FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5626, 483 aa 1>>>pF1KE5626 483 - 483 aa - 483 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0738+/-0.000917; mu= 15.4973+/- 0.055 mean_var=100.8657+/-19.545, 0's: 0 Z-trim(107.7): 72 B-trim: 69 in 1/51 Lambda= 0.127703 statistics sampled from 9692 (9764) to 9692 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16 Scan time: 3.180 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 3158 592.5 3.4e-169 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 1226 236.5 4.6e-62 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 879 172.7 1.3e-42 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 757 150.3 7.9e-36 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 757 150.3 7.9e-36 CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 749 148.6 1.2e-35 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 739 147.0 8.9e-35 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 739 147.0 8.9e-35 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 701 140.0 1e-32 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 693 138.3 1.6e-32 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 691 138.1 3.1e-32 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 691 138.1 3.1e-32 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 687 137.4 6.3e-32 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 682 136.4 9.2e-32 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 673 134.6 2.1e-31 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 666 133.3 4.9e-31 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 650 130.5 5.1e-30 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 650 130.5 5.1e-30 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 635 127.7 3.3e-29 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 635 127.7 3.8e-29 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 635 127.7 3.9e-29 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 635 127.8 4e-29 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 629 126.5 5.5e-29 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 623 125.5 1.7e-28 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 605 122.0 1.2e-27 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 601 121.4 2.7e-27 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 591 119.6 9.8e-27 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 586 118.6 1.5e-26 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 560 113.9 5.1e-25 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 553 112.7 1.5e-24 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 535 109.3 1.2e-23 CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 532 108.6 1.5e-23 CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 527 107.7 2.8e-23 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 517 106.0 1.4e-22 CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 506 103.8 3.4e-22 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 504 103.6 6.7e-22 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 504 103.6 6.8e-22 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 504 103.6 7.2e-22 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 504 103.6 7.8e-22 CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 486 100.1 5e-21 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 485 100.1 7.7e-21 CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 482 99.4 8.4e-21 CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 482 99.4 8.4e-21 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 477 98.5 1.7e-20 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 460 95.3 1.2e-19 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 455 94.4 2.2e-19 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 423 88.6 2e-17 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 421 88.3 2.5e-17 CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 403 84.9 2.2e-16 CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 355 76.2 1.5e-13 >>CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 (483 aa) initn: 3158 init1: 3158 opt: 3158 Z-score: 3151.0 bits: 592.5 E(32554): 3.4e-169 Smith-Waterman score: 3158; 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44.6% identity (75.6% similar) in 439 aa overlap (4-442:26-453) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILE : .::... : : : ::: .:: .:. :: :. CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 GRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLG ::: .: :.::::::.::.::::. : : : .: ::::::::::.::.:::..::. .: CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 LKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLVMDEADRLL ... .::::.: ..:.: :..:::..::::::: :::.... :... ...::::::::.: CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 EQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVSTVEQ .. :: .... :: ..: :.:.:::::.: ...:: : ..: ... .:::. CCDS86 NM---DFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEK 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFSFPTVAL :.: :...: : ::.:::...... . :..:: .::.. : ..::...: .. : CCDS86 LQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGN----SFMIFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPL 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 HSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGR :..:.:..:...: :::.. ::.:::::::::::: :.::.: . : : ::::::: CCDS86 HGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGR 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 TARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIK ::::::.:.:::.:::::..: . ::. : ::: : ... ::... .: ..: ... CCDS86 TARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARME 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 LEAAHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGR :. : ..:: . .. .. : . . ..: :.:.:. CCDS86 LRE-HGEKKK---RSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 AGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV >>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 (796 aa) initn: 739 init1: 286 opt: 879 Z-score: 878.8 bits: 172.7 E(32554): 1.3e-42 Smith-Waterman score: 879; 33.0% identity (65.6% similar) in 488 aa overlap (4-480:220-697) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCI : ...:: :.. .:.:::::.: .:: CCDS13 KVKDRKKKKKKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPIQKACI 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 PAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGI---FCLVLTPTRELAYQIAEQF :. : :.: .:: ::.::::::.::.:..: : :::.:::::. :. CCDS13 PVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPVTRVLVLVPTRELGIQVHSVT 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 RVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLV : :.. .. :. :::.:. .: : : ..::::::: :::.. .: ...:. :. CCDS13 RQLAQFCNITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHLSSIEVLI 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 MDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQ .:::::.:.. : ... :. .:::.:::::.:: ...: ... ..: .. CCDS13 LDEADRMLDEY---FEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIFVN 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 pF1KE5 APVSTVEQLDQRYLLV-PEKVKD--AYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMM . .... : :... . :.. : : .. :. : .: ...::.: : . . .. CCDS13 SNTDVAPFLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDH----VMLFTQTKKQAHRMHIL 430 440 450 460 470 480 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPG : ... . ::. ..: .:. :: .::. ::.:::::.::::: :..::: . :. CCDS13 LGLMGLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPN 490 500 510 520 530 540 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 LPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQ : :.::::::::::: :....:: . . .... : . : .. . . .:.. . CCDS13 TIKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKARILPQDVILKFRDK 550 560 570 580 590 600 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 VNVVRRECE--IKLEAAHFDEKK---EINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNRR .. .... ..::: . . .. .:: :.:. .::. .. . : . .. :..: CCDS13 IEKMEKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINTAKRLLEKGKEAVVQ---EPERSWFQTKEER 610 620 630 640 650 450 460 470 480 pF1KE5 FKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV :::. ..:.. . :.: : .....: . .. CCDS13 KKEKIAKALQEFDLALRGKKKRKKFMKDAKKKGEMTAEERSQFEILKAQMFAERLAKRNR 660 670 680 690 700 710 CCDS13 RAKRARAMPEEEPVRGPAKKQKQGKKSVFDEELTNTSKKALKQYRAGPSFEERKQLGLPH 720 730 740 750 760 770 >>CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (881 aa) initn: 717 init1: 214 opt: 757 Z-score: 756.7 bits: 150.3 E(32554): 7.9e-36 Smith-Waterman score: 757; 37.8% identity (63.3% similar) in 384 aa overlap (3-375:97-471) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGC :: .::: . . . : : :::.: CCDS31 TFPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKT 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 IPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPY--GIFCLVLTPTRELAYQIAEQF ::.::.:.: .. :.::::::: :.::....:. : :.:.:::::: : . CCDS31 IPVILDGKDVVAMARTGSGKTACFLLPMFERLKTHSAQTGARALILSPTRELALQTLKFT 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 RVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLV . ::: ::: .:.:: : : : ..: ..:::::::. :. ..........: CCDS31 KELGKFTGLKTALILGGDRMEDQFAALHENPDIIIATPGRLV-HVAVEMSLKLQSVEYVV 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 MDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQ .::::::.:.: :. .:. :.: .:. .::.:::::: : :. . ..: . . . CCDS31 FDEADRLFEMG---FAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLD 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 pF1KE5 APVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQ---RFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMM . .. ::: ..:: : .: : :.::.. : ::. ..:. : . . : . CCDS31 VDTKLNEQLKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQ-----TVVFVATKHHAEYLTEL 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPG : . ..: . : :::: . ::.::.:.:::::: .. :::.. :. CCDS31 LTTQRVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPA 360 370 380 390 400 410 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 LPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQ------YDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEV :...:::::.:::::.: : .::. :.:: . . . :.: : CCDS31 KGKLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEIPYLLDLHLFLGRSLTLARPLKEPSGVAGVD 420 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 LQILTQVNVVRRECEIKLEAAHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNR CCDS31 GMLGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKEM 480 490 500 510 520 530 >>CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (882 aa) initn: 717 init1: 214 opt: 757 Z-score: 756.7 bits: 150.3 E(32554): 7.9e-36 Smith-Waterman score: 757; 37.8% identity (63.3% similar) in 384 aa overlap (3-375:97-471) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGC :: .::: . . . : : :::.: CCDS44 TFPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKT 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 IPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPY--GIFCLVLTPTRELAYQIAEQF ::.::.:.: .. :.::::::: :.::....:. : :.:.:::::: : . CCDS44 IPVILDGKDVVAMARTGSGKTACFLLPMFERLKTHSAQTGARALILSPTRELALQTLKFT 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 RVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLV . ::: ::: .:.:: : : : ..: ..:::::::. :. ..........: CCDS44 KELGKFTGLKTALILGGDRMEDQFAALHENPDIIIATPGRLV-HVAVEMSLKLQSVEYVV 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 MDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQ .::::::.:.: :. .:. :.: .:. .::.:::::: : :. . ..: . . . CCDS44 FDEADRLFEMG---FAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLD 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 pF1KE5 APVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQ---RFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMM . .. ::: ..:: : .: : :.::.. : ::. ..:. : . . : . CCDS44 VDTKLNEQLKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQ-----TVVFVATKHHAEYLTEL 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPG : . ..: . : :::: . ::.::.:.:::::: .. :::.. :. CCDS44 LTTQRVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPA 360 370 380 390 400 410 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 LPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQ------YDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEV :...:::::.:::::.: : .::. :.:: . . . :.: : CCDS44 KGKLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEIPYLLDLHLFLGRSLTLARPLKEPSGVAGVD 420 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 LQILTQVNVVRRECEIKLEAAHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNR CCDS44 GMLGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKEM 480 490 500 510 520 530 >>CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (406 aa) initn: 1077 init1: 588 opt: 749 Z-score: 753.4 bits: 148.6 E(32554): 1.2e-35 Smith-Waterman score: 1007; 40.8% identity (66.5% similar) in 439 aa overlap (4-442:26-404) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILE : .::... : : : ::: .:: .:. :: :. CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQ 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 GRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLG ::: .: :.::::::.::.::::. : : : .: ::::::::::.::.:::..::. .: CCDS86 GRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIG 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 LKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIRFLVMDEADRLL ... .::::.: ..:.: :..:::..::::::: :::.... :... ...::::::::.: CCDS86 VQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRIL 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 EQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVSTVEQ .. :: .... :: ..: :.:.:::::.: ...:: : ..: ... .:::. CCDS86 NM---DFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEK 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFSFPTVAL :.: :...: : :. CCDS86 LQQYYIFIPSKFKS---------------------------------------------- 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 HSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGR .:...: :::.. ::.:::::::::::: :.::.: . : : ::::::: CCDS86 -------KRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGR 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 TARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIK ::::::.:.:::.:::::..: . ::. : ::: : ... ::... .: ..: ... CCDS86 TARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRFARME 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 LEAAHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGR :. : ..:: . .. .. : . . ..: :.:.:. CCDS86 LRE-HGEKKK---RSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR 370 380 390 400 460 470 480 pF1KE5 AGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV >>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031 aa) initn: 671 init1: 243 opt: 739 Z-score: 737.8 bits: 147.0 E(32554): 8.9e-35 Smith-Waterman score: 745; 29.2% identity (62.7% similar) in 483 aa overlap (1-461:371-845) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQL . .... :.: .... .. : ..:::.: CCDS34 ELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQT 350 360 370 380 390 400 40 50 60 70 80 pF1KE5 GCIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPIL-----QKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQ ::::. ::: .: :::::::: ::.::.. :. :. : . ...::::::: : CCDS34 QAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQ 410 420 430 440 450 460 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 IAEQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHL--RSSNTFSI :... . ..: :::. . :: . : ::.: .... ::::. : : :. . .. CCDS34 ITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNL 470 480 490 500 510 520 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 KKIRFLVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQ ... ..:.:::::....: : .. :. : :::..::::. ... : .. CCDS34 RRVTYVVLDEADRMFDMG---FEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSK 530 540 550 560 570 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 PFFWEAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQI :. .. . . ...:. ... :. : :..:. ..: :. :.:::.. . . CCDS34 PIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQ---ESGSVIIFVDKQEHADG 580 590 600 610 620 630 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LCMMLRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINH : : . :.: ..::. . : .: . . ::.. ..:.::.::.::::. . .:.:. CCDS34 LLKDLMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNY 640 650 660 670 680 690 330 340 350 360 370 pF1KE5 NTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQ----YDIHLVHAIE---EQIKKKLEEFSV . :. . :.::.:::.::: .: : :..:. : ...:.: . ::.. CCDS34 SCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWS 700 710 720 730 740 750 380 390 400 410 420 pF1KE5 EEAEVLQILTQVNVVRRECEIKLEAAHFDEKKEI--NKRKQL------ILEGKDPDLEAK . . : .. ..... .. .. .::: .. :.::.: . .. : : . CCDS34 DFKD--QQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVD 760 770 780 790 800 810 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 RKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV .. .. ....: :. . . : ::. CCDS34 IDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQDV 820 830 840 850 860 870 CCDS34 MQQATNAILRGGTILAPTVSAKTIAEQLAEKINAKLNYVPLEKQEEERQDGGQNESFKRY 880 890 900 910 920 930 >>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa) initn: 671 init1: 243 opt: 739 Z-score: 737.8 bits: 147.0 E(32554): 8.9e-35 Smith-Waterman score: 745; 29.2% identity (62.7% similar) in 483 aa overlap (1-461:371-845) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQL . .... :.: .... .. : ..:::.: CCDS75 ELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQT 350 360 370 380 390 400 40 50 60 70 80 pF1KE5 GCIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPIL-----QKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQ ::::. ::: .: :::::::: ::.::.. :. :. : . ...::::::: : CCDS75 QAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQ 410 420 430 440 450 460 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 IAEQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHL--RSSNTFSI :... . ..: :::. . :: . : ::.: .... ::::. : : :. . .. CCDS75 ITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNL 470 480 490 500 510 520 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 KKIRFLVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQ ... ..:.:::::....: : .. :. : :::..::::. ... : .. CCDS75 RRVTYVVLDEADRMFDMG---FEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSK 530 540 550 560 570 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 PFFWEAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQI :. .. . . ...:. ... :. : :..:. ..: :. :.:::.. . . CCDS75 PIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQ---ESGSVIIFVDKQEHADG 580 590 600 610 620 630 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LCMMLRKFSFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINH : : . :.: ..::. . : .: . . ::.. ..:.::.::.::::. . .:.:. CCDS75 LLKDLMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNY 640 650 660 670 680 690 330 340 350 360 370 pF1KE5 NTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQ----YDIHLVHAIE---EQIKKKLEEFSV . :. . :.::.:::.::: .: : :..:. : ...:.: . ::.. CCDS75 SCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWS 700 710 720 730 740 750 380 390 400 410 420 pF1KE5 EEAEVLQILTQVNVVRRECEIKLEAAHFDEKKEI--NKRKQL------ILEGKDPDLEAK . . : .. ..... .. .. .::: .. :.::.: . .. : : . CCDS75 DFKD--QQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVD 760 770 780 790 800 810 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 RKAELAKIKQKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV .. .. ....: :. . . : ::. CCDS75 IDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVD 820 830 840 850 860 870 CCDS75 VMQQATNAILRGGTILAPTVSAKTIAEQLAEKINAKLNYVPLEKQEEERQDGGQNESFKR 880 890 900 910 920 930 >>CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 (875 aa) initn: 447 init1: 223 opt: 701 Z-score: 701.0 bits: 140.0 E(32554): 1e-32 Smith-Waterman score: 701; 30.2% identity (61.3% similar) in 483 aa overlap (4-470:71-539) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCI :... ::. .. .. . : .: : CCDS83 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 pF1KE5 PAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKL------SEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIA :.:.: :: :::::::: ::..:.:. : : : :. :...:::::::: CCDS83 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGV--LIISPTRELAYQTF 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 EQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIR : .: .:: .. .:.:: :. .: ... . .... ::::: .:. . .: .. CCDS83 EVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERIN-NINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQ 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 FLVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQP-FF .::.:::::.:..: .: ..:.. .: .::::::::: : ....: :. ..: . CCDS83 MLVLDEADRILDMGFAD---TMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYV 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 W-EAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILC : . .: :: :.: :.. . : . .. : : . :.: ..:: : : CCDS83 WVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQK----ISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 MMLRKFSFPTV---ALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVIN .. .. : : :::. ..: .:. . .: . .:.:::.:.::::.:.:. :.. CCDS83 RVFCRLR-PGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQ 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 HNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVL . : . ::::.::::: ..:.:. .. . .:. . : : ..:.... ... CCDS83 FDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLL-QKKVPVKEIKINPEKLI 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 pF1KE5 QILTQV-NVVRRECEIKLEAAH----FDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIK .. .. ... .. ..: .: . . .. . : :... .: : : . :: CCDS83 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP 450 460 470 480 490 500 440 450 460 470 480 pF1KE5 QKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV . :: .:... .. . . : ::.:: CCDS83 R--VRFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRL 510 520 530 540 550 560 CCDS83 EGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTSEAQKIKEVPTQFLDR 570 580 590 600 610 620 >>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 (427 aa) initn: 591 init1: 277 opt: 693 Z-score: 697.3 bits: 138.3 E(32554): 1.6e-32 Smith-Waterman score: 693; 32.7% identity (66.3% similar) in 392 aa overlap (2-387:44-425) 10 20 30 pF1KE5 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLG .:: .. :. :.. . :...:. :: CCDS12 DEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHE 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 CIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFR ::: . : : : ::.: ::::.::: ::.. . ::. :::::.::..... 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