::. ::.::.       ..: ..::.... ::::: .:. : .:    . ...:.
CCDS32 AEIEELQQREQELDQHKVWVQQSIRNVTEDVQNSCLAYVTHEDICRCFAG---DTLLAIR
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pF1KB7 APPETQLQA-----VDSSENFQISLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEE
       ::  :.:..     .......:: ::: .:::.:.:  .:. ..  :  .:   :   :.
CCDS32 APSGTSLEVPIPEGLNGQKKYQIHLKSVSGPIEVLLVNKEAWSS-PPVAVP---VPPPED
      160       170       180       190       200           210    

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pF1KB7 NRATDSATIVSPPPSSPP----SSLTTDPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDEDRLSPL
          . :: . .:::   :    :. .. :..  :.    :  ... .. .:. :  .:  
CCDS32 LLQSPSA-VSTPPPLPKPALAQSQEASRPNSPQLTPTAVPGSAEVQGMAGPAAEITVSGG
          220        230       240       250       260       270   

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pF1KB7 VAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDCDFGDLTPLDF
        ..::                                                       
CCDS32 PGTDSKDSGELSSLPLGPTTLDTRPLQSSALLDSSSSSSSSSSSSSNSNSSSSSGPNPST
           280       290       300       310       320       330   

>>CCDS62858.1 E2F6 gene_id:1876|Hs109|chr2                (206 aa)
 initn: 428 init1: 214 opt: 452  Z-score: 344.0  bits: 71.7 E(33420): 7.9e-13
Smith-Waterman score: 455; 38.3% identity (67.8% similar) in 214 aa overlap (140-351:1-202)

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pF1KB7 GRGRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRIYD
                                     ..:.  .  :..::: .:  : :.:::.::
CCDS62                               MDLVRSAPGGILDLNKVATKLGVRKRRVYD
                                             10        20        30

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pF1KB7 ITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGSH-TTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMNICT
       :::::.::.:. :::::::.:.::  .. :.  . . : ..: .:.  :. ::.:.. :.
CCDS62 ITNVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSNFGAVPQQKKLQEELSDLSAMEDALDELIKDCA
               40        50        60        70        80        90

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pF1KB7 TQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSEN-FQISLK
        ::  :..: ...:::::: ::..::    ::.:...::: ::.:..    :. . . ..
CCDS62 QQLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAETRLDVPAPREDSITVHIR
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pF1KB7 SKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTTDPS
       : .:::::.::  :            :  ::....... ...  :  : .:    . . :
CCDS62 STNGPIDVYLCEVE------------QGQTSNKRSEGVGTSSSESTHPEGPEEEENPQQS
              160                   170       180       190        

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pF1KB7 QSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDEDRLSPLVAADSLLEHVREDFSGLLPEEFISLSPPHE
       . ::                                                        
CCDS62 EELLEVSN                                                    
      200                                                          




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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