FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9505, 337 aa 1>>>pF1KE9505 337 - 337 aa - 337 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1261+/-0.000836; mu= 17.1906+/- 0.050 mean_var=90.3448+/-23.652, 0's: 0 Z-trim(107.5): 199 B-trim: 1091 in 2/48 Lambda= 0.134934 statistics sampled from 9373 (9612) to 9373 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16 Scan time: 2.630 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 ( 337) 2293 456.6 1.3e-128 CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 780 162.1 6.2e-40 CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 456 99.2 7.5e-21 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 436 95.1 9.2e-20 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 436 95.2 1e-19 CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 368 81.9 9.2e-16 CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 ( 358) 353 79.0 6.6e-15 CCDS8165.1 GPR152 gene_id:390212|Hs108|chr11 ( 470) 350 78.5 1.2e-14 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 343 77.0 2.6e-14 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 343 77.0 2.6e-14 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 331 74.7 1.3e-13 CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 330 74.5 1.5e-13 CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 330 74.5 1.5e-13 CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 321 72.8 5.1e-13 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 317 72.0 9e-13 CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 315 71.6 1.1e-12 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 311 70.8 1.9e-12 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 311 70.8 2e-12 CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 307 70.0 3.2e-12 CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 307 70.0 3.3e-12 CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 307 70.0 3.4e-12 CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 302 69.1 6.9e-12 CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 300 68.7 8.3e-12 CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 298 68.3 1.1e-11 CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 298 68.3 1.2e-11 CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 297 68.1 1.3e-11 CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 296 67.9 1.6e-11 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 294 67.5 1.9e-11 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 294 67.5 1.9e-11 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 294 67.5 2e-11 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 294 67.5 2e-11 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 293 67.3 2.2e-11 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 292 67.1 2.5e-11 CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 291 66.9 3e-11 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 285 65.8 6.6e-11 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 283 65.4 8.6e-11 >>CCDS12699.1 C5AR2 gene_id:27202|Hs108|chr19 (337 aa) initn: 2293 init1: 2293 opt: 2293 Z-score: 2422.5 bits: 456.6 E(32554): 1.3e-128 Smith-Waterman score: 2293; 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CCDS33 ALVVWVTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 ILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYR :::.::::.::::..::: .:.. : : .. . : . .::..:: ::::::.:: .:: CCDS33 ILLNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 RLHQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALL--CWAARRC ...:.:: .. : :::. .. : ::. .:...::: ::.... :.. .: :. : CCDS33 VVREEYFPPKVLCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRAT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 RPLGT-----AIVVGFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCL : : :.:..::. : ::.. :.... :.: . . . : :..: . :. CCDS33 RSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMSFLEPSSPTFLLLKKLDSLCVSFAYINCCI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE9 NPMLFLYFGRA---QLRRSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTSHDLVSEMEV ::.... :.. .::.:::. ::. .. : .:: ... :. : CCDS33 NPIIYVVAGQGFQGRLRKSLPSL----LRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMAQKTQAV 300 310 320 330 340 350 >>CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 (482 aa) initn: 587 init1: 430 opt: 456 Z-score: 487.9 bits: 99.2 E(32554): 7.5e-21 Smith-Waterman score: 456; 40.2% identity (66.9% similar) in 169 aa overlap (32-197:20-183) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 GNDSVSYEYGDYSDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAMVAWVAG .: . . . . ::.:.:::..: :::: CCDS85 MASFSAETNSTDLLSQPWNEPPVILSMVILSLTFLLGLPGNGLVLWVAG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 KVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYAS .: :.. :.:::..::::::::::. . .: :.:::: :. .::::.:.:.:: CCDS85 LKMQRTVNTIWFLHLTLADLLCCLSLPFSLAHLALQGQWPYGRFLCKLIPSIIVLNMFAS 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE9 VLLLAALSADLCFLALGPAW---WSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQE :.::.:.: : :.... : : .: ::.. :: :..:... .: .::.. CCDS85 VFLLTAISLDRCLVVFKPIWCQNHRNVGMACSI---CGCIWVVAFVMCIPVFVYREIFTT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 HFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALLCWAARRCRPLGTAI : : .: ::: . CCDS85 DNHNR--CGYKFGLSSSLDYPDFYGDPLENRSLENIVQPPGEMNDRLDPSSFQTNDHPWT 170 180 190 200 210 220 >>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa) initn: 316 init1: 90 opt: 436 Z-score: 468.3 bits: 95.1 E(32554): 9.2e-20 Smith-Waterman score: 437; 31.7% identity (57.3% similar) in 356 aa overlap (3-334:22-362) 10 20 30 40 pF1KE9 MGNDSVSYEYGDY-SDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLP : : ::.::. :: : . : .: : : :: CCDS14 MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFD--R-AFLP 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KE9 -LYAAIFLVGVPGNAMVAWVAGKVARRRVGA---TWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIAR ::. .::.:. ::. :: : ..:: . . :.:::::::: : :.::. :: : CCDS14 ALYSLLFLLGLLGNGAVAAVL--LSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 GGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVACG .: .:. :.. ... ...::..:::: .: : . . . : ..: CCDS14 --QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 AAWTLALLLTVPSAIYRRLHQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAV :.: : ::...:. :. :... .: .. . : :. ..... ::: ::... CCDS14 AVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT--ALRVLQLVAGFLLPLLVM 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KE9 ASCHSALLCW-----AARRCRP--LGTAIVVGFFVCWAPYHLLGLV-----LTVAAPNSA : :.. .: . :: : : ...::.: .::.::::. :: : . : : . CCDS14 AYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCG 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KE9 LLARALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLRRSLPAACHWALRESQG-------Q .:. :. . ::. : ::::.:. . : ...:. . : : : : CCDS14 RESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVG-VKFRERM-----WMLLLRLGCPNQRGLQ 300 310 320 330 340 320 330 pF1KE9 DESVDSKKSTSHDLVSEMEV . .:....: . .:: CCDS14 RQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL 350 360 >>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa) initn: 316 init1: 90 opt: 436 Z-score: 467.6 bits: 95.2 E(32554): 1e-19 Smith-Waterman score: 437; 31.7% identity (57.3% similar) in 356 aa overlap (3-334:69-409) 10 20 30 pF1KE9 MGNDSVSYEYGDY-SDLSDRPVDCLDGACLAI : : ::.::. :: : . : . CCDS48 LYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNF 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 pF1KE9 DPLRVAPLP-LYAAIFLVGVPGNAMVAWVAGKVARRRVGA---TWLLHLAVADLLCCLSL : : : :: ::. .::.:. ::. :: : ..:: . . :.:::::::: : :.: CCDS48 D--R-AFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVL--LSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTL 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 PILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQR :. :: : .: .:. :.. ... ...::..:::: .: : . . . CCDS48 PLWAVDAAV--QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGP 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 ACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQEHFPARLQCVVDYGGSSSTENAVTAIRFLF : ..: :.: : ::...:. :. :... .: .. . : :. ..... CCDS48 PARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRT--ALRVLQLVA 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 pF1KE9 GFLGPLVAVASCHSALLCW-----AARRCRP--LGTAIVVGFFVCWAPYHLLGLV----- ::: ::...: :.. .: . :: : : ...::.: .::.::::. :: CCDS48 GFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMD 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 LTVAAPNSALLARALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLRRSLPAACHWALRESQ : . : : . .:. :. . ::. : ::::.:. . : ...:. . : : CCDS48 LGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVG-VKFRERM-----WMLLLRL 330 340 350 360 370 380 320 330 pF1KE9 G-------QDESVDSKKSTSHDLVSEMEV : : . .:....: . .:: CCDS48 GCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL 390 400 410 >>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 (385 aa) initn: 315 init1: 260 opt: 368 Z-score: 396.5 bits: 81.9 E(32554): 9.2e-16 Smith-Waterman score: 372; 32.0% identity (57.3% similar) in 328 aa overlap (14-326:58-369) 10 20 30 40 pF1KE9 MGNDSVSYEYGDYSDLSDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYA :: . : : . :. : :..: ::. CCDS12 ESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDTLELP-DSSRALLLGWVPTRLVP-ALYG 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 AIFLVGVPGNAMVAWVAGKVARRRVGATWLLHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYG ...::.:.:... :: . : : .. :..::.:::: :.:: . :: .::.: CCDS12 LVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLAAADLLLALALPPRIAYHLRGQRWPFG 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 AVGCRALPSIILLTMYASVLLLAALSADLCFLALGPAWWSTVQRACGVQVA---CGAAWT ..:: . . ::.:::::::.: : .::: . . : : ..: : ::: CCDS12 EAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDR-YLALVHPLRARALR--GRRLALGLCMAAWL 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 pF1KE9 LALLLTVPSAIYRRLHQEHFPARLQC--VVDYGGSSST-ENAVTAIRFLFGFLGPLVAVA .: :..: .. :. . :. : .. ...: . : : . .: :: ::.:. CCDS12 MAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQPAFTCLALLGCFL-PLLAML 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 pF1KE9 SCHSALLCWAARRCRPLG-----TAIV----VGFFVCWAPYHLLGLVLTVAAPNSALLAR :..: : : : : ::.: :.::: : .:: :.: . :. . . CCDS12 LCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFV---PSNLL-LLLHYSDPSPSAWGN 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 ALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRAQLRRSLPAACHWALRESQGQDESVDSKKSTS : ..:. .::..:... :. :..: .. :. ...: : ..: :: : CCDS12 LYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIY-YYVSAEFRDKVRAGL---FQRSPG--DTVASKASAE 320 330 340 350 360 370 330 pF1KE9 HDLVSEMEV CCDS12 GGSRGMGTHSSLLQ 380 >>CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 (358 aa) initn: 293 init1: 180 opt: 353 Z-score: 381.1 bits: 79.0 E(32554): 6.6e-15 Smith-Waterman score: 382; 31.8% identity (59.2% similar) in 299 aa overlap (47-326:32-320) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 SDRPVDCLDGACLAIDPLRVAPLPLYAAIFLVGVPGNAMVAW-VAG-KVARRR-VGATWL :.:.:::..:.: .:: . :: : ..:: . CCDS96 SVCYRPPGNETLLSWKTSRATGTAFLLLAALLGLPGNGFVVWSLAGWRPARGRPLAATLV 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE9 LHLAVADLLCCLSLPILAVPIARGGHWPYGAVGCRALPSIILLTMYASVLLLAALSADLC ::::.:: : :.... ..: . :: : .::.:. . :.::::::: . :: . : CCDS96 LHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQA-WPLGQAGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQRC 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KE9 FLALGPAWWSTVQRACGVQVACGAAWTLALLLTVPSAIYRRLHQEHFPARLQCVVDYGGS . . : .. .. :.: ::::.::.:.::.: ... : . . : CCDS96 LAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRHLWRDRV-----CQLCHP-S 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 pF1KE9 SSTENAVTAIRFLFGFLGPLVAVASCHSALLC------WAA----RRCRPLGTAIVVGFF : ... : .:. :. . .:.:. : :.. : : .:::..: CCDS96 PVHAAAHLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGARWGSGRHGARVGRLVSAIVLAFG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE9 VCWAPYHLLGLVLTVAA--PNSALLAR----ALRAEPLIVGLALAHSCLNPMLFLYFGRA . ::::: ..:. .::: : . ::. . :. ..::. : .::.:... . 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