FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6739, 1218 aa 1>>>pF1KE6739 1218 - 1218 aa - 1218 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3042+/-0.00161; mu= 20.2623+/- 0.096 mean_var=272.1129+/-51.319, 0's: 0 Z-trim(107.2): 259 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.077750 statistics sampled from 9181 (9451) to 9181 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16 Scan time: 3.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 9177 1045.2 0 CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 4815 555.9 2.2e-157 CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 2867 337.4 1.3e-91 CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 1771 214.1 1e-54 CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 1714 207.7 8.4e-53 CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 1509 185.6 1.3e-45 CCDS908.1 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CCDS99 KDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEV 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 DIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMAS :.: :::.::.:::.::: .::.: ::.:. ::::: .. : :.:::.: .: CCDS99 DVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGC----GS 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTC . : .:.::::::.: :: ::.:.: :..:::::::::::.:: ..:::::::: CCDS99 DAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTC 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 IDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHS :: :....:.: .:::: :.:: ::: .:::. : : :::::::: : .::::::::: CCDS99 IDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHS 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KE6 RDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGE :. ::: ::.::::::: ::.:.: :: ::.:.:: .:.::::::::: :::::: .: CCDS99 REFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGA 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 SFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININEC ::.:.:..:::: :..:::::.: ::::.: :::: ::.:::::::::::::::::.:: CCDS99 SFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDEC 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 QSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSG--RPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT ::::::.::::::::::::: ::::..: .:::: : : : . :. .: :..: .:::. CCDS99 QSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNS 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 pF1KE6 CQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSE-----CPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECR :.::.:: ::::::: .:::: :. : :: :: :. ::. :: . ::: CCDS99 CRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLL-AGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGEC- 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KE6 SSSLQPVKTKCTSDSYYQDN-CANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEY .. .: .: : : . :: :: .:. ::.. . : :. ::: .:.: . :. . CCDS99 -GAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDR 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE6 SIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRD--DGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAE . . :. . :. . ..::.: :: :.. :. . :. ...: :::::. ::.: CCDS99 LLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQR-GNSSLLLAVTE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE6 VRVQRRPLK-NRTDFLVPLLSSVLTVAWICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTN :.:. . : .:::.: ....: :. :.: .: ::::: ... :. ..: CCDS99 VKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACVVLCVWWT-RKRRKERERSRLPREE-SAN 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE6 NVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKD--YENKNSKMSKIRTH--------NSEVEEDDMDK : :: :.::::. :.. :: :. :: :. .. :.::. :. CCDS99 NQWAPLNPIRNPIERPGGH----KDVLYQCKNFTPPPRRADEALPGPAGHAAVREDEEDE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE6 HQQKARFAKQPAYTLVDRE-EKPPNGTPTKHPNWTN--KQDNRDLESAQSLNRMEYIV ... . : ..... : :. .: . .:.. : ::: ...:.:. .: CCDS99 DLGRGEEDSLEAEKFLSHKFTKDPGRSPGRPAHWASGPKVDNR---AVRSINEARYAGKE 1190 1200 1210 1220 1230 >>CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200 aa) initn: 4526 init1: 1717 opt: 2867 Z-score: 1758.3 bits: 337.4 E(32554): 1.3e-91 Smith-Waterman score: 4814; 51.1% identity (71.6% similar) in 1252 aa overlap (5-1216:2-1196) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGG-AR :..::. : :: :: :: ... : :::.. ...:::::: .: :: : .: CCDS99 MRAQGRGRLPRRLL--LLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 NPGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLK-ASRGNDRN . : .:::::: .:::::::..:: ::::.: :.:::.:::.: : :. ..:: CCDS99 TTRAGGCGHDECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGHGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 R-------------IVLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSI-IEKASHSGMINPS : .:.::.::::::.::.::::: .:::. . . ::..::.::::: CCDS99 RARARAGGDQDPGLVVIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 RQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGW .:..:. . :::.: :::: ::. ::. ::::::::.::::::.::: :::.::.:: CCDS99 DRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGW 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 MGPECNRAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLC :: ::..:.:.:::. ::.: .::.:::.::::: .::.:.:.:::::: : ::::: : CCDS99 MGKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGSCVEPWQCNC 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 ETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDP :::::: ::::::::::.:.:: ::::: :. ::.:.:.::.:::: ::: ::::: :.: CCDS99 ETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNP 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 CHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQW : : :::.:. ::::.: ::.::::. .::.:. : :. :::: : :.::.:.:: :: CCDS99 CANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQW 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 TGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASC .: ::::: .::: ::::. ..: CCDS99 VGATCQLD--------------------------------------VNDCRGQCQHGGTC 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 RDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQL .::::::.:.:: :..: ::: . :::::.:: .:: :.. . :.: :: :::: ::.. CCDS99 KDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEV 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 DIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMAS :.: :::.::.:::.::: .::.: ::.:. ::::: .. : :.:::.: .: CCDS99 DVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGC----GS 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTC . : .:.::::::.: :: ::.:.: :..:::::::::::.:: ..:::::::: CCDS99 DAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTC 560 570 580 590 600 610 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 IDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHS :: :....:.: .:::: :.:: ::: .:::. : : :::::::: : .::::::::: CCDS99 IDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHS 620 630 640 650 660 670 710 720 730 740 750 760 pF1KE6 RDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGE :. ::: ::.::::::: ::.:.: :: ::.:.:: .:.::::::::: :::::: .: CCDS99 REFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGA 680 690 700 710 720 730 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 SFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININEC ::.:.:..:::: :..:::::.: ::::.: :::: ::.:::::::::::::::::.:: CCDS99 SFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDEC 740 750 760 770 780 790 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 QSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSG--RPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT ::::::.::::::::::::: ::::..: .:::: : : : . :. .: :..: .:::. CCDS99 QSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNS 800 810 820 830 840 850 890 900 910 920 930 pF1KE6 CQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSE-----CPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECR :.::.:: ::::::: .:::: :. : :: :: :. ::. :: . ::: CCDS99 CRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLL-AGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGEC- 860 870 880 890 900 910 940 950 960 970 980 990 pF1KE6 SSSLQPVKTKCTSDSYYQDN-CANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEY .. .: .: : : . :: :: .:. ::.. . : :. ::: .:.: . :. . CCDS99 -GAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDR 920 930 940 950 960 970 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE6 SIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRD--DGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAE . . :. . :. . ..::.: :: :.. :. . :. ...: :::::. ::.: CCDS99 LLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQR-GNSSLLLAVTE 980 990 1000 1010 1020 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE6 VRVQRRPLK-NRTDFLVPLLSSVLTVAWICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTN :.:. . : .:::.: ....: :. :.: .: ::::: ... :. ..: CCDS99 VKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACVVLCVWWT-RKRRKERERSRLPREE-SAN 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE6 NVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKD--YENKNSKMSKIRTH--------NSEVEEDDMDK : :: :.::::. :.. :: :. :: :. .. :.::. :. CCDS99 NQWAPLNPIRNPIERPGGH----KDVLYQCKNFTPPPRRADEALPGPAGHAAVREDEEDE 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE6 HQQKARFAKQPAYTLVDRE-EKPPNGTPTKHPNWTN--KQDNRDLESAQSLNRMEYIV ... . : ..... : :. .: . .:.. : ::: ...:.:. .: CCDS99 DLGRGEEDSLEAEKFLSHKFTKDPGRSPGRPAHWASGPKVDNR---AVRSINEARYAGKE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 >>CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 (723 aa) initn: 1875 init1: 962 opt: 1771 Z-score: 1095.8 bits: 214.1 E(32554): 1e-54 Smith-Waterman score: 1784; 41.3% identity (64.8% similar) in 576 aa overlap (11-576:2-531) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCC-GGAR : .: ::.: :: .: .:: :::.. . : .: : : ::: ::: CCDS53 MGSRCALALAVLSALLCQV-WSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 NPGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDR-- : :. : :.:.::::.::. :. ::..::. :::.: ..:.: . : : CCDS53 PP---PCA---CRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGADSAF 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 -NRIVLPFSFAWPRSYTLLVEAW--DSSND--TVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQ : : .::.:.:: ...:..:: :: .: : .:. .: . . . .. ...:. . CCDS53 SNPIRFPFGFTWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLH 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 NTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRA ..: . ..:. : .::..::: ::. ::::::: :::..: . :.:.: :: :: :.. CCDS53 SSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEP 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 ICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQL :: ::. .:: : ::.:.:. :::: :::.:: .:::.:: :..:::: :. .::: . CCDS53 ICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLF 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 CDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCK :..::::: :.:: ::.::.::: .: ::: CCDS53 CNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSC---------------------------- 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLD ::.:: :: .::.:.:. :..::.: :: :...:.::: . :: :.:. CCDS53 ----------RPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELS 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 ANECEAKPCVNAKSCKNLI-ASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNG : : :: :. :.. ..: : : :. : ::. .:. : .. :.: :.: :: .. CCDS53 AMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDA 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 YRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCE : : : :..: ::. ..:.:::.:: ::: :.. .: :.: :: :..: :. .. :: CCDS53 YLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCE 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 PNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEG ::.::: :..:. : :.: . : : ::. : . : :.: CCDS53 HAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPA-VVDLTEKLEGQGGPFPW 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 VRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNS CCDS53 VAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVS 550 560 570 580 590 600 >>CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 (685 aa) initn: 1714 init1: 992 opt: 1714 Z-score: 1061.5 bits: 207.7 E(32554): 8.4e-53 Smith-Waterman score: 1717; 40.6% identity (68.2% similar) in 534 aa overlap (6-526:5-521) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN .:. :: : ::.:: . .. : :: :.:.. . : : : .: : . CCDS45 MAAASRSASGWALLLLVALW---QQRAAG-SGVFQLQLQEFINERGVLASGRPC----E 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE6 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKA-SRGNDRNR :: : :.:.::::..:. :.. :::.::. ::::.: :.: .. : :. :: CCDS45 PG--------CRTFFRVCLKHFQA-VVSPGPCTFGTVSTPVLGTNSFAVRDDSSGGGRNP 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 IVLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQP-----DSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNT . :::.:.:: ...:..::: . .: ..: :..: : . .: . ...: .:.. CCDS45 LQLPFNFTWPGTFSLIIEAWHAPGDDLRPEALPPDALISKIAIQGSLAVGQNWLLDEQTS 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAIC .....:. :: :.: ::: .:...:. :.: ::::.:. .:: .:. :: : :.. :: CCDS45 TLTRLRYSYRVICSDNYYGDNCSRLCKKRNDHFGHYVCQPDGNLSCLPGWTGEYCQQPIC 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 RQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCD .:: ..: :. :..: :. :::: :..:::: :: :: :. :::: :. .::: .:: CCDS45 LSGCHEQNGYCSKPAECLCRPGWQGRLCNECIPHNGCRHGTCSTPWQCTCDEGWGGLFCD 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 KDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKET .::::: :.:: ::.::::.: .: :.: ::.: .::. : :.::.: ::::. CCDS45 QDLNYCTHHSPCKNGATCSNSGQRSYTCTCRPGYTGVDCELELSECDSNPCRNGGSCKDQ 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 SLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNG--FKCVCPPQWTGKTCQLD :..: : ::. : : . .:. . : .::.:.. .: . : :::..::..:. CCDS45 EDGYHCLCPPGYYGLHCEHSTLSCADSPCFNGGSCRERNQGANYACECPPNFTGSNCEKK 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 ANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCL-GQCQNDASCRDLVNGY ...: ..::.:. .: : : .: : ::. : :.....:: . : . ..:.:: :: CCDS45 VDRCTSNPCANGGQCLNRGPSRMCRCRPGFTGTYCELHVSDCARNPCAHGGTCHDLENGL 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 pF1KE6 RCICPPGYAGDHCE--RDIDECASNPCLNGGHCQNEI--NRFQCLCPTGFSGNLCQLDID : :: :..: .:: .:: :::.::.: . : ... . : : :: :: :. :.. . CCDS45 MCTCPAGFSGRRCEVRTSIDACASSPCFNRATCYTDLSTDTFVCNCPYGFVGSRCEFPVG 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 YCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDT CCDS45 LPPSFPWVAVSLGVGLAVLLVLLGMVAVAVRQLRLRRPDDGSREAMNNLSDFQKDNLIPA 530 540 550 560 570 580 >>CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555 aa) initn: 2254 init1: 765 opt: 1509 Z-score: 932.2 bits: 185.6 E(32554): 1.3e-45 Smith-Waterman score: 2103; 35.6% identity (59.1% similar) in 824 aa overlap (186-949:399-1208) 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 SHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDF-FGHYACDQ :: . : : .:.. :. .: :.. CCDS43 LCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQ---DVDECSLGANPCEH 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 pF1KE6 NGNKT---------CMEGWMGPECNRAI--CRQGCSPKHGSC-KLPGD--CRCQYGWQGL :. :..:. ::.:. . : .. . ..: :. : :. :..:. CCDS43 AGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGV 430 440 450 460 470 480 270 280 290 300 310 pF1KE6 YC----DKCIPHPGCVH-GIC----NEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGT .: :.: : :.: : : :: .:: : :.. :.::. :.. :.. :: ::. CCDS43 HCEVNTDECASSP-CLHNGRCLDKINE-FQCECPTGFTGHLCQYDVDECAS-TPCKNGAK 490 500 510 520 530 540 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 CSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTC : . ::. : : : :::.: .::. : :::: ::::. : : : ::.:: : CCDS43 CLD-GPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCH-YGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHC 550 560 570 580 590 600 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 STNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLI :::..:: . : ::::::: :.. : : :: .:... ..: ..:: .. .: . : CCDS43 ETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPC-DSGTCLDKI 610 620 630 640 650 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 ASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDE .: : : ::. :. :.:::..: :. :.: ..:.: .::. : :: :: : ...: CCDS43 DGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNE 660 670 680 690 700 710 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 CASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCK : ::::..:. :.. .: ..: : :.::. :... . :: ::: ::. : . .: : : CCDS43 CNSNPCVHGA-CRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCT 720 730 740 750 760 770 560 570 580 590 600 pF1KE6 CPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNV------CGPH-- : : . : ::. ..: ..:: .: .:. . : ... :.: CCDS43 CREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPC 780 790 800 810 820 830 610 620 630 640 650 pF1KE6 ---GKCK-SQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDG :.:. :.. .:.: : :. : :. .::.: .:::.:..: . ..:.: :. : CCDS43 RNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAG 840 850 860 870 880 890 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 WEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGG . : :::.:.:: :::::::.: : .: .::: :..: :. ..: : ::. CCDS43 YSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGA 900 910 920 930 940 950 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 TCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPI .: : :.. : ::.:. : :. . .: . : :::::: . .::::.: :. : CCDS43 NCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCE-NNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSY 960 970 980 990 1000 1010 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 CAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDE : ...:.:. .:: ..::: :: . ::: : :..::.:. .. :.:::: :. : . CCDS43 CQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQT 1020 1030 1040 1050 1060 1070 840 850 860 870 880 pF1KE6 INGYRCVCPPGHSGAKCQ------EVSG-RPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT--CQCLNGR . ::: :: : .: :. ::.. : . .. . :. : :: :.: : CCDS43 HTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGY 1080 1090 1100 1110 1120 1130 890 900 910 920 930 pF1KE6 IA--CSKVW--CGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILD----------DQCFVHPCTGVGE . : . :.: :: .. .: :: . :.:. ::: . : CCDS43 TGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGT 1140 1150 1160 1170 1180 1190 940 950 960 970 980 990 pF1KE6 CRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAE : . : ::. CCDS43 CLD---LPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCT 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >-- initn: 555 init1: 299 opt: 883 Z-score: 552.7 bits: 115.4 E(32554): 1.8e-24 Smith-Waterman score: 1075; 36.2% identity (58.5% similar) in 417 aa overlap (368-770:21-398) 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 HACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNN-CSHGGTCQDLVNGF :: :: .:.. : .:: :. .:: CCDS43 MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCS------QPGETCLNGGKCEA-ANGT 10 20 30 40 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 K-CVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNL----IASYYCDCLPGWMGQNCDINI . ::: ..: :: : : : . :: :: .:. . .:.: :.: :. : : . CCDS43 EACVCGGAFVGPRCQ-DPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPL 50 60 70 80 90 100 460 470 480 490 500 pF1KE6 -NDCL-GQCQNDASCRDLVN--GYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEIN : :: . :.: ..: ::.. :.: ::::..: :.. : :::::: :::.: CCDS43 DNACLTNPCRNGGTC-DLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQ-ADPCASNPCANGGQCLPFEA 110 120 130 140 150 160 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 RFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYC--EPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKD . : :: .: : :. :.. : .:. :..:. :.:....: : : . : :: . CCDS43 SYICHCPPSFHGPTCRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYV 170 180 190 200 210 220 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 HCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTY : .::. ....: : : . : : :::: CCDS43 PCSPSPCQ---------------------NGGTCRPTGDVTHE------CACLPGFTGQN 230 240 250 630 640 650 660 670 680 pF1KE6 CHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNP--CHNGGTCR :.:::.:: .: :.:::.:.::::.:.: : : : :: ....:. : :.:::::. CCDS43 CEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCH 260 270 280 290 300 310 690 700 710 720 730 740 pF1KE6 DLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIA . . . : : ::: :. : ..: :.: .:.::.:. .: : :: : : :.. CCDS43 NTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHL- 320 330 340 350 360 370 750 760 770 780 790 800 pF1KE6 RNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNW :..:. :::..:..: .: . .: CCDS43 -NDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGKCIN 380 390 400 410 420 430 >-- initn: 358 init1: 207 opt: 530 Z-score: 338.7 bits: 75.8 E(32554): 1.5e-12 Smith-Waterman score: 661; 30.7% identity (52.5% similar) in 381 aa overlap (362-702:1209-1561) 340 350 360 370 380 pF1KE6 NCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPN--------NC : : : : :.:::.: .: CCDS43 NCSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKC 1180 1190 1200 1210 1220 1230 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 SHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPC--VNAKSCKNLIASYYCDCLPG ..::: : :.:..:.::: ..:. :. :.::: ..:: ....: . . ...:.: : CCDS43 FNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAG 1240 1250 1260 1270 1280 1290 450 460 470 480 490 pF1KE6 WMGQNCDININDCLGQ-CQNDASC---RDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCL :. :. :: : :. :.: ..: . . :. : :: :. : :: : :.: :: CCDS43 HTGRRCESVINGCKGKPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCL 1300 1310 1320 1330 1340 1350 500 510 520 530 540 pF1KE6 NGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASD--------YFC ::: : . ::: :.: ::. . .:: .: :::... : : CCDS43 NGGTCISGPRSPTCLCLGPFTGPECQFPAS----SPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRC 1360 1370 1380 1390 1400 1410 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 KCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQS :: ..: :...: . :. : : . ..: .:. .. CCDS43 LCPAKFNG------------LLCHILDYSFGGGAGRDIPPP---LIEEAC-ELPECQEDA 1420 1430 1440 1450 610 620 630 640 650 pF1KE6 GGKFTCD--CNK---GFTGTYCHENIND----C-ESNPCR---NGGTCIDGVNSYKCICS :.: .:. ::. :. : : :.:: : .: : . : : . :: :. 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CCDS90 EDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCA-FASCTPGSTCID 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 TGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLG--FECECSPGWTGPTCS . ..: :::: .: :.. . ::.:.:::. . : . :. . : : :. : :. CCDS90 RVAS-FSCMCPEGKAGLLCHL-DDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCT 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 pF1KE6 TNIDDCS---PNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKN ..:.:. : : :.: : . ..:.: : ..: :..: :::.. :: : .: . CCDS90 EDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLD 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 LIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDI :... : :.::. : .:...::.: .. : :...: : :: ..:.::::..: :. :: CCDS90 KIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 DECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYF :.:.:.:::::..: .. : ..: : :::.: ::. .:: :.:.::..: :: . ..: CCDS90 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHG-QCQDGIDSYT 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 pF1KE6 CKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPC----EVID-----SCTVAMASNDTPEGVRY--ISSN : : : : :: :.: ..:: . :: .:. ... . . . .:: CCDS90 CICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASN 600 610 620 630 640 650 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 VCGPHGKCKSQSG-GKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNS------ : :: : ..: ....: :. :::: :. .:..: :::::.:.:::.:::. CCDS90 PC-IHGIC--MDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICP 660 670 680 690 700 660 670 pF1KE6 -------------------------------YKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNG :::.:. :: : ::.. :.: .:::.:: CCDS90 EGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNG 710 720 730 740 750 760 680 690 700 710 720 730 pF1KE6 GTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTT ::: .::: . : ::.:.:: .:. ..: : : :::.:. ... : : . : . CCDS90 GTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKN 770 780 790 800 810 820 740 750 760 770 780 790 pF1KE6 CNIARNSSCLPNPCHNGGTC--VVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTC :. . . : ::::.:...: : ::.::.: ::.: :. . ..: .::.: : : CCDS90 CQTVL-APCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLC 830 840 850 860 870 880 800 810 820 830 840 850 pF1KE6 VDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQ- . .. : ::: :::.: ::. .:..: ..:: :..:.: .: . :.: :: .: ::: CCDS90 HNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQT 890 900 910 920 930 940 860 870 880 890 900 pF1KE6 ---EVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT----CQCLNGRIACSKVWC-GPRPCL--LHK : ..:: . :. .. :.. .: :. :.. : . :. ... CCDS90 DMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINS 950 960 970 980 990 1000 910 920 930 940 950 960 pF1KE6 GHSECP---SGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITF :: .:. :. ... : ::: . : : ..: . .: .: :: .. CCDS90 FSCLCPVGFTGSFCLHEINE-CSSHPCLNEGTC-VDGLGTYRCSCPL-GYTGKNCQTLVN 1010 1020 1030 1040 1050 1060 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE6 TFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRD CCDS90 LCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGV 1070 1080 1090 1100 1110 1120 >-- initn: 476 init1: 476 opt: 783 Z-score: 492.2 bits: 104.2 E(32554): 4.3e-21 Smith-Waterman score: 1019; 32.5% identity (53.6% similar) in 517 aa overlap (265-740:1067-1534) 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 RQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPW---QCLCETNWGGQ : : .: : . :::: ..:.: CCDS90 EGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGA 1040 1050 1060 1070 1080 1090 300 310 320 330 340 pF1KE6 LCDKDLNYCG---------THQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLS :: : ... : ..:.: :.: .: :.:: ::.: :: : : CCDS90 YCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHY-CQCPLGYTGSYCEEQLDECAS 1100 1110 1120 1130 1140 1150 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 DPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPP .::.. ..:.. :..::: ::. : .: ..:.:. . :..:::: :::: ::: ::: CCDS90 NPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPP 1160 1170 1180 1190 1200 1210 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 QWTGKTCQLDANECEAKP-CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQN : :. . ..: : :.:. .: . :..: : ::::. :. :. .::.::.. :.. CCDS90 GTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSS 1220 1230 1240 1250 1260 1270 470 480 490 500 510 pF1KE6 DAS--CRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHC---QNEINRFQCLCPT ..: : .:.: : :.: ...: ::: .: : . :::::: : .: . : : :: CCDS90 EGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPP 1280 1290 1300 1310 1320 1330 520 530 540 550 560 570 pF1KE6 GFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVI :::: :: . : :..: :: . :: : :: ..: .. : ..::. CCDS90 GFSGARCQ---SSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSP---RDC---ESGCASSPCQHG 1340 1350 1360 1370 1380 580 590 600 610 620 630 pF1KE6 DSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENIND--- :: :. : :. ..:.: :.:. :. CCDS90 GSCH--------PQ--RQ------PPY----------YSCQCAPPFSGSRCELYTAPPST 1390 1400 1410 1420 640 650 660 670 680 pF1KE6 ----CESNPCRN---GGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDL : :. : . :.: .. ::. : :.:. : .... : : . : : CCDS90 PPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHAC----QWDGGDCSLTMENPWAN-CSSPLPCWDY 1430 1440 1450 1460 1470 690 700 710 720 730 pF1KE6 VNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCN-NGGTC-YDE--GDAFK---C--MCPG--- .:. :: . :.. . :. :. :. :: ::. .: :: : : . CCDS90 INN-QCD-------ELCNTVECLFDNFECQGNSKTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEEC 1480 1490 1500 1510 1520 740 750 760 770 780 790 pF1KE6 GWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYN ::.: : CCDS90 GWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGEL 1530 1540 1550 1560 1570 1580 >>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321 aa) initn: 1327 init1: 842 opt: 1198 Z-score: 744.0 bits: 150.7 E(32554): 4e-35 Smith-Waterman score: 2039; 36.5% identity (60.2% similar) in 762 aa overlap (220-936:67-814) 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 YYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECN-RAICRQGCSPKHGSCK-- : ::.: .:. . :..: .: :. CCDS12 GAAAPPCLDGSPCANGGRCTQLPSREAACLCPPGWVGERCQLEDPCHSGPCAGRGVCQSS 40 50 60 70 80 90 250 260 270 280 290 pF1KE6 -LPG----DCRCQYGWQGLYC---DKCIPHPGCVHGI-CNE-P---WQCLCETNWGGQLC . : .::: :..: : : :. : :.:: :. : . : : .. :. : CCDS12 VVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLPDPCLSSP-CAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSC 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 DKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKE .:.. : . .:: .:::: :: : ...:.:: ::.:: :: : .::.: :.:.. CCDS12 RSDVDECRVGEPCRHGGTCLNT-PGSFRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQ 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 TS-LGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLD .. : ..: : ::. : .: .:.::: . : .:::: : :: ..: :::.:::. : : CCDS12 SGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTED 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 pF1KE6 ANECEAKP--CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDC-LGQCQNDASCRDLVN ..::. .: : :. .: : .... : :. :: :..:. ::.:: . : . :.:.: : CCDS12 VDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVA 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 GYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQ-NEIN-RFQCLCPTGFSGNLCQLDID .. : :: : .: :. : : :.:::: . . :. : .: : : :: ::.:. :. :.: CCDS12 SFYCACPMGKTGLLCHLD-DACVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVD 340 350 360 370 380 390 530 540 550 560 570 pF1KE6 YCE--PNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCT------ : :::.. ..: : ....:.: . : : : ..: . ::. .: CCDS12 ECSIGANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCGRGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQF 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KE6 --VAMAS---NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCE . ::. . . .:. : : ::.. .: :.: : .::.:. :. ....: CCDS12 TCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKDRVNG-FSCTCPSGFSGSTCQLDVDECA 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 SNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCK :.:::::. :.: ..:.: :..:.::. :. :..::: .:::.: : : . .: : : CCDS12 STPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTLCDRNVDDCSPDPCHHG-RCVDGIASFSCACA 520 530 540 550 560 570 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 NGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCH :. : :.:. ..: : .:: : : : . : ::.: :..:.. .. : ::: CCDS12 PGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDLVDKYLCRCPSGTTGVNCEVNIDD-CASNPC- 580 590 600 610 620 760 770 780 790 800 810 pF1KE6 NGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAG . :.: . . . :::. :. ::.: . :.:. :: ..:.::::.: .:: : :: CCDS12 TFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPCGEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLP 630 640 650 660 670 680 820 830 840 850 860 pF1KE6 PDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGR------PCITMGS : : . : ::. : : : .:.:::: :: :: .:.. .: :: . :. CCDS12 PLCLPPSHPCAHEPCSHGI-CYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGT 690 700 710 720 730 740 870 880 890 900 910 920 pF1KE6 VIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVW-CGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILD-DQCF :: . :. ..:: : . : : :: : :. : :: .:. . : . CCDS12 CSSDGMGFH--CTCPPGVQGR-QCELLSPCTPNPCE-HGGRCESAPGQ--LPVCSCPQGW 750 760 770 780 790 800 930 940 950 960 970 980 pF1KE6 VHP-CT-GVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELR : : : :: CCDS12 QGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDPNPCLNGG 810 820 830 840 850 860 >-- initn: 964 init1: 612 opt: 1011 Z-score: 630.6 bits: 129.7 E(32554): 8.3e-29 Smith-Waterman score: 1516; 34.1% identity (57.6% similar) in 627 aa overlap (344-936:819-1410) 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 NTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCST :: .: : . . .: : : :.:::.:. CCDS12 APGQLPVCSCPQGWQGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQ 790 800 810 820 830 840 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 NIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIAS .:.::.:: : .::.::: :..:.: : : ..: : :..:: ..:: . .: . .:: CCDS12 DINDCDPNPCLNGGSCQDGVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPC-GPGTCTDHVAS 850 860 870 880 890 900 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 YYCDCLPGWMGQNCDININDCL-GQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECA . : : ::. : .:. .. :: ..: : ..: : ::.. :.: :::.: ::... : : CCDS12 FTCTCPPGYGGFHCEQDLPDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEADPCL 910 920 930 940 950 960 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 SNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCP : :::.:: :. :.: : .:.: :: .:.: .:::::..: . .. .: :: CCDS12 SRPCLHGGVCSAAHPGFRCTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA--YCLCP 970 980 990 1000 1010 1020 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 EDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGK . :. :. :. ::. : :. ::: ..: :.: ...... CCDS12 PGWSGRLCD-----IRSLPCRE------AAAQI----GVRL--EQLCQAGGQCVDEDSSH 1030 1040 1050 1060 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 FTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCS . : : .: ::..:..... : ..::..:::: ...: : : :..: :: ....:. CCDS12 Y-CVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECA 1070 1080 1090 1100 1110 1120 680 690 700 710 720 pF1KE6 QNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEAT-------CNNGGTCYDEGD ..::..::.: ::: . :.: : : :. ...: . : ..::: : CCDS12 SQPCQHGGSCIDLVARYLCSCPPGTLGVLCEINEDDCGPGPPLDSGPRCLHNGTCVDLVG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 AFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGT--CVVN-GESFTCVCKEGWEGPICAQN .:.: :: :. : :. : . : . :: . : :. . : .: :.:. :. :: : CCDS12 GFRCTCPPGYTGLRCE-ADINECRSGACHAAHTRDCLQDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTV 1190 1200 1210 1220 1230 1240 790 800 810 820 830 pF1KE6 TNDCSPHPCYNSGTCVD-----GDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVD . : .:: ..: : : . :.:: : :: :. :. : :. : . CCDS12 LSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGGLTFTCHCAQPFWGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQ 1250 1260 1270 1280 1290 1300 840 850 860 870 880 pF1KE6 EINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNG--------- : ::.:::: :: .:. : : : ::. . .: . ::.: CCDS12 TPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSP--------P-GAS-NASCAAAPCLHGGSCRPAPLA 1310 1320 1330 1340 1350 890 900 910 920 930 pF1KE6 ---RIACSKVWCGPRPCLLHKGHSE------CPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSS : ::.. : ::: : . : :: . .: :: . :.. : : CCDS12 PFFRCACAQGWTGPR-CEAPAAAPEVSEEPRCPRA-ACQAKRGDQRCDRECNSPG-CGWD 1360 1370 1380 1390 1400 1410 940 950 960 970 980 990 pF1KE6 SLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIY CCDS12 GGDCSLSVGDPWRQCEALQCWRLFNNSRCDPACSSPACLYDNFDCHAGGRERTCNPVYEK 1420 1430 1440 1450 1460 1470 >>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003 aa) initn: 1062 init1: 614 opt: 1076 Z-score: 670.6 bits: 136.9 E(32554): 5e-31 Smith-Waterman score: 1921; 33.0% identity (55.6% similar) in 858 aa overlap (195-960:242-1086) 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 RQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNK--FCR--PRDDFFGHYACDQNGNKTC ::.. :. :. : : : : CCDS34 HNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHL-C------LC 220 230 240 250 260 230 240 250 260 pF1KE6 MEGWMGPEC--NRAICRQGCSPKHGSCKLPGD---CRCQYGWQGLYC----DKCIPH--P :..::.: : : . . :.:. : : : : : : :.: . : CCDS34 PPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPP 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 GCVHG-ICNEP---WQCLCETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCP : .: :.. ..:.: ..::: :...:. : : :.:: . ...: :: CCDS34 HCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDC-IAATCAPGSTCIDR-VGSFSCLCP 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 pF1KE6 EGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSL--GFECECSPGWTGPTCSTNIDDC----- : .: :.. : :::.:::. ..:. . : . : :.::..:::: ..:.: CCDS34 PGRTGLLCHL-EDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQ 390 400 410 420 430 440 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 SPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDC .:. : :::.: . ..:.:.::: .::. :. : ::: ..:: ...: .:.:...: : CCDS34 GPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLC 450 460 470 480 490 500 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 LPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCL :: :: :... :.: . : : :.:.::.::..::: ::..: .::.::::: :.:: CCDS34 PPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQCICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCA 510 520 530 540 550 560 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 NGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEG :::.::.. . :.: : :: : :: ..: : .:: ::.: . . .:: :: . : CCDS34 NGGQCQDQPGAFHCKCLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSGFTG 570 580 590 600 610 620 560 570 580 590 pF1KE6 KNCS------HL-------KDHCRTTPCEVIDS---CTVAMASNDTPEGVRYISSNVC-- . : .: ::. . : :. :. . .: :: :: CCDS34 QLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKANCLCPDGSPGCAPPEDNCTCHHGHCQRSSCVCDV 630 640 650 660 670 680 600 610 620 630 640 pF1KE6 ---GP---------------HG-KCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRN :: :: : : .: ..: : :.:: : :... :.:.:: : CCDS34 GWTGPECEAELGGCISAPCAHGGTCYPQPSG-YNCTCPTGYTGPTCSEEMTACHSGPCLN 690 700 710 720 730 740 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 GGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGK ::.: . ..: : : . : :.:. . : . :: ::::: . . : : : :..: CCDS34 GGSCNPSPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGP 750 760 770 780 790 800 710 720 730 740 750 pF1KE6 TCHSR-DSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTC :... .: .. : : .:: : .. .:.:: :. : .:. . : .:: .. : CCDS34 RCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDL-CAQKPCPRNSHC 810 820 830 840 850 760 770 780 790 800 pF1KE6 VVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHP----------CYNSGTCVDGDNWYRCECA . .: :: :.: .:: ::.: ..:. :.:.: :::. : :.: CCDS34 LQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSLCHNGGLCVDSGPSYFCHCP 860 870 880 890 900 910 810 820 830 840 850 860 pF1KE6 PGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQE----VSGRPCIT ::: : :. ..: :.: :: ::::. . .:: : : ::..: .:.. ...:: . CCDS34 PGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGYDGQNCSKELDACQSQPCHN 920 930 940 950 960 970 870 880 890 900 910 pF1KE6 MGSVIPDGAKWDDDCNT----CQCLNGRIACSKVWCGPR---PC--LLHKGHSEC-P--S :. : . . : .: . : : : : : . . .: : . CCDS34 HGTCTPKPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHT 980 990 1000 1010 1020 1030 920 930 940 950 960 970 pF1KE6 GQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQD-NCANITFTFNKEMMSP :: : . : : .:: : :.... .:. : . .. .:.. 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