FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9503, 384 aa 1>>>pF1KE9503 384 - 384 aa - 384 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4077+/-0.000827; mu= 16.6186+/- 0.049 mean_var=151.1898+/-54.559, 0's: 0 Z-trim(108.8): 155 B-trim: 1398 in 2/46 Lambda= 0.104307 statistics sampled from 10210 (10479) to 10210 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 3.090 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 2540 394.5 8.3e-110 CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 852 140.5 2.4e-33 CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 828 136.9 3e-32 CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 691 116.2 4.5e-26 CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 622 105.8 6e-23 CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 610 104.1 2.3e-22 CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 566 97.4 2.1e-20 CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 552 95.3 9e-20 CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 384 70.0 3.5e-12 CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 ( 360) 374 68.5 1.1e-11 >>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa) initn: 2540 init1: 2540 opt: 2540 Z-score: 2084.9 bits: 394.5 E(32554): 8.3e-110 Smith-Waterman score: 2540; 100.0% identity (100.0% similar) in 384 aa overlap (1-384:1-384) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 AARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 AVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDS 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 FRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI :::::::::::::::::::::::: CCDS12 FRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI 370 380 >>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa) initn: 822 init1: 418 opt: 852 Z-score: 712.1 bits: 140.5 E(32554): 2.4e-33 Smith-Waterman score: 858; 42.8% identity (69.0% similar) in 348 aa overlap (28-375:21-355) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV ::.. :.:::: . : : .. .. CCDS66 MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGKLAGRLKEASEGSTLTTVLFLVICSFI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL :::::.:: :: .. . . .:. . :..: :::.: :: .:.:.:: .:: :.:. ::: CCDS66 VLENLMVLIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWFL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP ::: .:.::.::: ::: : :: ::.. . :.: ::. .::.:::.: :: :: CCDS66 REGSMFVALGASTCSLLAIAIERHLTMIK-MRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFTLGALP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRP .:::::: . ::..::::::.:: ::. ::...:.::. ::. :. ::..:..:. CCDS66 ILGWNCLHNLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAILVTIVILYARIYFLVKSSSRKVANH 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 AARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNS ... ::.::.... .:..::.::: :.: :: . . : : .:...:::::: CCDS66 NNSERSMALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLIDV-ACRVQACPILFKAQWFIVLAVLNS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 AVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDS :.::.::.. :.:. :: . : :.:: .:: : ::: . . : : : ..: CCDS66 AMNPVIYTLASKEMRRAFFR-LVCNCL---VRGRG---ARASPIQPA---LDPS-RSKSS 300 310 320 330 340 370 380 pF1KE9 FRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI .. : : ...: : CCDS66 SSNNSSHSPKVKEDLPHTAPSSCIMDKNAALQNGIFCN 350 360 370 >>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa) initn: 722 init1: 333 opt: 828 Z-score: 692.6 bits: 136.9 E(32554): 3e-32 Smith-Waterman score: 828; 41.0% identity (72.8% similar) in 334 aa overlap (1-326:1-331) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV :. :..:.. .... . .:: :::..:.: . :.. . . . :.. CCDS77 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENS-IKLTSVVFILICCFI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL .:::..:: .: . . .: .:: . :..:::::.:.:: ::.::::: :..:.:::::: CCDS77 ILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP ::: .:.::.::.:::: : ::. ::.. ..: ... :.. .:. ::... .:: :: CCDS77 REGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNG-SNNFRLFLLISACWVISLILGGLP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQ----- ..::::. :.. ::..:::: :.::::: ..:. .: .:. :: :. ::.. .. CCDS77 IMGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 KAPRPAAR--RKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWIL : :.: .:. :::::...: .:..::.::: ::: :: : .. . . : ...: CCDS77 KNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDV-GCKVKTCDILFRAEYFL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 ALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFL-CCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTD .::::::..:::::.. ..:. :: . .. :: : CCDS77 VLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 SSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI CCDS77 SSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS 360 370 380 >>CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 (353 aa) initn: 653 init1: 277 opt: 691 Z-score: 581.5 bits: 116.2 E(32554): 4.5e-26 Smith-Waterman score: 691; 41.8% identity (70.4% similar) in 280 aa overlap (54-333:41-314) 30 40 50 60 70 80 pF1KE9 LIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYY : : .:.:::::: :.. . . . .: CCDS12 PNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVVENLLVLIAVARNSKFHSAMYL 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 CLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGER : :.. ::::.:.:..::.::::. :.::.:.::: ::: : .:.::.:::: : :: CCDS12 FLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASVFSLLAIAIER 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 FATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKR ..... : :. :. :. .:: ::.. .:: ::.:::::: .. ::..::::.:. CCDS12 HVAIAK-VKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACSTVLPLYAKH 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 YILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAPRPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVC :.: ..::. .: .:..:: :. .:..: : .. ::::: ..: .:.:: CCDS12 YVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAAP----QTLALLKTVTIVLGVFIVC 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 WGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLC : : :..:: : .. . . : ...:...::: .::.::..:::.. : :: : CCDS12 WLPAFSILLLD-YACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQ 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 CGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRS : .:..: CCDS12 CWRPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTSPTFLEGNTVV 310 320 330 340 350 >>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa) initn: 588 init1: 233 opt: 622 Z-score: 525.4 bits: 105.8 E(32554): 6e-23 Smith-Waterman score: 622; 39.0% identity (64.0% similar) in 336 aa overlap (21-350:9-335) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCL ... : . ::.::. :... :.: . :: ::.: : : CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVAL-GLTV--SVL 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 VVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWF :.: ::::.:::.:. : .. .:: : :.. .::..:.::: .. .: :: ::. :: CCDS12 VLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWF 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGML ::.::: :.:.::. .:: : :: . : : . .:: .: :. : ::.: CCDS12 LRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRS-VMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 PLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYI----LFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQ : .:.::::.:::: . :: :. :. : :..: ..:. .. . : :: .. CCDS12 PAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 KAP-RPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILA .. .: :. . :.:::..:: ::.::: : .:: : .: . . . : ..: CCDS12 HVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCE--SCNVLAVEKYFLL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 LAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSS :: :: :: .:: :. :. :. .:::.::: . : . . . :..:::: CCDS12 LAEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTR---ESVHYTSSAQGGASTRIML 290 300 310 320 330 360 370 380 pF1KE9 LRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI CCDS12 PENGHPLMDSTL 340 350 >>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa) initn: 816 init1: 346 opt: 610 Z-score: 515.1 bits: 104.1 E(32554): 2.3e-22 Smith-Waterman score: 824; 42.7% identity (67.1% similar) in 377 aa overlap (22-383:12-381) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV :..::::::..:.: : .:: : . .:. .. CCDS12 MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLAVCAFI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL ::::: :: .. : : . .. : ..::::::.:::: ::.:::: :..:.:: :: CCDS12 VLENLAVLLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP ::: .:.::.::..::: : :: ::.: . . ... .:. .. . : .. :::.:: CCDS12 REGGVFVALTASVLSLLAIALERSLTMARR-GPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLP 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE9 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQKAP-R :::::: .: ::..::::.: :.:::.. :.:.::.: .::. :. :.:.... : : CCDS12 ALGWNCLGRLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPAR 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE9 PA--------ARRKARRL--LKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGM :. :::: : : :.:. ..::::..:::::: ::: :: . . : CCDS12 PGTAGTTSTRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLDV-ACPARTCPVLLQA 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 DWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCL--ARAVEAHSG : .:.::. :: .:::::.. .:.. .:.: ..::: : : :. : :.:: .: CCDS12 DPFLGLAMANSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLVCCGRHSCG-RDPSGSQQSASAAEASGG 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 ASTTDSSLRP--RDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI : : :: ::. : .:. :.. .:. : CCDS12 LRRC---LPPGLDGSFSGSERSS-PQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD 350 360 370 380 390 >>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa) initn: 578 init1: 210 opt: 566 Z-score: 479.7 bits: 97.4 E(32554): 2.1e-20 Smith-Waterman score: 566; 35.0% identity (63.5% similar) in 337 aa overlap (1-324:1-328) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MNATGTPVAPESCQQLAAGG-----HSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGAL-RGLS : : .: . : :..: . ... :.. ::.::. :: : . .. : ::. CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLA----TEWNTVSKLVMGLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 VAASCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRL ... ...: ::::..:: . : . .:: ..:.. .:...: ::. .. .: : :: CCDS67 ITVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 APAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLA . . :.::.::. :.:.::. .:: : :: :. : .. .. :: : . : .: CCDS67 TVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNR-RVVVVIVVIWTMA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 ALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMG-LYGAIFRLVQA ..: .: .::::.: .. ::.. :::: :..: .:: : ..: ::. :: :. CCDS67 IVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 SGQKAPRPAAR-RKAR----RLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLR .. : .. :. : :::::...: ::..:: : . ::: :: . . : . CCDS67 RTMRMSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEK 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 GMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSG ..: :: .:::.::::::.:..:. . ..::: CCDS67 ---FFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE9 ASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI CCDS67 ILAGVHSNDHSVV 360 >>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa) initn: 559 init1: 187 opt: 552 Z-score: 468.5 bits: 95.3 E(32554): 9e-20 Smith-Waterman score: 552; 35.5% identity (67.4% similar) in 273 aa overlap (58-324:41-310) 30 40 50 60 70 80 pF1KE9 HYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLVVL-ENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLV :: .. : ::.::. .. . . :: :. CCDS70 DFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLA 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 NITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFAT :.. .:...: ::. .. .: . :. .::::.::: ..:.:: .:: : :: . CCDS70 NLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMS 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 MVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYIL ..: ..:. :: .:: .: : : .: ..: .: ::::::: .. :::: :.::. :.. CCDS70 IMRMRVHSNLTK-KRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLV 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 F----CLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQA-SGQKAPRPAARRKARRLLKTVLMILLAFL : :. : .... . .: . : ... : . . . :: .:.:::. .: ::. CCDS70 FWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFV 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 VCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSF ::: : . .:: : .. . .... :.: ::.:::.:::::::...... .. .. 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CCDS30 MMWGAGSPLA-----WLSAGSGN----VNVSSVGPAEGPTGPA-APLPSPKAWDVVLCIS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPA . :: :: ::.: :.. : .. . .....:::.: . ..: : .: .. : CCDS30 GTLVSCENALVVAIIVGTPAFRAPMFLLVGSLAVADLLAGLG----LVLHFAAVFCIGSA 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 QWFLRE-GLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAAL . : :.: :..:: ::: . .:. .. .. . : ..:.: ...: : : CCDS30 EMSLVLVGVLAMAFTASIGSLLAITVDRYLSLYNALTYYSETTVTRTYVMLALVWGGALG 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLV----- ::.::.:.:::: .. :. . :: :: ... . : :.. .. ::. : :.: CCDS30 LGLLPVLAWNCLDGLTTCGVVYPL-SKNHLVVLAIAFFMVFGIMLQLYAQICRIVCRHAQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE9 QASGQKAPRPAARRKA-RRLLKTVLMILLAFLVCWGPL-FGLLLADVFGSNLWAQEYLRG : . :. ::.. : :. . :. ..: :: .:: :. ::.:. . :.. :: CCDS30 QIALQRHLLPASHYVATRKGIATLAVVLGAFAACWLPFTVYCLLGDAHSPPLYT--YLT- 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 MDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGC----LRLGMRGPGDCLARAVEA : :. :: .:::::.::...: . :: .:: : . . :.:.: CCDS30 ----LLPATYNSMINPIIYAFRNQDV-QKVLWAVCCCCSSSKIPFRSRSPSDV 290 300 310 320 330 350 360 370 380 pF1KE9 HSGASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI >>CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 (360 aa) initn: 364 init1: 141 opt: 374 Z-score: 323.6 bits: 68.5 E(32554): 1.1e-11 Smith-Waterman score: 374; 28.7% identity (61.4% similar) in 334 aa overlap (40-357:30-348) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 PESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLVVLENLLVLA ::. ....: : . : .:::. :: CCDS24 MEECWVTEIANGSKDGLDSNPMKDYMILSGPQKTAVAVLCTL---LGLLSALENVAVLY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 AITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGART-FRL-----APAQWFLREG : : . :: : ... :.:: .::.:... . . :.. . : ..:. : CCDS24 LILSSHQLRRKPSYLFIGS-----LAGADFLASVVFACSFVNFHVFHGVDSKAVFLLKIG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 LLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLPLLG . ...::. :::.:: .:. . : . .. .:. .:. :.:.::...:::.: CCDS24 SVTMTFTASVGSLLLTAIDRYLCLRYPPSYKALLTRGRALVTLGIMWVLSALVSYLPLMG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE9 WNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIF-----RLVQASGQK-- :.: : :: :.:: . :.: :...: ... :. :: .. .... ::.. CCDS24 WTC-CPRP-CSELFPLIPNDYLLSWLLFIAFLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLSGHQDR 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 -APRPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILAL .: : : :: ::. ..: ..:.:: :...:. : ....: ... ... . : CCDS24 QVPGMARMRLDVRLAKTLGLVLAVLLICWFPVLALM-AHSLATTL-SDQVKKAFAFCSML 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 AVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTT--DS ..:: :::.::..:: :. . . : . . .:: :. :. .:... : :. CCDS24 CLINSMVNPVIYALRSGEIRSS--AHHCLAHWKKCVRGLGSE-AKEEAPRSSVTETEADG 290 300 310 320 330 340 360 370 380 pF1KE9 SLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI .. : CCDS24 KITPWPDSRDLDLSDC 350 360 384 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 13:34:39 2016 done: Sun Nov 6 13:34:40 2016 Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]