FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5767, 599 aa 1>>>pF1KE5767 599 - 599 aa - 599 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3513+/-0.00113; mu= 14.4677+/- 0.068 mean_var=102.4822+/-20.533, 0's: 0 Z-trim(104.7): 70 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.126692 statistics sampled from 7981 (8051) to 7981 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16 Scan time: 3.350 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 3879 720.2 1.8e-207 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 770 152.1 3.2e-36 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 770 152.1 3.2e-36 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 758 149.8 1e-35 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 722 143.2 1e-33 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 722 143.3 1.1e-33 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 719 142.7 1.4e-33 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 711 141.2 4.1e-33 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 707 140.5 6.3e-33 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 703 139.7 9.8e-33 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 694 138.2 4e-32 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 654 130.8 5.2e-30 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 644 129.0 2.1e-29 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 644 129.0 2.1e-29 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 634 127.2 9.1e-29 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 612 123.0 7.5e-28 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 614 123.5 8.7e-28 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 603 121.3 2.4e-27 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 602 121.3 3.7e-27 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 602 121.3 3.7e-27 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 597 120.3 5.5e-27 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 559 113.5 1.2e-24 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 559 113.5 1.2e-24 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 553 112.3 1.9e-24 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 553 112.3 2e-24 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 552 112.2 2.2e-24 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 551 112.1 3.2e-24 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 545 110.8 3.8e-24 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 544 110.6 4.2e-24 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 535 109.0 1.5e-23 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 519 106.0 1e-22 CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 513 104.9 2.4e-22 CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 502 102.9 9.7e-22 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 502 102.9 9.8e-22 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 479 98.8 2.5e-20 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 479 98.9 2.7e-20 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 471 97.4 7.6e-20 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 461 95.4 1.8e-19 CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 457 94.6 2.4e-19 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 453 93.9 3.9e-19 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 447 93.0 1.5e-18 CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 429 89.6 9.6e-18 CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 410 86.1 1.1e-16 CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 409 86.0 1.4e-16 CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 408 85.9 2.2e-16 CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 395 83.3 7.1e-16 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 391 82.5 9.6e-16 CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 388 82.1 1.9e-15 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 388 82.2 2.2e-15 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 312 68.3 3.2e-11 >>CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 (599 aa) initn: 3879 init1: 3879 opt: 3879 Z-score: 3838.2 bits: 720.2 E(32554): 1.8e-207 Smith-Waterman score: 3879; 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CCDS75 GELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPE 290 300 310 320 330 340 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 LENLRKEKINFLRNKHK-IHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDAGFQMPTP : .. .:..: .: . . : :.: : :: .. : :. ..:... :.. ::: CCDS75 LAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCG----ISMKILNSLKKHGYEKPTP 350 360 370 380 390 200 210 220 230 240 pF1KE5 IQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIP----ILMQLKQPANKGFRALIISPTREL :: ::::... ::.:.. : ::::::.:: .: :. : . ..: :.:..::::: CCDS75 IQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTREL 400 410 420 430 440 450 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 ASQIHRELIKISEGTGFRIHMIHKAAVAAKKFGPKSSKKFDILVTTPNRLIYLLKQDPPG : :: .: :.:. :.:. .. .. ..... . .. .:.: ::.:.: .: . CCDS75 ALQITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIA-ELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGR 460 470 480 490 500 510 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 I-DLASVEWLVVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAYDVEQWCK . .: : ..:.::.:..:. ::. :. : . . .:::::: .: . CCDS75 VTNLRRVTYVVLDEADRMFD---MGFEPQVMRIVDNVRPDR-QTVMFSATFPRAMEALAR 520 530 540 550 560 570 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LNLDNVISVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAVRELVKK-GFNPPVLVFVQSIER :.. : :..:.:. . :::... . : :.: . ::. . . :..::.. :. CCDS75 RILSKPIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVI-EEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEH 580 590 600 610 620 630 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 AKELFHELIYEGINVDVIHAERTQQQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLV : :...:. . .:. : .::. ...:. : .:. :.. :::.: : . :: CCDS75 ADGLLKDLMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILV 640 650 660 670 680 690 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 INYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGNKGKAITFFTEDDKPLLRSVANVIQQAGCPVPEYIKG .::. :. .:.:: :::::::::: : ::.:::. .. .... .: :: .. CCDS75 VNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEK 700 710 720 730 740 750 550 560 570 580 590 pF1KE5 FQKLLSKQKK---KMIKKPL----ERESISTTPKCFLEKAKDKQKKVTG-QNSKKKVALE . . .. :.: :.::: . ... : . . .. : :: . : :.: . : CCDS75 LWSDFKDQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAV 760 770 780 790 800 810 pF1KE5 DKS : CCDS75 DIDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQV 820 830 840 850 860 870 >>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 (648 aa) initn: 643 init1: 330 opt: 758 Z-score: 754.7 bits: 149.8 E(32554): 1e-35 Smith-Waterman score: 758; 32.8% identity (64.8% similar) in 488 aa overlap (100-573:177-647) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 NGEKKEESLTERKREQSKKKRKTMTSEIASQEEGATIQWMSSVEAKIED--KKVQRESKL .::: ..:... : . :. .:: CCDS49 TAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEG--LKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTA 150 160 170 180 190 200 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 TSG--KLE--NLRKEKINFLRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDA ::. :.: . :::..:. . : . .:.: :: :. .. ....:: : CCDS49 TSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLK-DGEKRPIPNPTCTF---DDAFQCYPEVMENIKKA 210 220 230 240 250 260 190 200 210 220 230 pF1KE5 GFQMPTPIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLK-QPANKGFRA----L ::: ::::: :: :..:.: .:.. : ::.:::: . .: ...: ::. :: : : CCDS49 GFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGML 270 280 290 300 310 320 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IISPTRELASQIHRELIKISEGTGFRIHMIHKAAVAAKKFGPKSSKKFDILVTTPNRLIY ...:::::: :.. : : : :.: .. .. ... . .: ::...::.:: CCDS49 VLTPTRELALQVEGECCKYSY-KGLRSVCVYGGGNRDEQI-EELKKGVDIIIATPGRLND 330 340 350 360 370 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LLKQDPPGIDLASVEWLVVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAY : : ..: .. .::.::.::... ::. :. .:.: . . .: :::. . CCDS49 L--QMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLD---MGFEPQIMKILLDVRPDR-QTVMTSATWPH 380 390 400 410 420 430 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 DVEQWCKLNLDNVISVSIGARN-SAVETVEQELLFVGSETGKLLAVRELVKK-GFNPPVL .:.. . : . . : .:. . :: .:.:... : .: : .. .... . . :. CCDS49 SVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNII-VTTEEEKWSHMQTFLQSMSSTDKVI 440 450 460 470 480 490 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 VFVQSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQQQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGI :::. : .: .:: .:.:. .:..: :..:......:..::. .:: : : .::. CCDS49 VFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGL 500 510 520 530 540 550 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 DFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGNKGKAITFFTEDDKPLLRSVANVIQQAGC : . :. : :.::: . ::.:::::::::: : .:: .:..: . . :....:. CCDS49 DVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQ 560 570 580 590 600 610 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 PVPEYIKGF-QKLLSKQKKKMIKKPLERESISTTPKCFLEKAKDKQKKVTGQNSKKKVAL .:: . .. ... ..:.:. ... .:: . :: : CCDS49 SIPEELVSMAERFKAHQQKREMERKMERPQ--GRPKKFH 620 630 640 pF1KE5 EDKS >>CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (704 aa) initn: 578 init1: 361 opt: 722 Z-score: 718.7 bits: 143.2 E(32554): 1e-33 Smith-Waterman score: 731; 30.2% identity (61.4% similar) in 559 aa overlap (7-543:125-652) 10 20 30 pF1KE5 MDVHDLFRRLGAGAKFDTRRFSADAARFQIGKRKYD .:: : :. : . . : .:. . : CCDS54 GFSNSRFEDGDSSGFWRGYRDGNNSEASGPYRRGGRGS------FRGCRGGFGLGSPNND 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 FDSSEVLQGLD-FFGNKKSVPGVCGASQTHQKPQNGEKKEESLTERKREQ--SKKKRKTM .: .: .: .::... : . : ..: :. ..: .:.. . :. . . ... CCDS54 LDPDECMQRTGGLFGSRRPVLSGTGNGDTSQS-RSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSW 150 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 pF1KE5 TSEI----ASQEEGATIQWMSSVEAKIEDKKVQRESKLTSGKLENLRKEKINFLR-NKHK :: .:. .: . .. . ::. .. .: ::: . . CCDS54 KSEAEGGESSDTQGPKVTYIPPPPPEDEDSIF---AHYQTG---------INFDKYDTIL 210 220 230 240 250 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 IHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDAGFQMPTPIQMQAIPVMLHGRELLAS ..:.: : : : ::.. . .:. :: ::. ::.: .::..: ::.:.: CCDS54 VEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNN----NIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMAC 260 270 280 290 300 310 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 APTGSGKTLAFSIPILMQLKQPANKGFR--------ALIISPTRELASQIHRELIKISEG : :::::: :: .::: .. . . . : .:..:::::..::. : :.: : CCDS54 AQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFG 320 330 340 350 360 370 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 TGFRIHMIHKAAVAAKKFGPKSSKKFDILVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLASVEWLVVDES : : .:. .. .... . . .:: .::.::. .. .. : : ....::.::. CCDS54 TCVRAVVIYGGTQLGHSIR-QIVQGCNILCATPGRLMDIIGKEKIG--LKQIKYLVLDEA 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 pF1KE5 DKLFEDGKTGFRDQLASIFLACT---SHKVRRA-MFSATFAYDVEQWCKLNL-DNVISVS :.... :: .. .. ..: :.. :.. :::::: .... : .: . :. CCDS54 DRMLD---MGFGPEMKKL-ISCPGMPSKEQRQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVA 430 440 450 460 470 480 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 IGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAVRELVKKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYE .: ..: . :.: .: :: . .: . :.... . ..:::.. ..: . : : CCDS54 VGQVGGACRDVQQTVLQVG-QFSKREKLVEILRNIGDERTMVFVETKKKADFIATFLCQE 490 500 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 GINVDVIHAERTQQQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVE :.. ::..: :..:.... .:: :: ::. :.. :::.:...:. :::.:.:.. : CCDS54 KISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDE 550 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 pF1KE5 YIHRIGRTGRAGNKGKAITFFT-EDDKPLLRSVANVIQQAGCPVPEYIKGFQKLLSKQKK :.:::::::: :: :.::.:: :.:. : . ...:. .: :: ... CCDS54 YVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGF 610 620 630 640 650 660 560 570 580 590 pF1KE5 KMIKKPLERESISTTPKCFLEKAKDKQKKVTGQNSKKKVALEDKS CCDS54 SGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPVDDESWD 670 680 690 700 >>CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (724 aa) initn: 578 init1: 361 opt: 722 Z-score: 718.5 bits: 143.3 E(32554): 1.1e-33 Smith-Waterman score: 731; 30.2% identity (61.4% similar) in 559 aa overlap (7-543:145-672) 10 20 30 pF1KE5 MDVHDLFRRLGAGAKFDTRRFSADAARFQIGKRKYD .:: : :. : . . : .:. . : CCDS39 NDCEDNPTRNRGFSKRGGYRDGNNSEASGPYRRGGRGS------FRGCRGGFGLGSPNND 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 FDSSEVLQGLD-FFGNKKSVPGVCGASQTHQKPQNGEKKEESLTERKREQ--SKKKRKTM .: .: .: .::... : . : ..: :. ..: .:.. . :. . . ... CCDS39 LDPDECMQRTGGLFGSRRPVLSGTGNGDTSQS-RSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSW 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 pF1KE5 TSEI----ASQEEGATIQWMSSVEAKIEDKKVQRESKLTSGKLENLRKEKINFLR-NKHK :: .:. .: . .. . ::. .. .: ::: . . CCDS39 KSEAEGGESSDTQGPKVTYIPPPPPEDEDSIF---AHYQTG---------INFDKYDTIL 230 240 250 260 270 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 IHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDAGFQMPTPIQMQAIPVMLHGRELLAS ..:.: : : : ::.. . .:. :: ::. ::.: .::..: ::.:.: CCDS39 VEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNN----NIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMAC 280 290 300 310 320 330 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 APTGSGKTLAFSIPILMQLKQPANKGFR--------ALIISPTRELASQIHRELIKISEG : :::::: :: .::: .. . . . : .:..:::::..::. : :.: : CCDS39 AQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFG 340 350 360 370 380 390 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 TGFRIHMIHKAAVAAKKFGPKSSKKFDILVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLASVEWLVVDES : : .:. .. .... . . .:: .::.::. .. .. : : ....::.::. CCDS39 TCVRAVVIYGGTQLGHSIR-QIVQGCNILCATPGRLMDIIGKEKIG--LKQIKYLVLDEA 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 pF1KE5 DKLFEDGKTGFRDQLASIFLACT---SHKVRRA-MFSATFAYDVEQWCKLNL-DNVISVS :.... :: .. .. ..: :.. :.. :::::: .... : .: . :. CCDS39 DRMLD---MGFGPEMKKL-ISCPGMPSKEQRQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVA 450 460 470 480 490 500 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 IGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAVRELVKKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYE .: ..: . :.: .: :: . .: . :.... . ..:::.. ..: . : : CCDS39 VGQVGGACRDVQQTVLQVG-QFSKREKLVEILRNIGDERTMVFVETKKKADFIATFLCQE 510 520 530 540 550 560 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 GINVDVIHAERTQQQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVE :.. ::..: :..:.... .:: :: ::. :.. :::.:...:. :::.:.:.. : CCDS39 KISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDE 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 550 pF1KE5 YIHRIGRTGRAGNKGKAITFFT-EDDKPLLRSVANVIQQAGCPVPEYIKGFQKLLSKQKK :.:::::::: :: :.::.:: :.:. : . ...:. .: :: ... CCDS39 YVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGF 630 640 650 660 670 680 560 570 580 590 pF1KE5 KMIKKPLERESISTTPKCFLEKAKDKQKKVTGQNSKKKVALEDKS CCDS39 SGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPVDDESWD 690 700 710 720 >>CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 (622 aa) initn: 554 init1: 293 opt: 719 Z-score: 716.5 bits: 142.7 E(32554): 1.4e-33 Smith-Waterman score: 722; 28.5% identity (63.0% similar) in 527 aa overlap (32-543:54-564) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 DVHDLFRRLGAGAKFDTRRFSADAARFQIGKRKYDFDSSEVLQGLDFFGNKKSVP-GVCG .:: . . .: . :.. ..: : . CCDS44 EAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQS 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ASQTHQKPQNGEKKEESLTERKREQSKKKRKTMTSEIASQEEGATIQWMSSVEAKIEDKK . .. :. ..: :. : .:.. :... . .: :: ... .. . : CCDS44 NVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVA---EGRALMSVKEMAKGITYDD 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 VQRESKLTSGKLENLRKEKINFLRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNI . : . .. .:. . .:.:..: :.: .: :: .: .:.:. . .:... CCDS44 PIKTSWTPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSF----KEMKFPAAILRGL 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 pF1KE5 LDAGFQMPTPIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILM----QLKQ-PANK-- :.. :::::.:.::..: ::.... : :::::::.:..:..: : :. : .: CCDS44 KKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKRE 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 pF1KE5 GFRALIISPTRELASQIHR------ELIKISEGTGFRIHMIHKAAVAAKKFGPKSSKKFD : .::: :.:::: : : .:.. . . .: . .....:. . CCDS44 GPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALC-IGGMSVKEQMETIRHGVH 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 ILVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLASVEWLVVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKV ..:.::.::. ::.. ..:. ..:..::.:.... ::. .. .:: ... CCDS44 MMVATPGRLMDLLQKKMVSLDI--CRYLALDEADRMID---MGFEGDIRTIFSYFKGQR- 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 RRAMFSATFAYDVEQWCKLNLDNVISVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAVRELV . .::::. .... : : . .....: ..: : ::. .: .: .:.. . : . CCDS44 QTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYV-KEEAKMVYLLECL 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 KKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQQQRDNTVHSFRAGKIWVLI .: ::::.:... . . . :. .:... .::. . :..: .....:: :: ::. CCDS44 QKT-PPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLV 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 CTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGNKGKAITFFTED-DKPLLRS : . ..:.:: ... :::::.: .:.::::::::.:: : : ::... :. .: . CCDS44 ATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMD 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KE5 VANVIQQAGCPVPEYIKGFQKLLSKQKKKMIKKPLERESISTTPKCFLEKAKDKQKKVTG . .. .: :: .. CCDS44 LKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVS 550 560 570 580 590 600 >>CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (690 aa) initn: 578 init1: 361 opt: 711 Z-score: 707.9 bits: 141.2 E(32554): 4.1e-33 Smith-Waterman score: 715; 30.8% identity (62.3% similar) in 530 aa overlap (36-543:134-638) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 LFRRLGAGAKFDTRRFSADAARFQIGKRKYDFDSSEVLQGLD-FFGNKKSVPGVCGASQT :.: .: .: .::... : . : ..: CCDS47 GDSSGFWRESSNDCEDNPTRNRGFSKRGDNDLDPDECMQRTGGLFGSRRPVLSGTGNGDT 110 120 130 140 150 160 70 80 90 100 110 pF1KE5 HQKPQNGEKKEESLTERKREQ--SKKKRKTMTSEI----ASQEEGATIQWMSSVEAKIED :. ..: .:.. . :. . . ... :: .:. .: . .. . :: CCDS47 SQS-RSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAEGGESSDTQGPKVTYIPPPPPEDED 170 180 190 200 210 220 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 KKVQRESKLTSGKLENLRKEKINFLR-NKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLL . .. .: ::: . . ..:.: : : : ::.. . .:. CCDS47 SIF---AHYQTG---------INFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNN--- 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 QNILDAGFQMPTPIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPANKG--F :: ::. ::.: .::..: ::.:.: : :::::: :: .::: .. . . . : CCDS47 -NIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRF 270 280 290 300 310 320 240 250 260 270 280 pF1KE5 RAL------IISPTRELASQIHRELIKISEGTGFRIHMIHKAAVAAKKFGPKSSKKFDIL . : :..:::::..::. : :.: :: : .:. .. .... . . .:: CCDS47 KELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIR-QIVQGCNIL 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 VTTPNRLIYLLKQDPPGIDLASVEWLVVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACT---SHK .::.::. .. .. : : ....::.::.:.... :: .. .. ..: :.. CCDS47 CATPGRLMDIIGKEKIG--LKQIKYLVLDEADRMLD---MGFGPEMKKL-ISCPGMPSKE 390 400 410 420 430 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 VRRA-MFSATFAYDVEQWCKLNL-DNVISVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAVR :.. :::::: .... : .: . :..: ..: . :.: .: :: . .: . CCDS47 QRQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVG-QFSKREKLV 440 450 460 470 480 490 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 ELVKKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQQQRDNTVHSFRAGKIW :.... . ..:::.. ..: . : : :.. ::..: :..:.... .:: :: CCDS47 EILRNIGDERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCP 500 510 520 530 540 550 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 VLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGNKGKAITFFT-EDDKPL ::. :.. :::.:...:. :::.:.:.. ::.:::::::: :: :.::.:: :.:. : CCDS47 VLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHL 560 570 580 590 600 610 530 540 550 560 570 580 pF1KE5 LRSVANVIQQAGCPVPEYIKGFQKLLSKQKKKMIKKPLERESISTTPKCFLEKAKDKQKK . ...:. .: :: ... CCDS47 AQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSS 620 630 640 650 660 670 >>CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 (619 aa) initn: 649 init1: 271 opt: 707 Z-score: 704.7 bits: 140.5 E(32554): 6.3e-33 Smith-Waterman score: 759; 30.9% identity (62.5% similar) in 541 aa overlap (58-591:110-619) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 FQIGKRKYDFDSSEVLQGLDFFGNKKSVPGVCGASQTHQKPQNGEKKEESLTERKREQSK ::: . .. : :: . .. . CCDS30 GAKDSHPSEEPVKSFSKTQRWAEPGEPICVVCGRYGEYICDKTDEDVC-SLECKAKHLLQ 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 KKRKTMTSEIASQEEGATIQWMSSVEAKIEDKKVQRESKLTSGKLENLRKEKINFLRNKH :.: :.... ... : :. .. . : .: . . ::....:. :... 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CCDS54 SQS-RSG-----SGSERDSWKSEAEGGE-----SSDTQGPKVTYIPPPPPEDEDSIF--- 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SKLTSGKLENLRKEKINFLR-NKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDA .. .: ::: . . ..:.: : : : ::.. . .:. :: : CCDS54 AHYQTG---------INFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNN----NIAKA 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE5 GFQMPTPIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPANKG--FRAL--- :. ::.: .::..: ::.:.: : :::::: :: .::: .. . . . :. : CCDS54 GYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQEP 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 ---IISPTRELASQIHRELIKISEGTGFRIHMIHKAAVAAKKFGPKSSKKFDILVTTPNR :..:::::..::. : :.: :: : .:. .. .... . . .:: .::.: CCDS54 ECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIR-QIVQGCNILCATPGR 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LIYLLKQDPPGIDLASVEWLVVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACT---SHKVRRA-M :. .. .. : : ....::.::.:.... :: .. .. ..: :.. :.. : CCDS54 LMDIIGKEKIG--LKQIKYLVLDEADRMLD---MGFGPEMKKL-ISCPGMPSKEQRQTLM 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 FSATFAYDVEQWCKLNL-DNVISVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAVRELVKKG ::::: .... : .: . :..: ..: . :.: .: :: . .: . :.... 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CCDS54 VLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPV 510 520 530 540 550 560 599 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:28:56 2016 done: Tue Nov 8 06:28:56 2016 Total Scan time: 3.350 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]