FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3810, 407 aa 1>>>pF1KE3810 407 - 407 aa - 407 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4067+/-0.000919; mu= 16.8044+/- 0.055 mean_var=65.6845+/-13.170, 0's: 0 Z-trim(105.5): 16 B-trim: 293 in 1/49 Lambda= 0.158250 statistics sampled from 8462 (8473) to 8462 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16 Scan time: 2.460 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11559.1 PDK2 gene_id:5164|Hs108|chr17 ( 407) 2723 630.5 8.3e-181 CCDS56039.1 PDK2 gene_id:5164|Hs108|chr17 ( 343) 2292 532.1 3e-151 CCDS2250.1 PDK1 gene_id:5163|Hs108|chr2 ( 436) 1959 456.1 2.8e-128 CCDS14212.1 PDK3 gene_id:5165|Hs108|chrX ( 406) 1876 437.2 1.4e-122 CCDS48088.1 PDK3 gene_id:5165|Hs108|chrX ( 415) 1876 437.2 1.4e-122 CCDS5643.1 PDK4 gene_id:5166|Hs108|chr7 ( 411) 1850 431.2 8.4e-121 CCDS63059.1 PDK1 gene_id:5163|Hs108|chr2 ( 456) 1487 348.4 8.1e-96 CCDS10705.1 BCKDK gene_id:10295|Hs108|chr16 ( 412) 288 74.6 1.9e-13 CCDS45467.1 BCKDK gene_id:10295|Hs108|chr16 ( 365) 258 67.7 2e-11 >>CCDS11559.1 PDK2 gene_id:5164|Hs108|chr17 (407 aa) initn: 2723 init1: 2723 opt: 2723 Z-score: 3359.5 bits: 630.5 E(32554): 8.3e-181 Smith-Waterman score: 2723; 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CCDS22 SPELELEELNAKSPGQPIQVVYVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEHHANRGVYPPIQVHVT 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 LGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTPQPGTG-GTPLAGFGYGLPISRLYA ::.:::..::::::::::::::.:::.::::::: :. :. ..:::::::::::::::: CCDS22 LGNEDLTVKMSDRGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPRVETSRAVPLAGFGYGLPISRLYA 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 KYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTE .::::::.:.:.::.:::::::.:::::::.::::::::.::.::.: .:: :::::: : CCDS22 QYFQGDLKLYSLEGYGTDAVIYIKALSTDSIERLPVYNKAAWKHYNTNHEADDWCVPSRE 370 380 390 400 410 420 400 pF1KE3 PKNTSTYRVS ::. .:.: CCDS22 PKDMTTFRSA 430 >>CCDS14212.1 PDK3 gene_id:5165|Hs108|chrX (406 aa) initn: 1852 init1: 1217 opt: 1876 Z-score: 2314.4 bits: 437.2 E(32554): 1.4e-122 Smith-Waterman score: 1876; 67.1% identity (87.5% similar) in 407 aa overlap (2-405:5-403) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MRWVWALLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQEL :: :::. .:: ::..:.:::::::.::::::: .:::::::. :::.:: CCDS14 MRLFRW---LLKQP----VPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKEL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHRTLSQFTDALV :::::: :.:.::::: .:. ::: ::::::.::.:...:. .:.::: ..:..: ..:. CCDS14 PVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFD .:::::::::::::::.:::. .: :: . :::::::::: .:::.:::::::::.: CCDS14 KVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPIH :.:::.::::::::::.:::..::::::. ::.::..::...:.::..:.:: .::. CCDS14 GDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 MVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHES-SLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVP .:::::::.:::::::::.:::::: .:. . : .:..:.::.::::::.:: ::::: CCDS14 VVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LRKIERLFSYMYSTAPTP--QPGTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGT ::::.:::.::::::: : .: : ..::::::::::::::::.::::::.:.:::: :: CCDS14 LRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEP-TRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 DAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS ::::::::::..: :::::.::::::::.: :: :: ::.::...: :. CCDS14 DAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQ 360 370 380 390 400 >>CCDS48088.1 PDK3 gene_id:5165|Hs108|chrX (415 aa) initn: 1852 init1: 1217 opt: 1876 Z-score: 2314.3 bits: 437.2 E(32554): 1.4e-122 Smith-Waterman score: 1876; 67.1% identity (87.5% similar) in 407 aa overlap (2-405:5-403) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MRWVWALLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQEL :: :::. .:: ::..:.:::::::.::::::: .:::::::. :::.:: CCDS48 MRLFRW---LLKQP----VPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKEL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHRTLSQFTDALV :::::: :.:.::::: .:. ::: ::::::.::.:...:. .:.::: ..:..: ..:. CCDS48 PVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFD .:::::::::::::::.:::. .: :: . :::::::::: .:::.:::::::::.: CCDS48 KVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPIH :.:::.::::::::::.:::..::::::. ::.::..::...:.::..:.:: .::. CCDS48 GDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 MVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHES-SLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVP .:::::::.:::::::::.:::::: .:. . : .:..:.::.::::::.:: ::::: CCDS48 VVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LRKIERLFSYMYSTAPTP--QPGTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGT ::::.:::.::::::: : .: : ..::::::::::::::::.::::::.:.:::: :: CCDS48 LRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEP-TRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 DAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS ::::::::::..: :::::.::::::::.: :: :: ::.::...: :. CCDS48 DAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTN 360 370 380 390 400 410 CCDS48 RTF >>CCDS5643.1 PDK4 gene_id:5166|Hs108|chr7 (411 aa) initn: 1109 init1: 1109 opt: 1850 Z-score: 2282.3 bits: 431.2 E(32554): 8.4e-121 Smith-Waterman score: 1850; 65.2% identity (89.1% similar) in 405 aa overlap (1-400:1-404) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MRWVWALLKNA-SLAGA---PKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQE :. . .:..: :: :: :. .::::..:::::::::.::::: ::::.:::.::::: CCDS56 MKAARFVLRSAGSLNGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 LPVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHRTLSQFTDAL ::::::::.:::..:: ....: :::::.:::.:::.:..:: .:.:.:...::.:.:.: CCDS56 LPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 VTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIF . .::::..::::::::..::::. :::.:::.::::::::..::: :::.::: ::: CCDS56 IKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 DGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPI . : . ..:.:::::::::.: ::.::.. ...:::.::..::.:.. ..:. ::: CCDS56 SDSQT-GNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 HMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHESSLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVP :.:::::::.:::::::::::::::: .:.. : ::.:.:.::.:::.::.:::::::: CCDS56 HIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LRKIERLFSYMYSTAPTP-QPGTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTD :: :.::::: ::::::: . .. ..:::::::::::::::::::::::.:.:. :.::: CCDS56 LRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 AVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS :.:::::::..:.:.:::.::::..::: .:: :::.:: :::: CCDS56 AIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM 360 370 380 390 400 410 >>CCDS63059.1 PDK1 gene_id:5163|Hs108|chr2 (456 aa) initn: 1952 init1: 642 opt: 1487 Z-score: 1833.7 bits: 348.4 E(32554): 8.1e-96 Smith-Waterman score: 1912; 67.0% identity (84.9% similar) in 418 aa overlap (11-405:37-454) 10 20 30 40 pF1KE3 MRWVWALLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFG :: :.: .. ...::::::::::::::: CCDS63 LRGAALAGPGPGLRAAGFSRSFSSDSGSSPASERGVPGQVDFYARFSPSPLSMKQFLDFG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 SSNACEKTSFTFLRQELPVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLD : :::::::: :::::::::::::::::.:::: .: :::::::::::.::: ....: : CCDS63 SVNACEKTSFMFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPSVQLVQSWYIQSLQELLDFKD 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 pF1KE3 KDPED--------HRTLSQ------------FTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDT :. :: .:: : :::... ::::::::.:::::::.:::.. CCDS63 KSAEDAKAIYERPRRTWLQVSSLCCMACKMIFTDTVIRIRNRHNDVIPTMAQGVIEYKES 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 pF1KE3 YGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGST--NPAHPKHIGSIDPNCNVS .: :::..::.::::::::.::::::::.:::.:.: :. .:.: ::::::.::::: CCDS63 FGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKGKGSPSHRKHIGSINPNCNVL 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 EVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPIHMVYVPSHLYHMLFELFKNAMR ::.::.:. :. ::: ::. ::.::..:.:: . :::..::::::::::.::::::::: CCDS63 EVIKDGYENARRLCDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQVVYVPSHLYHMVFELFKNAMR 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 ATVESHESSLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTPQPGT ::.: : . . :::.: :.::.:::..::::::::::::::.:::.::::::: :. : CCDS63 ATMEHHANRGVYPPIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPRVET 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 G-GTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNKS . ..::::::::::::::::.::::::.:.:.::.:::::::.:::::::.::::::::. CCDS63 SRAVPLAGFGYGLPISRLYAQYFQGDLKLYSLEGYGTDAVIYIKALSTDSIERLPVYNKA 370 380 390 400 410 420 380 390 400 pF1KE3 AWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS ::.::.: .:: :::::: :::. .:.: CCDS63 AWKHYNTNHEADDWCVPSREPKDMTTFRSA 430 440 450 >>CCDS10705.1 BCKDK gene_id:10295|Hs108|chr16 (412 aa) initn: 448 init1: 149 opt: 288 Z-score: 354.9 bits: 74.6 E(32554): 1.9e-13 Smith-Waterman score: 565; 32.8% identity (60.7% similar) in 338 aa overlap (49-369:90-407) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 YIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQELPVRLANIMKEINLLPDRVLST : .:.::::::.:. .: . :: . . CCDS10 DAAAEKPSVRLTPTMMLYAGRSQDGSHLLKSARYLQQELPVRIAHRIKGFRCLPFIIGCN 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 PSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLD-KDPEDHRTLSQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEY :.. :. :.... . .: :: :. :.. :. . :.::: .:.:. : CCDS10 PTILHVHELYIRAFQKLTDFPPIKDQADEAQYCQLVRQLL---DDHKDVVTLLAEGLRES 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 KDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNV . :. . ..::::. ::..:::: ..: . . .: .: : . CCDS10 RKHIEDEKL----VRYFLDKTLTSRLGIRMLATHHLALHED-----KPDFVGIICTRLSP 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 SEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPIHMVYVPSHLYHMLFELFKNAM ..... :.:. ::.. : .: ..:. :: . : ..: : ..: ::.:::: CCDS10 KKIIEKWVDFARRLCEHKYGNAPRVRINGHVAA--RFP----FIPMPLDYILPELLKNAM 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 RATVESH-ESSLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTA----- :::.::: .. .: . . .: .. :: :..::::::. . ..:...: ..:: CCDS10 RATMESHLDTPYNVPDVVITIANNDVDLIIRISDRGGGIAHKDLDRVMDYHFTTAEASTQ 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 pF1KE3 -PTPQP---------GTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLK : .: :. . :. :::.::: :: ::.:. :.::: :..:.::: .::. CCDS10 DPRISPLFGHLDMHSGAQSGPMHGFGFGLPTSRAYAEYLGGSLQLQSLQGIGTD--VYLR 350 360 370 380 390 370 380 390 400 pF1KE3 ALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS :. : CCDS10 LRHIDGREESFRI 400 410 >>CCDS45467.1 BCKDK gene_id:10295|Hs108|chr16 (365 aa) initn: 313 init1: 110 opt: 258 Z-score: 318.7 bits: 67.7 E(32554): 2e-11 Smith-Waterman score: 442; 30.1% identity (60.2% similar) in 279 aa overlap (49-325:90-350) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 YIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQELPVRLANIMKEINLLPDRVLST : .:.::::::.:. .: . :: . . CCDS45 DAAAEKPSVRLTPTMMLYAGRSQDGSHLLKSARYLQQELPVRIAHRIKGFRCLPFIIGCN 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 PSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLD-KDPEDHRTLSQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEY :.. :. :.... . .: :: :. :.. :. . :.::: .:.:. : CCDS45 PTILHVHELYIRAFQKLTDFPPIKDQADEAQYCQLVRQLL---DDHKDVVTLLAEGLRES 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 KDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNV . :. . ..::::. ::..:::: ..: . . . : .: : . CCDS45 RKHIEDEKL----VRYFLDKTLTSRLGIRMLATHHLALHEDK-----PDFVGIICTRLSP 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 SEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPIHMVYVPSHLYHMLFELFKNAM ..... :.:. ::.. : .: ..: :.. .. ..: : ..: ::.:::: CCDS45 KKIIEKWVDFARRLCEHKYGNAPRVRI------NGHVAARFPFIPMPLDYILPELLKNAM 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 RATVESH-ESSLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTPQP :::.::: .. .: . . .: .. :: :..::::::. . ..:...: ..:: . CCDS45 RATMESHLDTPYNVPDVVITIANNDVDLIIRISDRGGGIAHKDLDRVMDYHFTTAEASTQ 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 GTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNK .:: : CCDS45 DPRISPLFGHLDMHSGAQSGPMHG 350 360 407 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 06:38:07 2016 done: Sun Nov 6 06:38:08 2016 Total Scan time: 2.460 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]