FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0426, 845 aa 1>>>pF1KB0426 845 - 845 aa - 845 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6790+/-0.000598; mu= 5.8909+/- 0.036 mean_var=453.3220+/-100.143, 0's: 0 Z-trim(115.7): 263 B-trim: 0 in 0/56 Lambda= 0.060238 statistics sampled from 26043 (26308) to 26043 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16 Scan time: 13.540 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005419 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isofor ( 845) 5790 519.6 2.4e-146 XP_005259699 (OMIM: 164875) PREDICTED: proto-oncog ( 821) 5052 455.4 4.8e-127 NP_001245135 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav iso ( 823) 4385 397.4 1.4e-109 NP_001245136 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav iso ( 813) 4309 390.8 1.3e-107 NP_006104 (OMIM: 605541) guanine nucleotide exchan ( 847) 3428 314.3 1.5e-84 XP_016855543 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 783) 3155 290.5 2e-77 XP_016855544 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 751) 2816 261.0 1.4e-68 XP_005270417 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 753) 2810 260.5 2.1e-68 NP_003362 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exchan ( 839) 2808 260.4 2.5e-68 XP_016870601 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 844) 2790 258.8 7.3e-68 XP_005272270 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 868) 2544 237.5 2e-61 XP_005270418 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 621) 2526 235.7 5e-61 XP_016870599 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 873) 2526 235.9 6e-61 XP_016855542 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 823) 2513 234.8 1.3e-60 NP_001127870 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exc ( 878) 2510 234.5 1.6e-60 XP_016870598 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 891) 1858 177.9 1.8e-43 XP_016870600 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 867) 1840 176.3 5.3e-43 XP_016870597 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 896) 1840 176.3 5.4e-43 XP_016870602 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 620) 1738 167.2 2.1e-40 XP_016855545 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 407) 1462 142.9 2.8e-33 NP_001073343 (OMIM: 605541) guanine nucleotide exc ( 287) 924 95.9 2.7e-19 XP_005263745 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05 XP_005263746 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05 XP_011509578 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05 XP_011509579 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05 NP_001273723 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associ ( 596) 357 47.2 0.00027 XP_011529194 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 456) 336 45.2 0.00084 NP_001166950 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 463) 336 45.2 0.00085 XP_016884862 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 414) 334 44.9 0.0009 NP_001166951 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 414) 334 44.9 0.0009 XP_016884869 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 305) 307 42.4 0.0039 NP_065871 (OMIM: 606905) phosphatidylinositol 3,4, (1659) 321 44.7 0.0041 XP_006723397 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1327) 318 44.3 0.0043 XP_016882640 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1371) 318 44.3 0.0044 XP_016882639 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1374) 318 44.4 0.0044 NP_073746 (OMIM: 611893,616763) pleckstrin homolog (1386) 318 44.4 0.0044 XP_005259220 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1386) 318 44.4 0.0044 XP_011525534 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1387) 318 44.4 0.0044 NP_079446 (OMIM: 612139) phosphatidylinositol 3,4, ( 979) 304 42.9 0.0086 XP_011515914 (OMIM: 612139) PREDICTED: phosphatidy (1157) 304 43.0 0.0094 >>NP_005419 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isoform 1 (845 aa) initn: 5790 init1: 5790 opt: 5790 Z-score: 2748.3 bits: 519.6 E(85289): 2.4e-146 Smith-Waterman score: 5790; 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NP_006 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI :::::::::::::::::::..::: ::...::::::::::::.:::::: ::: :: ::: NP_006 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR : :: :::::: :..:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::. NP_006 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN .: . :: : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .::: NP_006 AEE-AHQPKCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA : .:...: ....:..... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. NP_006 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA ..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.:: NP_006 TKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK ::::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......: NP_006 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA ..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: NP_006 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB0 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT .: :.. ::..:::::.::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.:::::::: NP_006 NGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGT 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB0 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKM ::::: : .: : ::::::::: ::: .. ::.: . . . . :. . ::::: NP_006 FYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKM 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB0 EVFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKP .:...: : ::: :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . ::: NP_006 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB0 YVHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK : : : : . :::: ::: ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.: NP_006 CPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAK 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB0 HIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP ::::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .: NP_006 HIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRG 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB0 -----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGW .. : : .: : ::::::::: :::: .::..:: .: . .::::::. ::::: NP_006 NRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGW 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB0 FPANYVEEDYSEYC ::..::::: NP_006 FPSTYVEEDE 840 >>XP_016855543 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot (783 aa) initn: 2797 init1: 1630 opt: 3155 Z-score: 1511.1 bits: 290.5 E(85289): 2e-77 Smith-Waterman score: 3155; 58.8% identity (83.3% similar) in 779 aa overlap (1-775:1-776) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV :: :.::..:::.:.::: .::::::.::: .:::.:::::::::::::: :.:::.:. XP_016 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI :::::::::::::::::::..::: ::...::::::::::::.:::::: ::: :: ::: XP_016 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR : :: :::::: :..:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::. XP_016 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN .: . .: : : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .::: XP_016 AEEAHQP-KCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA : .:...: ....:..... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. XP_016 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA ..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.:: XP_016 TKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK ::::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......: XP_016 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA ..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: XP_016 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB0 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT .: :.. ::..:::::.::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.:::::::: XP_016 NGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGT 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB0 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKM ::::: : .: : ::::::::: ::: .. ::.: . . . . :. . ::::: XP_016 FYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKM 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB0 EVFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKP .:...: : ::: :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . ::: XP_016 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB0 YVHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK : : : : . :::: ::: ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.: XP_016 CPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAK 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB0 HIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP ::::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .: XP_016 HIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRG 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB0 AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANY XP_016 NRAGNS 780 >>XP_016855544 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot (751 aa) initn: 2545 init1: 1630 opt: 2816 Z-score: 1352.0 bits: 261.0 E(85289): 1.4e-68 Smith-Waterman score: 2816; 56.0% identity (80.9% similar) in 743 aa overlap (107-840:11-750) 80 90 100 110 120 130 pF1KB0 TFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPIAQNRGIMPFPTEEESV ::: ::: :: :::: :: :::::: :. XP_016 MMMRMMTMTTKVIETLSRLSRTPIALATGIRPFPTEE-SI 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KB0 GDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRSEPVSMPPKMTEYDKR .:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::..: . .: : : : : XP_016 NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMKAEEAHQP-KCPENDIR 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 CCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMK ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .:::: .:...: ....:.. XP_016 SCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPELVKLHRNLMQEIH 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 EALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAAREDVQMKLEECSQRA ... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. ..:::..::::::.:: XP_016 DSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKTKEDVKLKLEECSKRA 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 NNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKR :::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.::::::.:::: :::::: XP_016 NNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDAMKDLAQYVNEVKR 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 DNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICK ::::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......:..:. ::.: :...:: XP_016 DNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQERHIFLFDLAVIVCK 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 RRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQGYELFFKTRELKKKW :.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: .: :.. ::..::::: XP_016 RKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKW 340 350 360 370 380 390 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 MEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTFYQGYRCHRCRASAHK .::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::::::: : .: : ::: XP_016 LEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHK 400 410 420 430 440 450 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 ECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVFQEYYGLPPPPGAI :::::: ::: .. ::.: . . . . :. . :::::.:...: : ::: XP_016 ECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHE 460 470 480 490 500 510 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 GPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVHGP-PQDLSVHLWY :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . ::: : : : : . :: XP_016 GPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKPVDYSCQPWY 520 530 540 550 560 570 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 AGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEK :: ::: ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:::::.: .:...:.:. XP_016 AGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAEN 580 590 600 610 620 630 740 750 760 770 780 pF1KB0 KAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-----AVGSTKYFGTA . :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .: .. : : .: : XP_016 RKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIA 640 650 660 670 680 690 790 800 810 820 830 840 pF1KB0 KARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEEDYSEYC ::::::::: :::: .::..:: .: . .::::::. :::::::..::::: XP_016 IARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE 700 710 720 730 740 750 >>XP_005270417 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot (753 aa) initn: 2545 init1: 1630 opt: 2810 Z-score: 1349.2 bits: 260.5 E(85289): 2.1e-68 Smith-Waterman score: 2810; 55.9% identity (80.9% similar) in 742 aa overlap (108-840:14-752) 80 90 100 110 120 130 pF1KB0 FLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPIAQNRGIMPFPTEEESVG :: ::: :: :::: :: :::::: :.. XP_005 MQLPDCPCRAHLPVIETLSRLSRTPIALATGIRPFPTEE-SIN 10 20 30 40 140 150 160 170 180 190 pF1KB0 DEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRSEPVSMPPKMTEYDKRC :::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::..: . .: : : : : XP_005 DEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMKAEEAHQP-KCPENDIRS 50 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 CCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMKE ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .:::: .:...: ....:... XP_005 CCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPELVKLHRNLMQEIHD 110 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 ALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAAREDVQMKLEECSQRAN .. . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. ..:::..::::::.::: XP_005 SIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKTKEDVKLKLEECSKRAN 170 180 190 200 210 220 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 NGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKRD ::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.::::::.:::: ::::::: XP_005 NGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDAMKDLAQYVNEVKRD 230 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 NETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICKR :::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......:..:. ::.: :...::: XP_005 NETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQERHIFLFDLAVIVCKR 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 RGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQGYELFFKTRELKKKWM .::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: .: :.. ::..:::::. XP_005 KGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKWL 350 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 EQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTFYQGYRCHRCRASAHKE ::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::::::: : .: : :::: XP_005 EQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHKE 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 CLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVFQEYYGLPPPPGAIG ::::: ::: .. ::.: . . . . :. . :::::.:...: : ::: : XP_005 CLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHEG 470 480 490 500 510 520 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 PFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVHGP-PQDLSVHLWYA : :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . ::: : : : : . ::: XP_005 PPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKPVDYSCQPWYA 530 540 550 560 570 580 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 GPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKK : ::: ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:::::.: .:...:.:.. XP_005 GAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENR 590 600 610 620 630 640 740 750 760 770 780 pF1KB0 AFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-----AVGSTKYFGTAK :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .: .. : : .: : XP_005 KFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIAI 650 660 670 680 690 700 790 800 810 820 830 840 pF1KB0 ARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEEDYSEYC ::::::::: :::: .::..:: .: . .::::::. :::::::..::::: XP_005 ARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE 710 720 730 740 750 >>NP_003362 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exchange f (839 aa) initn: 2737 init1: 1235 opt: 2808 Z-score: 1347.8 bits: 260.4 E(85289): 2.5e-68 Smith-Waterman score: 2995; 52.0% identity (78.5% similar) in 856 aa overlap (1-840:1-836) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV :: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:... 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