Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2606
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2606, 706 aa
  1>>>pF1KE2606 706 - 706 aa - 706 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4329+/-0.00108; mu= 19.0794+/- 0.065
 mean_var=69.6848+/-13.873, 0's: 0 Z-trim(103.3): 28  B-trim: 50 in 1/49
 Lambda= 0.153640
 statistics sampled from 7336 (7356) to 7336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  2.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12245.1 SLC44A2 gene_id:57153|Hs108|chr19      ( 706) 4778 1068.9       0
CCDS54216.1 SLC44A2 gene_id:57153|Hs108|chr19      ( 704) 4702 1052.0       0
CCDS44164.1 SLC44A5 gene_id:204962|Hs108|chr1      ( 717) 2889 650.1 3.2e-186
CCDS667.1 SLC44A5 gene_id:204962|Hs108|chr1        ( 719) 2880 648.2 1.3e-185
CCDS4724.2 SLC44A4 gene_id:80736|Hs108|chr6        ( 710) 2350 530.7 2.9e-150
CCDS54989.1 SLC44A4 gene_id:80736|Hs108|chr6       ( 634) 2023 458.2 1.7e-128
CCDS54990.1 SLC44A4 gene_id:80736|Hs108|chr6       ( 668) 1937 439.1  1e-122
CCDS75868.1 SLC44A1 gene_id:23446|Hs108|chr9       ( 652)  689 162.5 1.8e-39
CCDS83390.1 SLC44A1 gene_id:23446|Hs108|chr9       ( 654)  689 162.5 1.8e-39
CCDS6763.1 SLC44A1 gene_id:23446|Hs108|chr9        ( 657)  689 162.5 1.9e-39
CCDS58011.1 SLC44A3 gene_id:126969|Hs108|chr1      ( 620)  624 148.1 3.8e-35
CCDS72827.1 SLC44A3 gene_id:126969|Hs108|chr1      ( 573)  615 146.0 1.4e-34
CCDS58012.1 SLC44A3 gene_id:126969|Hs108|chr1      ( 585)  615 146.1 1.5e-34
CCDS751.1 SLC44A3 gene_id:126969|Hs108|chr1        ( 605)  615 146.1 1.5e-34
CCDS58013.1 SLC44A3 gene_id:126969|Hs108|chr1      ( 617)  615 146.1 1.5e-34
CCDS44176.1 SLC44A3 gene_id:126969|Hs108|chr1      ( 653)  615 146.1 1.6e-34


>>CCDS12245.1 SLC44A2 gene_id:57153|Hs108|chr19           (706 aa)
 initn: 4778 init1: 4778 opt: 4778  Z-score: 5719.8  bits: 1068.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4778; 99.9% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 RKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSKPLARRCFPAIHAYK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLQDGDCPAVLIPSKPLARRCFPAIHAYK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTVSWYWIIIGLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTVSWYWIIIGLV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 IAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLVDLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLVDLG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 FQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSPCPFTAKTCNPETFPSSNESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSPCPFTAKTCNPETFPSSNESR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 QCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 KPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDQRLKAAENKFAKCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDQRLKAAENKFAKCL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 MTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700      
pF1KE2 GMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKAAES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKAAES
              670       680       690       700      

>>CCDS54216.1 SLC44A2 gene_id:57153|Hs108|chr19           (704 aa)
 initn: 4691 init1: 4691 opt: 4702  Z-score: 5628.7  bits: 1052.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4702; 98.9% identity (99.3% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-704)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDP
       : ::: .  : .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MEDERKN--GAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDP
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 RKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRY
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSKPLARRCFPAIHAYK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLQDGDCPAVLIPSKPLARRCFPAIHAYK
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTVSWYWIIIGLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTVSWYWIIIGLV
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 IAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLVDLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLVDLG
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 FQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCS
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSPCPFTAKTCNPETFPSSNESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSPCPFTAKTCNPETFPSSNESR
      360       370       380       390       400       410        

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 QCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALR
      420       430       440       450       460       470        

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 KPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDQRLKAAENKFAKCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDQRLKAAENKFAKCL
      480       490       500       510       520       530        

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 MTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDF
      540       550       560       570       580       590        

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVY
      600       610       620       630       640       650        

              670       680       690       700      
pF1KE2 GMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKAAES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKAAES
      660       670       680       690       700    

>>CCDS44164.1 SLC44A5 gene_id:204962|Hs108|chr1           (717 aa)
 initn: 2902 init1: 1389 opt: 2889  Z-score: 3456.8  bits: 650.1 E(32554): 3.2e-186
Smith-Waterman score: 2889; 54.9% identity (83.8% similar) in 705 aa overlap (4-702:9-713)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE2      MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAW
               . :      : :. ::: ::::. ::.:::..::...:: :.::...:..::
CCDS44 MNDTEKPADTPSEEEDFGDPRTYDPDFKGPVANRSCTDVLCCMIFLLCIIGYIVLGLVAW
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE2 THGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEK
       .:::::.. :::::.:.::::::: ::::  :::::...:.:: :::..:::: :::: :
CCDS44 VHGDPRRAAYPTDSQGHFCGQKGTPNENKTILFYFNLLRCTSPSVLLNLQCPTTQICVSK
               70        80        90       100       110       120

         120         130          140       150       160       170
pF1KE2 CPDRYLTYLNAR--SSRD---FEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSKPLAR
       ::...:::.. .   ..:   .: :.:::    :  :.....: : :::....::::. .
CCDS44 CPEKFLTYVEMQLLYTKDKSYWEDYRQFCKTTAKPVKSLTQLLLDDDCPTAIFPSKPFLQ
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KE2 RCFPAIHAYKGVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTV
       :::: . . .:.: .:..  ..::.:. .....:  .:.  : .:.:..:....::::. 
CCDS44 RCFPDFSTKNGTLTIGSKMMFQDGNGGTRSVVELGIAANGINKLLDAKSLGLKVFEDYAR
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KE2 SWYWIIIGLVIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEA
       .::::.:::.:::..: .:.:::::.:: . ::..: :: ..::::.:::..:. :. . 
CCDS44 TWYWILIGLTIAMVLSWIFLILLRFIAGCLFWVFMIGVIGIIGYGIWHCYQQYTNLQERP
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KE2 GSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEA
       .: ... :.:.::.. .:..:.:::..::::: :.:::.::.:::::.:: .:: :.::.
CCDS44 SSVLTIYDIGIQTNISMYFELQQTWFTFMIILCIIEVIVILMLIFLRNRIRVAIILLKEG
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390        400         
pF1KE2 SRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIF-DDSPCPFTAKTCN
       :.:.:::  .:.:: .::.:: .:: ::. :::::.::.  :::..   . :    .::.
CCDS44 SKAIGYVPSTLVYPALTFILLSICICYWVVTAVFLATSGVPVYKVIAPGGHCIHENQTCD
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE2 PETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLA
       :: : ... .. ::.: :.::::::.: ::. .  ....: :.:.:: :::.:::: .::
CCDS44 PEIFNTTEIAKACPGALCNFAFYGGKSLYHQYIPTFHVYNLFVFLWLINFVIALGQCALA
              430       440       450       460       470       480

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE2 GAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDQRL
       ::::.::::..::::.: .:::.:::::.::::::::::.::.:..:.....:::::.::
CCDS44 GAFATYYWAMKKPDDIPRYPLFTAFGRAIRYHTGSLAFGSLIIALIQMFKIVLEYLDHRL
              490       500       510       520       530       540

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE2 KAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNII
       : ..: ..: :. ::.:::::::. :::::::::::::::: ::: ::..:: :::::..
CCDS44 KRTQNTLSKFLQCCLRCCFWCLENAIKFLNRNAYIMIAIYGRNFCRSAKDAFNLLMRNVL
              550       560       570       580       590       600

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE2 RVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGS
       .::: :.:: :...:::::..::.:.:::.:::.:. .. .    :::::::.:::: ::
CCDS44 KVAVTDEVTYFVLFLGKLLVAGSIGVLAFLFFTQRLPVIAQGPASLNYYWVPLLTVIFGS
              610       620       630       640       650       660

     650       660       670       680       690       700      
pF1KE2 YLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKAAES
       :::::::::::.:::.:.:.::::::::::::. :::..:. : :.... : .    
CCDS44 YLIAHGFFSVYAMCVETIFICFLEDLERNDGSTARPYYVSQPLLKIFQEENPQTRKQ
              670       680       690       700       710       

>>CCDS667.1 SLC44A5 gene_id:204962|Hs108|chr1             (719 aa)
 initn: 2893 init1: 1380 opt: 2880  Z-score: 3446.0  bits: 648.2 E(32554): 1.3e-185
Smith-Waterman score: 2880; 55.1% identity (83.9% similar) in 701 aa overlap (4-698:9-709)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE2      MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAW
               . :      : :. ::: ::::. ::.:::..::...:: :.::...:..::
CCDS66 MNDTEKPADTPSEEEDFGDPRTYDPDFKGPVANRSCTDVLCCMIFLLCIIGYIVLGLVAW
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE2 THGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEK
       .:::::.. :::::.:.::::::: ::::  :::::...:.:: :::..:::: :::: :
CCDS66 VHGDPRRAAYPTDSQGHFCGQKGTPNENKTILFYFNLLRCTSPSVLLNLQCPTTQICVSK
               70        80        90       100       110       120

         120         130          140       150       160       170
pF1KE2 CPDRYLTYLNAR--SSRD---FEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSKPLAR
       ::...:::.. .   ..:   .: :.:::    :  :.....: : :::....::::. .
CCDS66 CPEKFLTYVEMQLLYTKDKSYWEDYRQFCKTTAKPVKSLTQLLLDDDCPTAIFPSKPFLQ
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KE2 RCFPAIHAYKGVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTV
       :::: . . .:.: .:..  ..::.:. .....:  .:.  : .:.:..:....::::. 
CCDS66 RCFPDFSTKNGTLTIGSKMMFQDGNGGTRSVVELGIAANGINKLLDAKSLGLKVFEDYAR
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KE2 SWYWIIIGLVIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEA
       .::::.:::.:::..: .:.:::::.:: . ::..: :: ..::::.:::..:. :. . 
CCDS66 TWYWILIGLTIAMVLSWIFLILLRFIAGCLFWVFMIGVIGIIGYGIWHCYQQYTNLQERP
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KE2 GSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEA
       .: ... :.:.::.. .:..:.:::..::::: :.:::.::.:::::.:: .:: :.::.
CCDS66 SSVLTIYDIGIQTNISMYFELQQTWFTFMIILCIIEVIVILMLIFLRNRIRVAIILLKEG
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390        400         
pF1KE2 SRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIF-DDSPCPFTAKTCN
       :.:.:::  .:.:: .::.:: .:: ::. :::::.::.  :::..   . :    .::.
CCDS66 SKAIGYVPSTLVYPALTFILLSICICYWVVTAVFLATSGVPVYKVIAPGGHCIHENQTCD
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE2 PETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLA
       :: : ... .. ::.: :.::::::.: ::. .  ....: :.:.:: :::.:::: .::
CCDS66 PEIFNTTEIAKACPGALCNFAFYGGKSLYHQYIPTFHVYNLFVFLWLINFVIALGQCALA
              430       440       450       460       470       480

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE2 GAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDQRL
       ::::.::::..::::.: .:::.:::::.::::::::::.::.:..:.....:::::.::
CCDS66 GAFATYYWAMKKPDDIPRYPLFTAFGRAIRYHTGSLAFGSLIIALIQMFKIVLEYLDHRL
              490       500       510       520       530       540

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE2 KAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNII
       : ..: ..: :. ::.:::::::. :::::::::::::::: ::: ::..:: :::::..
CCDS66 KRTQNTLSKFLQCCLRCCFWCLENAIKFLNRNAYIMIAIYGRNFCRSAKDAFNLLMRNVL
              550       560       570       580       590       600

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE2 RVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGS
       .::: :.:: :...:::::..::.:.:::.:::.:. .. .    :::::::.:::: ::
CCDS66 KVAVTDEVTYFVLFLGKLLVAGSIGVLAFLFFTQRLPVIAQGPASLNYYWVPLLTVIFGS
              610       620       630       640       650       660

     650       660       670       680       690       700        
pF1KE2 YLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKAAES  
       :::::::::::.:::.:.:.:: :::::::::.:.:::.. .:. .: :          
CCDS66 YLIAHGFFSVYAMCVETIFICFCEDLERNDGSTEKPYFVTPNLHGILIKKQLVPQKQKE
              670       680       690       700       710         

>>CCDS4724.2 SLC44A4 gene_id:80736|Hs108|chr6             (710 aa)
 initn: 2047 init1: 1178 opt: 2350  Z-score: 2811.1  bits: 530.7 E(32554): 2.9e-150
Smith-Waterman score: 2500; 53.3% identity (79.0% similar) in 719 aa overlap (3-701:7-700)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE2     MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWT
             ::  . :::   : ::::.:.::: ::.:::.::::..:: :.::..:::.:: 
CCDS47 MGGKQRDEDDEAYGK---PVKYDPSFRGPIKNRSCTDVICCVLFLLFILGYIVVGIVAWL
               10           20        30        40        50       

         60        70        80        90         100          110 
pF1KE2 HGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKC--ASPLVLLE---FQCPTPQI
       .::::.:.:: .: : .::. : .:..::::.:::: .:  .: .. .    .::::::.
CCDS47 YGDPRQVLYPRNSTGAYCGM-G-ENKDKPYLLYFNIFSCILSSNIISVAENGLQCPTPQV
        60        70          80        90       100       110     

              120       130           140       150       160      
pF1KE2 CVEKCP-DRYLTYLNARSSRDFEYY----KQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSK
       :: .:: : . .  :  :.   : .    ..::.::   :  :   :..  ::. :.:: 
CCDS47 CVSSCPEDPWTVGKNEFSQTVGEVFYTKNRNFCLPGVPWNMTVITSLQQELCPSFLLPSA
         120       130       140       150       160       170     

        170       180        190       200       210       220     
pF1KE2 PLARRCFPAIHAYKGVLM-VGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIF
       :   ::::  ..   .:  . :.:: ..:      :. :...       :.::.....::
CCDS47 PALGRCFPWTNVTPPALPGITNDTTIQQG------ISGLIDS-------LNARDISVKIF
         180       190       200             210              220  

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE2 EDYTVSWYWIIIGLVIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSR
       ::.. :::::...: .:...:::::.:::..:: .: :.:. :. ::.:::..:. ::  
CCDS47 EDFAQSWYWILVALGVALVLSLLFILLLRLVAGPLVLVLILGVLGVLAYGIYYCWEEYRV
            230       240       250       260       270       280  

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE2 LRGEAGSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIA
       :: . :...:  .::: :.. .:  ...:::: .:.:..::.:..:.:::::.:: ::::
CCDS47 LR-DKGASIS--QLGFTTNLSAYQSVQETWLAALIVLAVLEAILLLMLIFLRQRIRIAIA
             290         300       310       320       330         

         350       360       370       380       390          400  
pF1KE2 LIKEASRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDD---SP-C
       :.::::.::: .: ...:::::: :: .:::::: ::..:.::..  : .. .   :: :
CCDS47 LLKEASKAVGQMMSTMFYPLVTFVLLLICIAYWAMTALYLATSGQPQYVLWASNISSPGC
     340       350       360       370       380       390         

                410       420       430       440       450        
pF1KE2 ---PFTAKTCNPETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLAN
          :... .::: :    : :  ::.  : :  :....  .:....:::.... .::  :
CCDS47 EKVPINT-SCNP-TAHLVNSS--CPGLMCVFQGYSSKGLIQRSVFNLQIYGVLGLFWTLN
     400        410          420       430       440       450     

      460       470       480       490       500       510        
pF1KE2 FVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQII
       .:::::: .:::::::.:::..::.:.:.:::.::: :.:::::::::::::::..::: 
CCDS47 WVLALGQCVLAGAFASFYWAFHKPQDIPTFPLISAFIRTLRYHTGSLAFGALILTLVQIA
         460       470       480       490       500       510     

      520       530       540       550       560       570        
pF1KE2 RVILEYLDQRLKAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSAR
       ::::::.:..:....:  :.:.: :.:::.:::::::::::::::::::::: :::.::.
CCDS47 RVILEYIDHKLRGVQNPVARCIMCCFKCCLWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGKNFCVSAK
         520       530       540       550       560       570     

      580       590       600       610       620        630       
pF1KE2 NAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIR-IVQD-TAPPLN
       :::.::::::.::.:::::::.:...::::.::.::.:.::::. ::  . .:  .: ::
CCDS47 NAFMLLMRNIVRVVVLDKVTDLLLFFGKLLVVGGVGVLSFFFFSGRIPGLGKDFKSPHLN
         580       590       600       610       620       630     

        640       650       660       670       680       690      
pF1KE2 YYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLL
       :::.::.: :.:.:.:: :::::.::::::::::::::::::.:: .:::.::..: :.:
CCDS47 YYWLPIMTSILGAYVIASGFFSVFGMCVDTLFLCFLEDLERNNGSLDRPYYMSKSLLKIL
         640       650       660       670       680       690     

        700           
pF1KE2 NKTNKKAAES     
       .: :.          
CCDS47 GKKNEAPPDNKKRKK
         700       710

>>CCDS54989.1 SLC44A4 gene_id:80736|Hs108|chr6            (634 aa)
 initn: 1787 init1: 1178 opt: 2023  Z-score: 2420.2  bits: 458.2 E(32554): 1.7e-128
Smith-Waterman score: 2173; 52.6% identity (78.8% similar) in 642 aa overlap (80-701:3-624)

      50        60        70        80        90         100       
pF1KE2 VGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKC--ASPLVLLE---F
                                     .:..::::.:::: .:  .: .. .    .
CCDS54                             MGENKDKPYLLYFNIFSCILSSNIISVAENGL
                                           10        20        30  

          110        120       130           140       150         
pF1KE2 QCPTPQICVEKCP-DRYLTYLNARSSRDFEYY----KQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCP
       ::::::.:: .:: : . .  :  :.   : .    ..::.::   :  :   :..  ::
CCDS54 QCPTPQVCVSSCPEDPWTVGKNEFSQTVGEVFYTKNRNFCLPGVPWNMTVITSLQQELCP
             40        50        60        70        80        90  

     160       170       180        190       200       210        
pF1KE2 AVLIPSKPLARRCFPAIHAYKGVLM-VGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEAR
       . :.:: :   ::::  ..   .:  . :.:: ..:      :. :...       :.::
CCDS54 SFLLPSAPALGRCFPWTNVTPPALPGITNDTTIQQG------ISGLIDS-------LNAR
            100       110       120             130                

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE2 QLAMRIFEDYTVSWYWIIIGLVIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFH
       .....::::.. :::::...: .:...:::::.:::..:: .: :.:. :. ::.:::..
CCDS54 DISVKIFEDFAQSWYWILVALGVALVLSLLFILLLRLVAGPLVLVLILGVLGVLAYGIYY
     140       150       160       170       180       190         

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE2 CYMEYSRLRGEAGSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRK
       :. ::  :: . :...:  .::: :.. .:  ...:::: .:.:..::.:..:.:::::.
CCDS54 CWEEYRVLR-DKGASIS--QLGFTTNLSAYQSVQETWLAALIVLAVLEAILLLMLIFLRQ
     200        210         220       230       240       250      

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE2 RILIAIALIKEASRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDD
       :: :::::.::::.::: .: ...:::::: :: .:::::: ::..:.::..  : .. .
CCDS54 RIRIAIALLKEASKAVGQMMSTMFYPLVTFVLLLICIAYWAMTALYLATSGQPQYVLWAS
        260       270       280       290       300       310      

         400           410       420       430       440       450 
pF1KE2 ---SP-C---PFTAKTCNPETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAF
          :: :   :... .::: :    : :  ::.  : :  :....  .:....:::....
CCDS54 NISSPGCEKVPINT-SCNP-TAHLVNSS--CPGLMCVFQGYSSKGLIQRSVFNLQIYGVL
        320       330         340         350       360       370  

             460       470       480       490       500       510 
pF1KE2 MFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALI
        .::  :.:::::: .:::::::.:::..::.:.:.:::.::: :.::::::::::::::
CCDS54 GLFWTLNWVLALGQCVLAGAFASFYWAFHKPQDIPTFPLISAFIRTLRYHTGSLAFGALI
            380       390       400       410       420       430  

             520       530       540       550       560       570 
pF1KE2 LAIVQIIRVILEYLDQRLKAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGT
       :..::: ::::::.:..:....:  :.:.: :.:::.:::::::::::::::::::::: 
CCDS54 LTLVQIARVILEYIDHKLRGVQNPVARCIMCCFKCCLWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGK
            440       450       460       470       480       490  

             580       590       600       610       620        630
pF1KE2 NFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIR-IVQD
       :::.::.:::.::::::.::.:::::::.:...::::.::.::.:.::::. ::  . .:
CCDS54 NFCVSAKNAFMLLMRNIVRVVVLDKVTDLLLFFGKLLVVGGVGVLSFFFFSGRIPGLGKD
            500       510       520       530       540       550  

               640       650       660       670       680         
pF1KE2 -TAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMS
         .: :::::.::.: :.:.:.:: :::::.::::::::::::::::::.:: .:::.::
CCDS54 FKSPHLNYYWLPIMTSILGAYVIASGFFSVFGMCVDTLFLCFLEDLERNNGSLDRPYYMS
            560       570       580       590       600       610  

     690       700           
pF1KE2 STLKKLLNKTNKKAAES     
       ..: :.:.: :.          
CCDS54 KSLLKILGKKNEAPPDNKKRKK
            620       630    

>>CCDS54990.1 SLC44A4 gene_id:80736|Hs108|chr6            (668 aa)
 initn: 2019 init1: 1178 opt: 1937  Z-score: 2316.8  bits: 439.1 E(32554): 1e-122
Smith-Waterman score: 2354; 51.7% identity (76.6% similar) in 714 aa overlap (3-701:7-658)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE2     MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWT
             ::  . :::   : ::::.:.::: ::.:::.::::..:: :.::..:::.:: 
CCDS54 MGGKQRDEDDEAYGK---PVKYDPSFRGPIKNRSCTDVICCVLFLLFILGYIVVGIVAWL
               10           20        30        40        50       

         60        70        80        90         100          110 
pF1KE2 HGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKPYLFYFNIVKC--ASPLVLLE---FQCPTPQI
       .::::.:.:: .: : .::. : .:..::::.:::: .:  .: .. .    .:::::: 
CCDS54 YGDPRQVLYPRNSTGAYCGM-G-ENKDKPYLLYFNIFSCILSSNIISVAENGLQCPTPQT
        60        70          80        90       100       110     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE2 CVEKCPDRYLTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSKPLARR
        . .                                     :..  ::. :.:: :   :
CCDS54 VITS-------------------------------------LQQELCPSFLLPSAPALGR
                                              120       130        

             180        190       200       210       220       230
pF1KE2 CFPAIHAYKGVLM-VGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFEDYTV
       :::  ..   .:  . :.:: ..:      :. :...       :.::.....::::.. 
CCDS54 CFPWTNVTPPALPGITNDTTIQQG------ISGLIDS-------LNARDISVKIFEDFAQ
      140       150       160                    170       180     

              240       250       260       270       280       290
pF1KE2 SWYWIIIGLVIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEA
       :::::...: .:...:::::.:::..:: .: :.:. :. ::.:::..:. ::  :: . 
CCDS54 SWYWILVALGVALVLSLLFILLLRLVAGPLVLVLILGVLGVLAYGIYYCWEEYRVLR-DK
         190       200       210       220       230       240     

              300       310       320       330       340       350
pF1KE2 GSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEA
       :...:  .::: :.. .:  ...:::: .:.:..::.:..:.:::::.:: :::::.:::
CCDS54 GASIS--QLGFTTNLSAYQSVQETWLAALIVLAVLEAILLLMLIFLRQRIRIAIALLKEA
            250       260       270       280       290       300  

              360       370       380       390          400       
pF1KE2 SRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDD---SP-C---PF
       :.::: .: ...:::::: :: .:::::: ::..:.::..  : .. .   :: :   :.
CCDS54 SKAVGQMMSTMFYPLVTFVLLLICIAYWAMTALYLATSGQPQYVLWASNISSPGCEKVPI
            310       320       330       340       350       360  

           410       420       430       440       450       460   
pF1KE2 TAKTCNPETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLAL
       .. .::: :    : :  ::.  : :  :....  .:....:::.... .::  :.::::
CCDS54 NT-SCNP-TAHLVNSS--CPGLMCVFQGYSSKGLIQRSVFNLQIYGVLGLFWTLNWVLAL
              370         380       390       400       410        

           470       480       490       500       510       520   
pF1KE2 GQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILE
       :: .:::::::.:::..::.:.:.:::.::: :.:::::::::::::::..::: :::::
CCDS54 GQCVLAGAFASFYWAFHKPQDIPTFPLISAFIRTLRYHTGSLAFGALILTLVQIARVILE
      420       430       440       450       460       470        

           530       540       550       560       570       580   
pF1KE2 YLDQRLKAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFL
       :.:..:....:  :.:.: :.:::.:::::::::::::::::::::: :::.::.:::.:
CCDS54 YIDHKLRGVQNPVARCIMCCFKCCLWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGKNFCVSAKNAFML
      480       490       500       510       520       530        

           590       600       610       620        630        640 
pF1KE2 LMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIR-IVQD-TAPPLNYYWVP
       :::::.::.:::::::.:...::::.::.::.:.::::. ::  . .:  .: :::::.:
CCDS54 LMRNIVRVVVLDKVTDLLLFFGKLLVVGGVGVLSFFFFSGRIPGLGKDFKSPHLNYYWLP
      540       550       560       570       580       590        

             650       660       670       680       690       700 
pF1KE2 ILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNK
       :.: :.:.:.:: :::::.::::::::::::::::::.:: .:::.::..: :.:.: :.
CCDS54 IMTSILGAYVIASGFFSVFGMCVDTLFLCFLEDLERNNGSLDRPYYMSKSLLKILGKKNE
      600       610       620       630       640       650        

                 
pF1KE2 KAAES     
                 
CCDS54 APPDNKKRKK
      660        

>>CCDS75868.1 SLC44A1 gene_id:23446|Hs108|chr9            (652 aa)
 initn: 956 init1: 448 opt: 689  Z-score: 821.9  bits: 162.5 E(32554): 1.8e-39
Smith-Waterman score: 976; 28.8% identity (60.2% similar) in 699 aa overlap (25-706:20-636)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDP
                               :. .:.::::   ....:  .:.  .  .. . :  
CCDS75      MGCCSSASSAAQSSKREWKPLEDRSCTDIPWLLLFILFCIGMGFICGFSIATGAA
                    10        20        30        40        50     

               70        80                  90       100       110
pF1KE2 RKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKP----------YLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQ
        ...   :: :..::::.:: :  :          :.:...   :   : :.. .  .  
CCDS75 ARLVSGYDSYGNICGQKNTKLEAIPNSGMDHTQRKYVFFLD--PCN--LDLINRKIKSVA
          60        70        80        90           100       110 

              120       130       140       150       160          
pF1KE2 ICVEKCPDRYLTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSK---P
       .::  :: . :  :.  ..      . .:  ..: .. ..    .  :: . .:..   :
CCDS75 LCVAACPRQELKTLSDVQKFAEINGSALCSYNLKPSEYTTSPKSSVLCPKLPVPASAPIP
             120       130       140       150       160       170 

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE2 LARRCFPAIHAYKGVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFED
       . .:: :        . ..  . . ..  .   ..:     .  .::. ...        
CCDS75 FFHRCAP--------VNISCYAKFAEALITF--VSDNSVLHRLISGVMTSKE--------
                     180       190         200       210           

       230        240       250       260       270         280    
pF1KE2 YTVSWYWIIIGL-VIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVIL--VLGYGIFHCYMEYS
              ::.:: ......:.......:... ..::.. :.:::  . : :..  .  :.
CCDS75 -------IILGLCLLSLVLSMILMVIIRYISRVLVWILTILVILGSLGGTGVL--WWLYA
                  220       230       240       250         260    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE2 RLRGEAGSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAI
       . :      :.  .: .  :     .:: . : . :  ... ::..:... .:::. ..:
CCDS75 KQRRSPKETVTPEQLQIAED-----NLR-ALLIYAISATVFTVILFLIMLVMRKRVALTI
          270       280             290       300       310        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE2 ALIKEASRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSPCPFT
       ::.. :...  ..   .. :. ::: : :  .::  : .::.:..  : .  ...   : 
CCDS75 ALFHVAGKVFIHLPLLVFQPFWTFFALVLFWVYWIMTLLFLGTTGSPVQN--EQGFVEF-
      320       330       340       350       360         370      

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE2 AKTCNPETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALG
        :  .:                 :. ..     ::  ..::        .:...:.::  
CCDS75 -KISGP----------------LQYMWW-----YH--VVGL--------IWISEFILACQ
          380                              390               400   

          470       480       490       500       510       520    
pF1KE2 QVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEY
       :.:.::: ..::.. :   .::  :.... .: .::: :..: :..:...:.: :.:: :
CCDS75 QMTVAGAVVTYYFT-RDKRNLPFTPILASVNRLIRYHLGTVAKGSFIITLVKIPRMILMY
           410        420       430       440       450       460  

          530       540       550       560       570       580    
pF1KE2 LDQRLKAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLL
       . ..::. ::  :.:..    ::.::::: ...::.:::   :: .:::::::..:: .:
CCDS75 IHSQLKGKENACARCVLKSCICCLWCLEKCLNYLNQNAYTATAINSTNFCTSAKDAFVIL
            470       480       490       500       510       520  

          590       600       610       620       630       640    
pF1KE2 MRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWV-PIL
       ..: .:::... : ::...:::.::: :.:. ........    :: .      :: :..
CCDS75 VENALRVATINTVGDFMLFLGKVLIVCSTGLAGIMLLNYQ----QDYT-----VWVLPLI
            530       540       550       560                570   

           650       660       670       680       690       700   
pF1KE2 TVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKA
        : . ..:.:: :.:.: : ::.:::::  : . ::::  : ..:...: ...... :  
CCDS75 IVCLFAFLVAHCFLSIYEMVVDVLFLCFAIDTKYNDGSPGREFYMDKVLMEFVENSRKAM
           580       590       600       610       620       630   

                          
pF1KE2 AES                
        :.                
CCDS75 KEAGKGGVADSRELKPMIK
           640       650  

>>CCDS83390.1 SLC44A1 gene_id:23446|Hs108|chr9            (654 aa)
 initn: 956 init1: 448 opt: 689  Z-score: 821.9  bits: 162.5 E(32554): 1.8e-39
Smith-Waterman score: 976; 28.8% identity (60.2% similar) in 699 aa overlap (25-706:20-636)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDP
                               :. .:.::::   ....:  .:.  .  .. . :  
CCDS83      MGCCSSASSAAQSSKREWKPLEDRSCTDIPWLLLFILFCIGMGFICGFSIATGAA
                    10        20        30        40        50     

               70        80                  90       100       110
pF1KE2 RKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKP----------YLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQ
        ...   :: :..::::.:: :  :          :.:...   :   : :.. .  .  
CCDS83 ARLVSGYDSYGNICGQKNTKLEAIPNSGMDHTQRKYVFFLD--PCN--LDLINRKIKSVA
          60        70        80        90           100       110 

              120       130       140       150       160          
pF1KE2 ICVEKCPDRYLTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSK---P
       .::  :: . :  :.  ..      . .:  ..: .. ..    .  :: . .:..   :
CCDS83 LCVAACPRQELKTLSDVQKFAEINGSALCSYNLKPSEYTTSPKSSVLCPKLPVPASAPIP
             120       130       140       150       160       170 

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE2 LARRCFPAIHAYKGVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFED
       . .:: :        . ..  . . ..  .   ..:     .  .::. ...        
CCDS83 FFHRCAP--------VNISCYAKFAEALITF--VSDNSVLHRLISGVMTSKE--------
                     180       190         200       210           

       230        240       250       260       270         280    
pF1KE2 YTVSWYWIIIGL-VIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVIL--VLGYGIFHCYMEYS
              ::.:: ......:.......:... ..::.. :.:::  . : :..  .  :.
CCDS83 -------IILGLCLLSLVLSMILMVIIRYISRVLVWILTILVILGSLGGTGVL--WWLYA
                  220       230       240       250         260    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE2 RLRGEAGSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAI
       . :      :.  .: .  :     .:: . : . :  ... ::..:... .:::. ..:
CCDS83 KQRRSPKETVTPEQLQIAED-----NLR-ALLIYAISATVFTVILFLIMLVMRKRVALTI
          270       280             290       300       310        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE2 ALIKEASRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSPCPFT
       ::.. :...  ..   .. :. ::: : :  .::  : .::.:..  : .  ...   : 
CCDS83 ALFHVAGKVFIHLPLLVFQPFWTFFALVLFWVYWIMTLLFLGTTGSPVQN--EQGFVEF-
      320       330       340       350       360         370      

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE2 AKTCNPETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALG
        :  .:                 :. ..     ::  ..::        .:...:.::  
CCDS83 -KISGP----------------LQYMWW-----YH--VVGL--------IWISEFILACQ
          380                              390               400   

          470       480       490       500       510       520    
pF1KE2 QVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEY
       :.:.::: ..::.. :   .::  :.... .: .::: :..: :..:...:.: :.:: :
CCDS83 QMTVAGAVVTYYFT-RDKRNLPFTPILASVNRLIRYHLGTVAKGSFIITLVKIPRMILMY
           410        420       430       440       450       460  

          530       540       550       560       570       580    
pF1KE2 LDQRLKAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLL
       . ..::. ::  :.:..    ::.::::: ...::.:::   :: .:::::::..:: .:
CCDS83 IHSQLKGKENACARCVLKSCICCLWCLEKCLNYLNQNAYTATAINSTNFCTSAKDAFVIL
            470       480       490       500       510       520  

          590       600       610       620       630       640    
pF1KE2 MRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWV-PIL
       ..: .:::... : ::...:::.::: :.:. ........    :: .      :: :..
CCDS83 VENALRVATINTVGDFMLFLGKVLIVCSTGLAGIMLLNYQ----QDYT-----VWVLPLI
            530       540       550       560                570   

           650       660       670       680       690       700   
pF1KE2 TVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKA
        : . ..:.:: :.:.: : ::.:::::  : . ::::  : ..:...: ...... :  
CCDS83 IVCLFAFLVAHCFLSIYEMVVDVLFLCFAIDTKYNDGSPGREFYMDKVLMEFVENSRKAM
           580       590       600       610       620       630   

                            
pF1KE2 AES                  
        :.                  
CCDS83 KEAGKGGVADSRELKPMLKKR
           640       650    

>>CCDS6763.1 SLC44A1 gene_id:23446|Hs108|chr9             (657 aa)
 initn: 956 init1: 448 opt: 689  Z-score: 821.9  bits: 162.5 E(32554): 1.9e-39
Smith-Waterman score: 976; 28.8% identity (60.2% similar) in 699 aa overlap (25-706:20-636)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGDERPHYYGKHGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVFLLLAIVGYVAVGIIAWTHGDP
                               :. .:.::::   ....:  .:.  .  .. . :  
CCDS67      MGCCSSASSAAQSSKREWKPLEDRSCTDIPWLLLFILFCIGMGFICGFSIATGAA
                    10        20        30        40        50     

               70        80                  90       100       110
pF1KE2 RKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNENKP----------YLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQ
        ...   :: :..::::.:: :  :          :.:...   :   : :.. .  .  
CCDS67 ARLVSGYDSYGNICGQKNTKLEAIPNSGMDHTQRKYVFFLD--PCN--LDLINRKIKSVA
          60        70        80        90           100       110 

              120       130       140       150       160          
pF1KE2 ICVEKCPDRYLTYLNARSSRDFEYYKQFCVPGFKNNKGVAEVLRDGDCPAVLIPSK---P
       .::  :: . :  :.  ..      . .:  ..: .. ..    .  :: . .:..   :
CCDS67 LCVAACPRQELKTLSDVQKFAEINGSALCSYNLKPSEYTTSPKSSVLCPKLPVPASAPIP
             120       130       140       150       160       170 

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE2 LARRCFPAIHAYKGVLMVGNETTYEDGHGSRKNITDLVEGAKKANGVLEARQLAMRIFED
       . .:: :        . ..  . . ..  .   ..:     .  .::. ...        
CCDS67 FFHRCAP--------VNISCYAKFAEALITF--VSDNSVLHRLISGVMTSKE--------
                     180       190         200       210           

       230        240       250       260       270         280    
pF1KE2 YTVSWYWIIIGL-VIAMAMSLLFIILLRFLAGIMVWVMIIMVIL--VLGYGIFHCYMEYS
              ::.:: ......:.......:... ..::.. :.:::  . : :..  .  :.
CCDS67 -------IILGLCLLSLVLSMILMVIIRYISRVLVWILTILVILGSLGGTGVL--WWLYA
                  220       230       240       250         260    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE2 RLRGEAGSDVSLVDLGFQTDFRVYLHLRQTWLAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAI
       . :      :.  .: .  :     .:: . : . :  ... ::..:... .:::. ..:
CCDS67 KQRRSPKETVTPEQLQIAED-----NLR-ALLIYAISATVFTVILFLIMLVMRKRVALTI
          270       280             290       300       310        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE2 ALIKEASRAVGYVMCSLLYPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFDDSPCPFT
       ::.. :...  ..   .. :. ::: : :  .::  : .::.:..  : .  ...   : 
CCDS67 ALFHVAGKVFIHLPLLVFQPFWTFFALVLFWVYWIMTLLFLGTTGSPVQN--EQGFVEF-
      320       330       340       350       360         370      

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE2 AKTCNPETFPSSNESRQCPNARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALG
        :  .:                 :. ..     ::  ..::        .:...:.::  
CCDS67 -KISGP----------------LQYMWW-----YH--VVGL--------IWISEFILACQ
          380                              390               400   

          470       480       490       500       510       520    
pF1KE2 QVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEY
       :.:.::: ..::.. :   .::  :.... .: .::: :..: :..:...:.: :.:: :
CCDS67 QMTVAGAVVTYYFT-RDKRNLPFTPILASVNRLIRYHLGTVAKGSFIITLVKIPRMILMY
           410        420       430       440       450       460  

          530       540       550       560       570       580    
pF1KE2 LDQRLKAAENKFAKCLMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLL
       . ..::. ::  :.:..    ::.::::: ...::.:::   :: .:::::::..:: .:
CCDS67 IHSQLKGKENACARCVLKSCICCLWCLEKCLNYLNQNAYTATAINSTNFCTSAKDAFVIL
            470       480       490       500       510       520  

          590       600       610       620       630       640    
pF1KE2 MRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLIVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWV-PIL
       ..: .:::... : ::...:::.::: :.:. ........    :: .      :: :..
CCDS67 VENALRVATINTVGDFMLFLGKVLIVCSTGLAGIMLLNYQ----QDYT-----VWVLPLI
            530       540       550       560                570   

           650       660       670       680       690       700   
pF1KE2 TVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSTLKKLLNKTNKKA
        : . ..:.:: :.:.: : ::.:::::  : . ::::  : ..:...: ...... :  
CCDS67 IVCLFAFLVAHCFLSIYEMVVDVLFLCFAIDTKYNDGSPGREFYMDKVLMEFVENSRKAM
           580       590       600       610       620       630   

                               
pF1KE2 AES                     
        :.                     
CCDS67 KEAGKGGVADSRELKPMASGASSA
           640       650       




706 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 17:01:35 2016 done: Tue Nov  8 17:01:36 2016
 Total Scan time:  2.500 Total Display time:  0.160

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com