FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5426, 315 aa 1>>>pF1KE5426 315 - 315 aa - 315 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9193+/-0.00104; mu= 12.8955+/- 0.061 mean_var=192.9751+/-65.899, 0's: 0 Z-trim(105.0): 410 B-trim: 458 in 1/51 Lambda= 0.092326 statistics sampled from 7688 (8203) to 7688 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16 Scan time: 2.530 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 2077 289.8 1.8e-78 CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1834 257.5 1e-68 CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1828 256.7 1.8e-68 CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 1514 214.8 6.9e-56 CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 1497 212.6 3.3e-55 CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1059 154.2 1.2e-37 CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1024 149.6 3.1e-36 CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1012 148.0 9.3e-36 CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 990 145.0 7e-35 CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 964 141.6 8.1e-34 CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 927 136.7 2.4e-32 CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 921 135.8 4.1e-32 CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 920 135.7 4.5e-32 CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 920 135.7 4.6e-32 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 908 134.1 1.4e-31 CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 907 134.0 1.5e-31 CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 903 133.4 2.2e-31 CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 902 133.3 2.4e-31 CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 897 132.6 3.7e-31 CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 895 132.4 4.7e-31 CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 894 132.2 5e-31 CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 894 132.2 5e-31 CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 891 131.8 6.6e-31 CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 889 131.5 7.7e-31 CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 886 131.2 1e-30 CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 885 131.1 1.2e-30 CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 882 130.6 1.5e-30 CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 879 130.3 2.1e-30 CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 877 130.0 2.4e-30 CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 875 129.7 2.9e-30 CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 870 129.1 4.6e-30 CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 865 128.4 7.2e-30 CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 860 127.7 1.1e-29 CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 859 127.6 1.3e-29 CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 858 127.5 1.4e-29 CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 858 127.5 1.4e-29 CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 858 127.5 1.4e-29 CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 857 127.3 1.5e-29 CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 857 127.3 1.5e-29 CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 851 126.5 2.6e-29 CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 850 126.4 2.9e-29 CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 847 126.0 3.8e-29 CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 845 125.7 4.6e-29 CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 845 125.7 4.6e-29 CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 844 125.6 5e-29 CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 842 125.3 6.2e-29 CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 841 125.2 6.7e-29 CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 839 124.9 7.9e-29 CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 839 124.9 8.2e-29 CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 837 124.6 9.6e-29 >>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa) initn: 2077 init1: 2077 opt: 2077 Z-score: 1522.1 bits: 289.8 E(32554): 1.8e-78 Smith-Waterman score: 2077; 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CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE5 SAIFQLTFCGSHEIQHFLCHVPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVC-IMALLGCFLLILLSY . .:.: ::......:..: . .. ::: :. : : ..: ...:. ::.: .:: CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNT--DVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSY 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 AFIVADILKIPSAEGRNKAFSTCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTY :. :::::::::: :::::::::: ::::::: :: :::.: . . .. : :...:: CCDS30 LCILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTY 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 pF1KE5 AVLTPFLSPIIFSLRNKELKVAMKRTFLSTLYSSGT ...::.:.:...:::::....:..... CCDS30 TIVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN 300 310 320 330 315 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:38:58 2016 done: Tue Nov 8 00:38:59 2016 Total Scan time: 2.530 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]