FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3196, 470 aa 1>>>pF1KE3196 470 - 470 aa - 470 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6426+/-0.000749; mu= 13.8117+/- 0.045 mean_var=138.1086+/-27.387, 0's: 0 Z-trim(113.3): 17 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.109135 statistics sampled from 14151 (14164) to 14151 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16 Scan time: 1.700 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS11744.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 ( 470) 3206 516.0 3.5e-146 CCDS45785.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 ( 384) 2611 422.2 4.7e-118 CCDS59297.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 ( 398) 2586 418.3 7.4e-117 CCDS59404.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 595) 851 145.3 1.7e-34 CCDS59405.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 618) 851 145.3 1.8e-34 CCDS12727.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 654) 851 145.3 1.8e-34 CCDS74414.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 ( 448) 730 126.1 7.5e-29 >>CCDS11744.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs109|chr17 (470 aa) initn: 3206 init1: 3206 opt: 3206 Z-score: 2738.2 bits: 516.0 E(33420): 3.5e-146 Smith-Waterman score: 3206; 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CCDS59 MNGHLEAEEQQDQALHIQRLRPKPEARPRGGLVPLAEVSGCCTLRSRSPSDSAAYFCIYT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KE3 -PHSRPCDARLGSTDKELKAGAAATGSAPTAPGTPWQREPRVEVMD---PAGG---PRGV :..: :: .: . ..: .::: : . : . :. : : . CCDS59 YPRGRR-GARRRAT-RTFRADGAATYEENRAEAQRWATALTCLLRGLPLPGDGEITP-DL 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 LPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLFRSHVQPLLAEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELG :::: :.:.:.:: ::.: : : ..:: :...:: .::.:. :::.:::::::.. :. CCDS59 LPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELVQGLSLS 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 RWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQKPLCSLPAGSGNALAASLNHYAGYEQVT .::..:..:::::.:::.:::..::::: :.. :. :: :::::::...:...:.: . CCDS59 EWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGILPCGSGNALAGAVNQHGGFEPAL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 NEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLSLHTASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEM . ::: ::.::::: :..:::. ::: : :: ::.::::..:::..::..: :: CCDS59 GLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWGFVSDVDIQSERFRALGSA 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 RFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGP-VDAHLVPLEEPVPSHW :::::: : ::.:.::::::.:::. . ::::. ... : . ..:. .:.: CCDS59 RFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPA----TVEPASPTPAHSLPRAKSELTLTPDPAPPMA 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 TVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLFLAMEKG CCDS59 HSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWGGAGDAPLSPDPLLS 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 417 init1: 353 opt: 423 Z-score: 368.8 bits: 77.9 E(33420): 3.3e-14 Smith-Waterman score: 423; 45.4% identity (66.3% similar) in 163 aa overlap (300-460:445-595) 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 YRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEE : .:::..: :: : : :: CCDS59 PPGSPKAALHSPVSEGAPVIPPSSGLPLPTPDARVGAST--------CGPPDHLLPPLGT 420 430 440 450 460 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 PVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLF :.: : :. . ::::.::. ::::... ::: .: :..:: .::.:.::: ::::: CCDS59 PLPPDW-VTLEGDFVLMLAISPSHLGADLVAAPHARFDDGLVHLCWVRSGISRAALLRLF 470 480 490 500 510 520 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 LAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKDGKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVS ::::.: :. :: : :. . :::::: .::..:::: . .:.:.::. ... CCDS59 LAMERGSHFSLGCPQLGYAAARAFRLEPLTPRGVLTVDGEQVEYGPLQAQMHPGIGTLLT 530 540 550 560 570 580 450 460 470 pF1KE3 GCVEPP--PSWKPQQMPPPEEPL : :: :. .: CCDS59 G---PPGCPGREP 590 >>CCDS59405.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 (618 aa) initn: 1166 init1: 827 opt: 851 Z-score: 732.8 bits: 145.3 E(33420): 1.8e-34 Smith-Waterman score: 865; 43.8% identity (68.2% similar) in 349 aa overlap (1-332:33-373) 10 20 pF1KE3 MSAQVLGFLRSWTPLPLAAPRG---PAAAG ...:.: . : : : : ::: : : CCDS59 PPPPPLAASTPLLHGEFGSYPARGPRFALTLTSQALHIQR-LRPKPEARPRGGLVPLAEV 10 20 30 40 50 60 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 NDAGAPAATAPGGEGE-------PHSRPCDARLGSTDKELKAGAAATGSAPTAPGTPWQR . . . .:. . :..: :: .: . ..: .::: : . : CCDS59 SGCCTLRSRSPSDSAAYFCIYTYPRGRR-GARRRAT-RTFRADGAATYEENRAEAQRWAT 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 pF1KE3 EPRVEVMD---PAGG---PRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLFRSHVQPLLAEAEIS . :. : : .:::: :.:.:.:: ::.: : : ..:: :...:: .: CCDS59 ALTCLLRGLPLPGDGEITP-DLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLS 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 FTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQKPLCSL :.:. :::.:::::::.. :..::..:..:::::.:::.:::..::::: :.. :. : CCDS59 FNLIQTERQNHARELVQGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGIL 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 PAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLSLHTASGLRLFSVLS : :::::::...:...:.: . . ::: ::.::::: :..:::. ::: : :: :: CCDS59 PCGSGNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLS 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 LAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVV .::::..:::..::..: :: :::::: : ::.:.::::::.:::. . ::::. CCDS59 VAWGFVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPA----TVEPASPTP 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 VQQGP-VDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHL ... : . ..:. .:.: CCDS59 AHSLPRAKSELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGG 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 417 init1: 353 opt: 423 Z-score: 368.6 bits: 77.9 E(33420): 3.4e-14 Smith-Waterman score: 423; 45.4% identity (66.3% similar) in 163 aa overlap (300-460:468-618) 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 YRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEE : .:::..: :: : : :: CCDS59 PPGSPKAALHSPVSEGAPVIPPSSGLPLPTPDARVGAST--------CGPPDHLLPPLGT 440 450 460 470 480 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 PVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAPMGRCAAGVMHLFYVRAGVSRAMLLRLF :.: : :. . ::::.::. ::::... ::: .: :..:: .::.:.::: ::::: CCDS59 PLPPDW-VTLEGDFVLMLAISPSHLGADLVAAPHARFDDGLVHLCWVRSGISRAALLRLF 490 500 510 520 530 540 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 LAMEKGRHMEYECPYLVYVPVVAFRLEPKDGKGVFAVDGELMVSEAVQGQVHPNYFWMVS ::::.: :. :: : :. . :::::: .::..:::: . .:.:.::. ... CCDS59 LAMERGSHFSLGCPQLGYAAARAFRLEPLTPRGVLTVDGEQVEYGPLQAQMHPGIGTLLT 550 560 570 580 590 600 450 460 470 pF1KE3 GCVEPP--PSWKPQQMPPPEEPL : :: :. .: CCDS59 G---PPGCPGREP 610 >>CCDS12727.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs109|chr19 (654 aa) initn: 1190 init1: 827 opt: 851 Z-score: 732.4 bits: 145.3 E(33420): 1.8e-34 Smith-Waterman score: 865; 43.8% identity (68.2% similar) in 349 aa overlap (1-332:69-409) 10 20 pF1KE3 MSAQVLGFLRSWTPLPLAAPRG---PAAAG ...:.: . : : : : ::: : : CCDS12 PPPPPLAASTPLLHGEFGSYPARGPRFALTLTSQALHIQR-LRPKPEARPRGGLVPLAEV 40 50 60 70 80 90 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 NDAGAPAATAPGGEGE-------PHSRPCDARLGSTDKELKAGAAATGSAPTAPGTPWQR . . . .:. . :..: :: .: . ..: .::: : . : CCDS12 SGCCTLRSRSPSDSAAYFCIYTYPRGRR-GARRRAT-RTFRADGAATYEENRAEAQRWAT 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 pF1KE3 EPRVEVMD---PAGG---PRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLFRSHVQPLLAEAEIS . :. : : .:::: :.:.:.:: ::.: : : ..:: :...:: .: CCDS12 ALTCLLRGLPLPGDGEITP-DLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLS 160 170 180 190 200 210 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 FTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQKPLCSL :.:. :::.:::::::.. :..::..:..:::::.:::.:::..::::: :.. :. : CCDS12 FNLIQTERQNHARELVQGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRPDWEEAVKMPVGIL 220 230 240 250 260 270 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 PAGSGNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLSLHTASGLRLFSVLS : :::::::...:...:.: . . ::: ::.::::: :..:::. ::: : :: :: CCDS12 PCGSGNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLS 280 290 300 310 320 330 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 LAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGRVGSKTPASPVV .::::..:::..::..: :: :::::: : ::.:.::::::.:::. . ::::. 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CCDS74 LAMERGSHFSLGCPQLGYAAARAFRLEPLTPRGVLTVDGEQVEYGPLQAQMHPGIGTLLT 380 390 400 410 420 430 450 460 470 pF1KE3 GCVEPP--PSWKPQQMPPPEEPL : :: :. .: CCDS74 G---PPGCPGREP 440 470 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Oct 24 21:47:44 2019 done: Thu Oct 24 21:47:45 2019 Total Scan time: 1.700 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]