Result of FASTA (omim) for pFN21AB0426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0426, 845 aa
  1>>>pF1KB0426 845 - 845 aa - 845 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6790+/-0.000598; mu= 5.8909+/- 0.036
 mean_var=453.3220+/-100.143, 0's: 0 Z-trim(115.7): 263  B-trim: 0 in 0/56
 Lambda= 0.060238
 statistics sampled from 26043 (26308) to 26043 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.308), width:  16
 Scan time: 13.540

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005419 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isofor ( 845) 5790 519.6 2.4e-146
XP_005259699 (OMIM: 164875) PREDICTED: proto-oncog ( 821) 5052 455.4 4.8e-127
NP_001245135 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav iso ( 823) 4385 397.4 1.4e-109
NP_001245136 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav iso ( 813) 4309 390.8 1.3e-107
NP_006104 (OMIM: 605541) guanine nucleotide exchan ( 847) 3428 314.3 1.5e-84
XP_016855543 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 783) 3155 290.5   2e-77
XP_016855544 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 751) 2816 261.0 1.4e-68
XP_005270417 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 753) 2810 260.5 2.1e-68
NP_003362 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exchan ( 839) 2808 260.4 2.5e-68
XP_016870601 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 844) 2790 258.8 7.3e-68
XP_005272270 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 868) 2544 237.5   2e-61
XP_005270418 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 621) 2526 235.7   5e-61
XP_016870599 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 873) 2526 235.9   6e-61
XP_016855542 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 823) 2513 234.8 1.3e-60
NP_001127870 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exc ( 878) 2510 234.5 1.6e-60
XP_016870598 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 891) 1858 177.9 1.8e-43
XP_016870600 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 867) 1840 176.3 5.3e-43
XP_016870597 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 896) 1840 176.3 5.4e-43
XP_016870602 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 620) 1738 167.2 2.1e-40
XP_016855545 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 407) 1462 142.9 2.8e-33
NP_001073343 (OMIM: 605541) guanine nucleotide exc ( 287)  924 95.9 2.7e-19
XP_005263745 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483)  393 50.1 2.8e-05
XP_005263746 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483)  393 50.1 2.8e-05
XP_011509578 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483)  393 50.1 2.8e-05
XP_011509579 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483)  393 50.1 2.8e-05
NP_001273723 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associ ( 596)  357 47.2 0.00027
XP_011529194 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho  ( 456)  336 45.2 0.00084
NP_001166950 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 463)  336 45.2 0.00085
XP_016884862 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho  ( 414)  334 44.9  0.0009
NP_001166951 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 414)  334 44.9  0.0009
XP_016884869 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho  ( 305)  307 42.4  0.0039
NP_065871 (OMIM: 606905) phosphatidylinositol 3,4, (1659)  321 44.7  0.0041
XP_006723397 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1327)  318 44.3  0.0043
XP_016882640 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1371)  318 44.3  0.0044
XP_016882639 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1374)  318 44.4  0.0044
NP_073746 (OMIM: 611893,616763) pleckstrin homolog (1386)  318 44.4  0.0044
XP_005259220 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1386)  318 44.4  0.0044
XP_011525534 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1387)  318 44.4  0.0044
NP_079446 (OMIM: 612139) phosphatidylinositol 3,4, ( 979)  304 42.9  0.0086
XP_011515914 (OMIM: 612139) PREDICTED: phosphatidy (1157)  304 43.0  0.0094


>>NP_005419 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isoform 1   (845 aa)
 initn: 5790 init1: 5790 opt: 5790  Z-score: 2748.3  bits: 519.6 E(85289): 2.4e-146
Smith-Waterman score: 5790; 100.0% identity (100.0% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-845)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
              790       800       810       820       830       840

            
pF1KB0 YSEYC
       :::::
NP_005 YSEYC
            

>>XP_005259699 (OMIM: 164875) PREDICTED: proto-oncogene   (821 aa)
 initn: 5052 init1: 5052 opt: 5052  Z-score: 2401.8  bits: 455.4 E(85289): 4.8e-127
Smith-Waterman score: 5052; 100.0% identity (100.0% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
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pF1KB0 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
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pF1KB0 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
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pF1KB0 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
       :::::::::::::::::::                                         
XP_005 MTAEGLYRITEKKAFRGLTWEAQSILAQPKPAMTSAPETDQSCRSRRVTSSRSLTRRDSK
              730       740       750       760       770       780

>>NP_001245135 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isoform  (823 aa)
 initn: 4422 init1: 4384 opt: 4385  Z-score: 2088.6  bits: 397.4 E(85289): 1.4e-109
Smith-Waterman score: 5569; 97.4% identity (97.4% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-823)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
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pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
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pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
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pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
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pF1KB0 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
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pF1KB0 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
NP_001 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEG---------------------
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pF1KB0 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -PPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
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pF1KB0 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
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pF1KB0 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
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pF1KB0 YSEYC
       :::::
NP_001 YSEYC
      820   

>>NP_001245136 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isoform  (813 aa)
 initn: 5551 init1: 4278 opt: 4309  Z-score: 2052.9  bits: 390.8 E(85289): 1.3e-107
Smith-Waterman score: 5491; 96.2% identity (96.2% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-813)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
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pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
       ::::::                                ::::::::::::::::::::::
NP_001 EPVSMP--------------------------------HFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
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pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
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pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
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pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
      330       340       350       360       370       380        

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pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
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pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
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pF1KB0 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
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pF1KB0 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
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pF1KB0 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
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pF1KB0 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
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pF1KB0 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
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pF1KB0 YSEYC
       :::::
NP_001 YSEYC
      810   

>>NP_006104 (OMIM: 605541) guanine nucleotide exchange f  (847 aa)
 initn: 3080 init1: 1630 opt: 3428  Z-score: 1639.0  bits: 314.3 E(85289): 1.5e-84
Smith-Waterman score: 3428; 58.7% identity (82.4% similar) in 849 aa overlap (1-840:1-846)

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       .:  .  ::  : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.:::   ... .:::
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       .:...: : :::    :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . :::
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pF1KB0 -----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGW
            .. : : .: : :::::::::  :::: .::..:: .: . .::::::. :::::
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pF1KB0 FPANYVEEDYSEYC
       ::..:::::     
NP_006 FPSTYVEEDE    
       840           

>>XP_016855543 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot  (783 aa)
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pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
       :: :.::..:::.:.::: .::::::.::: .:::.::::::::::::::  :.:::.:.
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       .: . .: :  : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.:::   ... .:::
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       ..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: .  :: ::.::
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XP_016 NGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGT
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pF1KB0 YVHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK
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>>XP_016855544 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot  (751 aa)
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XP_016                     MMMRMMTMTTKVIETLSRLSRTPIALATGIRPFPTEE-SI
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pF1KB0 GDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRSEPVSMPPKMTEYDKR
       .:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::..: . .: :  : : :
XP_016 NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMKAEEAHQP-KCPENDIR
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pF1KB0 CCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMK
        ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.:::   ... .:::: .:...: ....:..
XP_016 SCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPELVKLHRNLMQEIH
       100       110       120       130       140       150       

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB0 EALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAAREDVQMKLEECSQRA
       ... . .  :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. ..:::..::::::.::
XP_016 DSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKTKEDVKLKLEECSKRA
       160       170       180       190       200       210       

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pF1KB0 NNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKR
       :::.:::::::.:::::::::::::::::::: .  :: ::.::::::.:::: ::::::
XP_016 NNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDAMKDLAQYVNEVKR
       220       230       240       250       260       270       

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pF1KB0 DNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICK
       ::::::.: .::::::::.: .  .:::. :::..::......:..:. ::.: :...::
XP_016 DNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQERHIFLFDLAVIVCK
       280       290       300       310       320       330       

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pF1KB0 RRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQGYELFFKTRELKKKW
       :.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: .: :.. ::..:::::
XP_016 RKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKW
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pF1KB0 MEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTFYQGYRCHRCRASAHK
       .::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::::::: : .: : :::
XP_016 LEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHK
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pF1KB0 ECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVFQEYYGLPPPPGAI
       ::::::  ::: ..   ::.:  . . .   .  :. . :::::.:...: : :::    
XP_016 ECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHE
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pF1KB0 GPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVHGP-PQDLSVHLWY
       :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . :::    : : : : . ::
XP_016 GPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKPVDYSCQPWY
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pF1KB0 AGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEK
       :: :::  ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:::::.: .:...:.:.
XP_016 AGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAEN
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pF1KB0 KAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-----AVGSTKYFGTA
       . :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .:      .. : : .: :
XP_016 RKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIA
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pF1KB0 KARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
        :::::::::  :::: .::..:: .: . .::::::. :::::::..:::::     
XP_016 IARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE    
       700       710       720       730       740       750     

>>XP_005270417 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot  (753 aa)
 initn: 2545 init1: 1630 opt: 2810  Z-score: 1349.2  bits: 260.5 E(85289): 2.1e-68
Smith-Waterman score: 2810; 55.9% identity (80.9% similar) in 742 aa overlap (108-840:14-752)

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB0 FLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPIAQNRGIMPFPTEEESVG
                                     :: ::: :: ::::   :: :::::: :..
XP_005                  MQLPDCPCRAHLPVIETLSRLSRTPIALATGIRPFPTEE-SIN
                                10        20        30         40  

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pF1KB0 DEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRSEPVSMPPKMTEYDKRC
       :::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::..: . .: :  : : : 
XP_005 DEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMKAEEAHQP-KCPENDIRS
             50        60        70         80        90        100

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pF1KB0 CCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMKE
       ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.:::   ... .:::: .:...: ....:...
XP_005 CCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPELVKLHRNLMQEIHD
              110       120       130       140       150       160

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pF1KB0 ALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAAREDVQMKLEECSQRAN
       .. . .  :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. ..:::..::::::.:::
XP_005 SIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKTKEDVKLKLEECSKRAN
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pF1KB0 NGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKRD
       ::.:::::::.:::::::::::::::::::: .  :: ::.::::::.:::: :::::::
XP_005 NGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDAMKDLAQYVNEVKRD
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pF1KB0 NETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICKR
       :::::.: .::::::::.: .  .:::. :::..::......:..:. ::.: :...:::
XP_005 NETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQERHIFLFDLAVIVCKR
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pF1KB0 RGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQGYELFFKTRELKKKWM
       .::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: .: :.. ::..:::::.
XP_005 KGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKWL
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pF1KB0 EQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTFYQGYRCHRCRASAHKE
       ::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::::::: : .: : ::::
XP_005 EQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHKE
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pF1KB0 CLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVFQEYYGLPPPPGAIG
       :::::  ::: ..   ::.:  . . .   .  :. . :::::.:...: : :::    :
XP_005 CLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHEG
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pF1KB0 PFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVHGP-PQDLSVHLWYA
       : :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . :::    : : : : . :::
XP_005 PPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKPVDYSCQPWYA
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pF1KB0 GPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKK
       : :::  ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:::::.: .:...:.:..
XP_005 GAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENR
              590       600       610       620       630       640

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pF1KB0 AFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-----AVGSTKYFGTAK
        :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .:      .. : : .: : 
XP_005 KFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIAI
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pF1KB0 ARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
       :::::::::  :::: .::..:: .: . .::::::. :::::::..:::::     
XP_005 ARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE    
              710       720       730       740       750       

>>NP_003362 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exchange f  (839 aa)
 initn: 2737 init1: 1235 opt: 2808  Z-score: 1347.8  bits: 260.4 E(85289): 2.5e-68
Smith-Waterman score: 2995; 52.0% identity (78.5% similar) in 856 aa overlap (1-840:1-836)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
       :: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:...
NP_003 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
       :.:::::::::::::::::..: .::::. ::::. ::::::.:::::: ..: ::   :
NP_003 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
       :::.:: :::.:: . .:.:.: .: ... :  .  ::.::::  :.. ::.::::... 
NP_003 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV
              130       140        150       160        170        

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pF1KB0 EPVSMPPKM--TEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFI
       : :..: ::  :: ::: ::: :::.:: ::  :: .:......::.  :.: :.  .::
NP_003 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI
       180       190       200       210       220       230       

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pF1KB0 NIEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVA
       :.:::..::  ::. .  .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :.. :... 
NP_003 NLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL
       240       250        260       270       280       290      

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pF1KB0 AAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRL
       :.::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. :  :...:. 
NP_003 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KB0 ALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRS
       ::.::.:::. .::::::.::::.:..:: :::::. .: ..::::::::::. :.  ..
NP_003 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT
        360       370       380       390       400       410      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB0 KMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQG
       :.::: ::.::....:::.: ::.::....:   .. ::  ...: ::::. : ::. ::
NP_003 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG
        420       430       440       450       460       470      

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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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