FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9564, 402 aa 1>>>pF1KE9564 402 - 402 aa - 402 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6136+/-0.000664; mu= 17.5407+/- 0.041 mean_var=102.9202+/-22.882, 0's: 0 Z-trim(113.8): 48 B-trim: 1625 in 2/49 Lambda= 0.126422 statistics sampled from 14327 (14379) to 14327 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.442), width: 16 Scan time: 3.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 ( 402) 2678 498.4 4.8e-141 CCDS30759.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 ( 297) 528 106.1 4.3e-23 CCDS686.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 ( 359) 528 106.2 4.9e-23 CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 ( 488) 456 93.2 5.5e-19 CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 343) 428 88.0 1.5e-17 CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 407) 428 88.0 1.7e-17 CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 365) 406 84.0 2.5e-16 CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 374) 406 84.0 2.5e-16 CCDS658.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 388) 406 84.0 2.6e-16 CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 406 84.0 2.6e-16 CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 406 84.0 2.6e-16 CCDS655.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 418) 406 84.0 2.7e-16 CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 ( 386) 331 70.3 3.4e-12 CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 ( 358) 329 69.9 4.2e-12 >>CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 (402 aa) initn: 2678 init1: 2678 opt: 2678 Z-score: 2645.6 bits: 498.4 E(32554): 4.8e-141 Smith-Waterman score: 2678; 100.0% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (1-402:1-402) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSPCGPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSGASPALPIFSMTLGAVSNLLALALLAQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MSPCGPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSGASPALPIFSMTLGAVSNLLALALLAQA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 AGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRAPAGGACHFLGGCMVFF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRAPAGGACHFLGGCMVFF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 GLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALAVALLPLARVGRYE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 GLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALAVALLPLARVGRYE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 LQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGLALLRARWRRRSRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGLALLRARWRRRSRR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 PPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTFFGGSRSSGSARRARAHDVEMVGQLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 PPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTFFGGSRSSGSARRARAHDVEMVGQLV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 GIMVVSCICWSPMLVLVALAVGGWSSTSLQRPLFLAVRLASWNQILDPWVYILLRQAVLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 GIMVVSCICWSPMLVLVALAVGGWSSTSLQRPLFLAVRLASWNQILDPWVYILLRQAVLR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 QLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSGLSHF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 QLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSGLSHF 370 380 390 400 >>CCDS30759.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 (297 aa) initn: 524 init1: 369 opt: 528 Z-score: 528.0 bits: 106.1 E(32554): 4.3e-23 Smith-Waterman score: 560; 32.9% identity (61.0% similar) in 313 aa overlap (7-314:1-266) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MSPCGPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSGASPALPIFSMTLGAVSNLLALALLAQA .... . . .. :: . ::. . : . .. ::.: .:: ::.:.: .: CCDS30 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE9 AGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRA-----PAGGACHFLGG :.:.. : :.:::....:. ::. ::.: ::... .:.. . .. : ..: CCDS30 YQRFRQK-SKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 CMVFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALAVALLPLAR :::: :::::::: ::.:::.:::.:..:..... .... :..: :. .::::. 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CCDS68 CMVFSGLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 VGRYELQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGLALLRARWR :..: :::: . :.. . ::. :::.:: ..:.::...:..:::.... CCDS68 HRDYKIQASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 RRSRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTFFGGSRSSGSARRARAHDVEM : . :..:.: .:: CCDS68 ----------------------------------------------SQQHRQGRSHHLEM 240 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 VGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVA-LAVGGWSSTSLQRPLFLAVRLASWNQILDPWVYILL : ::..:: ::::::::.:: .: ....: : . ..:.:.:.::::::::::::: CCDS68 VIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETTLFALRMATWNQILDPWVYILL 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 pF1KE9 RQAVLRQLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSGLSHF :.:::..: .: :.. .. :: ::...: CCDS68 RKAVLKNLYKLASQCCGVHV------ISLHIWELSSIKNSLKVAAISESPVAEKSAST 310 320 330 340 350 >>CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 (488 aa) initn: 343 init1: 161 opt: 456 Z-score: 454.3 bits: 93.2 E(32554): 5.5e-19 Smith-Waterman score: 467; 30.9% identity (60.9% similar) in 353 aa overlap (19-361:2-339) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MSPCGPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSG-ASPA-LPIFSMTLGAVSNLLALALLA ..: : ..... :. ::. .: . .:.:.::.:...: CCDS39 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLC 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 QAAGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRAPAGGA-CHFLGGCM .. :.... .:: .: .: .::: : .. . ... : :. :.: :.. . CCDS39 KS----RKEQKETTFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQWPGGQPLCEYSTFIL 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 VFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALAVALLPLARVG .::.: : . :.:.::: ..... ... :. : :.: :: : . :: .: CCDS39 LFFSLSGLSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLG 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 RYELQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGLALLRARWRRR .:::: ::::: . .: . ..:... .::...::.: :::: . :. CCDS39 SSRLQYPDTWCFIDW-TTNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMH-RQF 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 SRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTF--FGGSRSSGSARRARAHDVEM :: . : ... :. .::..: . :.. .. .. : : :: . ...: CCDS39 MRR--TSLGTEQH-----HAAAAASVASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQM 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 VGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVALAVGGWSSTSLQR-----PLFLAVRLASWNQILDPWV : :.. .: :: :..: : :. . ::.: : . :.:.:: : :::::. 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CCDS42 ALSVLAGARQGGSHTRS--SFLTFLCGLVLTDFLGLLVTGTIVVSQHAALFEWHAVDPGC 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 GACHFLGGCMVFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALA :.:.: :.:::: ::::: .:: :: .:.:::. . : .: :: ... : :.::: CCDS42 RLCRFMGVVMIFFGLSPLLLGAAMASERYLGITRPFSRPAVASQRRAWATVGLVWAAALA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 VALLPLARVGRYELQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGL ..:::: :::: .::::.:::. :: .: .. .. ::. :: ... ... ::.: CCDS42 LGLLPLLGVGRYTVQYPGSWCFLTLGAESG--DVAFGLLFSMLGGLSVGLSFLLNTVSVA 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 ALLRARWRRRSRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTFFGGSRSSGSARR .: .. :: ..:. .: CCDS42 TLCHVY----------------------HGQEAAQ-----------------------QR 230 290 300 310 320 330 pF1KE9 ARAHDVEMVGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVALAV---------GGWSSTSLQRPLFLAVR : .:::..::.:::::. .:: :.::..: .: .: : . .. :.. .: CCDS42 PRDSEVEMMAQLLGIMVVASVCWLPLLVFIAQTVLRNPPAMSPAGQLSRTTEKELLIYLR 240 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 LASWNQILDPWVYILLRQAVLRQLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSG .:.::::::::::::.:.::::.: :: ... : .:.: :. . :.:. CCDS42 VATWNQILDPWVYILFRRAVLRRL----QPRLSTR--PRSLSLQPQLTQRSGLQ 300 310 320 330 340 400 pF1KE9 LSHF >>CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 (407 aa) initn: 571 init1: 292 opt: 428 Z-score: 427.7 bits: 88.0 E(32554): 1.7e-17 Smith-Waterman score: 624; 35.4% identity (57.6% similar) in 384 aa overlap (1-369:8-326) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MSPC-GPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSGASPALPIFSMTLGAVSNLL ..:: : :..: : :.:: . : .: .:::: CCDS54 MWPNGSSLGPCFRPTNITLE-ERRLIASPWFAASFCV---------------VGLASNLL 10 20 30 40 60 70 80 90 100 pF1KE9 ALALLAQAAGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTA-----GRAPAG ::..:: : . :: .:: :. .:. ::. : .. :..:. ..: . :. CCDS54 ALSVLAGARQGGSHTRS--SFLTFLCGLVLTDFLGLLVTGTIVVSQHAALFEWHAVDPGC 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 GACHFLGGCMVFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALA :.:.: :.:::: ::::: .:: :: .:.:::. . : .: :: ... : :.::: CCDS54 RLCRFMGVVMIFFGLSPLLLGAAMASERYLGITRPFSRPAVASQRRAWATVGLVWAAALA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 VALLPLARVGRYELQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGL ..:::: :::: .::::.:::. :: .: .. .. ::. :: ... ... ::.: CCDS54 LGLLPLLGVGRYTVQYPGSWCFLTLGAESG--DVAFGLLFSMLGGLSVGLSFLLNTVSVA 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 ALLRARWRRRSRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTFFGGSRSSGSARR .: .. :: ..:. .: CCDS54 TLCHVY----------------------HGQEAAQ-----------------------QR 230 290 300 310 320 330 pF1KE9 ARAHDVEMVGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVALAV---------GGWSSTSLQRPLFLAVR : .:::..::.:::::. .:: :.::..: .: .: : . .. :.. .: CCDS54 PRDSEVEMMAQLLGIMVVASVCWLPLLVFIAQTVLRNPPAMSPAGQLSRTTEKELLIYLR 240 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 LASWNQILDPWVYILLRQAVLRQLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSG .:.::::::::::::.:.::::.: : : CCDS54 VATWNQILDPWVYILFRRAVLRRLQPRLSTRPRRSLTLWPSLEYSGTISAHCNLRLPGSS 300 310 320 330 340 350 400 pF1KE9 LSHF CCDS54 DSRASASRAAGITGVSHCARPCMLFDPEFDLLAGVQLLPFEPPTGKALSRKD 360 370 380 390 400 >>CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (365 aa) initn: 527 init1: 216 opt: 406 Z-score: 406.6 bits: 84.0 E(32554): 2.5e-16 Smith-Waterman score: 543; 33.6% identity (55.8% similar) in 387 aa overlap (4-362:14-357) 10 20 30 40 pF1KE9 MSPCGPLNLSLAGE-ATTCAAPWVPNTSAVPPSG-----ASPALPIFSMT : :: : .: : .: : . : :: .: :.:: . CCDS44 MKETRGYGGDAPFCTRLNHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 LGAVSNLLALALLAQAAGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRA : :.: ::. ::.. . : :. . .::: .. : :::.:... .:. .: . . CCDS44 TGFVGNALAM-LLVSRSYRRRESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQR 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KE9 -----PAGGACHFLGGCMVFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALA :.: : :.: :. ::: :... .::::: ... : .:..... .: .: CCDS44 WEHIDPSGRLCTFFGLTMTVFGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLL 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 AVAAVALAVALLPLARVGRYELQYPGTWCFIGLGPPGG-------WRQALLAGLFASLGL .: ..:: ::::. ::.: .:.:::::::. : :. : . ..:. :: ::: CCDS44 GVWLAVLAFALLPVLGVGQYTVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VALLAALVCNTLSGLALLRARWRRRSRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASA .:: ... :: :: ..: :: :.. .: .:: .. ..: CCDS44 LALTVTFSCN----LATIKALV---SRCRAKATASQSSAQWG-------RITTETAI--- 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE9 STFFGGSRSSGSARRARAHDVEMVGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVALAVGGWSS------ ::.::: : .::::.:... . . .: CCDS44 -------------------------QLMGIMCVLSVCWSPLLIMMLKMIFNQTSVEHCKT 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 -TSLQRP--LFL-AVRLASWNQILDPWVYILLRQAVLRQLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLT : :. .:: :::::: :::::::::.:::. .::.. CCDS44 HTEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQEEFWGN 320 330 340 350 360 390 400 pF1KE9 PSAWEASSLRSSRHSGLSHF >>CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (374 aa) initn: 529 init1: 216 opt: 406 Z-score: 406.5 bits: 84.0 E(32554): 2.5e-16 Smith-Waterman score: 545; 33.2% identity (56.3% similar) in 391 aa overlap (4-365:14-360) 10 20 30 40 pF1KE9 MSPCGPLNLSLAGE-ATTCAAPWVPNTSAVPPSG-----ASPALPIFSMT : :: : .: : .: : . : :: .: :.:: . CCDS65 MKETRGYGGDAPFCTRLNHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 LGAVSNLLALALLAQAAGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRA : :.: ::. ::.. . : :. . .::: .. : :::.:... .:. .: . . 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CCDS65 MKETRGYGGDAPFCTRLNHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 LGAVSNLLALALLAQAAGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRA : :.: ::. ::.. . : :. . .::: .. : :::.:... .:. .: . . 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