Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6739
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6739, 1218 aa
  1>>>pF1KE6739 1218 - 1218 aa - 1218 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3042+/-0.00161; mu= 20.2623+/- 0.096
 mean_var=272.1129+/-51.319, 0's: 0 Z-trim(107.2): 259  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.077750
 statistics sampled from 9181 (9451) to 9181 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.29), width:  16
 Scan time:  3.430

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20           (1218) 9177 1045.2       0
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1238) 4815 555.9 2.2e-157
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1200) 2867 337.4 1.3e-91
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6           ( 723) 1771 214.1   1e-54
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15         ( 685) 1714 207.7 8.4e-53
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9         (2555) 1509 185.6 1.3e-45
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1           (2471) 1393 172.6 1.1e-41
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19        (2321) 1198 150.7   4e-35
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6         (2003) 1076 136.9   5e-31
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523)  951 122.7 7.2e-27
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521)  940 121.4 1.7e-26
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525)  940 121.4 1.7e-26
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529)  940 121.4 1.7e-26
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530)  925 119.7 5.4e-26
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3144)  898 117.2 6.3e-25
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3165)  898 117.3 6.3e-25
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1294)  859 112.2 8.5e-24
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534)  844 110.7   3e-23
CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6           ( 383)  818 106.7 1.1e-22
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15       (1044)  814 107.0 2.5e-22
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          ( 870)  794 104.6 1.1e-21
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571)  802 106.6 1.2e-21
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1           (1406)  794 105.0 1.4e-21
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2          ( 737)  762 100.9 1.2e-20
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1382)  760 101.2 1.9e-20
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9          (1285)  758 100.9 2.2e-20
CCDS9963.1 DLK1 gene_id:8788|Hs108|chr14           ( 383)  739 97.9 5.3e-20
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1557)  714 96.1 7.3e-19
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1587)  714 96.1 7.4e-19
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1624)  714 96.1 7.5e-19
CCDS81852.1 DLK1 gene_id:8788|Hs108|chr14          ( 310)  696 92.9 1.3e-18
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 587)  687 92.3 3.7e-18
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 618)  687 92.4 3.8e-18
CCDS30892.1 PEAR1 gene_id:375033|Hs108|chr1        (1037)  608 83.9 2.3e-15
CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1     ( 236)  572 78.8 1.8e-14
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2         (1413)  569 79.8 5.5e-14
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15          (2871)  568 80.2 8.4e-14
CCDS9831.1 LTBP2 gene_id:4053|Hs108|chr14          (1821)  555 78.4 1.8e-13
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5           (2912)  553 78.5 2.7e-13
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19         (2809)  543 77.3 5.8e-13
CCDS44555.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11         ( 763)  519 73.7   2e-12
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9             (2201)  517 74.2 3.9e-12
CCDS75461.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6          ( 377)  499 70.9 6.6e-12
CCDS4967.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6           ( 594)  487 69.9 2.1e-11
CCDS47446.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          ( 619)  487 69.9 2.2e-11
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2          (1353)  489 70.7 2.7e-11
CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4           (4981)  495 72.4 3.2e-11


>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20                (1218 aa)
 initn: 9177 init1: 9177 opt: 9177  Z-score: 5583.4  bits: 1045.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9177; 100.0% identity (100.0% similar) in 1218 aa overlap (1-1218:1-1218)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 YQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAICRQGCSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAICRQGCSP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 GTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFEC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 ECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 GDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 YNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE6 PHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE6 GAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE6 YDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE6 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE6 GYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE6 PCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCAN
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE6 ITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAED
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE6 IRDDGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IRDDGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE6 WICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYE
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE6 NKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKARFAKQPAYTLVDREEKPPNGTPTKHPNWTNKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKARFAKQPAYTLVDREEKPPNGTPTKHPNWTNKQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210        
pF1KE6 DNRDLESAQSLNRMEYIV
       ::::::::::::::::::
CCDS13 DNRDLESAQSLNRMEYIV
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       :             .:.::.::::::.::.::::: .:::.  . . ::..::.::::: 
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        .:..:. .  :::.: :::: ::. ::.  ::::::::.::::::.::: :::.::.::
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       :: ::..:.:.:::.  ::.: .::.:::.::::: .::.:.:.:::::: : ::::: :
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CCDS99 ETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNP
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CCDS99 CANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQW
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CCDS99 VGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQCQHGGTC
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CCDS99 KDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEV
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CCDS99 DVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGC----GS
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pF1KE6 NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTC
       .  :      .:.::::::.: :: ::.:.: :..:::::::::::.:: ..::::::::
CCDS99 DAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTC
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       :: :....:.: .::::  :.:: :::  .:::. : : :::::::: : .:::::::::
CCDS99 IDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHS
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pF1KE6 RDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGE
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CCDS99 SFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDEC
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CCDS99 QSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNS
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CCDS99 CRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLL-AGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGEC-
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        .. .: .: :   : . :: :: .:. ::.. .  : :.  ::: .:.:   . :. . 
CCDS99 -GAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDR
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CCDS99 LLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQR-GNSSLLLAVTE
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CCDS99 VKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACVVLCVWWT-RKRRKERERSRLPREE-SAN
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CCDS99 NQWAPLNPIRNPIERPGGH----KDVLYQCKNFTPPPRRADEALPGPAGHAAVREDEEDE
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CCDS99 DLGRGEEDSLEAEKFLSHKFTKDPGRSPGRPAHWASGPKVDNR---AVRSINEARYAGKE
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CCDS99    MRAQGRGRLPRRLL--LLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGR
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CCDS99 RARARAGGDQDPGLVVIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPE
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CCDS99 DRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGW
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CCDS99 VGATCQLD--------------------------------------VNDCRGQCQHGGTC
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       .::::::.:.:: :..: ::: . :::::.:: .:: :..  . :.: :: :::: ::..
CCDS99 KDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEV
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pF1KE6 DIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMAS
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CCDS99 DVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGC----GS
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pF1KE6 NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTC
       .  :      .:.::::::.: :: ::.:.: :..:::::::::::.:: ..::::::::
CCDS99 DAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTC
           560       570       580       590       600       610   

          650       660       670       680       690       700    
pF1KE6 IDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHS
       :: :....:.: .::::  :.:: :::  .:::. : : :::::::: : .:::::::::
CCDS99 IDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHS
           620       630       640       650       660       670   

          710       720       730       740       750       760    
pF1KE6 RDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGE
       :. :::  ::.::::::: ::.:.: :: ::.:.:: .:.::::::::: :::::: .: 
CCDS99 REFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGA
           680       690       700       710       720       730   

          770       780       790       800       810       820    
pF1KE6 SFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININEC
       ::.:.:..::::  :..:::::.: ::::.: :::: ::.:::::::::::::::::.::
CCDS99 SFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDEC
           740       750       760       770       780       790   

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pF1KE6 QSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSG--RPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT
       ::::::.::::::::::::: ::::..: .:::: :  : : . :. .: :..: .:::.
CCDS99 QSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNS
           800       810       820       830       840       850   

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pF1KE6 CQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSE-----CPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECR
       :.::.::  ::::::: .::::  :. :     :: :: :.     ::.  :: . ::: 
CCDS99 CRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLL-AGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGEC-
           860       870        880       890       900       910  

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pF1KE6 SSSLQPVKTKCTSDSYYQDN-CANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEY
        .. .: .: :   : . :: :: .:. ::.. .  : :.  ::: .:.:   . :. . 
CCDS99 -GAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDR
              920       930       940       950       960       970

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pF1KE6 SIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRD--DGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAE
        . . :. . :. . ..::.:    ::  :.. :.  .  :.  ...: :::::. ::.:
CCDS99 LLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQR-GNSSLLLAVTE
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pF1KE6 VRVQRRPLK-NRTDFLVPLLSSVLTVAWICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTN
       :.:.      . : .:::.: ....: :. :.:   .:  :::::   ...   :. ..:
CCDS99 VKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACVVLCVWWT-RKRRKERERSRLPREE-SAN
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pF1KE6 NVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKD--YENKNSKMSKIRTH--------NSEVEEDDMDK
       :    :: :.::::. :..    ::  :. ::      :.         .. :.::. :.
CCDS99 NQWAPLNPIRNPIERPGGH----KDVLYQCKNFTPPPRRADEALPGPAGHAAVREDEEDE
      1090      1100          1110      1120      1130      1140   

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pF1KE6 HQQKARFAKQPAYTLVDRE-EKPPNGTPTKHPNWTN--KQDNRDLESAQSLNRMEYIV  
          ...  .  :  .....  : :. .: .  .:..  : :::   ...:.:. .:    
CCDS99 DLGRGEEDSLEAEKFLSHKFTKDPGRSPGRPAHWASGPKVDNR---AVRSINEARYAGKE
          1150      1160      1170      1180         1190      1200

>>CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6                (723 aa)
 initn: 1875 init1: 962 opt: 1771  Z-score: 1095.8  bits: 214.1 E(32554): 1e-54
Smith-Waterman score: 1784; 41.3% identity (64.8% similar) in 576 aa overlap (11-576:2-531)

               10        20        30        40        50          
pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCC-GGAR
                 :   .: ::.: ::  .:  .:: :::..  . : .: : : ::: ::: 
CCDS53          MGSRCALALAVLSALLCQV-WSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAG
                        10         20        30        40        50

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 NPGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDR--
        :    :.   : :.:.::::.::. :.   ::..::. :::.: ..:.:  . : :   
CCDS53 PP---PCA---CRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGADSAF
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pF1KE6 -NRIVLPFSFAWPRSYTLLVEAW--DSSND--TVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQ
        : : .::.:.:: ...:..::   :: .:  : .:. .: . . .  .. ...:.   .
CCDS53 SNPIRFPFGFTWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLH
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pF1KE6 NTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRA
       ..: . ..:. : .::..::: ::. ::::::: :::..: . :.:.:  :: :: :.. 
CCDS53 SSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEP
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pF1KE6 ICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQL
       ::  ::. .:: :  ::.:.:. :::: :::.:: .:::.:: :..:::: :. .::: .
CCDS53 ICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLF
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pF1KE6 CDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCK
       :..:::::  :.:: ::.::.:::  .: :::                            
CCDS53 CNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSC----------------------------
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pF1KE6 ETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLD
                  ::.:: ::  .::.:.:. :..::.: :: :...:.::: . :: :.:.
CCDS53 ----------RPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELS
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pF1KE6 ANECEAKPCVNAKSCKNLI-ASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNG
       :  :   :: :.  :..   ..: : :  :. : ::. .:. : .. :.: :.: :: ..
CCDS53 AMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDA
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pF1KE6 YRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCE
       : : :  :..: ::. ..:.:::.:: ::: :.. .: :.: :: :..:  :.  .. ::
CCDS53 YLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCE
        430       440       450       460       470       480      

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pF1KE6 PNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEG
         ::.::: :..:.  : :.: . : : ::. :  .    :  :.:              
CCDS53 HAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPA-VVDLTEKLEGQGGPFPW
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CCDS53 VAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVS
         550       560       570       580       590       600     

>>CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15              (685 aa)
 initn: 1714 init1: 992 opt: 1714  Z-score: 1061.5  bits: 207.7 E(32554): 8.4e-53
Smith-Waterman score: 1717; 40.6% identity (68.2% similar) in 534 aa overlap (6-526:5-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN
            .:. ::  : ::.::    . .. : :: :.:..  . :  : : .:  :    .
CCDS45  MAAASRSASGWALLLLVALW---QQRAAG-SGVFQLQLQEFINERGVLASGRPC----E
                10        20            30        40        50     

               70        80        90       100       110          
pF1KE6 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKA-SRGNDRNR
       ::        : :.:.::::..:. :.. :::.::. ::::.: :.: ..  : :. :: 
CCDS45 PG--------CRTFFRVCLKHFQA-VVSPGPCTFGTVSTPVLGTNSFAVRDDSSGGGRNP
                      60         70        80        90       100  

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pF1KE6 IVLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQP-----DSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNT
       . :::.:.:: ...:..::: . .: ..:     :..: : . .: .  ...:   .:..
CCDS45 LQLPFNFTWPGTFSLIIEAWHAPGDDLRPEALPPDALISKIAIQGSLAVGQNWLLDEQTS
            110       120       130       140       150       160  

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pF1KE6 GVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAIC
        .....:. :: :.: ::: .:...:. :.: ::::.:. .:: .:. :: :  :.. ::
CCDS45 TLTRLRYSYRVICSDNYYGDNCSRLCKKRNDHFGHYVCQPDGNLSCLPGWTGEYCQQPIC
            170       180       190       200       210       220  

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pF1KE6 RQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCD
        .::  ..: :. :..: :. ::::  :..:::: :: :: :. :::: :. .::: .::
CCDS45 LSGCHEQNGYCSKPAECLCRPGWQGRLCNECIPHNGCRHGTCSTPWQCTCDEGWGGLFCD
            230       240       250       260       270       280  

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pF1KE6 KDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKET
       .:::::  :.:: ::.::::.:  .: :.:  ::.: .::.    : :.::.: ::::. 
CCDS45 QDLNYCTHHSPCKNGATCSNSGQRSYTCTCRPGYTGVDCELELSECDSNPCRNGGSCKDQ
            290       300       310       320       330       340  

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pF1KE6 SLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNG--FKCVCPPQWTGKTCQLD
         :..: : ::. :  :  .  .:. . : .::.:..  .:  . : :::..::..:.  
CCDS45 EDGYHCLCPPGYYGLHCEHSTLSCADSPCFNGGSCRERNQGANYACECPPNFTGSNCEKK
            350       360       370       380       390       400  

            420       430       440       450        460       470 
pF1KE6 ANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCL-GQCQNDASCRDLVNGY
       ...: ..::.:. .: :   : .: : ::. :  :.....::  . : . ..:.:: :: 
CCDS45 VDRCTSNPCANGGQCLNRGPSRMCRCRPGFTGTYCELHVSDCARNPCAHGGTCHDLENGL
            410       420       430       440       450       460  

             480         490       500         510       520       
pF1KE6 RCICPPGYAGDHCE--RDIDECASNPCLNGGHCQNEI--NRFQCLCPTGFSGNLCQLDID
        : :: :..: .::   .:: :::.::.: . : ...  . : : :: :: :. :.. . 
CCDS45 MCTCPAGFSGRRCEVRTSIDACASSPCFNRATCYTDLSTDTFVCNCPYGFVGSRCEFPVG
            470       480       490       500       510       520  

       530       540       550       560       570       580       
pF1KE6 YCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDT
                                                                   
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            530       540       550       560       570       580  

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CCDS43 LCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQ---DVDECSLGANPCEH
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                   220       230         240        250         260
pF1KE6 NGNKT---------CMEGWMGPECNRAI--CRQGCSPKHGSC-KLPGD--CRCQYGWQGL
        :.           :..:. ::.:.  .  : ..   . ..:    :.  : :. :..:.
CCDS43 AGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGV
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pF1KE6 YC----DKCIPHPGCVH-GIC----NEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGT
       .:    :.:   : :.: : :    :: .:: : :.. :.::. :.. :..  :: ::. 
CCDS43 HCEVNTDECASSP-CLHNGRCLDKINE-FQCECPTGFTGHLCQYDVDECAS-TPCKNGAK
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       : . ::. : : : :::.: .::.    :  ::::  ::::.    : : : ::.::  :
CCDS43 CLD-GPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCH-YGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHC
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pF1KE6 STNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLI
        :::..:: . : :::::::  :.. : :    :: .:... ..: ..:: .. .: . :
CCDS43 ETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPC-DSGTCLDKI
              610       620       630       640       650          

             440       450        460       470       480       490
pF1KE6 ASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDE
        .: : : ::. :. :.:::..: :. :.: ..:.: .::. : :: ::    :  ...:
CCDS43 DGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNE
     660       670       680       690       700       710         

              500       510       520       530       540       550
pF1KE6 CASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCK
       : ::::..:. :.. .: ..: :  :.::. :... . :: ::: ::. : . .: : : 
CCDS43 CNSNPCVHGA-CRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCT
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       : : . : ::.   ..: ..::    .:   .:.      . : ...       :.:   
CCDS43 CREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPC
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pF1KE6 ---GKCK-SQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDG
          :.:. :..  .:.: :  :. :  :. .::.:  .:::.:..: .  ..:.: :. :
CCDS43 RNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAG
      840       850       860       870       880       890        

      660       670       680       690       700       710        
pF1KE6 WEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGG
       . :  :::.:.::  :::::::.: : .:  .:::  :..:  :.   ..:    : ::.
CCDS43 YSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGA
      900       910       920       930       940       950        

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pF1KE6 TCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPI
       .: :  :.. : ::.:. :  :.   . .:  . : :::::: . .::::.:  :. :  
CCDS43 NCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCE-NNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSY
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pF1KE6 CAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDE
       : ...:.:. .:: ..::: :: . ::: :  :..::.:.  .. :.::::  :. : . 
CCDS43 CQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQT
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pF1KE6 INGYRCVCPPGHSGAKCQ------EVSG-RPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT--CQCLNGR
        . ::: :: : .:  :.      ::.. :  . .. .   :.   :  ::  :.:  : 
CCDS43 HTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGY
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pF1KE6 IA--CSKVW--CGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILD----------DQCFVHPCTGVGE
        .  :  .   :.: ::      ..  .: ::  .            :.:. ::: . : 
CCDS43 TGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGT
      1140      1150      1160      1170      1180      1190       

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pF1KE6 CRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAE
       : .    :   ::.                                              
CCDS43 CLD---LPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCT
      1200         1210      1220      1230      1240      1250    

>--
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CCDS43           MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCS------QPGETCLNGGKCEA-ANGT
                         10        20              30         40   

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pF1KE6 K-CVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNL----IASYYCDCLPGWMGQNCDINI
       . :::   ..:  :: : : : . :: :: .:. .    .:.: :.:  :. :  :   .
CCDS43 EACVCGGAFVGPRCQ-DPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPL
            50         60        70        80        90       100  

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pF1KE6 -NDCL-GQCQNDASCRDLVN--GYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEIN
        : :: . :.: ..: ::..   :.: ::::..:  :..  : :::::: :::.:     
CCDS43 DNACLTNPCRNGGTC-DLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQ-ADPCASNPCANGGQCLPFEA
            110        120       130       140        150       160

       510       520         530       540       550       560     
pF1KE6 RFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYC--EPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKD
        . : :: .: :  :. :.. :  .:. :..:. :.:....: : :   . : :: .   
CCDS43 SYICHCPPSFHGPTCRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYV
              170       180       190       200       210       220

         570       580       590       600       610       620     
pF1KE6 HCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTY
        :  .::.                     ....: : :    .      : :  ::::  
CCDS43 PCSPSPCQ---------------------NGGTCRPTGDVTHE------CACLPGFTGQN
                                   230       240             250   

         630       640       650       660       670         680   
pF1KE6 CHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNP--CHNGGTCR
       :.:::.:: .: :.:::.:.::::.:.: :   : : ::  ....:.  :  :.:::::.
CCDS43 CEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCH
           260       270       280       290       300       310   

           690       700       710       720       730       740   
pF1KE6 DLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIA
       .  . . : : ::: :. :    ..:  :.: .:.::.:.  .: : :: :  :  :.. 
CCDS43 NTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHL-
           320       330       340       350       360       370   

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pF1KE6 RNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNW
        :..:. :::..:..: .:  .   .:                                 
CCDS43 -NDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGKCIN
             380       390       400       410       420       430 

>--
 initn: 358 init1: 207 opt: 530  Z-score: 338.7  bits: 75.8 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 661; 30.7% identity (52.5% similar) in 381 aa overlap (362-702:1209-1561)

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pF1KE6 NCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPN--------NC
                                     :  :  :  :  :.:::.:         .:
CCDS43 NCSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKC
     1180      1190      1200      1210      1220      1230        

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pF1KE6 SHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPC--VNAKSCKNLIASYYCDCLPG
        ..::: : :.:..:.::: ..:. :. :.::: ..::   ....: . . ...:.:  :
CCDS43 FNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAG
     1240      1250      1260      1270      1280      1290        

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pF1KE6 WMGQNCDININDCLGQ-CQNDASC---RDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCL
         :. :.  :: : :. :.: ..:    . . :. : :: :. :  :: :   :.:  ::
CCDS43 HTGRRCESVINGCKGKPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCL
     1300      1310      1320      1330      1340      1350        

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pF1KE6 NGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASD--------YFC
       ::: : .      :::   :.:  ::.  .    .:: .:  :::...         : :
CCDS43 NGGTCISGPRSPTCLCLGPFTGPECQFPAS----SPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRC
     1360      1370      1380          1390      1400      1410    

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pF1KE6 KCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQS
        ::  ..:              :...:    . :. : :     .  ..:    .:. ..
CCDS43 LCPAKFNG------------LLCHILDYSFGGGAGRDIPPP---LIEEAC-ELPECQEDA
         1420                  1430      1440          1450        

     610            620       630               640       650      
pF1KE6 GGKFTCD--CNK---GFTGTYCHENIND----C-ESNPCR---NGGTCIDGVNSYKCICS
       :.: .:.  ::.   :. :  :  :.::    : .:  :    . : : .  ::  :.  
CCDS43 GNK-VCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYFSDGHCDSQCNSAGCLF-
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pF1KE6 DGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCD--CKNG---WKGKTCHSRDSQCDE
       ::..   :.   ..:  :: ..   :.:  .: .::  :...   : :  :         
CCDS43 DGFD---CQRAEGQC--NPLYDQ-YCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLDCAEHVPERLA
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pF1KE6 ATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCK
                                                                   
CCDS43 AGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQQMIFPYYGREEELRKHP
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       :.:. :    :. :. :  :.: :  : .    . : : . :    .:::   : : .: 
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          :.:. .:. : .:  :   :  . :.: ..:.:. :..... :.    :  :.:: .
CCDS90 EDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCA-FASCTPGSTCID
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pF1KE6 TGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLG--FECECSPGWTGPTCS
          . ..: :::: .:  :.. . ::.:.:::. . :  . :.  . : :  :. :  :.
CCDS90 RVAS-FSCMCPEGKAGLLCHL-DDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCT
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pF1KE6 TNIDDCS---PNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKN
        ..:.:.    : : :.: : .  ..:.: :   ..:  :..: :::.. :: :  .: .
CCDS90 EDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLD
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KE6 LIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDI
        :... : :.::. : .:...::.: .. : :...: : :: ..:.::::..:  :. ::
CCDS90 KIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI
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pF1KE6 DECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYF
       :.:.:.:::::..: .. : ..: : :::.: ::. .:: :.:.::..: :: .  ..: 
CCDS90 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHG-QCQDGIDSYT
           540       550       560       570       580        590  

      550       560       570                580       590         
pF1KE6 CKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPC----EVID-----SCTVAMASNDTPEGVRY--ISSN
       : :   : :  ::   :.: ..::    . ::     .:.   ... .   . .   .::
CCDS90 CICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASN
            600       610       620       630       640       650  

       600       610        620       630       640       650      
pF1KE6 VCGPHGKCKSQSG-GKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNS------
        :  :: :  ..: ....: :. ::::  :. .:..: :::::.:.:::.:::.      
CCDS90 PC-IHGIC--MDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICP
               660       670       680       690       700         

                                             660       670         
pF1KE6 -------------------------------YKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNG
                                      :::.:. :: :  ::.. :.: .:::.::
CCDS90 EGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNG
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pF1KE6 GTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTT
       ::: .::: . : ::.:.:: .:.   ..:    : : :::.:. ... : :   . : .
CCDS90 GTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKN
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       :. .  . : ::::.:...:    : ::.::.:  ::.:  :. . ..:  .::.: : :
CCDS90 CQTVL-APCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLC
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pF1KE6 VDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQ-
        . .. : ::: :::.: ::. .:..: ..::  :..:.: .: . :.: :: .: ::: 
CCDS90 HNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQT
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pF1KE6 ---EVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT----CQCLNGRIACSKVWC-GPRPCL--LHK
          :  ..:: . :.      ..   :..     .: :.   :..  : .   :.  ...
CCDS90 DMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINS
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pF1KE6 GHSECP---SGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITF
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CCDS90 FSCLCPVGFTGSFCLHEINE-CSSHPCLNEGTC-VDGLGTYRCSCPL-GYTGKNCQTLVN
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pF1KE6 TFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRD
                                                                   
CCDS90 LCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGV
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>--
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CCDS90 EGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGA
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        ::     :          ... : ..:.: :.:  .: :.:: ::.:  ::     : :
CCDS90 YCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHY-CQCPLGYTGSYCEEQLDECAS
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       .::.. ..:..   :..::: ::. : .:  ..:.:. . :..:::: :::: ::: :::
CCDS90 NPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPP
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pF1KE6 QWTGKTCQLDANECEAKP-CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQN
          :  :. . ..:   : :.:. .: . :..: : ::::. :. :. .::.::.. :..
CCDS90 GTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSS
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       ..:  : .:.: : :.:  ...: :::  .: : . :::::: :   .:  . : : :: 
CCDS90 EGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPP
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       ::::  ::   . :    :..: :: . ::   : ::     ..:   .. : ..::.  
CCDS90 GFSGARCQ---SSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSP---RDC---ESGCASSPCQHG
        1340         1350      1360      1370            1380      

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        ::         :.  :        :.          ..:.:   :.:. :.        
CCDS90 GSCH--------PQ--RQ------PPY----------YSCQCAPPFSGSRCELYTAPPST
       1390                                1400      1410      1420

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           : :. : .    :.: .. ::. :     :.:. :  ....   : : .   : : 
CCDS90 PPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHAC----QWDGGDCSLTMENPWAN-CSSPLPCWDY
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pF1KE6 VNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCN-NGGTC-YDE--GDAFK---C--MCPG---
       .:.  ::       . :.. .   :.  :. :. :: ::.  .: ::   :   : .   
CCDS90 INN-QCD-------ELCNTVECLFDNFECQGNSKTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEEC
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       ::.:  :                                                     
CCDS90 GWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGEL
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>>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19             (2321 aa)
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pF1KE6 YYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECN-RAICRQGCSPKHGSCK--
                                     :  ::.: .:. .  :..:    .: :.  
CCDS12 GAAAPPCLDGSPCANGGRCTQLPSREAACLCPPGWVGERCQLEDPCHSGPCAGRGVCQSS
         40        50        60        70        80        90      

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pF1KE6 -LPG----DCRCQYGWQGLYC---DKCIPHPGCVHGI-CNE-P---WQCLCETNWGGQLC
        . :    .:::  :..:  :   : :.  : :.::  :.  :   . : :  .. :. :
CCDS12 VVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLPDPCLSSP-CAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSC
        100       110       120        130       140       150     

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE6 DKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKE
        .:.. : . .:: .:::: :: : ...:.:: ::.:: ::     :  .::.: :.:..
CCDS12 RSDVDECRVGEPCRHGGTCLNT-PGSFRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQ
         160       170        180       190       200       210    

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE6 TS-LGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLD
       .. : ..: : ::. : .: .:.:::  . : .:::: : :: ..: :::.:::. :  :
CCDS12 SGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTED
          220       230       240       250       260       270    

            420         430       440       450        460         
pF1KE6 ANECEAKP--CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDC-LGQCQNDASCRDLVN
       ..::. .:  : :. .: : .... : :. :: :..:. ::.::  . : . :.:.: : 
CCDS12 VDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVA
          280       290       300       310       320       330    

     470       480       490       500         510       520       
pF1KE6 GYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQ-NEIN-RFQCLCPTGFSGNLCQLDID
       .. : :: : .:  :. : : :.:::: . . :. : .: :  : :: ::.:. :. :.:
CCDS12 SFYCACPMGKTGLLCHLD-DACVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVD
          340       350        360       370       380       390   

       530         540       550       560       570               
pF1KE6 YCE--PNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCT------
        :    :::.. ..: :  ....:.: . : :  :    ..: . ::.   .:       
CCDS12 ECSIGANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCGRGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQF
           400       410       420       430       440       450   

       580          590       600       610       620       630    
pF1KE6 --VAMAS---NDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCE
         . ::.   .     .   .:. :   : ::.. .: :.: : .::.:. :. ....: 
CCDS12 TCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKDRVNG-FSCTCPSGFSGSTCQLDVDECA
           460       470       480       490        500       510  

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pF1KE6 SNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCK
       :.:::::. :.:  ..:.: :..:.::. :. :..::: .:::.:  : : . .: : : 
CCDS12 STPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTLCDRNVDDCSPDPCHHG-RCVDGIASFSCACA
            520       530       540       550        560       570 

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pF1KE6 NGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCH
        :. :  :.:. ..:    : .:: : :  : . : ::.:  :..:..  .. :  ::: 
CCDS12 PGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDLVDKYLCRCPSGTTGVNCEVNIDD-CASNPC-
             580       590       600       610       620           

          760       770       780       790       800       810    
pF1KE6 NGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAG
       . :.:  . . . :::. :. ::.:  . :.:.  :: ..:.::::.: .:: : ::   
CCDS12 TFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPCGEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLP
     630       640       650       660       670       680         

          820       830       840       850       860              
pF1KE6 PDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGR------PCITMGS
       : :    . :   ::. :  : :  .:.:::: :: :: .:..  .:      :: . :.
CCDS12 PLCLPPSHPCAHEPCSHGI-CYDAPGGFRCVCEPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGT
     690       700        710       720       730       740        

      870       880       890        900       910       920       
pF1KE6 VIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVW-CGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILD-DQCF
          ::  .   :.    ..::  :  .  : : ::  : :. :   ::  .:. .  : .
CCDS12 CSSDGMGFH--CTCPPGVQGR-QCELLSPCTPNPCE-HGGRCESAPGQ--LPVCSCPQGW
      750         760        770       780        790         800  

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pF1KE6 VHP-CT-GVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELR
         : :   : ::                                                
CCDS12 QGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDPNPCLNGG
            810       820       830       840       850       860  

>--
 initn: 964 init1: 612 opt: 1011  Z-score: 630.6  bits: 129.7 E(32554): 8.3e-29
Smith-Waterman score: 1516; 34.1% identity (57.6% similar) in 627 aa overlap (344-936:819-1410)

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pF1KE6 NTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCST
                                     ::  .: : . . .: : :  :.:::.:. 
CCDS12 APGQLPVCSCPQGWQGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQ
      790       800       810       820       830       840        

           380       390       400       410       420       430   
pF1KE6 NIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIAS
       .:.::.:: : .::.::: :..:.: : : ..:  :  :..:: ..:: .  .: . .::
CCDS12 DINDCDPNPCLNGGSCQDGVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPC-GPGTCTDHVAS
      850       860       870       880       890        900       

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pF1KE6 YYCDCLPGWMGQNCDININDCL-GQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECA
       . : : ::. : .:. .. ::  ..: : ..: : ::.. :.: :::.: ::... : : 
CCDS12 FTCTCPPGYGGFHCEQDLPDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEADPCL
       910       920       930       940       950       960       

            500       510       520       530       540       550  
pF1KE6 SNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCP
       : :::.:: :.     :.: :  .:.:  ::  .:.:  .:::::..: . ..  .: ::
CCDS12 SRPCLHGGVCSAAHPGFRCTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA--YCLCP
       970       980       990      1000      1010      1020       

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pF1KE6 EDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGK
         . :. :.      :. ::.       : :.     :::    ..:   :.: ......
CCDS12 PGWSGRLCD-----IRSLPCRE------AAAQI----GVRL--EQLCQAGGQCVDEDSSH
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pF1KE6 FTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCS
       . : : .: ::..:..... : ..::..::::   ...: : :  :..:  :: ....:.
CCDS12 Y-CVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECA
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

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pF1KE6 QNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEAT-------CNNGGTCYDEGD
       ..::..::.: :::  . :.:  :  :  :.  ...:  .        : ..::: :   
CCDS12 SQPCQHGGSCIDLVARYLCSCPPGTLGVLCEINEDDCGPGPPLDSGPRCLHNGTCVDLVG
      1130      1140      1150      1160      1170      1180       

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pF1KE6 AFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGT--CVVN-GESFTCVCKEGWEGPICAQN
       .:.: :: :. :  :. :  . :  . :: . :  :. . : .: :.:. :. :: :   
CCDS12 GFRCTCPPGYTGLRCE-ADINECRSGACHAAHTRDCLQDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTV
      1190      1200       1210      1220      1230      1240      

            790            800       810       820       830       
pF1KE6 TNDCSPHPCYNSGTCVD-----GDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVD
        . :  .:: ..: :       :   . :.::  : :: :.     :.   :  :. : .
CCDS12 LSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGGLTFTCHCAQPFWGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQ
       1250      1260      1270      1280      1290      1300      

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pF1KE6 EINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNG---------
          : ::.:::: :: .:.   : :        : ::. . .: .  ::.:         
CCDS12 TPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSP--------P-GAS-NASCAAAPCLHGGSCRPAPLA
       1310      1320      1330                1340      1350      

         890       900       910             920       930         
pF1KE6 ---RIACSKVWCGPRPCLLHKGHSE------CPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSS
          : ::.. : ::: :    .  :      :: . .:     ::   . :.. : :   
CCDS12 PFFRCACAQGWTGPR-CEAPAAAPEVSEEPRCPRA-ACQAKRGDQRCDRECNSPG-CGWD
       1360      1370       1380      1390       1400       1410   

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pF1KE6 SLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIY
                                                                   
CCDS12 GGDCSLSVGDPWRQCEALQCWRLFNNSRCDPACSSPACLYDNFDCHAGGRERTCNPVYEK
          1420      1430      1440      1450      1460      1470   

>>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6              (2003 aa)
 initn: 1062 init1: 614 opt: 1076  Z-score: 670.6  bits: 136.9 E(32554): 5e-31
Smith-Waterman score: 1921; 33.0% identity (55.6% similar) in 858 aa overlap (195-960:242-1086)

          170       180       190         200         210       220
pF1KE6 RQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNK--FCR--PRDDFFGHYACDQNGNKTC
                                     ::..   :.  :. :   :  :       :
CCDS34 HNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHL-C------LC
             220       230       240       250       260           

                230       240       250          260               
pF1KE6 MEGWMGPEC--NRAICRQGCSPKHGSCKLPGD---CRCQYGWQGLYC----DKCIPH--P
         :..::.:  :   : .    . :.:.   :   : :   : :  :    :.:  .  :
CCDS34 PPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPP
          270       280       290       300       310       320    

     270           280       290       300       310       320     
pF1KE6 GCVHG-ICNEP---WQCLCETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCP
        : .:  :..    ..:.: ..:::  :...:. :     :  :.:: .    ...: ::
CCDS34 HCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDC-IAATCAPGSTCIDR-VGSFSCLCP
          330       340       350        360       370        380  

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pF1KE6 EGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSL--GFECECSPGWTGPTCSTNIDDC-----
        : .:  :.. :  :::.:::. ..:. . :  .  : :.::..::::  ..:.:     
CCDS34 PGRTGLLCHL-EDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQ
            390        400       410       420       430       440 

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pF1KE6 SPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDC
       .:. : :::.: .  ..:.:.::: .::. :. : ::: ..::  ...: .:.:...: :
CCDS34 GPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLC
             450       460       470       480       490       500 

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pF1KE6 LPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCL
        ::  :: :... :.: .  : : :.:.::.::..::: ::..: .::.::::: :.:: 
CCDS34 PPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQCICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCA
             510       520       530       540       550       560 

       500       510       520       530       540       550       
pF1KE6 NGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEG
       :::.::.. . :.: :  :: :  :: ..: :  .::  ::.: .  . .:: ::  . :
CCDS34 NGGQCQDQPGAFHCKCLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSGFTG
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pF1KE6 KNCS------HL-------KDHCRTTPCEVIDS---CTVAMASNDTPEGVRYISSNVC--
       . :       .:       ::.   . :   :.   :.    .    .:    :: ::  
CCDS34 QLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKANCLCPDGSPGCAPPEDNCTCHHGHCQRSSCVCDV
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pF1KE6 ---GP---------------HG-KCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRN
          ::               ::  :  : .: ..: :  :.::  : :... :.:.:: :
CCDS34 GWTGPECEAELGGCISAPCAHGGTCYPQPSG-YNCTCPTGYTGPTCSEEMTACHSGPCLN
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pF1KE6 GGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGK
       ::.:  . ..: : :  .  :  :.:. . : . :: ::::: .  . : : :  :..: 
CCDS34 GGSCNPSPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGP
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pF1KE6 TCHSR-DSQCDEATCNNGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTC
        :...   .: .. : : .:: :  .. .:.:: :. : .:.   .  :  .::  .. :
CCDS34 RCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGSCQTLMDL-CAQKPCPRNSHC
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pF1KE6 VVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTNDCSPHP----------CYNSGTCVDGDNWYRCECA
       . .: :: :.: .:: ::.:    ..:.             :.:.: :::.   : :.: 
CCDS34 LQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSLCHNGGLCVDSGPSYFCHCP
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pF1KE6 PGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQE----VSGRPCIT
       ::: :  :. ..: :.: ::  ::::. . .:: : : ::..: .:..     ...:: .
CCDS34 PGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGYDGQNCSKELDACQSQPCHN
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pF1KE6 MGSVIPDGAKWDDDCNT----CQCLNGRIACSKVWCGPR---PC--LLHKGHSEC-P--S
        :.  :  . .   :       .: .    :    : :     :  : .  . .: :  .
CCDS34 HGTCTPKPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHT
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pF1KE6 GQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQD-NCANITFTFNKEMMSP
       :: :  .  : :  .::   : :.... .:.   :   . ..  .:..            
CCDS34 GQWC-EVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHHCHH
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pF1KE6 GLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRDDGNPIKEIT
                                                                   
CCDS34 GGLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFR
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CCDS43 EP-MADRLLLTTPTHRFQCKGPVDI---NIVAKCNACLSSPCKNNGTCTQDPVELYRCAC
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pF1KE6 SPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQ---DLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAK
         .. :  :.. :. :  : :.:::::.   .  .::.: ::  . :. :... ..:: .
CCDS43 PYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQRCEINPDDCEDN
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        : :  .: . : .: : : :.. :. ::  :. :   :. ::..:.:  : .:. : : 
CCDS43 DCENNATCVDGINNYVCICPPNYTGELCDEVIDHCVPELNLCQHEAKCIPLDKGFSCECV
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       :::.:  :: : :.:... : .:..: . :: . : :: :::: .:.       :. . :
CCDS43 PGYSGKLCETDNDDCVAHKCRHGAQCVDTINGYTCTCPQGFSGPFCEHPPPMVLLQTSPC
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CCDS43 DQYECQNGAQCIVVQQEPTCRCPPGFAGPRCEKLITVNFVGKDSYVELASAKVRPQANIS
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       . ...:  .:.   ...   : .    :.  ... :  ..  : .:  :..:: . .  .
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         .   .  .   :.  ::      : . :: . : .  :..  :.     ::  . :..
CCDS43 TDRPLGGFHGCIHEVRINN------ELQDFKALPPQSL-GVSPGCK-----SC--TVCKH
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CCDS43 GLCRSVEKDSVVCECRPGWTGPLCDQEARDPCLGHRCHH-GKCVATGTSYMCKCAEGYGG
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       .:    :.                                                    
CCDS43 ECGCLACS                                                    
        1520                                                       




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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